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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002290 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1b
Alias: wu:fc91a05|zgc:66298
Full Name: RNA polymerase I subunit B
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5634 bases
Position: chrCCOE01000440.1:907751-913384
Accession: ZDB-GENE-040426-1598
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpa2_4	PF06883.12	5.2e-21	1	1
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpb2_1	PF04563.15	3.3e-38	1	1
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpb2_2	PF04561.14	1.2e-07	1	1
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpb2_3	PF04565.16	2.8e-28	1	1
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpb2_7	PF04560.20	1.9e-21	1	1
ENSACIP00000002888	RNA_pol_Rpb2_6	PF00562.28	2.3e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002986	-	3405	-	ENSACIP00000002888	1134 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.249	ENSG00000125630	POLR1B	99	83.696	Homo_sapiens
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.642	ENSG00000013503	POLR3B	96	30.642	Homo_sapiens
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.734	ENSAPOG00000018360	polr3b	98	30.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	91.446	ENSAPOG00000000931	polr1b	100	91.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSAMEG00000010826	POLR1B	99	77.072	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002290	polr1b	100	91.534	ENSAOCG00000004249	polr1b	100	91.534	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.166	ENSAPEG00000006829	polr3b	93	30.166	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002290	polr1b	100	91.623	ENSAPEG00000004971	polr1b	100	91.623	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002290	polr1b	98	30.126	ENSATEG00000021713	polr3b	99	30.126	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	91.887	ENSATEG00000010957	polr1b	100	91.887	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002290	polr1b	94	70.748	ENSAPLG00000004142	POLR1B	99	70.748	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002290	polr1b	61	79.016	ENSACAG00000007117	-	99	79.305	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002290	polr1b	51	69.983	ENSACAG00000005660	POLR1B	99	69.983	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.642	ENSANAG00000036735	POLR3B	96	30.642	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.476	ENSANAG00000026201	POLR1B	99	83.002	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002290	polr1b	100	94.268	ENSACLG00000019089	polr1b	100	94.268	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002290	polr1b	100	83.157	ENSAMXG00000037818	polr1b	100	83.157	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002290	polr1b	62	32.552	ENSBTAG00000019366	POLR2B	72	32.552	Bos_taurus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.543	ENSBTAG00000014166	POLR1B	99	76.543	Bos_taurus
ENSACIG00000002290	polr1b	97	46.133	WBGene00008781	rpoa-2	99	46.133	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.631	ENSCJAG00000016433	POLR1B	99	83.152	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSCAFG00000007174	POLR1B	99	77.160	Canis_familiaris
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSCAFG00020017367	POLR1B	99	77.160	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002290	polr1b	90	30.399	ENSCAFG00020005062	POLR3B	99	30.399	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSCHIG00000014527	POLR1B	99	77.072	Capra_hircus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.455	ENSTSYG00000003669	POLR1B	99	81.522	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002290	polr1b	90	84.085	ENSCAPG00000012821	POLR1B	85	84.085	Cavia_aperea
ENSACIG00000002290	polr1b	99	75.838	ENSCPOG00000015744	POLR1B	99	75.838	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.808	ENSCCAG00000035252	POLR1B	99	83.333	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002290	polr1b	57	39.313	ENSCATG00000035334	POLR3B	60	39.313	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSCATG00000037382	POLR1B	99	83.514	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.367	ENSCLAG00000004899	POLR1B	99	76.367	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSCSAG00000016783	POLR1B	99	77.160	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002290	polr1b	85	77.835	ENSCHOG00000007229	POLR1B	99	77.835	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.224	ENSCPBG00000003962	POLR1B	96	83.621	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.069	ENSCPBG00000023199	POLR3B	96	30.069	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002290	polr1b	99	53.339	ENSCING00000003329	-	99	53.251	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000002290	polr1b	73	33.425	ENSCSAVG00000007982	-	75	33.425	Ciona_savignyi
ENSACIG00000002290	polr1b	93	42.105	ENSCSAVG00000000129	-	86	42.105	Ciona_savignyi
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.896	ENSCANG00000039531	POLR1B	99	82.971	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSCGRG00001014254	Polr1b	99	77.160	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSCGRG00000017847	Polr1b	99	77.072	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.609	ENSCSEG00000005922	polr3b	91	30.609	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002290	polr1b	100	89.242	ENSCSEG00000008564	polr1b	100	89.242	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002290	polr1b	100	90.476	ENSCVAG00000005824	polr1b	100	90.476	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	82.187	ENSDARG00000077469	polr1b	100	82.187	Danio_rerio
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.696	ENSDNOG00000017718	POLR1B	97	76.528	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.543	ENSDORG00000014309	Polr1b	99	76.543	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002290	polr1b	97	46.063	FBgn0003278	RpI135	97	46.063	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000002290	polr1b	56	37.718	ENSETEG00000011734	POLR2B	56	37.718	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002290	polr1b	57	35.201	ENSETEG00000017715	POLR3B	62	35.201	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002290	polr1b	89	80.248	ENSETEG00000004001	POLR1B	89	80.248	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002290	polr1b	70	57.250	ENSEBUG00000015791	polr1b	99	58.250	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002290	polr1b	62	34.000	ENSEBUG00000010186	-	68	34.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002290	polr1b	90	43.443	ENSEASG00005021189	POLR3B	96	43.443	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSEASG00005006504	POLR1B	99	77.072	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSECAG00000010062	POLR1B	99	77.072	Equus_caballus
ENSACIG00000002290	polr1b	88	30.447	ENSECAG00000019086	POLR3B	92	30.447	Equus_caballus
ENSACIG00000002290	polr1b	76	88.356	ENSEEUG00000004559	-	80	88.356	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002290	polr1b	66	34.000	ENSEEUG00000009798	POLR2B	68	34.000	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.916	ENSELUG00000023988	polr3b	95	30.916	Esox_lucius
ENSACIG00000002290	polr1b	100	86.243	ENSELUG00000019627	polr1b	100	86.243	Esox_lucius
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.778	ENSFCAG00000008091	POLR1B	99	83.152	Felis_catus
ENSACIG00000002290	polr1b	89	71.316	ENSFALG00000000717	POLR1B	100	71.316	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.631	ENSFDAG00000020976	POLR1B	99	76.631	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002290	polr1b	86	88.413	ENSFHEG00000000533	polr1b	92	90.439	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002290	polr1b	77	40.994	ENSFHEG00000008215	polr3b	79	40.994	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.221	ENSGMOG00000004212	polr3b	96	30.221	Gadus_morhua
ENSACIG00000002290	polr1b	74	32.603	ENSGMOG00000016206	polr2b	76	32.603	Gadus_morhua
ENSACIG00000002290	polr1b	92	74.067	ENSGMOG00000005847	polr1b	100	74.067	Gadus_morhua
ENSACIG00000002290	polr1b	95	70.381	ENSGALG00000032273	POLR1B	96	70.381	Gallus_gallus
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.769	ENSGALG00000012655	POLR3B	93	30.769	Gallus_gallus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	87.743	ENSGAFG00000001383	polr1b	100	87.743	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.128	ENSGACG00000011794	polr3b	97	30.085	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	86.532	ENSGACG00000003012	polr1b	100	86.532	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002290	polr1b	95	79.554	ENSGAGG00000016312	POLR1B	99	80.201	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.000	ENSGAGG00000014364	POLR3B	96	30.000	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.105	ENSGGOG00000016608	POLR3B	96	30.105	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.072	ENSGGOG00000013494	POLR1B	99	83.514	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002290	polr1b	75	32.682	ENSGGOG00000034986	POLR2B	76	32.682	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002290	polr1b	100	94.268	ENSHBUG00000012650	polr1b	100	94.268	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.367	ENSHGLG00000011497	POLR1B	99	76.367	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002290	polr1b	99	75.838	ENSHGLG00100009371	POLR1B	99	75.838	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002290	polr1b	100	81.746	ENSHCOG00000000709	polr1b	100	81.746	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.128	ENSHCOG00000006817	polr3b	96	30.128	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002290	polr1b	100	83.598	ENSIPUG00000018216	polr1b	100	83.598	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.545	ENSIPUG00000016720	Polr3b	96	30.545	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002290	polr1b	95	77.654	ENSSTOG00000008160	POLR1B	99	77.654	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002290	polr1b	92	84.106	ENSJJAG00000000143	Polr1b	94	84.106	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	90.123	ENSKMAG00000016037	polr1b	100	90.123	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	84.215	ENSLBEG00000027396	polr1b	100	84.480	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002290	polr1b	100	78.943	ENSLACG00000009481	POLR1B	100	78.943	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002290	polr1b	100	81.674	ENSLOCG00000016558	polr1b	100	81.674	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002290	polr1b	62	32.640	ENSLAFG00000003198	POLR2B	79	32.640	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.411	ENSLAFG00000001633	POLR3B	91	30.411	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.341	ENSLAFG00000007659	POLR1B	99	82.640	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.102	ENSMFAG00000032912	POLR1B	99	83.333	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002290	polr1b	73	34.610	ENSMFAG00000038425	POLR3B	78	34.610	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.586	ENSMMUG00000005208	POLR3B	91	30.586	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.102	ENSMMUG00000009468	POLR1B	99	83.333	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.896	ENSMNEG00000036047	POLR1B	99	83.333	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002290	polr1b	99	72.928	ENSMLEG00000030588	POLR1B	99	83.514	Mandrillus_leucophaeus
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ENSACIG00000002290	polr1b	97	30.128	ENSMAMG00000006251	polr3b	96	30.128	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002290	polr1b	100	94.268	ENSMZEG00005011850	polr1b	100	94.268	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002290	polr1b	92	71.237	ENSMGAG00000007074	POLR1B	99	71.237	Meleagris_gallopavo
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ENSACIG00000002290	polr1b	99	77.160	ENSMICG00000013245	POLR1B	99	77.160	Microcebus_murinus
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ENSACIG00000002290	polr1b	99	76.896	ENSMOCG00000005942	Polr1b	99	76.896	Microtus_ochrogaster
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ENSACIG00000002290	polr1b	99	78.748	ENSMODG00000006573	POLR1B	99	78.748	Monodelphis_domestica
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ENSACIG00000002290	polr1b	92	83.559	ENSODEG00000005501	POLR1B	97	83.559	Octodon_degus
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ENSACIG00000002290	polr1b	100	86.332	ENSPMGG00000021622	polr1b	100	86.332	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000002290	polr1b	91	30.498	ENSXCOG00000020478	polr3b	94	30.498	Xiphophorus_couchianus
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