EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002515 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cnot6l
Alias: zgc:111987
Full Name: CCR4-NOT transcription complex%2C subunit 6-like
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16207 bases
Position: chrCCOE01000528.1:1134598-1150804
Accession: ZDB-GENE-050522-302
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003161	Exo_endo_phos	PF03372.23	6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003269	-	1662	-	ENSACIP00000003161	553 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000002515's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000002515's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	75.360	ENSACIG00000016566	cnot6b	100	75.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSG00000138767	CNOT6L	100	92.405	Homo_sapiens
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	97.468	ENSAPOG00000005894	cnot6l	100	97.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSAMEG00000005570	CNOT6L	95	86.466	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	94.033	ENSAOCG00000006705	cnot6l	100	94.033	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	91.682	ENSAPEG00000020035	cnot6l	100	91.682	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.373	ENSATEG00000008774	cnot6l	100	98.373	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.750	ENSAPLG00000003448	CNOT6L	96	85.289	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002515	cnot6l	99	84.810	ENSACAG00000012099	CNOT6L	96	85.526	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSANAG00000023917	CNOT6L	95	86.654	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.011	ENSACLG00000000879	cnot6l	100	98.011	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	89.693	ENSAMXG00000008943	cnot6l	98	88.969	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSBTAG00000049571	CNOT6L	95	86.654	Bos_taurus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCJAG00000014846	CNOT6L	95	86.654	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCAFG00000008699	CNOT6L	95	86.654	Canis_familiaris
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.629	ENSCAFG00020011108	CNOT6L	96	86.226	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCHIG00000006297	CNOT6L	96	86.654	Capra_hircus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSTSYG00000009068	CNOT6L	96	86.654	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002515	cnot6l	86	89.474	ENSCPOG00000010337	CNOT6L	99	89.474	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCCAG00000025000	CNOT6L	95	86.654	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCATG00000029623	CNOT6L	95	86.654	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCLAG00000004598	CNOT6L	96	86.278	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCSAG00000004580	CNOT6L	95	86.654	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002515	cnot6l	74	75.342	ENSCHOG00000001108	-	55	88.000	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.324	ENSCPBG00000019403	CNOT6L	96	85.902	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSCANG00000028583	CNOT6L	95	86.654	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSCGRG00001022099	Cnot6l	96	85.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.063	ENSCGRG00000000543	Cnot6l	96	84.586	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002515	cnot6l	75	91.367	ENSCSEG00000010395	-	98	91.367	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	92.405	ENSCSEG00000014001	cnot6l	100	92.405	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002515	cnot6l	98	97.037	ENSCVAG00000021683	cnot6l	97	97.037	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	99	91.486	ENSDARG00000054597	cnot6l	98	90.580	Danio_rerio
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	76.744	ENSDNOG00000004229	CNOT6L	93	81.848	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	76.216	ENSDORG00000011458	Cnot6l	100	75.315	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	72.389	ENSEBUG00000004849	cnot6l	100	72.114	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002515	cnot6l	87	86.515	ENSEASG00005016429	CNOT6L	91	86.515	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002515	cnot6l	93	84.749	ENSECAG00000001582	CNOT6L	87	86.515	Equus_caballus
ENSACIG00000002515	cnot6l	99	92.572	ENSELUG00000013353	cnot6l	87	91.667	Esox_lucius
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSFCAG00000008322	CNOT6L	95	86.654	Felis_catus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.199	ENSFALG00000008515	CNOT6L	99	84.657	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSFDAG00000007719	CNOT6L	95	84.144	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	88.288	ENSFHEG00000012364	cnot6l	100	88.288	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002515	cnot6l	92	66.996	ENSGMOG00000011077	-	99	66.996	Gadus_morhua
ENSACIG00000002515	cnot6l	87	80.833	ENSGMOG00000000730	cnot6l	99	80.833	Gadus_morhua
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.296	ENSGALG00000010333	CNOT6L	87	85.876	Gallus_gallus
ENSACIG00000002515	cnot6l	97	94.579	ENSGAFG00000006105	cnot6l	98	94.717	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002515	cnot6l	88	84.490	ENSGAGG00000008605	CNOT6L	94	84.490	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSGGOG00000023412	CNOT6L	94	86.654	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.192	ENSHBUG00000004755	cnot6l	95	98.333	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.225	ENSHGLG00000006452	CNOT6L	96	86.466	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.225	ENSHGLG00100012384	CNOT6L	94	86.466	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	80.385	ENSHCOG00000009512	cnot6l	100	80.035	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	89.331	ENSIPUG00000009879	cnot6l	100	88.608	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSSTOG00000015293	CNOT6L	96	86.654	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.505	ENSJJAG00000020583	Cnot6l	96	86.090	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.298	ENSKMAG00000004165	cnot6l	100	95.298	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	92.405	ENSLBEG00000027202	cnot6l	100	91.863	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSLACG00000004684	CNOT6L	97	86.466	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	86.257	ENSLOCG00000007420	cnot6l	92	85.353	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSLAFG00000011449	CNOT6L	96	84.743	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSMFAG00000044296	CNOT6L	95	86.654	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSMMUG00000045609	CNOT6L	95	86.654	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSMNEG00000041259	CNOT6L	96	86.654	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSMLEG00000029198	CNOT6L	95	86.654	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002515	cnot6l	99	98.007	ENSMAMG00000016954	cnot6l	98	98.007	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.011	ENSMZEG00005020235	cnot6l	100	98.011	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.296	ENSMGAG00000005144	CNOT6L	95	85.876	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.685	ENSMICG00000017026	CNOT6L	99	84.144	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSMOCG00000009451	Cnot6l	96	85.338	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	97.107	ENSMMOG00000014621	cnot6l	100	97.107	Mola_mola
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.505	ENSMODG00000011744	CNOT6L	72	86.090	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	97.112	ENSMALG00000006354	cnot6l	100	97.112	Monopterus_albus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	MGP_CAROLIEiJ_G0027429	Cnot6l	99	85.550	Mus_caroli
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSMUSG00000034724	Cnot6l	99	85.550	Mus_musculus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	MGP_PahariEiJ_G0017207	Cnot6l	96	85.338	Mus_pahari
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	MGP_SPRETEiJ_G0028426	Cnot6l	96	85.338	Mus_spretus
ENSACIG00000002515	cnot6l	95	80.529	ENSMPUG00000003895	CNOT6L	96	82.016	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002515	cnot6l	93	84.586	ENSMLUG00000000936	CNOT6L	96	86.290	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.604	ENSNGAG00000019803	Cnot6l	96	85.150	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002515	cnot6l	90	96.988	ENSNBRG00000016345	cnot6l	81	96.988	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSNLEG00000028820	CNOT6L	95	86.654	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002515	cnot6l	80	71.076	ENSMEUG00000009767	-	77	70.203	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.225	ENSODEG00000004161	CNOT6L	95	86.466	Octodon_degus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	97.670	ENSONIG00000013992	cnot6l	97	97.670	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.685	ENSOANG00000003561	CNOT6L	100	84.144	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSOCUG00000002497	CNOT6L	95	86.654	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	91.320	ENSORLG00000018874	cnot6l	100	91.320	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	91.501	ENSOMEG00000010026	cnot6l	100	91.501	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	81.786	ENSOGAG00000012122	CNOT6L	96	81.750	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSOARG00000017771	CNOT6L	95	86.654	Ovis_aries
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	82.162	ENSPPAG00000030178	-	96	83.647	Pan_paniscus
ENSACIG00000002515	cnot6l	84	89.474	ENSPPAG00000034242	-	98	89.474	Pan_paniscus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPPRG00000008857	CNOT6L	95	86.654	Panthera_pardus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPTIG00000015698	CNOT6L	95	86.654	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002515	cnot6l	84	89.474	ENSPTRG00000045291	-	95	89.474	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPTRG00000016198	CNOT6L	95	86.654	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPANG00000007831	CNOT6L	95	86.654	Papio_anubis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	90.235	ENSPKIG00000002892	cnot6l	100	89.512	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.243	ENSPSIG00000016241	CNOT6L	95	84.962	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.895	ENSPMGG00000004021	cnot6l	97	87.736	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSPEMG00000011554	Cnot6l	96	85.338	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000002515	cnot6l	95	71.429	ENSPMAG00000005706	cnot6l	96	71.455	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSPCIG00000027504	-	100	83.243	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.841	ENSPFOG00000013163	cnot6l	100	95.841	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.479	ENSPLAG00000019862	cnot6l	100	95.479	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.660	ENSPMEG00000015834	cnot6l	100	95.660	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.118	ENSPREG00000003561	cnot6l	100	95.118	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPPYG00000014869	CNOT6L	96	86.654	Pongo_abelii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	55.135	ENSPCAG00000016617	CNOT6L	78	89.189	Procavia_capensis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSPCOG00000014669	CNOT6L	95	86.654	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000002515	cnot6l	83	86.486	ENSPVAG00000002690	CNOT6L	75	86.486	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000002515	cnot6l	91	95.626	ENSPNYG00000006717	cnot6l	92	95.626	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	89.512	ENSPNAG00000003537	cnot6l	98	88.788	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSRNOG00000002075	Cnot6l	96	85.338	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.685	ENSRBIG00000027644	CNOT6L	96	86.278	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSRROG00000031003	CNOT6L	96	86.466	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	85.045	ENSSBOG00000028521	CNOT6L	96	86.654	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.505	ENSSHAG00000006072	CNOT6L	95	86.090	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	89.693	ENSSFOG00015019044	cnot6l	100	89.150	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	93.309	ENSSMAG00000015568	cnot6l	100	93.309	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.011	ENSSDUG00000018426	cnot6l	100	98.011	Seriola_dumerili
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	97.830	ENSSLDG00000000335	cnot6l	100	97.830	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.505	ENSSPUG00000002016	CNOT6L	96	85.526	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	98.373	ENSSPAG00000022932	cnot6l	100	98.373	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSSSCG00000008989	CNOT6L	96	86.466	Sus_scrofa
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.838	ENSTGUG00000001737	-	99	84.296	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.479	ENSTRUG00000004332	cnot6l	100	95.479	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	94.033	ENSTNIG00000016717	cnot6l	100	94.033	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002515	cnot6l	87	81.120	ENSTBEG00000016519	CNOT6L	96	81.120	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000002515	cnot6l	87	86.100	ENSTTRG00000005606	CNOT6L	99	86.100	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSUAMG00000026982	CNOT6L	96	86.466	Ursus_americanus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	84.865	ENSUMAG00000007955	CNOT6L	95	86.466	Ursus_maritimus
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	81.081	ENSVPAG00000010892	CNOT6L	96	82.519	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	89.349	ENSVVUG00000024858	CNOT6L	96	89.349	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	83.784	ENSXETG00000000372	cnot6l	99	82.703	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002515	cnot6l	100	95.479	ENSXMAG00000002900	cnot6l	100	95.479	Xiphophorus_maculatus