EuRBPDB

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RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000003906 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 882 bases
Position: chrCCOE01000080.1:13503-14384
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000004934	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005093	-	882	-	ENSACIP00000004934	293 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000003906	-	69	32.886	ENSACIG00000005573	-	81	32.886
ENSACIG00000003906	-	68	34.123	ENSACIG00000023381	-	79	34.123
ENSACIG00000003906	-	68	36.493	ENSACIG00000002263	-	73	36.493
ENSACIG00000003906	-	67	30.476	ENSACIG00000014703	-	82	30.476
ENSACIG00000003906	-	66	33.810	ENSACIG00000016888	-	64	33.810
ENSACIG00000003906	-	54	34.884	ENSACIG00000012204	-	72	34.884
ENSACIG00000003906	-	66	30.693	ENSACIG00000004040	-	76	30.693
ENSACIG00000003906	-	68	31.527	ENSACIG00000020225	-	69	31.373
ENSACIG00000003906	-	55	30.675	ENSACIG00000016313	-	50	30.675
ENSACIG00000003906	-	65	32.338	ENSACIG00000005223	-	76	32.338
ENSACIG00000003906	-	67	33.010	ENSACIG00000016635	-	76	33.010
ENSACIG00000003906	-	57	33.140	ENSACIG00000012761	-	73	33.140
ENSACIG00000003906	-	66	37.864	ENSACIG00000022362	-	71	37.864
ENSACIG00000003906	-	67	31.604	ENSACIG00000014646	zgc:113625	78	31.604
ENSACIG00000003906	-	68	32.243	ENSACIG00000006478	-	76	32.243
ENSACIG00000003906	-	61	36.548	ENSACIG00000008001	-	79	36.458
ENSACIG00000003906	-	74	36.087	ENSACIG00000006503	-	71	36.087
ENSACIG00000003906	-	65	30.244	ENSACIG00000020244	-	83	30.244
ENSACIG00000003906	-	66	37.379	ENSACIG00000007466	-	60	37.379
ENSACIG00000003906	-	64	34.737	ENSACIG00000007158	-	58	34.737
ENSACIG00000003906	-	67	36.232	ENSACIG00000001596	-	80	36.232
ENSACIG00000003906	-	72	37.168	ENSACIG00000003582	-	72	37.611
ENSACIG00000003906	-	71	32.273	ENSACIG00000012707	-	81	32.273
ENSACIG00000003906	-	66	37.624	ENSACIG00000004245	-	70	37.624
ENSACIG00000003906	-	67	31.500	ENSACIG00000000893	-	79	31.500
ENSACIG00000003906	-	69	30.047	ENSACIG00000020234	-	72	30.047
ENSACIG00000003906	-	70	30.374	ENSACIG00000014662	-	85	30.374
ENSACIG00000003906	-	66	30.769	ENSACIG00000014745	-	89	30.769
ENSACIG00000003906	-	66	38.614	ENSACIG00000001070	-	70	38.614
ENSACIG00000003906	-	66	32.353	ENSACIG00000022355	-	68	32.353
ENSACIG00000003906	-	64	33.668	ENSACIG00000007178	-	68	33.668
ENSACIG00000003906	-	66	31.731	ENSACIG00000014634	zgc:113625	85	30.667
ENSACIG00000003906	-	54	32.919	ENSACIG00000000976	-	79	32.919
ENSACIG00000003906	-	67	35.437	ENSACIG00000022366	-	71	35.922
ENSACIG00000003906	-	67	33.333	ENSACIG00000006484	-	62	33.333
ENSACIG00000003906	-	78	35.146	ENSACIG00000001455	-	81	35.146
ENSACIG00000003906	-	66	32.673	ENSACIG00000012648	-	66	32.673
ENSACIG00000003906	-	70	31.839	ENSACIG00000014680	-	90	31.839
ENSACIG00000003906	-	71	30.275	ENSACIG00000019524	-	88	30.275
ENSACIG00000003906	-	68	35.714	ENSACIG00000007494	-	66	35.714
ENSACIG00000003906	-	67	33.654	ENSACIG00000002950	-	54	33.654
ENSACIG00000003906	-	68	36.842	ENSACIG00000008045	-	78	37.441
ENSACIG00000003906	-	72	31.364	ENSACIG00000012718	-	90	31.364
ENSACIG00000003906	-	69	33.333	ENSACIG00000012714	-	68	33.333
ENSACIG00000003906	-	55	34.756	ENSACIG00000022374	-	82	34.756
ENSACIG00000003906	-	67	35.266	ENSACIG00000022377	-	72	35.749
ENSACIG00000003906	-	66	39.901	ENSACIG00000022370	-	70	39.901
ENSACIG00000003906	-	69	32.558	ENSACIG00000014655	-	77	32.558
ENSACIG00000003906	-	53	39.877	ENSACIG00000008666	-	79	39.877
ENSACIG00000003906	-	67	33.493	ENSACIG00000007191	-	56	33.493

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000003906	-	62	34.896	ENSAPOG00000018915	-	81	34.896	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	67	37.019	ENSAPOG00000008529	-	77	37.019	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	68	31.944	ENSAPOG00000000066	-	57	31.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	62	31.250	ENSAPOG00000010738	-	61	31.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	62	30.928	ENSAPOG00000007123	-	70	30.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	68	32.692	ENSAPOG00000021365	-	66	32.692	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	60	31.771	ENSAPOG00000020108	-	53	33.673	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000003906	-	69	30.660	ENSAOCG00000015984	-	67	30.660	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000003906	-	70	30.275	ENSAPEG00000003513	-	86	32.031	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003906	-	72	30.172	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	78	30.622	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003906	-	70	30.556	ENSAPEG00000019003	-	81	30.556	Amphiprion_percula
ENSACIG00000003906	-	67	32.850	ENSATEG00000011931	-	58	32.850	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	62	33.871	ENSATEG00000011594	-	75	33.871	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	66	31.707	ENSATEG00000011814	-	64	31.707	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	67	31.884	ENSATEG00000011918	-	67	31.884	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	67	31.429	ENSATEG00000011789	-	61	31.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	67	34.135	ENSATEG00000017209	-	75	34.135	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	76	33.562	ENSATEG00000011635	-	60	31.020	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	62	33.854	ENSATEG00000011820	-	68	33.854	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	67	30.846	ENSATEG00000011837	-	62	30.653	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	65	32.338	ENSATEG00000011979	-	91	32.338	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	69	30.841	ENSATEG00000011720	-	75	30.841	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	74	32.314	ENSATEG00000011712	-	84	32.314	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	67	32.850	ENSATEG00000011953	-	56	32.850	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	57	32.544	ENSATEG00000012017	-	69	32.544	Anabas_testudineus
ENSACIG00000003906	-	61	32.461	ENSACLG00000005319	-	86	32.461	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	62	31.414	ENSACLG00000004543	-	78	31.414	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	66	33.659	ENSACLG00000005659	-	65	33.659	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	88	59.846	ENSACLG00000016272	-	100	59.846	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	66	31.068	ENSACLG00000011905	-	78	31.068	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	66	33.659	ENSACLG00000005232	-	81	31.481	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	85	61.694	ENSACLG00000016327	-	97	61.694	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	68	30.374	ENSACLG00000016235	-	57	30.374	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000003906	-	66	33.846	ENSAMXG00000042848	-	89	33.831	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	34.466	ENSAMXG00000015575	-	63	34.634	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	50	32.653	ENSAMXG00000039994	-	54	34.351	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	70	33.161	ENSAMXG00000038580	-	59	33.161	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	56	30.120	ENSAMXG00000040863	-	53	30.120	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	68	33.182	ENSAMXG00000031962	-	70	33.182	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	33.654	ENSAMXG00000013452	-	58	33.019	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	65	33.668	ENSAMXG00000013450	-	54	33.668	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	31.527	ENSAMXG00000029731	-	70	31.683	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	61	32.275	ENSAMXG00000035925	-	83	32.275	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	33.171	ENSAMXG00000037798	-	63	33.171	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	33.663	ENSAMXG00000030159	-	57	33.663	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	67	32.683	ENSAMXG00000013799	-	65	33.158	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	67	31.863	ENSAMXG00000030472	-	85	31.863	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	63	31.606	ENSAMXG00000033190	-	70	31.606	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	66	33.010	ENSAMXG00000032381	-	55	33.498	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	63	33.793	ENSAMXG00000036317	-	76	33.793	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	50	33.333	ENSAMXG00000031181	-	54	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000003906	-	68	31.797	ENSCSEG00000006826	-	57	31.797	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000003906	-	62	33.333	ENSCVAG00000018895	-	87	33.333	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	67	31.553	ENSCVAG00000003277	-	94	31.553	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	68	30.622	ENSCVAG00000000429	-	64	30.622	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	62	32.821	ENSCVAG00000004881	-	61	33.019	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	61	30.102	ENSCVAG00000009295	-	77	30.102	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	66	31.373	ENSCVAG00000001601	-	77	31.373	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	61	30.526	ENSCVAG00000005473	-	67	30.526	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	61	31.282	ENSCVAG00000007737	-	83	31.282	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	62	32.461	ENSCVAG00000018769	-	83	32.461	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	58	32.402	ENSCVAG00000004890	-	72	32.402	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	59	33.333	ENSCVAG00000013717	-	83	33.333	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	68	30.622	ENSCVAG00000014872	-	87	30.622	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	64	31.156	ENSCVAG00000009387	-	59	31.156	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	66	31.863	ENSCVAG00000001617	-	82	31.863	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	66	32.353	ENSCVAG00000005487	-	59	32.353	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	65	33.333	ENSCVAG00000007827	-	74	33.333	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000003906	-	68	30.144	ENSDARG00000111949	BX005442.2	65	30.144	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	60	34.031	ENSDARG00000088906	CABZ01059403.1	92	34.031	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	68	31.100	ENSDARG00000112755	CR394546.4	80	31.100	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	68	31.100	ENSDARG00000035088	si:ch211-254c8.3	87	30.928	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	68	30.918	ENSDARG00000052876	CR933791.2	59	30.918	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	62	33.051	ENSDARG00000063108	CABZ01059392.1	60	33.051	Danio_rerio
ENSACIG00000003906	-	66	31.188	ENSELUG00000007627	si:ch211-254c8.3	71	31.188	Esox_lucius
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ENSACIG00000003906	-	67	30.000	ENSELUG00000008582	-	54	30.000	Esox_lucius
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