EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004041 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7279 bases
Position: chrCCOE01000533.1:220301-227579
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000005757	zf-C2H2	PF00096.26	5.7e-55	10	10
ENSACIP00000005571	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-51	1	9
ENSACIP00000005571	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-51	2	9
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ENSACIP00000005571	zf-C2H2	PF00096.26	6.9e-51	9	9
ENSACIP00000005682	zf-met	PF12874.7	4.7e-24	1	3
ENSACIP00000005682	zf-met	PF12874.7	4.7e-24	2	3
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ENSACIP00000005850	zf-met	PF12874.7	5.7e-22	1	3
ENSACIP00000005850	zf-met	PF12874.7	5.7e-22	2	3
ENSACIP00000005850	zf-met	PF12874.7	5.7e-22	3	3
ENSACIP00000005571	zf-met	PF12874.7	2.3e-15	1	1
ENSACIP00000005757	zf-met	PF12874.7	3.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSACIT00000005739	-	1308	-	ENSACIP00000005571	435 (aa)	-	-
ENSACIT00000005934	-	1317	-	ENSACIP00000005757	438 (aa)	-	-
ENSACIT00000005858	-	1482	-	ENSACIP00000005682	493 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004041	-	97	53.293	ENSACIG00000019710	-	93	53.293
ENSACIG00000004041	-	99	51.538	ENSACIG00000022625	-	99	53.000
ENSACIG00000004041	-	91	44.444	ENSACIG00000017653	-	97	44.255
ENSACIG00000004041	-	99	70.391	ENSACIG00000000311	-	77	76.000
ENSACIG00000004041	-	96	59.633	ENSACIG00000008448	-	98	58.559
ENSACIG00000004041	-	96	60.199	ENSACIG00000003754	-	94	59.701
ENSACIG00000004041	-	90	51.240	ENSACIG00000004641	-	70	51.449
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ENSACIG00000004041	-	92	53.435	ENSACIG00000010637	-	97	52.308
ENSACIG00000004041	-	98	61.508	ENSACIG00000010966	-	74	58.333
ENSACIG00000004041	-	90	48.750	ENSACIG00000006228	-	99	46.957
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ENSACIG00000004041	-	94	44.167	ENSACIG00000007855	-	93	54.054
ENSACIG00000004041	-	97	58.261	ENSACIG00000018059	-	88	58.261
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ENSACIG00000004041	-	95	52.105	ENSACIG00000022738	-	94	53.684
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ENSACIG00000004041	-	98	61.290	ENSACIG00000017050	-	99	59.664
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ENSACIG00000004041	-	99	41.370	ENSACIG00000016117	-	89	41.370
ENSACIG00000004041	-	94	43.014	ENSACIG00000017644	-	89	43.014
ENSACIG00000004041	-	98	62.637	ENSACIG00000017647	-	92	64.032
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