EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002472 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: apo2b
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1764 bases
Position: chrCCOE01000161.1:74574-76337
Accession: 605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003107	APOBEC_N	PF08210.11	5.4e-45	1	1
ENSACIP00000003099	APOBEC_N	PF08210.11	8.3e-45	1	1
ENSACIP00000003107	APOBEC_C	PF05240.14	5.4e-26	1	1
ENSACIP00000003099	APOBEC_C	PF05240.14	7.9e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003208	APOBEC2-201	915	-	ENSACIP00000003099	304 (aa)	-	-
ENSACIT00000003216	APOBEC2-202	717	-	ENSACIP00000003107	238 (aa)	-	-

Gene Model

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002472	APOBEC2	70	32.948	ENSACIG00000012301	aicda	88	32.948
ENSACIG00000002472	APOBEC2	72	58.960	ENSACIG00000016370	apobec2a	67	58.960

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSG00000124701	APOBEC2	85	60.209	Homo_sapiens
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	76.866	ENSAPOG00000019390	apobec2b	100	83.955	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	70	57.471	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	69	57.471	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	54.878	ENSAOCG00000003291	apobec2a	100	51.095	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	76.866	ENSAOCG00000023355	apobec2b	100	83.955	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	54.878	ENSAPEG00000003630	apobec2a	100	50.735	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	76.493	ENSAPEG00000004591	apobec2b	100	83.582	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	75.465	ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.528	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	50.988	ENSATEG00000000956	apobec2a	97	58.382	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	92	52.423	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	96	53.211	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002472	APOBEC2	81	51.000	ENSACAG00000016506	APOBEC2	98	54.054	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSANAG00000026993	APOBEC2	98	55.204	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	81.273	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	91.386	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002472	APOBEC2	71	59.412	ENSACLG00000026736	-	96	59.412	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002472	APOBEC2	91	59.375	ENSAMXG00000015966	apobec2b	100	56.940	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	87	55.760	ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	49.635	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	70	54.128	Bos_taurus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	55.656	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	85	58.639	Canis_familiaris
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	85	58.639	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	57.592	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	97	53.211	Capra_hircus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	97	54.505	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	84	58.115	Cavia_aperea
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	84	58.115	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	98	55.656	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSCATG00000010691	APOBEC2	96	55.204	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	84	58.639	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	98	56.109	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	70	59.195	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	97	59.195	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002472	APOBEC2	75	57.297	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	99	51.121	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSCANG00000035072	APOBEC2	98	56.109	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSCGRG00001014983	Apobec2	85	58.639	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSCGRG00000007835	Apobec2	85	58.639	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	51.984	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	50.996	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	79	73.404	ENSCSEG00000000690	-	100	62.963	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.060	ENSCVAG00000012342	apobec2b	100	78.731	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	57.312	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	56.972	Danio_rerio
ENSACIG00000002472	APOBEC2	94	61.842	ENSDARG00000113992	apobec2b	95	60.076	Danio_rerio
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	41.538	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	97	39.189	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSDORG00000006447	Apobec2	98	52.679	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSETEG00000000624	APOBEC2	83	58.639	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002472	APOBEC2	65	58.491	ENSEASG00005002937	APOBEC2	83	58.491	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSECAG00000006576	APOBEC2	85	59.162	Equus_caballus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	97	54.587	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	78	60.317	ENSELUG00000003736	apobec2a	73	58.654	Esox_lucius
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	97	53.670	Felis_catus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	76	50.532	ENSFALG00000003910	APOBEC2	99	46.429	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	97	53.425	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	79.498	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	79.079	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	72	60.920	ENSGMOG00000007028	apobec2a	99	60.920	Gadus_morhua
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	69.512	ENSGMOG00000006819	apobec2b	100	63.333	Gadus_morhua
ENSACIG00000002472	APOBEC2	89	52.273	ENSGALG00000003226	APOBEC2	100	51.556	Gallus_gallus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.436	ENSGAFG00000007634	apobec2b	91	78.571	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	80.242	ENSGACG00000009663	apobec2b	96	84.259	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	78	59.043	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	59.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	75	57.297	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	52.018	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	98	54.386	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002472	APOBEC2	99	56.504	ENSHBUG00000015890	apobec2a	89	58.636	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	79.478	ENSHBUG00000005993	apobec2b	100	89.552	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	57.592	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	84	57.592	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	57.592	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	84	57.592	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002472	APOBEC2	96	51.429	ENSHCOG00000020319	apobec2a	82	57.635	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	73.308	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	100	77.407	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	54.851	ENSIPUG00000013784	Apobec2	100	56.884	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	53.200	ENSIPUG00000017355	apobec2a	74	49.825	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	97	55.505	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSJJAG00000009733	Apobec2	99	54.018	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	99	70.566	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	75.655	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	89	82.511	ENSLBEG00000009422	-	100	75.714	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	53.878	ENSLBEG00000025214	apobec2a	100	52.049	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002472	APOBEC2	93	54.667	ENSLACG00000015985	APOBEC2	94	55.204	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002472	APOBEC2	82	61.194	ENSLOCG00000012415	apobec2b	99	54.513	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	99	55.804	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	98	56.109	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	98	56.109	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	98	56.109	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	98	56.109	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	98	54.098	ENSMAMG00000023685	apobec2a	99	48.727	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	73.162	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	100	80.147	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	90	58.182	ENSMZEG00005005240	-	94	58.182	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	81.716	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	100	90.299	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002472	APOBEC2	92	51.982	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	97	51.556	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSMAUG00000011016	Apobec2	85	59.162	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	86	55.000	ENSMICG00000043339	APOBEC2	98	55.000	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSMOCG00000001904	Apobec2	85	59.686	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.809	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	79.401	Mola_mola
ENSACIG00000002472	APOBEC2	76	56.842	ENSMODG00000013090	APOBEC2	86	56.842	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.436	ENSMALG00000013779	APOBEC2	100	79.259	Monopterus_albus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	52.823	ENSMALG00000020523	apobec2a	89	55.708	Monopterus_albus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	85	59.686	Mus_caroli
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSMUSG00000040694	Apobec2	85	59.686	Mus_musculus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	Mus_pahari
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	99	52.381	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	83	58.639	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	ENSNGAG00000013717	Apobec2	85	58.115	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002472	APOBEC2	86	58.654	ENSNBRG00000021776	apobec2a	89	57.727	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	87.541	ENSNBRG00000018806	apobec2b	100	87.541	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	55.656	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002472	APOBEC2	76	57.368	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	86	57.368	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	99	53.744	Ochotona_princeps
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSODEG00000016183	APOBEC2	83	58.639	Octodon_degus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	99	55.102	ENSONIG00000004644	-	89	58.636	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	81.716	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	91.791	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	66	58.025	ENSOANG00000000824	APOBEC2	99	54.444	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	98	54.709	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002472	APOBEC2	99	54.959	ENSORLG00000010752	apobec2a	97	54.783	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.060	ENSORLG00000022372	APOBEC2	100	79.104	Oryzias_latipes
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ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.639	ENSTBEG00000003553	APOBEC2	97	54.128	Tupaia_belangeri
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ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.162	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	99	53.982	Ursus_americanus
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ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	75.000	ENSXCOG00000007398	apobec2b	100	76.838	Xiphophorus_couchianus
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