EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002190 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: gfi1b
Alias: si:ch211-231o6.2
Full Name: growth factor independent 1B transcription repressor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3480 bases
Position: chrCCOE01000865.1:3195389-3198868
Accession: ZDB-GENE-091118-129
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002700	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-23	1	5
ENSACIP00000002700	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-23	2	5
ENSACIP00000002700	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-23	3	5
ENSACIP00000002700	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-23	4	5
ENSACIP00000002700	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-23	5	5
ENSACIP00000002700	zf-met	PF12874.7	5.2e-08	1	2
ENSACIP00000002700	zf-met	PF12874.7	5.2e-08	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002797	-	912	-	ENSACIP00000002700	303 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	43.529	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	81	43.529
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	49.630	ENSACIG00000008448	-	67	49.630
ENSACIG00000002190	gfi1b	83	45.625	ENSACIG00000019791	-	89	45.625
ENSACIG00000002190	gfi1b	65	40.541	ENSACIG00000017013	-	54	40.541
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	41.304	ENSACIG00000013149	-	79	41.304
ENSACIG00000002190	gfi1b	69	45.255	ENSACIG00000010637	-	60	45.255
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	44.048	ENSACIG00000009717	-	86	43.750
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	46.429	ENSACIG00000023162	-	51	46.429
ENSACIG00000002190	gfi1b	78	36.585	ENSACIG00000017683	-	82	36.585
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	43.750	ENSACIG00000003515	-	93	43.750
ENSACIG00000002190	gfi1b	53	42.029	ENSACIG00000017166	-	57	41.304
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	44.099	ENSACIG00000023212	-	79	44.099
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	39.568	ENSACIG00000021986	-	92	39.568
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	37.956	ENSACIG00000018641	snai2	53	37.956
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	39.189	ENSACIG00000023313	-	93	39.189
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	47.674	ENSACIG00000017653	-	93	47.674
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	46.552	ENSACIG00000019534	-	76	46.552
ENSACIG00000002190	gfi1b	65	46.250	ENSACIG00000004666	-	92	50.943
ENSACIG00000002190	gfi1b	66	45.185	ENSACIG00000011515	-	76	45.185
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	32.323	ENSACIG00000011516	-	79	34.109
ENSACIG00000002190	gfi1b	78	43.925	ENSACIG00000006172	-	86	45.570
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	41.420	ENSACIG00000007882	-	74	41.420
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	34.302	ENSACIG00000006377	-	56	34.302
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	46.957	ENSACIG00000003754	-	84	46.957
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	40.000	ENSACIG00000009128	-	70	40.000
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	49.138	ENSACIG00000015835	-	67	44.444
ENSACIG00000002190	gfi1b	91	46.309	ENSACIG00000010647	-	99	42.553
ENSACIG00000002190	gfi1b	63	46.207	ENSACIG00000010966	-	53	46.207
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	42.941	ENSACIG00000016182	-	84	45.349
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	41.880	ENSACIG00000019815	-	82	41.880
ENSACIG00000002190	gfi1b	53	44.000	ENSACIG00000007855	-	95	44.000
ENSACIG00000002190	gfi1b	63	39.568	ENSACIG00000006755	-	75	39.568
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	41.071	ENSACIG00000020982	znf710b	50	41.071
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	39.130	ENSACIG00000013163	-	77	39.130
ENSACIG00000002190	gfi1b	76	44.860	ENSACIG00000012084	-	97	43.548
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	41.463	ENSACIG00000000406	prdm5	74	41.463
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	39.823	ENSACIG00000013750	-	58	39.823
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	45.556	ENSACIG00000018440	-	96	45.556
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	44.375	ENSACIG00000024444	-	63	44.375
ENSACIG00000002190	gfi1b	74	41.481	ENSACIG00000015429	-	85	42.466
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	42.857	ENSACIG00000007096	-	80	42.857
ENSACIG00000002190	gfi1b	62	39.535	ENSACIG00000023049	znf646	95	33.333
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	33.987	ENSACIG00000014233	znf407	67	33.987
ENSACIG00000002190	gfi1b	64	43.125	ENSACIG00000011541	-	75	43.125
ENSACIG00000002190	gfi1b	79	44.262	ENSACIG00000019710	-	74	44.262
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	45.625	ENSACIG00000004041	-	91	45.625
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	32.927	ENSACIG00000009443	-	78	31.081
ENSACIG00000002190	gfi1b	60	50.476	ENSACIG00000022738	-	92	42.400
ENSACIG00000002190	gfi1b	63	43.976	ENSACIG00000011153	-	75	43.976
ENSACIG00000002190	gfi1b	52	39.130	ENSACIG00000008611	-	50	39.130
ENSACIG00000002190	gfi1b	95	46.324	ENSACIG00000017050	-	96	48.344
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	43.609	ENSACIG00000012263	znf319b	89	43.609
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	45.255	ENSACIG00000016944	-	74	45.255
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	41.129	ENSACIG00000015411	-	67	41.129
ENSACIG00000002190	gfi1b	77	43.750	ENSACIG00000013604	-	100	43.671
ENSACIG00000002190	gfi1b	97	46.875	ENSACIG00000017647	-	89	46.875
ENSACIG00000002190	gfi1b	64	40.120	ENSACIG00000017644	-	87	40.120
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	36.667	ENSACIG00000016117	-	85	36.667
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	46.875	ENSACIG00000003556	-	68	46.875
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	42.857	ENSACIG00000012636	ZNF319	89	42.857
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	36.905	ENSACIG00000018404	-	73	36.905
ENSACIG00000002190	gfi1b	53	40.141	ENSACIG00000008886	znf1164	82	40.141
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	41.353	ENSACIG00000009755	-	85	41.353
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	43.293	ENSACIG00000003720	-	57	43.293
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	44.578	ENSACIG00000022293	-	94	44.578
ENSACIG00000002190	gfi1b	73	43.704	ENSACIG00000018022	-	77	44.444
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	40.741	ENSACIG00000016133	-	61	40.741
ENSACIG00000002190	gfi1b	69	39.157	ENSACIG00000010739	-	88	39.157
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	44.643	ENSACIG00000004626	-	79	44.643
ENSACIG00000002190	gfi1b	65	40.299	ENSACIG00000001369	-	85	40.299
ENSACIG00000002190	gfi1b	88	44.086	ENSACIG00000014123	znf236	64	44.086
ENSACIG00000002190	gfi1b	64	43.902	ENSACIG00000013470	-	73	43.902
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	43.750	ENSACIG00000019447	-	67	43.750
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	34.167	ENSACIG00000001767	zbtb41	67	34.167
ENSACIG00000002190	gfi1b	58	43.151	ENSACIG00000022625	-	84	43.151
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	38.806	ENSACIG00000020938	zbtb47b	74	38.806
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	44.375	ENSACIG00000004745	-	93	43.373
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	42.675	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	89	42.675
ENSACIG00000002190	gfi1b	68	42.857	ENSACIG00000009780	-	93	42.857
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	43.590	ENSACIG00000000286	-	68	43.590
ENSACIG00000002190	gfi1b	77	45.000	ENSACIG00000022658	-	94	45.000
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	85.294	ENSACIG00000016354	gfi1ab	100	49.344
ENSACIG00000002190	gfi1b	53	46.774	ENSACIG00000010660	-	99	46.774
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	38.776	ENSACIG00000017892	-	78	38.776
ENSACIG00000002190	gfi1b	54	42.424	ENSACIG00000022330	-	89	42.424
ENSACIG00000002190	gfi1b	53	43.529	ENSACIG00000007034	-	71	43.529
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	46.358	ENSACIG00000000311	-	57	46.358
ENSACIG00000002190	gfi1b	56	40.164	ENSACIG00000006228	-	65	40.164
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	42.593	ENSACIG00000019804	-	85	42.593
ENSACIG00000002190	gfi1b	74	40.741	ENSACIG00000004641	-	77	40.741
ENSACIG00000002190	gfi1b	61	37.383	ENSACIG00000011318	snai1a	51	34.746
ENSACIG00000002190	gfi1b	55	44.000	ENSACIG00000006806	-	60	44.000
ENSACIG00000002190	gfi1b	57	36.800	ENSACIG00000002944	-	77	36.800
ENSACIG00000002190	gfi1b	59	42.105	ENSACIG00000007000	-	73	42.105

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	71.605	ENSAPOG00000001296	gfi1b	99	71.605	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	70.988	ENSAOCG00000021187	gfi1b	99	70.988	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	73.186	ENSAPEG00000016196	gfi1b	99	73.186	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	70.517	ENSATEG00000002534	gfi1b	99	70.517	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002190	gfi1b	74	74.222	ENSAPLG00000003373	GFI1B	67	74.222	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002190	gfi1b	100	76.292	ENSACLG00000027053	gfi1b	100	76.292	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002190	gfi1b	79	80.833	ENSAMXG00000037544	GFI1B	72	80.833	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002190	gfi1b	100	55.963	ENSCAPG00000010404	GFI1B	100	55.963	Cavia_aperea
ENSACIG00000002190	gfi1b	73	73.214	ENSCPBG00000021186	GFI1B	65	73.214	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	69.846	ENSCSEG00000001315	gfi1b	99	69.846	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	74.598	ENSCVAG00000017168	gfi1b	99	74.598	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002190	gfi1b	100	63.095	ENSDARG00000079947	gfi1b	98	82.553	Danio_rerio
ENSACIG00000002190	gfi1b	75	48.246	ENSEEUG00000012609	-	97	48.246	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002190	gfi1b	79	84.167	ENSELUG00000016933	gfi1b	71	84.167	Esox_lucius
ENSACIG00000002190	gfi1b	74	65.079	ENSFALG00000001479	GFI1B	69	65.079	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	71.341	ENSFHEG00000015138	gfi1b	99	71.341	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002190	gfi1b	79	81.590	ENSGMOG00000019123	gfi1b	89	81.590	Gadus_morhua
ENSACIG00000002190	gfi1b	74	72.889	ENSGALG00000003478	GFI1B	66	72.889	Gallus_gallus
ENSACIG00000002190	gfi1b	77	89.744	ENSGAFG00000003059	gfi1b	99	89.744	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	66.762	ENSGACG00000018134	gfi1b	99	66.762	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002190	gfi1b	73	73.661	ENSGAGG00000021327	GFI1B	67	73.661	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002190	gfi1b	100	76.292	ENSHBUG00000005451	gfi1b	100	76.292	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	68.438	ENSHCOG00000013713	gfi1b	99	68.652	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	65.257	ENSIPUG00000012769	gfi1b	99	65.257	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	50.954	ENSJJAG00000016355	Gfi1b	100	50.954	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	72.812	ENSKMAG00000016047	gfi1b	99	72.812	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	71.609	ENSLBEG00000020297	gfi1b	99	71.609	Labrus_bergylta
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ENSACIG00000002190	gfi1b	99	40.060	ENSTBEG00000014459	GFI1B	99	40.060	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	56.587	ENSXETG00000006263	gfi1b	67	75.000	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002190	gfi1b	99	72.561	ENSXMAG00000027589	gfi1b	99	72.561	Xiphophorus_maculatus