EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002242 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw3
Alias: zgc:92277
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6198 bases
Position: chrCCOE01000953.1:1008573-1014770
Accession: ZDB-GENE-040718-355
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002794	TYW3	PF02676.14	9.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002892	-	705	-	ENSACIP00000002794	234 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002242	tyw3	91	53.680	ENSG00000162623	TYW3	100	73.214	Homo_sapiens
ENSACIG00000002242	tyw3	97	67.816	ENSAPOG00000009462	tyw3	98	65.134	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002242	tyw3	93	55.128	ENSAMEG00000003461	TYW3	72	63.102	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002242	tyw3	97	67.050	ENSAOCG00000002161	tyw3	98	65.517	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002242	tyw3	86	53.617	ENSAPEG00000009395	tyw3	71	80.303	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002242	tyw3	97	76.395	ENSATEG00000004411	-	98	75.966	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	76.395	ENSATEG00000004518	tyw3	98	75.966	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002242	tyw3	77	58.854	ENSACAG00000011380	TYW3	72	59.375	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.032	ENSANAG00000034485	TYW3	72	62.032	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002242	tyw3	97	80.426	ENSACLG00000022833	tyw3	98	80.426	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002242	tyw3	80	70.588	ENSAMXG00000039965	tyw3	100	60.392	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.636	ENSBTAG00000005196	TYW3	72	63.636	Bos_taurus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	52.245	ENSCJAG00000006550	TYW3	72	62.567	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002242	tyw3	61	63.636	ENSCAFG00000032209	TYW3	67	63.636	Canis_familiaris
ENSACIG00000002242	tyw3	77	64.088	ENSCAFG00020017095	TYW3	66	62.903	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002242	tyw3	93	56.710	ENSCHIG00000009333	TYW3	72	65.241	Capra_hircus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	52.361	ENSTSYG00000006369	TYW3	68	64.497	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.636	ENSCCAG00000034210	TYW3	72	63.636	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.807	ENSCATG00000044397	TYW3	72	62.567	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.567	ENSCLAG00000004370	TYW3	69	62.567	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.807	ENSCSAG00000001387	TYW3	72	62.567	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002242	tyw3	93	51.055	ENSCPBG00000017047	TYW3	92	51.055	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.406	ENSCANG00000036108	TYW3	72	62.032	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	56.621	ENSCGRG00001022820	Tyw3	100	56.250	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002242	tyw3	66	56.688	ENSCGRG00000003132	Tyw3	95	56.098	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002242	tyw3	88	64.135	ENSCSEG00000021219	tyw3	93	63.320	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002242	tyw3	78	70.492	ENSCVAG00000003270	tyw3	99	58.167	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002242	tyw3	88	64.545	ENSDARG00000038222	tyw3	87	63.182	Danio_rerio
ENSACIG00000002242	tyw3	97	51.837	ENSDNOG00000033863	TYW3	73	61.497	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002242	tyw3	72	53.226	ENSETEG00000012572	TYW3	64	66.406	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002242	tyw3	54	54.762	ENSEBUG00000014020	tyw3	50	54.762	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSEASG00005007776	TYW3	72	63.102	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSECAG00000007888	TYW3	72	63.102	Equus_caballus
ENSACIG00000002242	tyw3	89	48.673	ENSEEUG00000009289	TYW3	72	53.476	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	61.382	ENSELUG00000023000	tyw3	98	60.976	Esox_lucius
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSFCAG00000035340	TYW3	73	63.102	Felis_catus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	57.798	ENSFDAG00000003816	TYW3	72	63.636	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002242	tyw3	78	74.863	ENSFHEG00000001347	tyw3	74	74.863	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002242	tyw3	98	45.627	ENSGALG00000032549	TYW3	98	45.247	Gallus_gallus
ENSACIG00000002242	tyw3	99	63.019	ENSGAFG00000012457	tyw3	99	63.019	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002242	tyw3	77	83.978	ENSGACG00000014630	tyw3	80	83.978	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002242	tyw3	91	53.680	ENSGGOG00000013676	TYW3	72	61.497	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002242	tyw3	92	57.339	ENSHGLG00000004440	TYW3	72	63.102	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002242	tyw3	92	54.128	ENSHGLG00100018315	TYW3	71	59.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002242	tyw3	77	71.823	ENSHCOG00000016590	TYW3	87	71.823	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002242	tyw3	84	69.458	ENSIPUG00000012907	tyw3	78	62.661	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	51.142	ENSSTOG00000028816	TYW3	78	50.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002242	tyw3	62	61.111	ENSJJAG00000005103	-	100	61.111	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	62.222	ENSKMAG00000020761	tyw3	99	63.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	75.424	ENSLBEG00000021318	tyw3	98	75.847	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002242	tyw3	99	56.746	ENSLACG00000012636	TYW3	73	69.519	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002242	tyw3	80	70.588	ENSLOCG00000003437	tyw3	74	70.588	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.567	ENSLAFG00000011373	TYW3	72	62.567	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.004	ENSMFAG00000003496	TYW3	72	61.497	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002242	tyw3	99	43.775	ENSMMUG00000014595	TYW3	58	66.935	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002242	tyw3	80	61.497	ENSMNEG00000028346	TYW3	72	61.497	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.807	ENSMLEG00000041647	TYW3	72	62.567	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	67.954	ENSMAMG00000010987	tyw3	98	67.954	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	70.498	ENSMZEG00005023808	tyw3	98	72.414	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002242	tyw3	93	53.879	ENSMICG00000015883	TYW3	70	62.567	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	71.667	ENSMMOG00000021442	tyw3	98	70.833	Mola_mola
ENSACIG00000002242	tyw3	95	54.008	ENSMODG00000019082	TYW3	67	62.567	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002242	tyw3	97	68.582	ENSMALG00000014442	tyw3	98	68.582	Monopterus_albus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	58.904	MGP_CAROLIEiJ_G0025755	Tyw3	100	60.417	Mus_caroli
ENSACIG00000002242	tyw3	92	58.447	ENSMUSG00000047583	Tyw3	100	60.417	Mus_musculus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	65.241	MGP_PahariEiJ_G0027206	Tyw3	100	61.111	Mus_pahari
ENSACIG00000002242	tyw3	92	58.447	MGP_SPRETEiJ_G0026708	Tyw3	100	59.722	Mus_spretus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	56.223	ENSMPUG00000010967	TYW3	72	63.102	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002242	tyw3	97	51.626	ENSMLUG00000005999	TYW3	95	50.407	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000002242	tyw3	62	59.310	ENSNGAG00000000586	-	100	59.310	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002242	tyw3	99	52.209	ENSNLEG00000009556	TYW3	72	63.102	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002242	tyw3	72	48.521	ENSOPRG00000014182	TYW3	66	48.521	Ochotona_princeps
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSODEG00000005361	TYW3	100	58.621	Octodon_degus
ENSACIG00000002242	tyw3	77	82.873	ENSONIG00000019965	tyw3	92	82.873	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002242	tyw3	68	56.522	ENSOANG00000002172	-	93	55.435	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.032	ENSOCUG00000003043	TYW3	73	62.032	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	58.400	ENSORLG00000004470	tyw3	97	58.400	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002242	tyw3	97	58.400	ENSORLG00020003793	tyw3	97	58.400	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002242	tyw3	97	57.600	ENSORLG00015006950	tyw3	97	57.600	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002242	tyw3	97	59.200	ENSOMEG00000016176	tyw3	96	63.158	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.032	ENSOGAG00000011590	-	72	62.032	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002242	tyw3	94	50.427	ENSOGAG00000025029	-	73	57.447	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002242	tyw3	80	64.706	ENSOARG00000012508	TYW3	72	64.706	Ovis_aries
ENSACIG00000002242	tyw3	91	53.247	ENSPPAG00000043438	TYW3	72	61.497	Pan_paniscus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSPPRG00000023209	TYW3	73	63.102	Panthera_pardus
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSPTIG00000017448	TYW3	73	63.102	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002242	tyw3	91	53.680	ENSPTRG00000000867	TYW3	72	62.032	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002242	tyw3	99	51.807	ENSPANG00000013397	TYW3	72	62.567	Papio_anubis
ENSACIG00000002242	tyw3	94	53.846	ENSPKIG00000009802	tyw3	94	53.846	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002242	tyw3	56	56.081	ENSPSIG00000008432	TYW3	85	54.730	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002242	tyw3	97	62.097	ENSPMGG00000005290	tyw3	97	61.290	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002242	tyw3	92	57.991	ENSPEMG00000013100	Tyw3	100	59.028	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000002242	tyw3	89	56.951	ENSPCIG00000024204	TYW3	62	62.567	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002242	tyw3	97	62.595	ENSPFOG00000000927	tyw3	98	62.595	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002242	tyw3	97	62.595	ENSPLAG00000009891	tyw3	98	62.595	Poecilia_latipinna
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ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.636	ENSPCAG00000000524	TYW3	72	63.636	Procavia_capensis
ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	ENSPCOG00000023207	TYW3	70	63.102	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000002242	tyw3	80	62.567	ENSPVAG00000002356	TYW3	75	62.567	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000002242	tyw3	93	82.796	ENSPNYG00000017982	tyw3	70	82.796	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002242	tyw3	99	60.163	ENSPNAG00000028431	tyw3	97	58.537	Pygocentrus_nattereri
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ENSACIG00000002242	tyw3	79	69.565	ENSTNIG00000003368	tyw3	92	70.166	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002242	tyw3	97	53.469	ENSTBEG00000017002	TYW3	95	52.653	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000002242	tyw3	92	56.109	ENSTTRG00000010464	TYW3	84	55.204	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000002242	tyw3	93	55.556	ENSUAMG00000010803	TYW3	74	63.636	Ursus_americanus
ENSACIG00000002242	tyw3	93	55.556	ENSUMAG00000006460	TYW3	73	63.636	Ursus_maritimus
ENSACIG00000002242	tyw3	79	64.324	ENSVPAG00000006900	TYW3	100	63.978	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002242	tyw3	79	63.978	ENSVVUG00000006902	TYW3	83	53.271	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002242	tyw3	80	66.845	ENSXETG00000002996	tyw3	99	54.000	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002242	tyw3	77	78.022	ENSXCOG00000000715	tyw3	98	57.422	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002242	tyw3	77	78.022	ENSXMAG00000006464	tyw3	98	56.870	Xiphophorus_maculatus