EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002878 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl23a
Alias: wu:fa93f05|wu:fj20e05|zgc:110139
Full Name: ribosomal protein L23a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4636 bases
Position: chrCCOE01001657.1:118854-123489
Accession: ZDB-GENE-030131-7479
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003732	Ribosomal_L23	PF00276.20	8.5e-16	1	1
ENSACIP00000003699	Ribosomal_L23	PF00276.20	1.2e-15	1	1
ENSACIP00000003732	Ribosomal_L23eN	PF03939.13	2.1e-27	1	1
ENSACIP00000003699	Ribosomal_L23eN	PF03939.13	7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003820	-	588	-	ENSACIP00000003699	195 (aa)	-	-
ENSACIT00000003854	-	504	-	ENSACIP00000003732	167 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	97.656	ENSG00000198242	RPL23A	99	94.203	Homo_sapiens
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	96.753	ENSAPOG00000008770	rpl23a	91	96.753	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	72.868	ENSAMEG00000011777	-	99	69.677	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	67.188	ENSAMEG00000009758	-	99	68.182	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	64.800	ENSAMEG00000010669	-	93	66.207	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	56	72.043	ENSAMEG00000017534	-	99	64.286	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	56	76.596	ENSAMEG00000018533	-	89	76.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	77.922	ENSAMEG00000019431	-	99	77.922	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	96.094	ENSAMEG00000004684	RPL23A	99	92.903	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	62.821	ENSAMEG00000013394	-	99	62.821	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	96.753	ENSAOCG00000007918	rpl23a	91	96.753	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	96.753	ENSAPEG00000023469	rpl23a	99	96.753	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	96.104	ENSATEG00000021517	rpl23a	99	96.104	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002878	rpl23a	87	93.878	ENSAPLG00000000604	RPL23A	96	91.946	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	96.753	ENSACAG00000005311	RPL23A	99	96.753	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002878	rpl23a	60	76.923	ENSANAG00000025336	-	100	76.336	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	90.400	ENSANAG00000019559	-	99	88.387	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	93.600	ENSANAG00000029957	-	98	90.728	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	96.000	ENSANAG00000035778	-	99	92.903	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	88.387	ENSANAG00000022026	-	95	88.387	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	87.218	ENSANAG00000011108	-	99	85.890	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	94.156	ENSAMXG00000041598	rpl23a	99	94.156	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	89.600	ENSBTAG00000032775	-	99	87.742	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	95.312	ENSBTAG00000032432	-	98	91.613	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	92.800	ENSBTAG00000022498	-	98	90.323	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	96.000	ENSBTAG00000022278	-	98	92.903	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	54.839	ENSBTAG00000011830	-	99	50.323	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	96.094	ENSBTAG00000046394	-	97	94.444	Bos_taurus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	95.200	ENSCJAG00000042604	-	99	92.258	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	91.200	ENSCJAG00000039429	-	99	89.032	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	96.094	ENSCJAG00000013126	-	99	92.903	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	93.750	ENSCJAG00000042808	-	99	91.613	Callithrix_jacchus
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ENSACIG00000002878	rpl23a	77	93.750	ENSCJAG00000046769	-	99	90.789	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	95.200	ENSCJAG00000047682	-	99	92.258	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002878	rpl23a	77	78.295	ENSCAFG00000017449	-	94	77.241	Canis_familiaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	92	78.065	ENSCAFG00000030051	-	99	78.846	Canis_familiaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	66	64.957	ENSCAFG00000007718	-	100	66.667	Canis_familiaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	75	95.200	ENSCAFG00000015394	-	99	92.258	Canis_familiaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	72	86.667	ENSCAFG00000000014	-	99	77.070	Canis_familiaris
ENSACIG00000002878	rpl23a	89	57.718	ENSCAFG00000003985	-	97	57.718	Canis_familiaris
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