EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002993 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: purbb
Alias: purb|zgc:65916
Full Name: purine-rich element binding protein Bb
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4425 bases
Position: chrCCOE01000077.1:759313-763737
Accession: ZDB-GENE-040426-1478
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003766	PurA	PF04845.13	2e-101	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000003890	-	861	-	ENSACIP00000003766	286 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002993	purbb	91	72.797	ENSACIG00000005213	purab	83	74.219
ENSACIG00000002993	purbb	94	50.814	ENSACIG00000010863	purg	89	49.839
ENSACIG00000002993	purbb	99	87.234	ENSACIG00000013197	PURB	92	86.667
ENSACIG00000002993	purbb	93	72.659	ENSACIG00000003389	puraa	79	72.285

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002993	purbb	93	79.783	ENSG00000146676	PURB	95	77.517	Homo_sapiens
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSG00000185129	PURA	74	74.436	Homo_sapiens
ENSACIG00000002993	purbb	94	55.446	ENSG00000172733	PURG	84	54.305	Homo_sapiens
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSAPOG00000007645	purab	88	71.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002993	purbb	99	99.296	ENSAPOG00000008153	-	93	99.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002993	purbb	99	87.234	ENSAPOG00000013695	PURB	92	86.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002993	purbb	99	70.629	ENSAPOG00000008260	puraa	73	70.629	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002993	purbb	95	49.518	ENSAPOG00000019614	purg	89	48.875	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002993	purbb	94	55.446	ENSAMEG00000019352	PURG	84	55.298	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002993	purbb	93	74.717	ENSAMEG00000011192	PURA	95	75.969	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002993	purbb	71	73.558	ENSAMEG00000017803	PURB	100	73.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002993	purbb	99	70.629	ENSAOCG00000007783	puraa	89	70.629	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002993	purbb	99	99.296	ENSAOCG00000022949	-	93	99.296	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSAOCG00000014550	purab	88	71.636	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002993	purbb	99	86.879	ENSAOCG00000000544	PURB	93	86.620	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002993	purbb	95	50.482	ENSAOCG00000022776	purg	89	48.875	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002993	purbb	99	86.879	ENSAPEG00000008843	PURB	93	86.620	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002993	purbb	95	50.804	ENSAPEG00000014003	purg	89	49.196	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002993	purbb	99	99.296	ENSAPEG00000011640	purbb	93	99.296	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSAPEG00000008417	purab	88	71.636	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002993	purbb	99	70.629	ENSAPEG00000024208	puraa	89	70.629	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002993	purbb	99	99.296	ENSATEG00000006188	-	93	99.296	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002993	purbb	76	51.969	ENSATEG00000008857	purg	80	50.575	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSATEG00000018506	purab	82	74.219	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002993	purbb	99	86.879	ENSATEG00000001810	PURB	92	86.316	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002993	purbb	99	70.280	ENSATEG00000019813	puraa	89	70.280	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002993	purbb	59	69.399	ENSACAG00000006057	PURB	100	67.164	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002993	purbb	94	60.364	ENSACAG00000003215	PURG	95	59.124	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSANAG00000035484	PURA	78	74.436	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002993	purbb	91	74.144	ENSANAG00000030655	-	95	72.203	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.155	ENSANAG00000037667	PURG	90	57.951	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002993	purbb	99	88.652	ENSACLG00000015253	PURB	92	86.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002993	purbb	99	99.648	ENSACLG00000024110	purbb	93	99.648	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002993	purbb	93	72.659	ENSACLG00000019437	puraa	84	72.285	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSACLG00000022559	purab	88	71.636	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002993	purbb	99	86.063	ENSAMXG00000020161	PURB	97	86.207	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002993	purbb	99	69.521	ENSAMXG00000025364	puraa	90	69.521	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.898	ENSAMXG00000024949	purab	82	71.898	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002993	purbb	95	87.273	ENSAMXG00000031168	purba	89	87.770	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSBTAG00000008881	PURA	74	74.436	Bos_taurus
ENSACIG00000002993	purbb	97	80.986	ENSBTAG00000052945	PURB	95	78.644	Bos_taurus
ENSACIG00000002993	purbb	81	54.717	ENSBTAG00000039328	PURG	78	53.788	Bos_taurus
ENSACIG00000002993	purbb	81	35.470	WBGene00004046	plp-1	87	34.764	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000002993	purbb	73	33.077	WBGene00008976	plp-2	52	31.783	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000002993	purbb	79	54.264	ENSCJAG00000012509	PURG	76	53.307	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002993	purbb	91	81.273	ENSCJAG00000011946	PURB	95	77.592	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSCJAG00000047468	PURA	74	74.436	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002993	purbb	75	55.918	ENSCAFG00000006442	PURG	80	54.918	Canis_familiaris
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSCAFG00020003033	PURA	74	74.436	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002993	purbb	75	55.918	ENSCAFG00020001221	PURG	80	54.918	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002993	purbb	97	81.053	ENSCAFG00020019767	PURB	95	78.644	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002993	purbb	97	80.986	ENSCHIG00000011367	PURB	95	78.644	Capra_hircus
ENSACIG00000002993	purbb	81	53.992	ENSCHIG00000024210	PURG	77	53.053	Capra_hircus
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSCHIG00000009332	PURA	74	74.436	Capra_hircus
ENSACIG00000002993	purbb	91	70.673	ENSTSYG00000013362	PURA	74	68.326	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002993	purbb	90	84.615	ENSTSYG00000026756	PURB	99	88.525	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.155	ENSTSYG00000008288	PURG	88	59.011	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002993	purbb	93	54.086	ENSCAPG00000011652	PURG	85	53.906	Cavia_aperea
ENSACIG00000002993	purbb	94	55.446	ENSCPOG00000039319	PURG	84	55.298	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002993	purbb	92	81.716	ENSCPOG00000033652	PURB	93	78.746	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.140	ENSCCAG00000029224	PURG	88	57.914	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002993	purbb	91	81.273	ENSCCAG00000009241	PURB	95	77.592	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002993	purbb	91	81.273	ENSCATG00000021124	PURB	95	77.592	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.155	ENSCATG00000041294	PURG	88	57.951	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002993	purbb	81	53.992	ENSCLAG00000001059	PURG	78	53.053	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002993	purbb	88	75.610	ENSCLAG00000017602	PURA	87	75.610	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002993	purbb	91	81.273	ENSCSAG00000019598	PURB	95	77.592	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002993	purbb	74	56.148	ENSCSAG00000015815	PURG	78	55.144	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSCSAG00000000495	PURA	74	74.436	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002993	purbb	78	55.118	ENSCHOG00000001299	PURG	75	54.150	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002993	purbb	94	56.187	ENSCPBG00000013416	PURG	87	55.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002993	purbb	91	82.061	ENSCPBG00000023221	PURB	82	79.371	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002993	purbb	86	74.899	ENSCPBG00000006537	PURA	76	75.403	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002993	purbb	95	48.936	ENSCING00000006338	pur-alpha/beta/gamma	84	47.331	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000002993	purbb	95	47.601	ENSCSAVG00000008328	-	94	45.756	Ciona_savignyi
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.155	ENSCANG00000032501	PURG	90	57.951	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002993	purbb	91	81.648	ENSCGRG00001000874	Purb	95	76.568	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002993	purbb	79	54.941	ENSCGRG00001015485	Purg	76	53.968	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSCGRG00001005040	Pura	74	74.436	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002993	purbb	94	56.040	ENSCGRG00000016119	Purg	85	55.892	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002993	purbb	93	49.679	ENSCSEG00000018750	purg	86	48.589	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	87	86.747	ENSCSEG00000011673	PURB	89	86.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	97	71.223	ENSCSEG00000009380	puraa	85	71.223	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	94	96.269	ENSCSEG00000020589	purbb	91	95.941	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.609	ENSCSEG00000017000	purab	82	74.609	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	97	95.324	ENSCSEG00000007786	-	85	95.357	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.636	ENSCVAG00000019500	purab	88	71.636	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.636	ENSCVAG00000000525	purab	88	71.636	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	91	54.237	ENSCVAG00000009983	purg	84	52.560	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	99	95.390	ENSCVAG00000007064	-	93	93.684	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.898	ENSCVAG00000013829	puraa	89	70.175	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	99	87.943	ENSCVAG00000004571	PURB	92	87.368	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.168	ENSDARG00000099614	purab	89	71.168	Danio_rerio
ENSACIG00000002993	purbb	99	89.716	ENSDARG00000068822	purba	90	89.753	Danio_rerio
ENSACIG00000002993	purbb	99	69.521	ENSDARG00000067591	puraa	89	69.792	Danio_rerio
ENSACIG00000002993	purbb	99	92.580	ENSDARG00000103546	purbb	96	93.007	Danio_rerio
ENSACIG00000002993	purbb	90	53.819	ENSDARG00000099187	purg	88	53.125	Danio_rerio
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSDNOG00000014337	PURA	74	74.436	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002993	purbb	92	81.111	ENSDNOG00000049318	PURB	93	79.505	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002993	purbb	93	54.980	ENSDNOG00000023747	PURG	100	54.762	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002993	purbb	94	56.522	ENSDORG00000023729	Purg	83	55.116	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSDORG00000008317	Pura	78	74.436	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002993	purbb	87	49.187	FBgn0022361	Pur-alpha	87	46.748	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000002993	purbb	89	72.941	ENSEBUG00000003859	puraa	88	69.686	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002993	purbb	90	75.391	ENSEASG00005020920	PURA	73	74.436	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002993	purbb	97	81.272	ENSEASG00005017830	PURB	71	78.644	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002993	purbb	79	53.696	ENSEASG00005016933	PURG	76	53.696	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002993	purbb	97	81.272	ENSECAG00000017685	PURB	95	78.644	Equus_caballus
ENSACIG00000002993	purbb	79	53.696	ENSECAG00000028324	PURG	76	53.696	Equus_caballus
ENSACIG00000002993	purbb	81	51.362	ENSEEUG00000012326	PURG	80	50.391	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002993	purbb	90	74.219	ENSELUG00000008830	purab	88	71.898	Esox_lucius
ENSACIG00000002993	purbb	77	49.813	ENSELUG00000017851	purg	84	49.064	Esox_lucius
ENSACIG00000002993	purbb	93	74.532	ENSELUG00000022572	puraa	79	74.532	Esox_lucius
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ENSACIG00000002993	purbb	99	89.860	ENSELUG00000005772	-	94	88.581	Esox_lucius
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ENSACIG00000002993	purbb	97	81.053	ENSFCAG00000039247	PURB	95	78.644	Felis_catus
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ENSACIG00000002993	purbb	94	59.507	ENSRBIG00000028388	PURG	90	58.304	Rhinopithecus_bieti
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ENSACIG00000002993	purbb	91	81.273	ENSRROG00000000118	PURB	95	77.592	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000002993	purbb	94	59.140	ENSSBOG00000017596	PURG	89	57.914	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACIG00000002993	purbb	94	55.116	ENSSSCG00000038933	PURG	84	55.298	Sus_scrofa
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ENSACIG00000002993	purbb	100	70.280	ENSTNIG00000010005	puraa	89	70.280	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002993	purbb	99	96.099	ENSTNIG00000015630	-	97	96.099	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002993	purbb	89	57.471	ENSTNIG00000001673	purg	80	56.322	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002993	purbb	94	71.481	ENSTNIG00000004639	purab	88	71.481	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002993	purbb	80	55.336	ENSTBEG00000012582	PURG	78	54.365	Tupaia_belangeri
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ENSACIG00000002993	purbb	94	55.446	ENSUAMG00000021325	PURG	84	55.298	Ursus_americanus
ENSACIG00000002993	purbb	97	81.053	ENSUAMG00000013460	PURB	92	80.000	Ursus_americanus
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ENSACIG00000002993	purbb	78	54.118	ENSVPAG00000011003	PURG	76	53.150	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002993	purbb	96	81.272	ENSVVUG00000012004	PURB	91	78.157	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002993	purbb	75	55.918	ENSVVUG00000019861	PURG	80	54.918	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002993	purbb	90	61.628	ENSXETG00000018299	purg	89	60.700	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002993	purbb	98	82.594	ENSXETG00000001257	purb	94	81.818	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002993	purbb	96	72.993	ENSXETG00000003837	pura	88	72.993	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002993	purbb	93	56.159	ENSXCOG00000017050	purg	88	54.745	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002993	purbb	99	96.842	ENSXCOG00000011776	purbb	93	96.842	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002993	purbb	96	71.636	ENSXCOG00000017141	puraa	89	69.930	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002993	purbb	99	88.652	ENSXCOG00000017525	PURB	93	87.719	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000002993	purbb	96	71.636	ENSXMAG00000019887	puraa	89	69.930	Xiphophorus_maculatus
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ENSACIG00000002993	purbb	93	52.787	ENSXMAG00000007654	purg	86	51.485	Xiphophorus_maculatus
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