EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003050 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 735 bases
Position: chrCCOE01000078.1:9804-10538
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003840	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-08	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000003964	-	660	-	ENSACIP00000003840	219 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACIG00000003050	-	77	35.326	ENSACIG00000020244	-	74	35.326
ENSACIG00000003050	-	83	32.828	ENSACIG00000014737	-	91	32.828
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ENSACIG00000003050	-	95	33.953	ENSACIG00000008001	-	89	33.953
ENSACIG00000003050	-	85	30.151	ENSACIG00000016313	-	63	30.151
ENSACIG00000003050	-	81	35.106	ENSACIG00000007725	-	67	35.106
ENSACIG00000003050	-	83	34.759	ENSACIG00000001455	-	69	34.759
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ENSACIG00000003050	-	94	35.377	ENSACIG00000001070	-	75	34.562
ENSACIG00000003050	-	77	39.080	ENSACIG00000022366	-	63	39.080
ENSACIG00000003050	-	84	33.505	ENSACIG00000022362	-	68	33.505
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ENSACIG00000003050	-	84	34.211	ENSACIG00000014690	-	73	34.211
ENSACIG00000003050	-	81	35.135	ENSACIG00000022355	-	63	35.135
ENSACIG00000003050	-	80	36.264	ENSACIG00000002263	-	65	36.264
ENSACIG00000003050	-	85	32.124	ENSACIG00000012718	-	81	32.124
ENSACIG00000003050	-	81	33.333	ENSACIG00000012714	-	61	33.333
ENSACIG00000003050	-	77	37.714	ENSACIG00000004245	-	73	34.123
ENSACIG00000003050	-	97	31.197	ENSACIG00000014716	-	93	31.197
ENSACIG00000003050	-	71	32.919	ENSACIG00000016502	-	69	32.919
ENSACIG00000003050	-	91	32.850	ENSACIG00000014703	-	84	32.850
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ENSACIG00000003050	-	91	32.093	ENSACIG00000014662	-	87	32.093
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ENSACIG00000003050	-	79	36.517	ENSACIG00000015088	-	71	36.517
ENSACIG00000003050	-	71	37.037	ENSACIG00000000976	-	80	37.037

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003050	-	76	31.694	ENSAPOG00000002527	-	59	31.694	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	79	34.254	ENSAPOG00000001075	-	83	34.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	76	32.796	ENSAPOG00000002517	-	63	32.796	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	91	31.925	ENSAPOG00000000066	-	58	31.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	81	33.333	ENSAPOG00000018915	-	79	33.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	56	33.077	ENSAPOG00000008819	-	60	33.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	84	32.812	ENSAPOG00000007123	-	71	32.812	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	77	34.286	ENSAPOG00000021365	-	57	34.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	79	35.593	ENSAPOG00000022321	-	80	35.593	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	88	31.841	ENSAPOG00000009059	-	51	31.868	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	72	32.335	ENSAPOG00000007631	-	78	32.335	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	55	34.400	ENSAPOG00000008529	-	51	34.400	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	83	34.225	ENSAPOG00000010738	-	61	34.225	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003050	-	71	36.420	ENSAOCG00000007815	-	59	36.420	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003050	-	81	33.333	ENSAOCG00000015984	-	60	33.333	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003050	-	75	34.302	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	34.302	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003050	-	83	33.511	ENSAOCG00000013326	-	67	33.511	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003050	-	81	33.333	ENSAPEG00000003513	-	81	37.288	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003050	-	81	35.326	ENSAPEG00000013532	-	94	35.326	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003050	-	80	33.880	ENSAPEG00000019003	-	72	33.880	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003050	-	81	35.326	ENSAPEG00000013508	-	77	35.326	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003050	-	99	31.278	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	82	31.532	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003050	-	71	36.420	ENSAPEG00000013378	-	58	36.420	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000003050	-	71	32.121	ENSATEG00000010991	-	61	32.121	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003050	-	80	32.597	ENSATEG00000019504	-	61	32.597	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003050	-	82	32.447	ENSATEG00000011953	-	54	31.771	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000003050	-	83	30.653	ENSACLG00000001896	-	54	30.653	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000003050	-	77	36.364	ENSACLG00000003393	-	70	36.364	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003050	-	78	31.746	ENSACLG00000001909	-	55	32.432	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003050	-	81	34.043	ENSACLG00000005659	-	61	34.043	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003050	-	74	32.353	ENSACLG00000001790	-	55	32.353	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003050	-	78	30.556	ENSACLG00000001800	-	51	31.884	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003050	-	77	32.768	ENSACLG00000023539	-	63	32.768	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000003050	-	76	35.057	ENSAMXG00000031180	-	80	35.057	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000003050	-	60	35.294	ENSAMXG00000039994	-	56	35.294	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003050	-	79	37.569	ENSAMXG00000041969	si:ch1073-185p12.2	55	37.569	Astyanax_mexicanus
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