EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002596 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 999 bases
Position: chrCCOE01000995.1:892658-893656
Accession: ZDB-GENE-081110-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003255	PTH2	PF01981.16	3.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003367	-	381	-	ENSACIP00000003255	126 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000002596's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000002596's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSG00000184924	PTRHD1	90	58.268	Homo_sapiens
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	95.238	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	95.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	54.331	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	90	54.331	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	95.238	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	95.238	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	95.238	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	95.238	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	93.651	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	93.651	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSANAG00000019089	PTRHD1	90	58.268	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	99.206	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	99.206	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	75.591	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	75.591	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	61.417	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	90	61.417	Bos_taurus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	90	50.442	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	46.774	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	90	56.693	Canis_familiaris
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	61.417	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	90	61.417	Capra_hircus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	90	57.480	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	57.480	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	90	58.268	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.730	ENSCATG00000033690	PTRHD1	90	58.730	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	87	58.268	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	90	58.268	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	48.413	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	91	48.413	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	90	57.480	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	58.261	ENSCING00000019647	-	97	58.261	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSCANG00000034444	PTRHD1	90	58.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	60	57.480	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	90	57.480	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	90.551	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	90.551	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	92.857	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	92.857	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	78.571	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	78.571	Danio_rerio
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	83	56.693	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	91	56.693	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	93	62.393	FBgn0038446	CG14903	98	62.393	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000002596	ptrhd1	96	47.107	ENSETEG00000009379	-	90	47.107	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002596	ptrhd1	53	54.412	ENSETEG00000001615	-	81	54.412	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	60.000	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002596	ptrhd1	99	43.651	ENSEASG00005001302	-	88	43.651	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	99	43.651	ENSECAG00000005314	-	86	43.651	Equus_caballus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSECAG00000017730	PTRHD1	90	58.268	Equus_caballus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.055	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	90	59.055	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	80.952	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	80.952	Esox_lucius
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.906	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	90	55.906	Felis_catus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.843	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	90	59.843	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	92.063	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	92.063	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	56.522	ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	54.839	Gallus_gallus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	90.476	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	90.476	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	99	92.000	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	92.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.843	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	59.843	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	57.480	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	98.413	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	98.413	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	61.417	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	90	61.417	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	60.630	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	90	60.630	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	60.630	ENSHGLG00100004341	-	92	60.630	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	92.913	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	92.913	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002596	ptrhd1	93	76.068	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	98	76.068	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	90	58.268	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	91	57.480	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	89	88.393	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	88.393	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	92.063	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	92.063	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	72.174	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	68.254	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	80.469	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	80.469	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	90	57.480	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	90	57.480	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	90	57.480	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	90	57.480	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.143	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	90	57.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	90.476	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	90.476	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	99.206	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	99.206	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	90	58.268	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.055	ENSMICG00000001578	PTRHD1	90	59.055	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	91.270	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	91.270	Mola_mola
ENSACIG00000002596	ptrhd1	95	55.372	ENSMODG00000015895	PTRHD1	89	55.372	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	91.270	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	91.270	Monopterus_albus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	90	56.693	Mus_caroli
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	Mus_musculus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	90	56.693	Mus_spretus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.906	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	90	55.906	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002596	ptrhd1	98	52.800	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	89	52.800	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.906	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	90	55.906	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	99.206	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	99.206	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	90	57.480	Ochotona_princeps
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	ENSODEG00000007805	PTRHD1	87	56.693	Octodon_degus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	98.413	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	98.413	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	90	57.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	82.051	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	82.051	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	82.051	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	82.051	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	82.051	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	82.051	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	79.528	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	79.528	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	54.331	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	90	54.331	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	61.417	ENSOARG00000018052	PTRHD1	90	61.417	Ovis_aries
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	90	58.268	Pan_paniscus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.906	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	90	55.906	Panthera_pardus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.906	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	90	55.906	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	90	58.268	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.055	ENSPANG00000006781	PTRHD1	90	59.055	Papio_anubis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	72.222	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	86	72.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	90.517	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	88.889	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	84	69.811	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	93	68.376	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	57.759	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	57.759	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	88.889	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	89	88.889	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	88.889	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	88.889	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	89.683	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	89.683	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	89.683	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	89.683	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	90	58.268	Pongo_abelii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	98	56.000	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	89	56.000	Procavia_capensis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	59.055	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	90	59.055	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	90	57.480	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	99.206	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	99.206	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	76.378	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	100	76.378	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	90	57.480	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	ENSRROG00000029627	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	90	57.480	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	56.897	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	56.897	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000002596	ptrhd1	96	73.554	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	92	92.241	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	88.976	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	94.444	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	94.444	Seriola_dumerili
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	94.444	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	94.444	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	59.483	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	58.268	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	96.825	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	96.825	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	97	48.361	ENSSSCG00000040441	-	92	48.361	Sus_scrofa
ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	57.759	ENSTGUG00000015169	-	85	57.759	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	84.921	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	84.921	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	87.302	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.118	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	90	55.118	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	55.118	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	90	55.118	Ursus_americanus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	91	57.480	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002596	ptrhd1	88	63.964	ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	90.476	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	90.476	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	90.476	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	90.476	Xiphophorus_maculatus