EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002263 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2785 bases
Position: chrCCOE01002499.1:2399-5183
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002816	MMR_HSR1	PF01926.23	3.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002914	-	834	-	ENSACIP00000002816	277 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002263	-	60	53.846	ENSACIG00000012204	-	73	53.846
ENSACIG00000002263	-	73	48.276	ENSACIG00000020225	-	81	47.479
ENSACIG00000002263	-	70	48.469	ENSACIG00000014634	zgc:113625	89	44.737
ENSACIG00000002263	-	76	42.723	ENSACIG00000016502	-	91	42.723
ENSACIG00000002263	-	74	40.306	ENSACIG00000005573	-	89	39.796
ENSACIG00000002263	-	75	51.675	ENSACIG00000000893	-	84	51.675
ENSACIG00000002263	-	72	46.766	ENSACIG00000014745	-	91	46.766
ENSACIG00000002263	-	81	74.107	ENSACIG00000023381	-	89	74.107
ENSACIG00000002263	-	78	44.843	ENSACIG00000014662	-	92	44.493
ENSACIG00000002263	-	90	68.273	ENSACIG00000022362	-	88	68.571
ENSACIG00000002263	-	88	68.313	ENSACIG00000022366	-	87	68.619
ENSACIG00000002263	-	72	49.239	ENSACIG00000007158	-	64	48.756
ENSACIG00000002263	-	86	46.988	ENSACIG00000016313	-	76	46.988
ENSACIG00000002263	-	63	32.768	ENSACIG00000007737	-	70	32.065
ENSACIG00000002263	-	82	62.719	ENSACIG00000008001	-	91	61.611
ENSACIG00000002263	-	83	43.621	ENSACIG00000012714	-	80	43.621
ENSACIG00000002263	-	75	53.023	ENSACIG00000012718	-	88	53.023
ENSACIG00000002263	-	73	46.569	ENSACIG00000014716	-	82	46.569
ENSACIG00000002263	-	81	52.402	ENSACIG00000002950	-	61	51.515
ENSACIG00000002263	-	85	49.160	ENSACIG00000005780	-	71	49.160
ENSACIG00000002263	-	63	67.429	ENSACIG00000008666	-	85	67.429
ENSACIG00000002263	-	87	65.560	ENSACIG00000004245	-	83	67.094
ENSACIG00000002263	-	79	43.612	ENSACIG00000012159	-	52	44.608
ENSACIG00000002263	-	84	65.574	ENSACIG00000007466	-	90	65.574
ENSACIG00000002263	-	87	69.295	ENSACIG00000003582	-	75	70.815
ENSACIG00000002263	-	69	36.548	ENSACIG00000009811	-	80	36.041
ENSACIG00000002263	-	77	57.277	ENSACIG00000001596	-	84	56.808
ENSACIG00000002263	-	77	43.519	ENSACIG00000014646	zgc:113625	84	43.519
ENSACIG00000002263	-	85	56.596	ENSACIG00000016888	-	78	56.118
ENSACIG00000002263	-	81	54.978	ENSACIG00000012648	-	78	54.978
ENSACIG00000002263	-	82	50.218	ENSACIG00000006484	-	69	50.218
ENSACIG00000002263	-	61	32.768	ENSACIG00000014730	zgc:172131	87	32.768
ENSACIG00000002263	-	63	36.612	ENSACIG00000014737	-	84	36.612
ENSACIG00000002263	-	67	38.220	ENSACIG00000014670	-	74	38.220
ENSACIG00000002263	-	83	67.965	ENSACIG00000007494	-	78	66.109
ENSACIG00000002263	-	89	68.421	ENSACIG00000022370	-	87	68.724
ENSACIG00000002263	-	59	50.000	ENSACIG00000022374	-	84	50.000
ENSACIG00000002263	-	86	66.527	ENSACIG00000022377	-	89	66.122
ENSACIG00000002263	-	73	36.493	ENSACIG00000003906	-	68	36.493
ENSACIG00000002263	-	82	46.522	ENSACIG00000014690	-	88	45.923
ENSACIG00000002263	-	67	47.849	ENSACIG00000015088	-	73	48.370
ENSACIG00000002263	-	88	66.667	ENSACIG00000001070	-	86	67.364
ENSACIG00000002263	-	82	50.216	ENSACIG00000019149	-	70	50.216
ENSACIG00000002263	-	68	36.224	ENSACIG00000007725	-	70	36.224
ENSACIG00000002263	-	71	54.146	ENSACIG00000012707	-	76	54.146
ENSACIG00000002263	-	73	46.305	ENSACIG00000014703	-	84	46.305
ENSACIG00000002263	-	82	53.648	ENSACIG00000016635	-	85	53.571
ENSACIG00000002263	-	74	49.515	ENSACIG00000019524	-	89	48.598
ENSACIG00000002263	-	74	46.602	ENSACIG00000020234	-	72	46.602
ENSACIG00000002263	-	81	40.598	ENSACIG00000005587	-	81	40.598
ENSACIG00000002263	-	87	57.438	ENSACIG00000008045	-	87	60.345
ENSACIG00000002263	-	71	42.788	ENSACIG00000012061	-	62	42.788
ENSACIG00000002263	-	77	48.372	ENSACIG00000014655	-	78	48.372
ENSACIG00000002263	-	63	43.503	ENSACIG00000000631	-	73	40.529
ENSACIG00000002263	-	79	48.649	ENSACIG00000007191	-	62	48.649
ENSACIG00000002263	-	81	54.545	ENSACIG00000022355	-	79	54.545
ENSACIG00000002263	-	74	51.208	ENSACIG00000020244	-	87	51.208
ENSACIG00000002263	-	83	67.391	ENSACIG00000006503	-	74	65.823
ENSACIG00000002263	-	58	54.321	ENSACIG00000012761	-	91	54.321
ENSACIG00000002263	-	84	48.319	ENSACIG00000022222	-	70	50.909
ENSACIG00000002263	-	65	36.264	ENSACIG00000003050	-	80	36.264
ENSACIG00000002263	-	69	34.197	ENSACIG00000019509	-	89	34.197
ENSACIG00000002263	-	84	77.155	ENSACIG00000001455	-	86	77.155
ENSACIG00000002263	-	78	45.622	ENSACIG00000014680	-	93	45.622
ENSACIG00000002263	-	74	52.657	ENSACIG00000006478	-	77	52.657
ENSACIG00000002263	-	68	33.654	ENSACIG00000009149	-	70	33.654
ENSACIG00000002263	-	77	52.358	ENSACIG00000004040	-	83	52.358
ENSACIG00000002263	-	58	51.250	ENSACIG00000000976	-	79	51.250
ENSACIG00000002263	-	65	53.261	ENSACIG00000005223	-	70	53.261
ENSACIG00000002263	-	73	47.087	ENSACIG00000007178	-	70	47.087

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002263	-	87	68.880	ENSAPOG00000021159	-	78	69.456	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	75	54.327	ENSAPOG00000006488	-	88	52.632	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	74	54.412	ENSAPOG00000011509	-	77	52.679	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	73	48.276	ENSAPOG00000007322	-	71	47.867	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	76	45.540	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	75	45.540	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	75	49.758	ENSAPOG00000020897	-	85	48.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	82	52.193	ENSAPOG00000006177	-	50	52.193	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	78	42.202	ENSAPOG00000001315	-	70	41.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	83	70.435	ENSAPOG00000012716	-	77	70.435	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	68	54.787	ENSAPOG00000001262	-	90	54.787	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	85	43.446	ENSAPOG00000001268	-	69	43.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	71	47.475	ENSAPOG00000022240	-	58	47.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	73	47.783	ENSAPOG00000007333	-	64	48.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	87	70.954	ENSAPOG00000008063	-	80	70.040	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	76	54.286	ENSAPOG00000006169	-	64	52.609	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	73	45.631	ENSAPOG00000014243	-	85	45.631	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	85	50.213	ENSAPOG00000014759	-	77	50.213	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002263	-	73	47.291	ENSAOCG00000011167	-	68	46.919	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	85	53.191	ENSAOCG00000008525	-	67	53.191	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	82	50.877	ENSAOCG00000008522	-	69	53.333	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	73	47.783	ENSAOCG00000011155	-	64	48.416	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	94	47.566	ENSAOCG00000021905	-	68	52.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	70	55.670	ENSAOCG00000001993	-	84	52.703	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	79	40.625	ENSAOCG00000011794	-	67	40.625	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	77	53.991	ENSAOCG00000023255	-	75	53.991	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	77	53.521	ENSAOCG00000023240	-	78	53.521	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	85	51.504	ENSAOCG00000014702	-	88	51.504	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	72	45.813	ENSAOCG00000012651	-	86	46.117	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002263	-	73	47.291	ENSAPEG00000012184	-	64	47.964	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	84	65.812	ENSAPEG00000022382	-	79	65.812	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	79	68.778	ENSAPEG00000022386	-	83	68.778	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	55	42.675	ENSAPEG00000003102	-	64	47.619	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	70	56.186	ENSAPEG00000016554	-	80	54.028	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	77	46.296	ENSAPEG00000012191	-	73	46.296	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	85	51.504	ENSAPEG00000016533	-	89	51.504	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	86	68.619	ENSAPEG00000022374	-	82	68.619	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	82	50.439	ENSAPEG00000004217	-	76	50.439	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	73	47.291	ENSAPEG00000012179	-	71	46.919	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	79	40.625	ENSAPEG00000000770	-	67	40.625	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	81	62.500	ENSAPEG00000003884	-	73	62.500	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	74	42.788	ENSAPEG00000013651	-	82	42.788	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	94	47.955	ENSAPEG00000015763	-	75	52.609	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002263	-	72	45.813	ENSATEG00000017202	-	60	43.612	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	79	43.243	ENSATEG00000005844	-	64	42.857	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	87	64.730	ENSATEG00000013008	-	82	65.272	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	74	45.631	ENSATEG00000020431	zgc:113625	81	45.631	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	83	50.781	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	87	48.918	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	83	62.553	ENSATEG00000014028	-	78	60.571	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	88	62.857	ENSATEG00000014085	-	83	62.857	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	82	54.825	ENSATEG00000019003	-	85	54.825	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	73	47.059	ENSATEG00000017193	-	66	46.725	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	73	46.798	ENSATEG00000017198	-	67	47.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	69	59.896	ENSATEG00000016536	-	58	59.896	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	74	45.854	ENSATEG00000020391	-	84	45.854	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002263	-	88	67.490	ENSACLG00000001976	-	84	68.201	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002263	-	83	48.560	ENSACLG00000008006	-	72	48.400	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002263	-	72	50.500	ENSACLG00000023525	-	69	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002263	-	69	45.641	ENSACLG00000003276	-	75	45.641	Astatotilapia_calliptera
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