EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003035 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16895 bases
Position: chrCCOE01001545.1:1237887-1254781
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003895	ResIII	PF04851.15	1.5e-08	1	1
ENSACIP00000003895	BRK	PF07533.16	5.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000004022	-	4527	-	ENSACIP00000003895	1508 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003035	-	97	85.087	ENSACIG00000021550	smarca4a	94	84.635
ENSACIG00000003035	-	97	72.793	ENSACIG00000015607	SMARCA2	91	73.379

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003035	-	96	82.420	ENSG00000127616	SMARCA4	99	95.652	Homo_sapiens
ENSACIG00000003035	-	91	97.403	ENSAPOG00000004542	SMARCA4	99	97.403	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003035	-	78	88.739	ENSAPOG00000003509	smarca4a	93	87.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003035	-	96	86.575	ENSAMEG00000010868	SMARCA4	89	76.172	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000003035	-	91	87.260	ENSAOCG00000019167	smarca4a	100	86.913	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003035	-	96	94.674	ENSAOCG00000009450	-	97	94.075	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003035	-	91	87.331	ENSAPEG00000015559	smarca4a	100	86.984	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003035	-	99	95.295	ENSAPEG00000023108	-	96	95.295	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003035	-	97	94.210	ENSATEG00000001094	-	97	94.113	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003035	-	97	85.524	ENSATEG00000011524	smarca4a	95	84.645	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003035	-	96	86.804	ENSANAG00000036991	SMARCA4	95	81.448	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000003035	-	99	84.747	ENSACLG00000000163	smarca4a	96	84.784	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003035	-	99	97.090	ENSACLG00000008638	-	100	97.090	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003035	-	97	87.256	ENSAMXG00000021023	smarca4a	96	86.842	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003035	-	96	87.442	ENSAMXG00000011238	-	96	90.855	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003035	-	76	89.822	ENSCJAG00000005936	SMARCA4	95	80.824	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000003035	-	97	84.853	ENSCAFG00020024620	SMARCA4	96	83.739	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000003035	-	96	83.734	ENSCAPG00000015932	SMARCA4	99	83.196	Cavia_aperea
ENSACIG00000003035	-	97	82.659	ENSCCAG00000031660	SMARCA4	95	83.295	Cebus_capucinus
ENSACIG00000003035	-	96	86.769	ENSCATG00000029530	SMARCA4	95	84.701	Cercocebus_atys
ENSACIG00000003035	-	97	85.817	ENSCLAG00000011946	SMARCA4	95	85.480	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000003035	-	96	87.888	ENSCANG00000036013	SMARCA4	95	84.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000003035	-	97	88.455	ENSCGRG00000017242	Smarca4	95	88.615	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000003035	-	93	83.367	ENSCSEG00000014771	smarca4a	95	82.914	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000003035	-	96	93.209	ENSCVAG00000003018	-	96	90.945	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003035	-	97	84.347	ENSCVAG00000006979	smarca4a	95	83.700	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003035	-	97	85.576	ENSDARG00000077226	smarca4a	95	85.567	Danio_rerio
ENSACIG00000003035	-	96	84.218	ENSDARG00000104339	SMARCA4	96	84.074	Danio_rerio
ENSACIG00000003035	-	96	84.215	ENSDNOG00000048847	SMARCA4	90	90.476	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000003035	-	95	76.648	ENSETEG00000013361	SMARCA4	94	72.345	Echinops_telfairi
ENSACIG00000003035	-	97	85.359	ENSEASG00005006167	SMARCA4	94	84.522	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000003035	-	97	87.000	ENSELUG00000010247	smarca4a	94	86.087	Esox_lucius
ENSACIG00000003035	-	97	85.000	ENSELUG00000023232	-	90	84.902	Esox_lucius
ENSACIG00000003035	-	79	90.879	ENSFALG00000004208	SMARCA4	95	81.944	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000003035	-	93	83.056	ENSFHEG00000010182	smarca4a	98	84.663	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003035	-	99	90.593	ENSFHEG00000007902	-	96	90.399	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003035	-	85	83.806	ENSGMOG00000002649	smarca4a	82	85.882	Gadus_morhua
ENSACIG00000003035	-	84	86.179	ENSGMOG00000005756	-	80	85.753	Gadus_morhua
ENSACIG00000003035	-	87	88.328	ENSGAFG00000014900	smarca4a	94	85.415	Gambusia_affinis
ENSACIG00000003035	-	97	90.214	ENSGAFG00000008827	-	94	89.933	Gambusia_affinis
ENSACIG00000003035	-	93	83.478	ENSGACG00000006691	smarca4a	95	82.527	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000003035	-	97	85.346	ENSGACG00000016033	-	96	84.324	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000003035	-	96	88.507	ENSGGOG00000009882	SMARCA4	95	86.009	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000003035	-	97	86.597	ENSHBUG00000021172	smarca4a	95	85.032	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000003035	-	99	97.490	ENSHBUG00000005447	-	100	97.490	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000003035	-	99	84.567	ENSHCOG00000009510	smarca4a	96	84.204	Hippocampus_comes
ENSACIG00000003035	-	97	86.135	ENSIPUG00000006107	smarca4a	97	85.858	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000003035	-	95	87.559	ENSIPUG00000016346	-	92	87.178	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000003035	-	99	93.010	ENSKMAG00000019518	-	98	91.089	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000003035	-	97	86.300	ENSKMAG00000011931	smarca4a	95	86.605	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000003035	-	99	83.419	ENSLBEG00000017383	smarca4a	97	83.519	Labrus_bergylta
ENSACIG00000003035	-	96	84.214	ENSLBEG00000020655	-	94	84.337	Labrus_bergylta
ENSACIG00000003035	-	51	78.623	ENSLACG00000015309	SMARCA4	100	77.174	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000003035	-	97	83.812	ENSLOCG00000007820	smarca4a	95	83.431	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000003035	-	98	85.195	ENSLAFG00000001433	SMARCA4	95	85.125	Loxodonta_africana
ENSACIG00000003035	-	96	87.820	ENSMFAG00000032146	SMARCA4	94	84.701	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000003035	-	96	81.860	ENSMMUG00000012042	SMARCA4	90	91.741	Macaca_mulatta
ENSACIG00000003035	-	96	86.769	ENSMNEG00000028512	SMARCA4	95	84.681	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000003035	-	96	86.769	ENSMLEG00000034976	SMARCA4	95	82.716	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000003035	-	99	94.798	ENSMAMG00000002841	-	99	94.083	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000003035	-	97	86.469	ENSMAMG00000009256	smarca4a	94	86.262	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000003035	-	99	91.796	ENSMZEG00005023861	-	95	94.478	Maylandia_zebra
ENSACIG00000003035	-	97	86.597	ENSMZEG00005003889	smarca4a	94	86.277	Maylandia_zebra
ENSACIG00000003035	-	96	86.662	ENSMICG00000009806	SMARCA4	95	84.665	Microcebus_murinus
ENSACIG00000003035	-	97	83.097	ENSMMOG00000007571	smarca4a	98	82.968	Mola_mola
ENSACIG00000003035	-	97	93.474	ENSMMOG00000008466	-	94	93.066	Mola_mola
ENSACIG00000003035	-	91	94.957	ENSMALG00000021534	-	99	94.444	Monopterus_albus
ENSACIG00000003035	-	93	85.724	ENSMALG00000003388	smarca4a	94	85.537	Monopterus_albus
ENSACIG00000003035	-	78	83.465	MGP_CAROLIEiJ_G0031879	Smarca4	98	82.664	Mus_caroli
ENSACIG00000003035	-	78	83.465	ENSMUSG00000032187	Smarca4	98	82.664	Mus_musculus
ENSACIG00000003035	-	78	83.465	MGP_SPRETEiJ_G0033003	Smarca4	98	82.664	Mus_spretus
ENSACIG00000003035	-	91	97.768	ENSNBRG00000018865	-	99	97.768	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000003035	-	99	87.156	ENSNBRG00000011457	smarca4a	96	87.299	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000003035	-	97	86.201	ENSNLEG00000012389	SMARCA4	95	86.624	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000003035	-	81	89.655	ENSOPRG00000000885	-	77	89.655	Ochotona_princeps
ENSACIG00000003035	-	97	86.005	ENSODEG00000017127	SMARCA4	95	85.076	Octodon_degus
ENSACIG00000003035	-	97	86.706	ENSONIG00000008196	smarca4a	95	86.182	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000003035	-	99	91.786	ENSONIG00000018040	-	95	90.794	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000003035	-	99	79.105	ENSOCUG00000001787	SMARCA4	95	79.987	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000003035	-	93	84.734	ENSORLG00000015452	smarca4a	95	83.689	Oryzias_latipes
ENSACIG00000003035	-	87	93.727	ENSORLG00000003955	-	98	91.217	Oryzias_latipes
ENSACIG00000003035	-	87	93.667	ENSORLG00020009728	-	98	91.439	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000003035	-	93	84.802	ENSORLG00020004611	smarca4a	99	85.817	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000003035	-	93	84.802	ENSORLG00015016560	smarca4a	98	83.118	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000003035	-	96	88.187	ENSORLG00015007739	-	98	88.591	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000003035	-	97	85.010	ENSOMEG00000007486	smarca4a	95	84.695	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000003035	-	95	93.962	ENSOMEG00000016626	-	95	87.144	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000003035	-	90	84.868	ENSOGAG00000016148	SMARCA4	100	82.666	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000003035	-	96	85.802	ENSPPAG00000043191	SMARCA4	95	84.701	Pan_paniscus
ENSACIG00000003035	-	96	85.802	ENSPTRG00000010488	SMARCA4	95	84.701	Pan_troglodytes
ENSACIG00000003035	-	96	86.769	ENSPANG00000011042	SMARCA4	94	84.811	Papio_anubis
ENSACIG00000003035	-	95	85.781	ENSPKIG00000010087	-	92	85.656	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000003035	-	97	87.015	ENSPKIG00000007770	SMARCA4	94	86.367	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000003035	-	83	87.461	ENSPSIG00000005547	SMARCA4	95	81.116	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000003035	-	84	96.468	ENSPFOG00000012930	-	95	88.013	Poecilia_formosa
ENSACIG00000003035	-	83	90.427	ENSPFOG00000007892	smarca4a	95	82.798	Poecilia_formosa
ENSACIG00000003035	-	97	86.880	ENSPLAG00000014294	smarca4a	95	86.364	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000003035	-	99	93.170	ENSPLAG00000018616	-	97	93.170	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000003035	-	97	94.534	ENSPMEG00000008929	-	94	94.467	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000003035	-	83	90.348	ENSPMEG00000003725	smarca4a	96	82.542	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000003035	-	97	92.376	ENSPREG00000014823	-	94	91.967	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000003035	-	97	83.256	ENSPREG00000014608	smarca4a	95	83.498	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000003035	-	75	89.130	ENSPCAG00000014054	SMARCA4	73	88.889	Procavia_capensis
ENSACIG00000003035	-	96	87.916	ENSPCOG00000023011	SMARCA4	95	84.535	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000003035	-	75	74.327	ENSPVAG00000007787	SMARCA4	90	73.963	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000003035	-	99	98.733	ENSPNYG00000023995	-	100	98.733	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000003035	-	97	87.761	ENSPNYG00000000717	smarca4a	96	84.903	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000003035	-	97	86.452	ENSPNAG00000024136	smarca4a	94	86.107	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000003035	-	97	87.176	ENSPNAG00000006636	-	93	86.945	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000003035	-	96	87.888	ENSRBIG00000038696	SMARCA4	94	82.640	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000003035	-	96	87.888	ENSRROG00000045509	SMARCA4	95	84.701	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000003035	-	96	87.548	ENSSBOG00000026896	SMARCA4	95	84.701	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000003035	-	96	86.312	ENSSHAG00000001642	SMARCA4	95	84.756	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000003035	-	93	84.783	ENSSFOG00015009921	-	86	92.616	Scleropages_formosus
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