EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002240 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5181 bases
Position: chrCCOE01002491.1:528-5708
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002776	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002874	-	1596	-	ENSACIP00000002776	531 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002240	-	99	60.152	ENSACIG00000014973	-	99	60.152
ENSACIG00000002240	-	98	57.854	ENSACIG00000008246	-	94	57.854
ENSACIG00000002240	-	92	37.059	ENSACIG00000009923	-	81	37.059
ENSACIG00000002240	-	95	64.961	ENSACIG00000012148	-	94	65.157
ENSACIG00000002240	-	95	67.061	ENSACIG00000021449	-	94	67.061
ENSACIG00000002240	-	87	37.821	ENSACIG00000009814	-	85	37.821
ENSACIG00000002240	-	72	66.839	ENSACIG00000023712	-	96	66.839
ENSACIG00000002240	-	96	64.797	ENSACIG00000010569	-	95	64.797
ENSACIG00000002240	-	97	82.592	ENSACIG00000014982	-	98	82.592
ENSACIG00000002240	-	95	70.370	ENSACIG00000008256	-	95	70.370
ENSACIG00000002240	-	85	37.045	ENSACIG00000022228	-	78	37.045
ENSACIG00000002240	-	98	66.031	ENSACIG00000001022	-	98	66.031
ENSACIG00000002240	-	97	65.953	ENSACIG00000021889	-	93	65.953
ENSACIG00000002240	-	93	65.726	ENSACIG00000021882	-	93	65.594
ENSACIG00000002240	-	99	63.429	ENSACIG00000003888	-	99	63.429
ENSACIG00000002240	-	95	69.034	ENSACIG00000014961	-	92	69.034
ENSACIG00000002240	-	95	65.613	ENSACIG00000008585	-	99	65.613
ENSACIG00000002240	-	95	69.472	ENSACIG00000023726	-	96	69.472
ENSACIG00000002240	-	94	61.952	ENSACIG00000014898	-	95	61.464
ENSACIG00000002240	-	98	65.854	ENSACIG00000003168	-	99	65.854
ENSACIG00000002240	-	94	31.641	ENSACIG00000022269	-	86	32.164

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002240	-	84	36.285	ENSAPOG00000016636	-	91	36.501	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002240	-	98	60.728	ENSAPOG00000005749	-	96	60.728	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002240	-	97	62.984	ENSAPOG00000021040	-	86	62.984	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002240	-	98	61.420	ENSAPOG00000005726	-	96	61.420	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002240	-	97	61.776	ENSAPEG00000000062	-	97	61.776	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002240	-	96	56.250	ENSATEG00000017635	-	94	56.250	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002240	-	94	66.200	ENSATEG00000012558	-	93	66.200	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002240	-	94	67.000	ENSATEG00000023346	-	92	67.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002240	-	94	66.667	ENSATEG00000019965	-	93	66.667	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002240	-	93	56.301	ENSACLG00000018599	-	94	56.301	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	91	63.580	ENSACLG00000021761	-	90	63.580	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	92	34.608	ENSACLG00000023468	-	87	34.799	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	96	67.793	ENSACLG00000009261	-	98	67.793	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	67	38.338	ENSACLG00000023033	-	93	38.338	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	91	67.045	ENSACLG00000017259	-	93	67.045	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	91	59.627	ENSACLG00000006543	-	91	59.486	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	96	57.059	ENSACLG00000018271	-	94	56.947	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	94	69.745	ENSACLG00000006538	-	97	69.745	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	80	61.538	ENSACLG00000009330	-	82	61.538	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	72	63.446	ENSACLG00000015361	-	94	63.446	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	84	65.924	ENSACLG00000006285	-	98	65.924	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	93	62.903	ENSACLG00000010007	-	74	62.097	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	98	35.502	ENSACLG00000023126	-	99	35.502	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002240	-	91	41.922	ENSAMXG00000039672	-	94	42.331	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	93	42.308	ENSAMXG00000032695	-	95	42.308	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	95	42.026	ENSAMXG00000034407	-	95	42.293	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	88	46.392	ENSAMXG00000029346	-	91	47.047	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	95	31.157	ENSAMXG00000036353	-	92	31.716	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	90	43.299	ENSAMXG00000033407	-	93	43.416	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	95	42.717	ENSAMXG00000037920	-	98	42.717	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	93	32.054	ENSAMXG00000035937	-	91	32.054	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	95	38.654	ENSAMXG00000041770	-	94	38.462	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	95	54.884	ENSAMXG00000030535	-	95	54.884	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002240	-	98	58.541	ENSCVAG00000008146	-	97	58.541	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	92	33.068	ENSCVAG00000008633	-	92	33.267	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	94	53.984	ENSCVAG00000006308	-	91	53.984	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	97	35.436	ENSCVAG00000015205	-	95	35.436	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	92	33.730	ENSCVAG00000011261	-	92	33.598	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	96	56.164	ENSCVAG00000008127	-	96	56.055	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	96	62.475	ENSCVAG00000009446	-	98	62.475	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	87	65.443	ENSCVAG00000005819	-	99	65.443	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002240	-	97	60.886	ENSCVAG00000004690	-	96	60.886	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000002240	-	69	67.302	ENSCVAG00000014791	-	100	67.302	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000002240	-	63	61.424	ENSCVAG00000022676	-	99	61.424	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000002240	-	85	34.914	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	82	34.914	Eptatretus_burgeri
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ENSACIG00000002240	-	95	58.580	ENSFHEG00000006430	-	97	58.580	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	95	54.724	ENSFHEG00000012343	-	99	54.724	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	99	58.444	ENSFHEG00000006411	-	98	58.444	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	90	36.072	ENSFHEG00000021963	-	91	35.944	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	95	56.548	ENSFHEG00000016342	-	98	56.548	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	95	56.832	ENSFHEG00000023034	-	97	56.832	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	94	57.485	ENSFHEG00000006425	-	97	57.485	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	96	57.647	ENSFHEG00000006385	-	94	57.647	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	98	59.615	ENSFHEG00000006403	-	98	59.615	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	95	57.594	ENSFHEG00000006408	-	97	57.594	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002240	-	93	33.400	ENSGMOG00000011319	-	96	33.400	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	85	34.773	ENSGMOG00000008232	-	98	34.773	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	94	34.170	ENSGMOG00000019330	-	86	34.170	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	94	33.398	ENSGMOG00000017552	-	86	33.398	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	69	32.391	ENSGMOG00000019529	-	83	32.391	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	88	33.196	ENSGMOG00000019825	-	99	33.128	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	94	34.674	ENSGMOG00000005680	-	86	34.674	Gadus_morhua
ENSACIG00000002240	-	96	58.513	ENSGAFG00000005032	-	94	58.513	Gambusia_affinis
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