EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002739 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22462 bases
Position: chrCCOE01001280.1:1103759-1126220
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003462	KH_1	PF00013.29	9.1e-49	1	3
ENSACIP00000003462	KH_1	PF00013.29	9.1e-49	2	3
ENSACIP00000003462	KH_1	PF00013.29	9.1e-49	3	3
ENSACIP00000003462	KH_2	PF07650.17	1.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003577	-	978	-	ENSACIP00000003462	325 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000002739's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000002739's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002739	-	89	30.159	ENSACIG00000013204	igf2bp1	56	30.159
ENSACIG00000002739	-	97	70.064	ENSACIG00000016893	PCBP2	97	70.064
ENSACIG00000002739	-	71	52.055	ENSACIG00000014814	hnrpkl	58	52.055
ENSACIG00000002739	-	73	50.685	ENSACIG00000005320	hnrnpk	51	50.685
ENSACIG00000002739	-	99	67.544	ENSACIG00000002577	zgc:110045	95	73.585
ENSACIG00000002739	-	62	43.333	ENSACIG00000009298	khsrp	56	44.643
ENSACIG00000002739	-	84	61.433	ENSACIG00000015264	pcbp4	62	61.433
ENSACIG00000002739	-	88	61.716	ENSACIG00000020434	-	73	61.716
ENSACIG00000002739	-	99	88.529	ENSACIG00000010933	pcbp3	98	88.529
ENSACIG00000002739	-	88	38.356	ENSACIG00000005212	-	62	38.356
ENSACIG00000002739	-	97	73.016	ENSACIG00000000035	pcbp2	97	73.016

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002739	-	100	98.466	ENSAPOG00000016582	-	100	98.466	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002739	-	99	91.925	ENSAPOG00000020003	pcbp3	89	91.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002739	-	98	87.353	ENSAMEG00000001697	-	99	85.057	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002739	-	97	92.744	ENSAOCG00000008592	-	98	92.744	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002739	-	89	92.667	ENSAOCG00000007806	-	100	92.667	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002739	-	100	96.319	ENSAPEG00000005209	-	100	96.319	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002739	-	97	88.690	ENSAPEG00000008011	pcbp3	95	88.690	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002739	-	100	96.923	ENSATEG00000009833	-	100	96.923	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002739	-	97	90.303	ENSATEG00000015787	-	100	90.303	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002739	-	95	76.136	ENSAPLG00000008951	-	79	76.136	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002739	-	98	88.657	ENSAPLG00000002975	-	98	88.657	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002739	-	99	82.111	ENSACAG00000009819	-	99	82.111	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002739	-	98	84.594	ENSACAG00000004607	-	99	84.594	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002739	-	75	93.878	ENSANAG00000030702	-	100	93.878	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002739	-	99	86.957	ENSACLG00000011835	pcbp3	98	86.957	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002739	-	100	96.000	ENSACLG00000003801	-	100	96.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002739	-	97	91.401	ENSAMXG00000013588	-	100	91.401	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002739	-	97	90.419	ENSAMXG00000003440	pcbp3	95	90.419	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002739	-	95	68.468	ENSAMXG00000001760	zgc:110045	72	68.468	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002739	-	90	90.678	ENSCAFG00020019472	-	81	90.678	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002739	-	98	92.835	ENSCSAG00000007440	-	89	92.835	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002739	-	96	81.873	ENSCPBG00000000733	-	73	81.873	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002739	-	95	92.926	ENSCPBG00000012151	-	99	87.390	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002739	-	100	78.063	ENSCSEG00000016984	-	100	78.063	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002739	-	97	92.038	ENSCSEG00000000822	pcbp3	99	92.038	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002739	-	100	95.092	ENSCVAG00000005262	-	100	95.092	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002739	-	97	88.393	ENSCVAG00000014482	pcbp3	95	88.393	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002739	-	100	91.279	ENSDARG00000054378	pcbp3	100	91.279	Danio_rerio
ENSACIG00000002739	-	98	81.620	ENSETEG00000015988	-	98	81.620	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002739	-	88	72.125	ENSEBUG00000016192	pcbp3	99	72.464	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002739	-	98	77.469	ENSEBUG00000007485	-	92	76.549	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002739	-	92	65.748	ENSEBUG00000005495	pcbp3	74	65.748	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002739	-	97	88.724	ENSELUG00000003521	pcbp3	98	87.578	Esox_lucius
ENSACIG00000002739	-	97	93.396	ENSELUG00000001560	-	99	85.552	Esox_lucius
ENSACIG00000002739	-	98	91.900	ENSFALG00000003949	-	98	91.900	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002739	-	95	76.420	ENSFALG00000004411	-	74	76.420	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002739	-	98	93.060	ENSFHEG00000016615	pcbp3	96	93.060	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002739	-	100	95.399	ENSFHEG00000006539	-	100	95.399	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002739	-	96	68.843	ENSGMOG00000008611	-	100	68.843	Gadus_morhua
ENSACIG00000002739	-	97	76.901	ENSGMOG00000011992	pcbp3	97	76.901	Gadus_morhua
ENSACIG00000002739	-	98	85.070	ENSGALG00000004394	-	99	85.070	Gallus_gallus
ENSACIG00000002739	-	97	81.873	ENSGALG00000013155	-	99	81.873	Gallus_gallus
ENSACIG00000002739	-	97	94.025	ENSGAFG00000010274	-	95	94.025	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002739	-	100	86.804	ENSGAFG00000011430	pcbp3	99	86.804	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002739	-	100	87.966	ENSGACG00000002266	-	100	87.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002739	-	100	77.747	ENSGACG00000014955	-	100	77.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002739	-	84	86.861	ENSGAGG00000000271	-	100	86.861	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002739	-	82	83.495	ENSGAGG00000006956	-	95	77.056	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002739	-	100	96.000	ENSHBUG00000021782	-	100	96.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002739	-	97	92.744	ENSHBUG00000010697	pcbp3	98	92.744	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002739	-	100	89.329	ENSHCOG00000006067	-	100	89.329	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002739	-	97	88.657	ENSHCOG00000017868	pcbp3	95	88.657	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002739	-	100	94.462	ENSIPUG00000006238	pcbp3	100	94.462	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002739	-	97	88.690	ENSKMAG00000003046	pcbp3	95	88.690	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002739	-	100	92.638	ENSKMAG00000018530	-	100	92.638	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002739	-	99	92.547	ENSLBEG00000006201	pcbp3	98	92.547	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002739	-	100	84.308	ENSLBEG00000006542	-	100	84.098	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002739	-	96	75.921	ENSLACG00000010804	zgc:110045	74	75.921	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002739	-	95	82.571	ENSLACG00000010386	pcbp3	74	82.571	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002739	-	98	90.208	ENSLOCG00000009369	pcbp3	99	90.208	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002739	-	95	81.651	ENSLOCG00000005058	zgc:110045	80	81.651	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002739	-	97	93.312	ENSMAMG00000022336	pcbp3	93	93.312	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002739	-	100	95.692	ENSMAMG00000011620	-	100	95.692	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002739	-	99	88.047	ENSMZEG00005008993	pcbp3	98	88.922	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002739	-	97	90.909	ENSMZEG00005014882	-	100	86.744	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002739	-	94	79.130	ENSMGAG00000001883	-	95	79.130	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002739	-	95	76.420	ENSMGAG00000006794	-	74	76.420	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002739	-	97	90.596	ENSMMOG00000000730	pcbp3	88	90.596	Mola_mola
ENSACIG00000002739	-	100	95.077	ENSMMOG00000005216	-	100	95.077	Mola_mola
ENSACIG00000002739	-	72	79.439	ENSMODG00000027884	-	93	79.439	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002739	-	96	90.000	ENSMALG00000000691	pcbp3	95	90.000	Monopterus_albus
ENSACIG00000002739	-	98	84.911	ENSMPUG00000001779	-	90	84.911	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002739	-	99	87.941	ENSNBRG00000016409	-	98	87.941	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002739	-	97	90.909	ENSNBRG00000016714	-	99	89.939	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002739	-	95	84.104	ENSOPRG00000003431	-	99	84.104	Ochotona_princeps
ENSACIG00000002739	-	97	83.853	ENSONIG00000012122	-	98	83.853	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002739	-	100	95.122	ENSONIG00000004611	-	100	95.122	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002739	-	98	91.900	ENSOCUG00000002696	-	89	91.900	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002739	-	97	92.744	ENSORLG00000000059	pcbp3	100	92.744	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002739	-	100	94.512	ENSORLG00000022739	-	100	94.512	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002739	-	100	95.077	ENSORLG00020006124	-	100	95.077	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002739	-	99	91.411	ENSORLG00020012671	pcbp3	99	91.411	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002739	-	99	91.411	ENSORLG00015000429	pcbp3	99	91.411	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002739	-	99	92.661	ENSORLG00015008051	-	98	92.661	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002739	-	100	94.769	ENSOMEG00000020162	-	100	94.769	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002739	-	91	92.881	ENSOMEG00000020811	pcbp3	99	92.881	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002739	-	98	81.944	ENSOGAG00000008044	-	99	81.944	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002739	-	78	83.246	ENSPKIG00000020913	-	83	83.246	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002739	-	100	94.462	ENSPKIG00000019329	pcbp3	100	94.462	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002739	-	98	79.586	ENSPSIG00000014970	-	98	80.178	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002739	-	71	82.114	ENSPSIG00000008350	-	68	82.114	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002739	-	96	89.157	ENSPMGG00000022383	pcbp3	95	89.157	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002739	-	98	70.154	ENSPMAG00000004551	pcbp3	91	70.154	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000002739	-	76	84.043	ENSPMAG00000004637	-	97	84.043	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000002739	-	98	89.318	ENSPCIG00000028092	-	99	89.318	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002739	-	99	91.317	ENSPLAG00000004074	-	92	91.317	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002739	-	100	81.894	ENSPLAG00000011449	pcbp3	91	81.894	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002739	-	99	92.059	ENSPMEG00000006653	-	99	92.059	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002739	-	100	85.714	ENSPMEG00000021239	pcbp3	95	88.690	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002739	-	100	95.077	ENSPREG00000020585	-	100	95.077	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002739	-	97	91.720	ENSPREG00000015736	pcbp3	99	91.720	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002739	-	97	93.060	ENSPNYG00000012326	pcbp3	95	93.060	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002739	-	100	96.000	ENSPNYG00000013205	-	100	96.000	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002739	-	96	91.987	ENSPNAG00000008541	-	98	91.987	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002739	-	100	94.207	ENSPNAG00000015104	pcbp3	100	94.207	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002739	-	98	92.523	ENSRNOG00000001245	Pcbp3	98	92.523	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000002739	-	98	83.784	ENSRBIG00000028177	-	99	76.423	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000002739	-	98	86.804	ENSSHAG00000007890	-	99	86.804	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000002739	-	97	88.323	ENSSFOG00015014706	pcbp3	95	88.323	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002739	-	97	93.711	ENSSFOG00015010205	pcbp3	100	90.991	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002739	-	98	81.818	ENSSFOG00015007118	-	95	81.818	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002739	-	100	96.000	ENSSMAG00000003135	-	100	96.000	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002739	-	97	93.631	ENSSMAG00000011929	pcbp3	97	93.631	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002739	-	97	93.987	ENSSDUG00000008502	-	95	93.987	Seriola_dumerili
ENSACIG00000002739	-	97	89.458	ENSSDUG00000011608	pcbp3	99	89.458	Seriola_dumerili
ENSACIG00000002739	-	97	94.654	ENSSLDG00000020161	-	95	94.654	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002739	-	97	89.458	ENSSLDG00000008518	pcbp3	99	89.458	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002739	-	95	77.681	ENSSPUG00000013214	-	92	82.131	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000002739	-	89	93.000	ENSSPAG00000004190	-	100	93.000	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002739	-	97	79.154	ENSSPAG00000023341	-	95	79.154	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002739	-	98	85.358	ENSTGUG00000008158	-	99	85.358	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000002739	-	98	83.768	ENSTGUG00000003316	-	99	83.768	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000002739	-	97	92.570	ENSTRUG00000013604	pcbp3	95	92.570	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000002739	-	99	90.062	ENSTRUG00000006280	-	99	90.062	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000002739	-	98	82.913	ENSTTRG00000015075	-	99	83.473	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000002739	-	98	85.337	ENSXETG00000011483	pcbp1	99	85.337	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002739	-	90	75.444	ENSXETG00000010491	pcbp2	74	75.444	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002739	-	96	88.690	ENSXCOG00000020481	pcbp3	95	88.690	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002739	-	97	88.690	ENSXMAG00000008175	pcbp3	95	88.690	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000002739	-	100	92.941	ENSXMAG00000028711	-	100	92.941	Xiphophorus_maculatus