EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004040 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5094 bases
Position: chrCCOE01001419.1:240136-245229
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005101	MMR_HSR1	PF01926.23	8.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005263	-	759	-	ENSACIP00000005101	252 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004040	-	82	52.153	ENSACIG00000001455	-	77	52.153
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ENSACIG00000004040	-	83	52.153	ENSACIG00000001070	-	75	52.153
ENSACIG00000004040	-	81	38.140	ENSACIG00000005587	-	75	38.140
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ENSACIG00000004040	-	77	37.379	ENSACIG00000012061	-	62	37.198
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ENSACIG00000004040	-	82	52.381	ENSACIG00000023381	-	83	52.381
ENSACIG00000004040	-	82	51.923	ENSACIG00000004245	-	74	51.923
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ENSACIG00000004040	-	85	44.292	ENSACIG00000014662	-	89	44.292
ENSACIG00000004040	-	67	37.209	ENSACIG00000007737	-	66	36.994
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ENSACIG00000004040	-	77	46.231	ENSACIG00000014703	-	82	46.231
ENSACIG00000004040	-	87	43.043	ENSACIG00000019149	-	68	43.805
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ENSACIG00000004040	-	95	44.130	ENSACIG00000016888	-	81	44.130
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ENSACIG00000004040	-	94	45.902	ENSACIG00000007466	-	97	45.902
ENSACIG00000004040	-	83	48.837	ENSACIG00000012648	-	72	48.837
ENSACIG00000004040	-	81	49.524	ENSACIG00000008045	-	78	50.244
ENSACIG00000004040	-	68	45.402	ENSACIG00000000631	-	73	43.333
ENSACIG00000004040	-	83	47.887	ENSACIG00000008001	-	89	46.341
ENSACIG00000004040	-	61	44.937	ENSACIG00000012761	-	69	44.937
ENSACIG00000004040	-	83	53.081	ENSACIG00000022370	-	76	53.081
ENSACIG00000004040	-	82	53.365	ENSACIG00000022377	-	76	53.365
ENSACIG00000004040	-	78	48.241	ENSACIG00000020225	-	84	43.426
ENSACIG00000004040	-	78	44.724	ENSACIG00000007178	-	69	44.724
ENSACIG00000004040	-	74	44.444	ENSACIG00000001596	-	75	44.444
ENSACIG00000004040	-	80	46.535	ENSACIG00000014690	-	78	46.535
ENSACIG00000004040	-	83	45.581	ENSACIG00000022355	-	74	45.581
ENSACIG00000004040	-	77	45.771	ENSACIG00000006478	-	74	45.771
ENSACIG00000004040	-	84	45.413	ENSACIG00000005780	-	66	45.413
ENSACIG00000004040	-	79	43.069	ENSACIG00000014646	zgc:113625	79	43.069
ENSACIG00000004040	-	87	39.485	ENSACIG00000012714	-	77	39.485
ENSACIG00000004040	-	87	40.090	ENSACIG00000012718	-	86	46.341
ENSACIG00000004040	-	81	46.860	ENSACIG00000014716	-	83	46.860
ENSACIG00000004040	-	70	43.956	ENSACIG00000005223	-	70	43.956
ENSACIG00000004040	-	82	50.481	ENSACIG00000022362	-	75	50.481
ENSACIG00000004040	-	82	53.365	ENSACIG00000022366	-	76	53.365
ENSACIG00000004040	-	86	46.575	ENSACIG00000016313	-	69	46.575
ENSACIG00000004040	-	77	46.154	ENSACIG00000019524	-	82	46.154
ENSACIG00000004040	-	84	42.523	ENSACIG00000016502	-	92	42.523
ENSACIG00000004040	-	77	45.960	ENSACIG00000014745	-	90	45.960
ENSACIG00000004040	-	61	74.675	ENSACIG00000000976	-	77	74.675
ENSACIG00000004040	-	72	36.139	ENSACIG00000009149	-	69	36.139
ENSACIG00000004040	-	74	48.128	ENSACIG00000007158	-	61	48.128
ENSACIG00000004040	-	83	47.442	ENSACIG00000016635	-	81	47.442
ENSACIG00000004040	-	70	34.807	ENSACIG00000014670	-	70	34.807
ENSACIG00000004040	-	81	33.810	ENSACIG00000007725	-	74	33.810
ENSACIG00000004040	-	78	48.485	ENSACIG00000020234	-	70	48.485
ENSACIG00000004040	-	69	38.798	ENSACIG00000014737	-	85	38.798
ENSACIG00000004040	-	62	32.317	ENSACIG00000014730	zgc:172131	81	32.317
ENSACIG00000004040	-	76	30.693	ENSACIG00000003906	-	66	30.693
ENSACIG00000004040	-	73	44.624	ENSACIG00000015088	-	74	44.624
ENSACIG00000004040	-	80	43.689	ENSACIG00000014680	-	89	43.689
ENSACIG00000004040	-	85	33.953	ENSACIG00000003050	-	95	33.953
ENSACIG00000004040	-	82	50.239	ENSACIG00000003582	-	68	50.000
ENSACIG00000004040	-	87	50.000	ENSACIG00000022222	-	71	50.000
ENSACIG00000004040	-	71	33.516	ENSACIG00000019509	-	84	33.516
ENSACIG00000004040	-	81	73.171	ENSACIG00000000893	-	83	73.171

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004040	-	82	61.650	ENSAPOG00000020897	-	84	60.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	80	66.337	ENSAPOG00000011509	-	75	64.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	71	50.556	ENSAPOG00000001262	-	87	50.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	84	47.393	ENSAPOG00000001268	-	52	47.393	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	84	48.341	ENSAPOG00000014759	-	71	48.341	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	78	48.744	ENSAPOG00000007333	-	62	48.357	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	81	66.667	ENSAPOG00000006488	-	86	65.297	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	76	51.031	ENSAPOG00000022240	-	56	51.031	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	81	66.667	ENSAPOG00000006169	-	62	65.297	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	85	50.698	ENSAPOG00000012716	-	72	50.698	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	82	53.589	ENSAPOG00000021159	-	68	53.589	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	92	43.162	ENSAPOG00000007322	-	75	43.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	80	45.146	ENSAPOG00000014243	-	85	45.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	81	45.673	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	45.673	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	84	44.393	ENSAPOG00000001315	-	66	44.393	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	85	53.953	ENSAPOG00000008063	-	69	53.953	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004040	-	85	39.352	ENSAOCG00000011794	-	65	39.352	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	87	67.123	ENSAOCG00000023240	-	81	67.123	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	83	55.024	ENSAOCG00000014702	-	69	55.024	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	92	43.404	ENSAOCG00000011167	-	72	43.404	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	83	49.048	ENSAOCG00000021905	-	64	49.048	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	78	45.000	ENSAOCG00000012651	-	88	46.009	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	75	51.053	ENSAOCG00000001993	-	80	49.275	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	87	67.580	ENSAOCG00000023255	-	78	67.580	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	78	49.246	ENSAOCG00000011155	-	62	48.826	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	87	66.667	ENSAOCG00000008522	-	73	66.667	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	84	70.755	ENSAOCG00000008525	-	62	70.755	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004040	-	87	68.493	ENSAPEG00000004217	-	76	68.493	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	92	42.979	ENSAPEG00000012179	-	75	42.979	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	85	39.352	ENSAPEG00000000770	-	65	39.352	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	83	49.048	ENSAPEG00000015763	-	70	49.048	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	91	40.000	ENSAPEG00000013651	-	92	40.000	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004040	-	82	50.239	ENSAPEG00000022382	-	71	50.239	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	77	48.731	ENSAPEG00000022386	-	74	48.731	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004040	-	75	51.579	ENSAPEG00000016554	-	79	49.758	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	83	55.024	ENSAPEG00000016533	-	70	55.024	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004040	-	80	48.529	ENSAPEG00000012191	-	70	48.529	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004040	-	81	40.196	ENSATEG00000020391	-	84	40.196	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	84	57.346	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	80	49.761	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	77	46.193	ENSATEG00000017202	-	57	46.009	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	77	42.268	ENSATEG00000020431	zgc:113625	77	42.268	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	84	43.925	ENSATEG00000005844	-	63	43.925	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	80	48.276	ENSATEG00000017198	-	69	48.276	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	78	47.739	ENSATEG00000017193	-	62	47.418	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	82	50.704	ENSATEG00000014028	-	74	49.390	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	75	43.455	ENSATEG00000016536	-	58	43.455	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	83	46.667	ENSATEG00000014085	-	71	47.143	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	84	75.943	ENSATEG00000019003	-	81	75.943	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004040	-	76	46.154	ENSACLG00000023525	-	67	46.154	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000004040	-	81	52.657	ENSACLG00000025976	-	66	52.358	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004040	-	92	46.502	ENSACLG00000001976	-	85	46.502	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004040	-	77	47.716	ENSACLG00000021959	-	67	46.479	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004040	-	84	51.852	ENSACLG00000016933	-	73	51.852	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004040	-	52	51.095	ENSACLG00000003287	-	70	51.095	Astatotilapia_calliptera
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