EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003888 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2509 bases
Position: chrCCOE01000079.1:32168-34676
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000004926	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005083	-	1596	-	ENSACIP00000004926	531 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003888	-	95	67.383	ENSACIG00000023726	-	96	67.383
ENSACIG00000003888	-	86	36.192	ENSACIG00000022228	-	79	35.417
ENSACIG00000003888	-	97	66.731	ENSACIG00000001022	-	97	66.731
ENSACIG00000003888	-	95	67.583	ENSACIG00000012148	-	94	67.387
ENSACIG00000003888	-	98	58.621	ENSACIG00000008246	-	93	58.621
ENSACIG00000003888	-	89	34.818	ENSACIG00000009923	-	79	34.615
ENSACIG00000003888	-	94	63.168	ENSACIG00000014898	-	95	62.500
ENSACIG00000003888	-	99	63.429	ENSACIG00000002240	-	99	63.429
ENSACIG00000003888	-	96	63.495	ENSACIG00000021449	-	95	63.495
ENSACIG00000003888	-	96	64.440	ENSACIG00000014973	-	96	64.440
ENSACIG00000003888	-	93	90.101	ENSACIG00000021882	-	93	89.919
ENSACIG00000003888	-	95	68.442	ENSACIG00000021889	-	92	68.442
ENSACIG00000003888	-	94	33.786	ENSACIG00000022269	-	86	33.786
ENSACIG00000003888	-	99	65.019	ENSACIG00000014982	-	99	65.019
ENSACIG00000003888	-	89	36.743	ENSACIG00000009814	-	86	36.743
ENSACIG00000003888	-	95	67.899	ENSACIG00000010569	-	95	67.510
ENSACIG00000003888	-	94	61.829	ENSACIG00000008585	-	98	61.829
ENSACIG00000003888	-	95	65.619	ENSACIG00000014961	-	92	65.619
ENSACIG00000003888	-	95	66.602	ENSACIG00000008256	-	95	66.602
ENSACIG00000003888	-	72	66.581	ENSACIG00000023712	-	97	66.581
ENSACIG00000003888	-	97	62.715	ENSACIG00000003168	-	97	62.715

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003888	-	83	35.526	ENSAPOG00000016636	-	90	36.184	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003888	-	96	60.659	ENSAPOG00000021040	-	86	60.659	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003888	-	96	60.156	ENSAPOG00000005749	-	94	59.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003888	-	97	61.359	ENSAPOG00000005726	-	95	61.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003888	-	93	61.694	ENSAPEG00000000062	-	92	61.694	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003888	-	94	65.070	ENSATEG00000019965	-	93	65.070	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003888	-	95	59.289	ENSATEG00000017635	-	93	59.136	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003888	-	93	64.777	ENSATEG00000023346	-	91	64.777	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003888	-	94	64.414	ENSATEG00000012558	-	93	64.414	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003888	-	95	69.781	ENSACLG00000009261	-	97	69.781	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	91	58.385	ENSACLG00000006543	-	88	58.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	94	34.834	ENSACLG00000023126	-	96	34.834	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	92	60.976	ENSACLG00000017259	-	94	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	85	63.889	ENSACLG00000006285	-	98	81.429	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	96	58.412	ENSACLG00000021761	-	97	58.412	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	95	63.889	ENSACLG00000006538	-	96	81.429	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	72	59.791	ENSACLG00000015361	-	94	59.791	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	93	33.333	ENSACLG00000023468	-	89	33.585	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	92	59.053	ENSACLG00000018599	-	93	58.230	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	93	58.635	ENSACLG00000010007	-	74	58.635	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	77	61.489	ENSACLG00000009330	-	80	67.470	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	95	58.929	ENSACLG00000018271	-	93	58.929	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	67	37.466	ENSACLG00000023033	-	92	37.466	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003888	-	96	39.179	ENSAMXG00000034407	-	96	38.951	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	92	45.850	ENSAMXG00000029346	-	95	46.512	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	93	33.205	ENSAMXG00000035937	-	93	32.458	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	97	39.155	ENSAMXG00000037920	-	96	40.763	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	94	38.160	ENSAMXG00000041770	-	93	38.160	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	91	42.449	ENSAMXG00000033407	-	93	42.653	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	93	50.685	ENSAMXG00000030535	-	94	50.685	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	92	41.165	ENSAMXG00000032695	-	94	40.583	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	94	31.309	ENSAMXG00000036353	-	90	31.638	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	94	41.650	ENSAMXG00000039672	-	98	41.165	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003888	-	96	55.962	ENSCVAG00000007256	-	97	55.962	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	97	55.985	ENSCVAG00000008134	-	97	54.221	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	97	62.062	ENSCVAG00000007803	-	98	62.062	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	99	57.845	ENSCVAG00000008146	-	98	57.089	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	95	61.660	ENSCVAG00000007269	-	95	61.660	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	96	56.836	ENSCVAG00000008127	-	96	56.641	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	97	55.146	ENSCVAG00000000224	-	87	55.146	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	90	65.063	ENSCVAG00000007831	-	92	65.063	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	97	61.047	ENSCVAG00000007794	-	98	61.047	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	63	56.973	ENSCVAG00000022676	-	99	56.973	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	91	52.236	ENSCVAG00000013384	-	99	52.439	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	93	33.594	ENSCVAG00000008633	-	94	33.789	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000003888	-	95	60.552	ENSCVAG00000009446	-	98	60.552	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003888	-	96	61.793	ENSCVAG00000004690	-	95	61.793	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000003888	-	85	33.619	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	82	33.619	Eptatretus_burgeri
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ENSACIG00000003888	-	98	59.434	ENSFHEG00000006403	-	98	59.434	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	95	54.617	ENSFHEG00000016342	-	98	54.617	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	95	59.881	ENSFHEG00000006430	-	97	59.881	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	97	53.668	ENSFHEG00000023034	-	99	53.668	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	91	34.851	ENSFHEG00000021963	-	92	34.851	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	96	60.196	ENSFHEG00000006385	-	94	59.020	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	97	58.607	ENSFHEG00000006411	-	96	57.640	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	94	59.082	ENSFHEG00000006425	-	97	58.882	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	93	53.693	ENSFHEG00000012343	-	97	53.693	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000003888	-	93	34.429	ENSGMOG00000019330	-	86	32.689	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	88	33.198	ENSGMOG00000019825	-	99	33.878	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	95	33.966	ENSGMOG00000017552	-	87	32.258	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	56	35.032	ENSGMOG00000019529	-	71	35.045	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	86	34.056	ENSGMOG00000008232	-	98	34.056	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	93	34.357	ENSGMOG00000005680	-	86	33.142	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	92	33.932	ENSGMOG00000011319	-	96	33.932	Gadus_morhua
ENSACIG00000003888	-	95	60.511	ENSGAFG00000005032	-	94	60.511	Gambusia_affinis
ENSACIG00000003888	-	95	59.082	ENSGAFG00000005023	-	94	58.812	Gambusia_affinis
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