EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002944 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7592 bases
Position: chrCCOE01001412.1:647504-655095
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003712	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-25	1	4
ENSACIP00000003712	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-25	2	4
ENSACIP00000003712	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-25	3	4
ENSACIP00000003712	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-25	4	4
ENSACIP00000003712	zf-met	PF12874.7	2.6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003834	-	903	-	ENSACIP00000003712	300 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002944	-	82	33.803	ENSACIG00000001369	-	81	35.115
ENSACIG00000002944	-	93	32.168	ENSACIG00000022738	-	97	32.168
ENSACIG00000002944	-	79	35.433	ENSACIG00000002180	-	100	35.433
ENSACIG00000002944	-	86	35.417	ENSACIG00000019815	-	90	35.417
ENSACIG00000002944	-	78	34.286	ENSACIG00000018022	-	52	34.286
ENSACIG00000002944	-	84	32.961	ENSACIG00000006755	-	85	33.600
ENSACIG00000002944	-	87	36.000	ENSACIG00000016944	-	71	36.000
ENSACIG00000002944	-	51	41.558	ENSACIG00000017166	-	67	42.466
ENSACIG00000002944	-	84	33.333	ENSACIG00000018404	-	85	33.333
ENSACIG00000002944	-	89	35.433	ENSACIG00000022293	-	96	35.433
ENSACIG00000002944	-	77	34.862	ENSACIG00000007464	-	62	34.862
ENSACIG00000002944	-	83	32.911	ENSACIG00000023049	znf646	85	32.911
ENSACIG00000002944	-	82	33.673	ENSACIG00000019534	-	78	33.673
ENSACIG00000002944	-	91	36.986	ENSACIG00000000406	prdm5	79	36.986
ENSACIG00000002944	-	93	39.024	ENSACIG00000004666	-	99	31.381
ENSACIG00000002944	-	77	37.069	ENSACIG00000008886	znf1164	94	37.069
ENSACIG00000002944	-	87	39.344	ENSACIG00000017013	-	54	39.344
ENSACIG00000002944	-	91	36.885	ENSACIG00000009780	-	81	36.885
ENSACIG00000002944	-	97	38.182	ENSACIG00000010647	-	98	38.182
ENSACIG00000002944	-	50	35.135	ENSACIG00000018641	snai2	68	35.135
ENSACIG00000002944	-	85	32.484	ENSACIG00000003556	-	72	32.484
ENSACIG00000002944	-	80	36.641	ENSACIG00000011153	-	84	37.097
ENSACIG00000002944	-	90	36.641	ENSACIG00000022658	-	88	36.641
ENSACIG00000002944	-	89	35.000	ENSACIG00000006806	-	67	35.000
ENSACIG00000002944	-	98	31.944	ENSACIG00000013163	-	88	30.769
ENSACIG00000002944	-	76	35.484	ENSACIG00000007096	-	70	35.484
ENSACIG00000002944	-	86	33.557	ENSACIG00000010966	-	54	33.557
ENSACIG00000002944	-	94	34.959	ENSACIG00000013750	-	84	34.959
ENSACIG00000002944	-	79	34.167	ENSACIG00000016133	-	74	34.167
ENSACIG00000002944	-	94	35.714	ENSACIG00000023212	-	82	35.714
ENSACIG00000002944	-	92	36.220	ENSACIG00000015429	-	86	38.060
ENSACIG00000002944	-	89	30.714	ENSACIG00000020982	znf710b	53	31.646
ENSACIG00000002944	-	52	32.653	ENSACIG00000004641	-	65	32.653
ENSACIG00000002944	-	77	36.800	ENSACIG00000002190	gfi1b	57	36.800
ENSACIG00000002944	-	93	36.364	ENSACIG00000021986	-	94	37.795
ENSACIG00000002944	-	69	36.607	ENSACIG00000019804	-	85	36.607
ENSACIG00000002944	-	78	36.000	ENSACIG00000003720	-	61	36.000
ENSACIG00000002944	-	85	37.815	ENSACIG00000012084	-	88	37.815
ENSACIG00000002944	-	86	38.017	ENSACIG00000023794	-	83	38.017
ENSACIG00000002944	-	85	40.678	ENSACIG00000023162	-	51	37.795
ENSACIG00000002944	-	92	30.488	ENSACIG00000009755	-	83	30.065
ENSACIG00000002944	-	85	34.545	ENSACIG00000018440	-	96	34.545
ENSACIG00000002944	-	92	36.000	ENSACIG00000013149	-	78	36.000
ENSACIG00000002944	-	88	43.529	ENSACIG00000014282	znf526	65	31.538
ENSACIG00000002944	-	78	32.919	ENSACIG00000000311	-	68	32.919
ENSACIG00000002944	-	93	37.008	ENSACIG00000016117	-	92	37.008
ENSACIG00000002944	-	85	34.667	ENSACIG00000022645	-	50	34.667
ENSACIG00000002944	-	93	38.281	ENSACIG00000017050	-	95	38.144
ENSACIG00000002944	-	91	31.395	ENSACIG00000004626	-	88	31.395
ENSACIG00000002944	-	89	35.644	ENSACIG00000015411	-	81	33.333
ENSACIG00000002944	-	93	32.450	ENSACIG00000004745	-	89	32.450
ENSACIG00000002944	-	91	37.600	ENSACIG00000004041	-	96	37.903
ENSACIG00000002944	-	60	40.000	ENSACIG00000012604	scrt2	58	40.000
ENSACIG00000002944	-	89	33.884	ENSACIG00000003515	-	90	39.450
ENSACIG00000002944	-	84	31.707	ENSACIG00000019447	-	56	35.246
ENSACIG00000002944	-	95	36.364	ENSACIG00000017647	-	89	32.576
ENSACIG00000002944	-	83	33.010	ENSACIG00000017644	-	83	33.010
ENSACIG00000002944	-	52	38.095	ENSACIG00000013946	-	62	38.095
ENSACIG00000002944	-	90	37.956	ENSACIG00000009717	-	75	36.885
ENSACIG00000002944	-	63	36.145	ENSACIG00000007034	-	69	36.145
ENSACIG00000002944	-	86	33.654	ENSACIG00000015835	-	68	40.789
ENSACIG00000002944	-	94	36.170	ENSACIG00000008448	-	69	36.170
ENSACIG00000002944	-	97	33.775	ENSACIG00000019791	-	93	33.775
ENSACIG00000002944	-	89	35.433	ENSACIG00000003754	-	92	35.433
ENSACIG00000002944	-	89	34.416	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	95	33.962
ENSACIG00000002944	-	89	33.951	ENSACIG00000022625	-	80	40.000
ENSACIG00000002944	-	91	30.620	ENSACIG00000013604	-	95	30.620
ENSACIG00000002944	-	82	31.538	ENSACIG00000007855	-	89	40.299
ENSACIG00000002944	-	92	36.364	ENSACIG00000024444	-	74	34.884
ENSACIG00000002944	-	92	31.780	ENSACIG00000019710	-	76	31.780
ENSACIG00000002944	-	88	32.911	ENSACIG00000000286	-	76	32.911
ENSACIG00000002944	-	75	36.885	ENSACIG00000007882	-	86	36.885
ENSACIG00000002944	-	86	30.672	ENSACIG00000013470	-	55	30.672
ENSACIG00000002944	-	89	37.931	ENSACIG00000014123	znf236	68	37.931
ENSACIG00000002944	-	77	32.558	ENSACIG00000011516	-	60	32.558
ENSACIG00000002944	-	93	30.488	ENSACIG00000016182	-	89	31.461
ENSACIG00000002944	-	89	34.646	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	36.441
ENSACIG00000002944	-	89	38.281	ENSACIG00000006172	-	91	31.818
ENSACIG00000002944	-	92	32.530	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	62	32.530
ENSACIG00000002944	-	78	34.532	ENSACIG00000017683	-	77	34.532

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002944	-	93	30.126	ENSAPOG00000019138	-	56	30.126	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002944	-	87	31.250	ENSAPOG00000008319	-	66	31.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002944	-	63	39.086	ENSAPOG00000012437	-	77	39.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002944	-	80	30.625	ENSAOCG00000014769	-	73	30.625	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002944	-	77	35.772	ENSAOCG00000001325	-	64	35.772	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002944	-	80	30.625	ENSAOCG00000015944	-	67	30.625	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002944	-	60	38.579	ENSAPEG00000015714	-	81	38.579	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002944	-	97	33.824	ENSATEG00000018931	-	93	36.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002944	-	75	44.898	ENSACLG00000011658	-	66	44.898	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002944	-	89	36.220	ENSCSEG00000010453	-	70	36.220	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002944	-	88	35.833	ENSCVAG00000003250	-	88	35.833	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002944	-	77	38.211	ENSCVAG00000006653	-	70	38.211	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002944	-	52	31.250	ENSCVAG00000020141	-	68	39.216	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002944	-	80	37.692	ENSCVAG00000015616	-	74	38.525	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002944	-	88	36.220	ENSEBUG00000002290	-	59	36.220	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002944	-	78	34.646	ENSEBUG00000007931	-	60	34.646	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002944	-	76	37.755	ENSELUG00000024007	-	74	37.755	Esox_lucius
ENSACIG00000002944	-	86	35.135	ENSGAFG00000001879	-	58	35.135	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002944	-	88	31.220	ENSGAFG00000008204	-	72	31.220	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002944	-	78	36.800	ENSHCOG00000015497	-	73	36.800	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002944	-	78	37.008	ENSHCOG00000001873	-	63	37.008	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002944	-	90	34.646	ENSHCOG00000013489	-	91	34.646	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002944	-	77	36.066	ENSHCOG00000019389	-	57	36.066	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002944	-	78	37.008	ENSHCOG00000008550	-	63	37.008	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002944	-	77	54.091	ENSKMAG00000014184	-	53	59.545	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002944	-	82	37.383	ENSLBEG00000007106	-	65	37.383	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002944	-	50	35.135	ENSLBEG00000006161	-	88	33.696	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002944	-	82	35.922	ENSLBEG00000001132	-	77	35.922	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002944	-	96	32.632	ENSLOCG00000004208	-	96	32.632	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002944	-	88	37.008	ENSMAMG00000017939	-	91	37.600	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002944	-	89	35.052	ENSMZEG00005013907	-	78	35.052	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002944	-	89	39.416	ENSMALG00000004279	-	75	38.636	Monopterus_albus
ENSACIG00000002944	-	93	32.039	ENSONIG00000007967	-	72	32.039	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002944	-	87	39.496	ENSORLG00000002268	-	93	39.496	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002944	-	55	52.632	ENSORLG00000028711	-	84	52.632	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002944	-	85	31.538	ENSORLG00000021885	-	70	31.538	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002944	-	91	33.858	ENSORLG00020018921	-	76	33.858	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002944	-	79	34.454	ENSOMEG00000005578	-	95	34.454	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002944	-	68	31.405	ENSPMGG00000019750	-	77	31.405	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002944	-	77	34.211	ENSPMGG00000007051	-	50	34.211	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002944	-	85	36.800	ENSPMGG00000002661	-	71	36.800	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002944	-	95	33.846	ENSPMGG00000002455	-	92	38.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002944	-	75	48.148	ENSPMGG00000002659	-	86	48.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002944	-	92	33.065	ENSPMAG00000004189	-	91	34.146	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000002944	-	93	31.373	ENSPFOG00000018860	-	99	31.373	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002944	-	75	36.885	ENSPFOG00000009491	-	57	36.885	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002944	-	79	31.373	ENSPLAG00000008941	-	79	31.373	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002944	-	74	36.449	ENSPLAG00000014832	-	72	36.449	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002944	-	85	31.707	ENSPMEG00000024117	-	52	46.835	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002944	-	74	36.449	ENSPMEG00000005210	-	72	36.449	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002944	-	77	30.636	ENSPMEG00000002953	-	65	30.636	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002944	-	91	30.175	ENSPNAG00000005946	-	91	30.249	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002944	-	83	38.095	ENSSMAG00000013291	-	91	33.846	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002944	-	82	30.000	ENSSLDG00000011849	-	54	30.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002944	-	81	33.333	ENSSPAG00000011533	-	86	34.409	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002944	-	90	38.655	ENSXETG00000012506	znf91	99	38.655	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002944	-	80	37.143	ENSXCOG00000020768	-	67	37.143	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002944	-	51	33.333	ENSXCOG00000003441	-	54	33.333	Xiphophorus_couchianus