EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003092 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab11a
Alias: wu:fi15h09|zgc:103679
Full Name: RAB11a%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11060 bases
Position: chrCCOE01001068.1:1305635-1316694
Accession: ZDB-GENE-041114-53
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000003890	MMR_HSR1	PF01926.23	2.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000004016	-	648	-	ENSACIP00000003890	215 (aa)	-	UPI0000363C28

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003092	rab11a	71	36.129	ENSACIG00000000100	kras	54	37.126
ENSACIG00000003092	rab11a	72	52.903	ENSACIG00000003157	-	82	52.903
ENSACIG00000003092	rab11a	95	35.185	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	35.185
ENSACIG00000003092	rab11a	76	46.341	ENSACIG00000008102	rab18b	80	46.341
ENSACIG00000003092	rab11a	100	65.116	ENSACIG00000017414	rab25b	100	65.116
ENSACIG00000003092	rab11a	99	78.505	ENSACIG00000024374	rab11ba	96	73.391
ENSACIG00000003092	rab11a	100	86.239	ENSACIG00000024376	-	100	86.239
ENSACIG00000003092	rab11a	80	32.973	ENSACIG00000018406	rasl11a	73	32.973
ENSACIG00000003092	rab11a	73	34.591	ENSACIG00000000670	rabl2	69	34.591
ENSACIG00000003092	rab11a	73	36.306	ENSACIG00000014605	rab6a	75	36.306
ENSACIG00000003092	rab11a	91	39.899	ENSACIG00000003102	rab42a	93	39.216
ENSACIG00000003092	rab11a	94	42.105	ENSACIG00000023837	-	97	42.105
ENSACIG00000003092	rab11a	97	46.411	ENSACIG00000019049	rab1ab	99	47.115
ENSACIG00000003092	rab11a	78	46.746	ENSACIG00000000154	RAB39B	79	46.746
ENSACIG00000003092	rab11a	95	38.028	ENSACIG00000020616	rab12	83	38.028
ENSACIG00000003092	rab11a	80	34.302	ENSACIG00000007154	rab6ba	81	34.302
ENSACIG00000003092	rab11a	93	39.706	ENSACIG00000006949	RAB17	86	39.706
ENSACIG00000003092	rab11a	93	36.408	ENSACIG00000022520	rab33a	88	36.408
ENSACIG00000003092	rab11a	76	47.239	ENSACIG00000010896	rab5c	75	47.826
ENSACIG00000003092	rab11a	73	36.943	ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.943
ENSACIG00000003092	rab11a	68	42.763	ENSACIG00000013119	-	75	42.763
ENSACIG00000003092	rab11a	73	41.718	ENSACIG00000013630	RAB7A	78	41.718
ENSACIG00000003092	rab11a	67	37.241	ENSACIG00000020496	rab23	80	36.585
ENSACIG00000003092	rab11a	73	36.076	ENSACIG00000014094	rab6bb	77	36.076
ENSACIG00000003092	rab11a	85	33.696	ENSACIG00000017824	rras	89	33.696
ENSACIG00000003092	rab11a	100	77.064	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	77.064
ENSACIG00000003092	rab11a	73	40.994	ENSACIG00000018043	rab9a	79	40.994
ENSACIG00000003092	rab11a	85	71.978	ENSACIG00000019803	rab25a	85	71.978
ENSACIG00000003092	rab11a	75	42.857	ENSACIG00000014012	rab22a	83	42.857
ENSACIG00000003092	rab11a	75	43.114	ENSACIG00000007739	rab9b	82	43.114
ENSACIG00000003092	rab11a	69	36.667	ENSACIG00000000699	hrasb	85	37.654
ENSACIG00000003092	rab11a	93	35.437	ENSACIG00000006558	-	97	35.437
ENSACIG00000003092	rab11a	74	42.767	ENSACIG00000009306	RAB15	75	42.767
ENSACIG00000003092	rab11a	90	32.663	ENSACIG00000000642	rab36	76	32.663
ENSACIG00000003092	rab11a	73	41.718	ENSACIG00000022381	-	78	41.718
ENSACIG00000003092	rab11a	84	36.788	ENSACIG00000021855	rab33ba	79	36.788
ENSACIG00000003092	rab11a	75	38.272	ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.272
ENSACIG00000003092	rab11a	76	30.357	ENSACIG00000009139	dnajc27	62	30.357
ENSACIG00000003092	rab11a	78	54.167	ENSACIG00000009006	zgc:171927	79	54.167
ENSACIG00000003092	rab11a	94	37.931	ENSACIG00000023222	-	84	37.931
ENSACIG00000003092	rab11a	99	86.047	ENSACIG00000017403	rab11al	99	86.047
ENSACIG00000003092	rab11a	73	41.718	ENSACIG00000022208	-	78	41.718
ENSACIG00000003092	rab11a	85	46.448	ENSACIG00000008584	rab13	88	46.448
ENSACIG00000003092	rab11a	54	30.579	ENSACIG00000013359	arl4d	59	30.579
ENSACIG00000003092	rab11a	59	32.283	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	67	34.532
ENSACIG00000003092	rab11a	84	39.344	ENSACIG00000021459	zgc:101559	80	39.344
ENSACIG00000003092	rab11a	77	43.976	ENSACIG00000010619	rab15	78	43.976
ENSACIG00000003092	rab11a	54	39.316	ENSACIG00000008620	rab34a	52	39.316
ENSACIG00000003092	rab11a	77	53.012	ENSACIG00000014625	-	82	53.012
ENSACIG00000003092	rab11a	94	39.901	ENSACIG00000019251	rab5aa	92	39.901

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSG00000103769	RAB11A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSAPOG00000018256	rab11a	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSAMEG00000003119	RAB11A	84	94.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSAOCG00000020106	rab11a	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSAPEG00000000075	rab11a	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSATEG00000022531	rab11a	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003092	rab11a	98	92.453	ENSAPLG00000014962	RAB11A	98	92.453	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000003092	rab11a	99	94.884	ENSACAG00000004479	RAB11A	99	94.884	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSANAG00000008429	RAB11A	100	94.907	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSACLG00000001775	rab11a	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003092	rab11a	96	94.686	ENSAMXG00000003155	rab11a	96	94.686	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSBTAG00000018959	RAB11A	100	94.907	Bos_taurus
ENSACIG00000003092	rab11a	99	74.766	ENSBTAG00000048711	-	97	74.384	Bos_taurus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCJAG00000042037	RAB11A	100	94.907	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCAFG00000017255	RAB11A	100	94.907	Canis_familiaris
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCAFG00020008478	RAB11A	100	94.907	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCHIG00000012183	-	100	94.907	Capra_hircus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	91.204	ENSTSYG00000031189	RAB11A	97	96.324	Carlito_syrichta
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCPOG00000037599	RAB11A	100	94.907	Cavia_porcellus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCCAG00000021286	RAB11A	100	94.907	Cebus_capucinus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCATG00000034739	-	100	94.907	Cercocebus_atys
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCLAG00000007435	RAB11A	100	94.907	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCSAG00000013038	RAB11A	100	94.907	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	95.370	ENSCPBG00000014614	RAB11A	100	95.370	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCANG00000034570	-	100	94.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCGRG00001023313	Rab11a	100	94.907	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSCGRG00000018359	Rab11a	100	94.907	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000003092	rab11a	100	99.535	ENSCSEG00000007383	rab11a	100	99.535	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSCVAG00000013878	rab11a	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	97.209	ENSDARG00000041450	rab11a	100	97.209	Danio_rerio
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSDNOG00000038479	RAB11A	83	94.907	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000003092	rab11a	99	84.112	FBgn0015790	Rab11	100	84.112	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000003092	rab11a	100	89.815	ENSETEG00000004920	RAB11A	99	89.815	Echinops_telfairi
ENSACIG00000003092	rab11a	100	87.097	ENSEBUG00000007493	rab11a	100	87.097	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSEASG00005006431	RAB11A	100	94.907	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSECAG00000023865	RAB11A	88	93.500	Equus_caballus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	97.674	ENSELUG00000002999	rab11a	100	97.674	Esox_lucius
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSFCAG00000030174	RAB11A	100	94.907	Felis_catus
ENSACIG00000003092	rab11a	97	92.823	ENSFALG00000010052	RAB11A	100	92.823	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000003092	rab11a	96	94.686	ENSFDAG00000021495	RAB11A	96	94.686	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSFHEG00000019668	rab11a	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	97.727	ENSGMOG00000004096	-	100	97.727	Gadus_morhua
ENSACIG00000003092	rab11a	100	95.349	ENSGMOG00000008355	rab11a	99	95.349	Gadus_morhua
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSGALG00000007615	RAB11A	100	94.907	Gallus_gallus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSGAFG00000016549	rab11a	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSACIG00000003092	rab11a	100	95.370	ENSGAGG00000014814	RAB11A	100	95.370	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSGGOG00000014252	RAB11A	100	94.907	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000003092	rab11a	94	99.505	ENSHBUG00000023035	rab11a	88	99.505	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSHGLG00000005396	RAB11A	100	94.907	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000003092	rab11a	94	82.266	ENSHGLG00000006346	-	99	82.266	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSHGLG00100011237	RAB11A	100	94.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000003092	rab11a	94	82.266	ENSHGLG00100015502	-	99	82.266	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSHCOG00000005652	rab11a	100	100.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000003092	rab11a	100	97.209	ENSIPUG00000021401	Rab11a	100	97.209	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSSTOG00000015255	RAB11A	100	94.907	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSJJAG00000015445	Rab11a	100	94.907	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSJJAG00000012036	-	100	94.907	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	100.000	ENSKMAG00000011905	rab11a	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.444	ENSLOCG00000013835	rab11a	99	94.444	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000003092	rab11a	100	94.907	ENSLAFG00000011418	RAB11A	100	94.907	Loxodonta_africana
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