EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004208 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: fdxacb1
Alias: fb11b09|si:dkey-71l1.3|wu:fb11b09
Full Name: ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3617 bases
Position: chrCCOE01001132.1:1314057-1317673
Accession: ZDB-GENE-030131-8403
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005337	FDX-ACB	PF03147.14	4.6e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005502	-	1776	-	ENSACIP00000005337	591 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.349	ENSG00000255561	FDXACB1	99	36.236	Homo_sapiens
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	73.396	ENSAPOG00000009041	FDXACB1	100	73.396	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	73.396	ENSAPOG00000009726	fdxacb1	100	73.396	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	72.926	ENSAOCG00000007455	fdxacb1	100	72.926	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	72.926	ENSAPEG00000023857	fdxacb1	100	72.926	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	69.231	ENSATEG00000020757	fdxacb1	100	69.231	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.193	ENSAPLG00000004681	FDXACB1	100	36.207	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.728	ENSANAG00000022744	FDXACB1	100	36.378	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	82.160	ENSACLG00000027415	-	100	82.160	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	82.160	ENSACLG00000020497	fdxacb1	100	82.160	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	45.875	ENSAMXG00000038372	fdxacb1	100	45.875	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.312	ENSBTAG00000004949	FDXACB1	100	34.898	Bos_taurus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.687	ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.997	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.693	ENSCAFG00020006314	FDXACB1	99	36.535	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.433	ENSCHIG00000017261	FDXACB1	100	34.851	Capra_hircus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.681	ENSTSYG00000029218	FDXACB1	100	36.012	Carlito_syrichta
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	37.363	ENSCPOG00000032584	FDXACB1	99	36.520	Cavia_porcellus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.747	ENSCCAG00000024232	FDXACB1	100	35.858	Cebus_capucinus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.547	ENSCATG00000035600	FDXACB1	99	36.589	Cercocebus_atys
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	36.434	ENSCLAG00000015613	FDXACB1	100	35.294	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.661	ENSCSAG00000002878	FDXACB1	99	36.703	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	35.423	ENSCHOG00000003037	FDXACB1	99	35.703	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.596	ENSCPBG00000009087	FDXACB1	81	41.707	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	37.129	ENSCANG00000043844	FDXACB1	99	36.842	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	34.992	ENSCGRG00001023825	Fdxacb1	97	34.526	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	34.992	ENSCGRG00000001752	Fdxacb1	97	34.526	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	64.735	ENSCSEG00000006964	fdxacb1	100	64.735	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	65.561	ENSCVAG00000013005	fdxacb1	100	65.561	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	48.435	ENSDARG00000095750	fdxacb1	100	48.435	Danio_rerio
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	34.562	ENSDNOG00000037748	FDXACB1	100	34.255	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.285	ENSDORG00000028060	Fdxacb1	100	35.131	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	37.520	ENSETEG00000004898	FDXACB1	99	37.520	Echinops_telfairi
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.294	ENSEASG00005007198	FDXACB1	100	35.139	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.703	ENSECAG00000009561	FDXACB1	100	35.549	Equus_caballus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	80	51.402	ENSEEUG00000009839	FDXACB1	81	51.402	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	48.397	ENSELUG00000011250	fdxacb1	99	48.780	Esox_lucius
ENSACIG00000004208	fdxacb1	96	37.660	ENSFCAG00000024559	FDXACB1	100	36.518	Felis_catus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	36.223	ENSFALG00000006177	FDXACB1	99	36.025	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.870	ENSFDAG00000016115	FDXACB1	100	35.039	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	65.981	ENSFHEG00000016602	fdxacb1	100	65.981	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	35.394	ENSGALG00000007967	FDXACB1	99	34.003	Gallus_gallus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.289	ENSGAFG00000001162	fdxacb1	95	68.289	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.700	ENSGACG00000020639	fdxacb1	99	68.700	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	34.862	ENSGAGG00000020645	FDXACB1	79	41.320	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.901	ENSGGOG00000037643	FDXACB1	99	36.349	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	81.690	ENSHBUG00000003489	fdxacb1	100	81.690	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.503	ENSHGLG00000004171	FDXACB1	100	36.252	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.503	ENSHGLG00100017458	FDXACB1	100	36.252	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	62.267	ENSHCOG00000018986	fdxacb1	100	62.267	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	45.799	ENSIPUG00000022559	FDXACB1	100	45.964	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.994	ENSJJAG00000010367	Fdxacb1	100	36.421	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	69.408	ENSKMAG00000022235	fdxacb1	100	69.408	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.217	ENSLBEG00000016100	fdxacb1	100	68.372	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004208	fdxacb1	88	54.128	ENSLACG00000018780	FDXACB1	100	54.128	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.620	ENSLAFG00000014650	FDXACB1	99	36.449	Loxodonta_africana
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.817	ENSMFAG00000002448	FDXACB1	99	36.858	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.817	ENSMNEG00000041539	FDXACB1	99	36.858	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	69.678	ENSMAMG00000018674	fdxacb1	99	69.678	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.453	ENSMAUG00000019310	Fdxacb1	100	35.759	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	37.072	ENSMICG00000045510	FDXACB1	99	36.434	Microcebus_murinus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.491	ENSMOCG00000011835	Fdxacb1	100	35.870	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	70.667	ENSMMOG00000018749	fdxacb1	100	70.667	Mola_mola
ENSACIG00000004208	fdxacb1	74	81.545	ENSMALG00000007153	fdxacb1	90	81.545	Monopterus_albus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	34.675	MGP_CAROLIEiJ_G0032197	Fdxacb1	100	34.365	Mus_caroli
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	35.039	ENSMUSG00000037845	Fdxacb1	99	34.729	Mus_musculus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.814	MGP_PahariEiJ_G0015065	Fdxacb1	100	35.194	Mus_pahari
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	36.068	MGP_SPRETEiJ_G0033336	Fdxacb1	99	35.759	Mus_spretus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.770	ENSMPUG00000003585	FDXACB1	100	35.514	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.449	ENSMLUG00000014872	FDXACB1	99	36.279	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.023	ENSNGAG00000014606	Fdxacb1	100	34.361	Nannospalax_galili
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	84.343	ENSNBRG00000006939	fdxacb1	100	84.343	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.491	ENSNLEG00000030387	FDXACB1	99	36.491	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	36.392	ENSMEUG00000003077	FDXACB1	99	36.081	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	34.748	ENSOPRG00000012593	FDXACB1	99	34.277	Ochotona_princeps
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	35.913	ENSODEG00000010360	FDXACB1	99	35.826	Octodon_degus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	82.979	ENSONIG00000004939	fdxacb1	100	82.979	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.220	ENSOANG00000003844	-	99	34.748	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	55.940	ENSORLG00020008420	fdxacb1	100	55.940	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	63.799	ENSOMEG00000019353	fdxacb1	100	63.166	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.692	ENSOARG00000015064	FDXACB1	99	35.118	Ovis_aries
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.349	ENSPPAG00000030196	FDXACB1	99	36.349	Pan_paniscus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	96	37.981	ENSPPRG00000005967	FDXACB1	100	36.826	Panthera_pardus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	37.134	ENSPTIG00000016420	FDXACB1	100	36.826	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.349	ENSPTRG00000004272	FDXACB1	99	36.349	Pan_troglodytes
ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.661	ENSPANG00000019268	FDXACB1	99	36.703	Papio_anubis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	47.579	ENSPKIG00000009407	fdxacb1	100	47.579	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000004208	fdxacb1	85	75.725	ENSPMGG00000004912	fdxacb1	97	75.725	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	35.816	ENSPEMG00000020188	Fdxacb1	100	36.262	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.671	ENSPFOG00000022156	fdxacb1	100	68.671	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.987	ENSPLAG00000019966	fdxacb1	100	68.987	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	68.671	ENSPMEG00000002110	fdxacb1	100	68.671	Poecilia_mexicana
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ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.392	ENSPCAG00000000333	FDXACB1	99	36.434	Procavia_capensis
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.703	ENSPCOG00000027443	FDXACB1	100	36.703	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000004208	fdxacb1	99	34.884	ENSPVAG00000009610	FDXACB1	99	34.729	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	81.690	ENSPNYG00000012981	fdxacb1	100	81.690	Pundamilia_nyererei
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ENSACIG00000004208	fdxacb1	88	46.847	ENSRNOG00000010743	Fdxacb1	97	46.957	Rattus_norvegicus
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ENSACIG00000004208	fdxacb1	98	36.661	ENSRROG00000045453	FDXACB1	99	36.703	Rhinopithecus_roxellana
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