EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003556 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2259 bases
Position: chrCCOE01000533.1:137667-139925
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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Transcripts

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ENSACIT00000004835	-	1215	-	ENSACIP00000004689	404 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACIG00000003556	-	96	57.895	ENSACIG00000017647	-	99	56.274
ENSACIG00000003556	-	87	51.351	ENSACIG00000007464	-	85	50.806
ENSACIG00000003556	-	85	40.385	ENSACIG00000012604	scrt2	81	40.385

Orthologs

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ENSACIG00000003556	-	93	48.182	ENSAPOG00000023479	-	93	48.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	93	63.636	ENSAPOG00000001742	-	78	63.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	85	55.696	ENSAPOG00000000503	-	82	55.696	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	77	57.273	ENSAPOG00000006282	-	91	57.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	65	67.647	ENSAPOG00000022964	-	98	67.647	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	69	57.752	ENSAPOG00000021690	-	91	57.752	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	77	52.105	ENSAPOG00000020343	-	98	52.105	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	93	56.566	ENSAPOG00000002691	-	84	59.459	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	80	56.291	ENSAPOG00000005986	-	86	56.291	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	95	62.857	ENSAPOG00000001725	-	98	53.737	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	65	56.923	ENSAPOG00000004878	-	82	56.923	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	92	54.688	ENSAPOG00000007528	-	85	54.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	91	57.034	ENSAPOG00000013125	-	90	57.034	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	72	57.669	ENSAPOG00000007955	-	77	57.669	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003556	-	93	45.778	ENSAPOG00000014378	-	74	46.000	Acanthochromis_polyacanthus
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