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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003711 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17789 bases
Position: chrCCOE01001453.1:1886451-1904239
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000004765	IBN_N	PF03810.19	1.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000004915	-	2328	-	ENSACIP00000004765	775 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	85.992	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	85.992
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	86.494	ENSACIG00000009586	-	99	86.494

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSG00000083312	TNPO1	87	92.894	Homo_sapiens
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.450	ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	98.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	91.049	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.320	ENSAOCG00000008154	tnpo1	87	98.320	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.320	ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	98.320	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.804	ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.804	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003711	tnpo1	98	88.932	ENSAPLG00000009619	-	84	89.774	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.411	ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.411	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	60.941	ENSANAG00000027118	-	86	60.814	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	82.817	ENSANAG00000025351	-	86	82.817	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	ENSANAG00000022453	-	86	92.377	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.413	ENSACLG00000027223	tnpo1	87	97.413	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.557	ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.299	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSBTAG00000007979	TNPO1	86	93.023	Bos_taurus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.506	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.506	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	92.848	ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.848	Canis_familiaris
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	90.402	ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	90.181	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.894	Capra_hircus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	88.947	ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.610	Carlito_syrichta
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.377	Cebus_capucinus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSCATG00000043792	TNPO1	95	92.973	Cercocebus_atys
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.377	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	92.894	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	83.658	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.787	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.540	ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.540	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	75.871	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.124	Ciona_savignyi
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	92.894	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	93.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.234	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	86	93.234	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.995	ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.995	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.899	ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.899	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.935	ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.806	Danio_rerio
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	86.727	ENSDNOG00000006647	TNPO1	86	86.727	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000003711	tnpo1	92	93.137	ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	93.128	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	58.648	FBgn0035693	CG8219	86	58.127	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000003711	tnpo1	89	93.548	ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.548	Echinops_telfairi
ENSACIG00000003711	tnpo1	93	84.392	ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	84.116	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSEASG00005018055	TNPO1	87	92.894	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	92.894	Equus_caballus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	87.032	ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.725	Esox_lucius
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSFCAG00000013181	TNPO1	87	92.894	Felis_catus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.669	ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.669	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.506	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.506	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.774	ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.774	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.535	ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.535	Gadus_morhua
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.894	Gallus_gallus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.521	ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.521	Gambusia_affinis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.866	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.866	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.411	ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.411	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSGGOG00000026800	TNPO1	87	92.894	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	79.226	ENSGGOG00000022535	-	86	79.226	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.966	ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	98.966	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	ENSHGLG00000000970	-	86	92.377	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	92.432	ENSHGLG00100017090	-	86	92.432	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000003711	tnpo1	96	71.063	ENSHGLG00100000963	-	84	70.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	93.023	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.382	ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.382	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000003711	tnpo1	100	97.169	ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.169	Labrus_bergylta
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	90.848	ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.848	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	94.186	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	94.186	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	97	92.267	ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.267	Loxodonta_africana
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	92.894	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.857	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.857	Macaca_mulatta
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	92.894	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	92.894	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.062	ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	98.062	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.965	ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	98.965	Maylandia_zebra
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	88.760	ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.760	Microcebus_murinus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	93.023	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000003711	tnpo1	100	96.658	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.658	Mola_mola
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.402	ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.402	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.028	ENSMALG00000009782	tnpo1	87	97.028	Monopterus_albus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.152	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.765	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	92.894	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	92.463	ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.463	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.152	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	93.152	Nannospalax_galili
ENSACIG00000003711	tnpo1	100	99.226	ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	99.226	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSNLEG00000004572	TNPO1	87	92.894	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000003711	tnpo1	88	86.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.901	Ochotona_princeps
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.119	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	92.119	Octodon_degus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.329	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	98.329	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.775	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.775	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	85.811	ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.541	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.280	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.280	Oryzias_latipes
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.143	ENSORLG00020011559	tnpo1	87	97.143	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.017	ENSORLG00015019113	tnpo1	87	97.017	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.887	ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.887	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	92.894	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	ENSOARG00000005038	TNPO1	73	93.023	Ovis_aries
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	92.894	Pan_paniscus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSPPRG00000022336	TNPO1	87	92.894	Panthera_pardus
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	92.894	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000003711	tnpo1	93	82.044	ENSPTRG00000047731	-	90	82.044	Pan_troglodytes
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSPTRG00000016972	TNPO1	86	92.894	Pan_troglodytes
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	92.894	Papio_anubis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	89.664	ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	89.664	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.540	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.540	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.935	ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.806	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.234	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	93.234	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.765	ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.765	Pteropus_vampyrus
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