EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003515 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 55051 bases
Position: chrCCOE01000011.1:550837-605887
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	1	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	2	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	3	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	4	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	5	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	6	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	7	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	8	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	9	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	10	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	11	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	12	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	13	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	14	15
ENSACIP00000004428	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-88	15	15
ENSACIP00000004446	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-16	1	3
ENSACIP00000004446	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-16	2	3
ENSACIP00000004446	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-16	3	3
ENSACIP00000004435	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-15	1	2
ENSACIP00000004435	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-15	2	2
ENSACIP00000004428	zf-met	PF12874.7	1.2e-16	1	2
ENSACIP00000004428	zf-met	PF12874.7	1.2e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000004572	-	2589	-	ENSACIP00000004428	862 (aa)	-	-
ENSACIT00000004579	-	441	-	ENSACIP00000004435	146 (aa)	-	-
ENSACIT00000004590	-	387	-	ENSACIP00000004446	128 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003515	-	87	52.212	ENSACIG00000009717	-	97	45.283
ENSACIG00000003515	-	88	45.000	ENSACIG00000013750	-	83	33.898
ENSACIG00000003515	-	92	43.651	ENSACIG00000003720	-	69	43.651
ENSACIG00000003515	-	90	41.176	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	41.176
ENSACIG00000003515	-	94	47.727	ENSACIG00000015411	-	82	37.727
ENSACIG00000003515	-	98	49.412	ENSACIG00000019791	-	96	47.748
ENSACIG00000003515	-	99	39.568	ENSACIG00000019804	-	84	39.568
ENSACIG00000003515	-	99	49.600	ENSACIG00000010647	-	94	54.386
ENSACIG00000003515	-	92	44.340	ENSACIG00000019710	-	81	40.833
ENSACIG00000003515	-	89	46.199	ENSACIG00000023162	-	50	50.877
ENSACIG00000003515	-	90	51.515	ENSACIG00000022625	-	99	45.238
ENSACIG00000003515	-	86	41.111	ENSACIG00000011318	snai1a	51	39.286
ENSACIG00000003515	-	93	43.750	ENSACIG00000002190	gfi1b	56	43.750
ENSACIG00000003515	-	94	33.803	ENSACIG00000014233	znf407	67	33.803
ENSACIG00000003515	-	93	45.918	ENSACIG00000008886	znf1164	97	45.918
ENSACIG00000003515	-	87	38.667	ENSACIG00000006826	-	60	43.103
ENSACIG00000003515	-	92	41.270	ENSACIG00000000406	prdm5	82	35.484
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ENSACIG00000003515	-	90	50.442	ENSACIG00000022293	-	97	50.442
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ENSACIG00000003515	-	93	37.143	ENSACIG00000001860	-	63	44.086
ENSACIG00000003515	-	93	42.920	ENSACIG00000017644	-	92	41.525
ENSACIG00000003515	-	98	45.113	ENSACIG00000017647	-	97	45.113
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ENSACIG00000003515	-	92	48.000	ENSACIG00000014282	znf526	92	36.438
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ENSACIG00000003515	-	90	42.188	ENSACIG00000017892	-	98	38.144
ENSACIG00000003515	-	93	46.847	ENSACIG00000011153	-	77	45.385
ENSACIG00000003515	-	94	41.176	ENSACIG00000023313	-	92	41.176
ENSACIG00000003515	-	97	35.699	ENSACIG00000012636	ZNF319	96	35.699
ENSACIG00000003515	-	95	50.000	ENSACIG00000014123	znf236	78	41.353
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ENSACIG00000003515	-	94	38.411	ENSACIG00000019534	-	84	38.411
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ENSACIG00000003515	-	93	40.991	ENSACIG00000017653	-	96	41.667
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ENSACIG00000003515	-	98	45.890	ENSACIG00000004041	-	96	47.059
ENSACIG00000003515	-	99	44.569	ENSACIG00000003556	-	69	49.107
ENSACIG00000003515	-	93	40.625	ENSACIG00000007882	-	93	41.361
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ENSACIG00000003515	-	93	40.000	ENSACIG00000013149	-	83	46.602
ENSACIG00000003515	-	99	42.291	ENSACIG00000004745	-	89	50.588
ENSACIG00000003515	-	98	44.103	ENSACIG00000009780	-	80	45.631
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ENSACIG00000003515	-	90	44.776	ENSACIG00000024444	-	92	43.011
ENSACIG00000003515	-	97	39.306	ENSACIG00000018404	-	82	39.306
ENSACIG00000003515	-	90	45.536	ENSACIG00000007464	-	65	44.056
ENSACIG00000003515	-	96	39.367	ENSACIG00000022330	-	90	45.882
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ENSACIG00000003515	-	98	44.167	ENSACIG00000011541	-	77	44.167
ENSACIG00000003515	-	91	45.263	ENSACIG00000007855	-	94	45.263
ENSACIG00000003515	-	88	49.558	ENSACIG00000010966	-	51	47.059
ENSACIG00000003515	-	99	46.774	ENSACIG00000000311	-	66	46.774
ENSACIG00000003515	-	98	39.024	ENSACIG00000006377	-	70	40.764
ENSACIG00000003515	-	85	51.064	ENSACIG00000013946	-	65	39.048
ENSACIG00000003515	-	93	42.135	ENSACIG00000021378	gfi1aa	52	42.135
ENSACIG00000003515	-	92	34.821	ENSACIG00000011516	-	80	34.821
ENSACIG00000003515	-	94	41.463	ENSACIG00000001369	-	86	41.494
ENSACIG00000003515	-	93	47.748	ENSACIG00000004641	-	59	47.748
ENSACIG00000003515	-	98	44.444	ENSACIG00000004626	-	87	45.977
ENSACIG00000003515	-	90	54.545	ENSACIG00000019407	sall3b	75	52.830
ENSACIG00000003515	-	83	54.386	ENSACIG00000017298	sall4	61	51.020
ENSACIG00000003515	-	93	36.041	ENSACIG00000023513	znf384l	51	34.810
ENSACIG00000003515	-	93	53.165	ENSACIG00000015429	-	85	53.165
ENSACIG00000003515	-	93	45.370	ENSACIG00000006755	-	87	45.370
ENSACIG00000003515	-	90	45.238	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	90	45.238
ENSACIG00000003515	-	98	39.322	ENSACIG00000019102	-	51	39.322
ENSACIG00000003515	-	86	41.748	ENSACIG00000007000	-	61	33.427
ENSACIG00000003515	-	93	44.643	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	89	44.248
ENSACIG00000003515	-	94	44.048	ENSACIG00000011515	-	80	48.810
ENSACIG00000003515	-	100	47.200	ENSACIG00000017050	-	96	46.429
ENSACIG00000003515	-	93	45.098	ENSACIG00000016117	-	92	37.173
ENSACIG00000003515	-	88	48.673	ENSACIG00000008448	-	82	42.661
ENSACIG00000003515	-	92	38.158	ENSACIG00000017166	-	95	38.776
ENSACIG00000003515	-	99	41.935	ENSACIG00000010739	-	82	41.935

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003515	-	93	43.182	ENSAPOG00000018480	-	73	43.182	Acanthochromis_polyacanthus
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