EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004245 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2648 bases
Position: chrCCOE01001187.1:5277-7924
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005368	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-09	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000005533	-	843	-	ENSACIP00000005368	280 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004245	-	74	43.662	ENSACIG00000020244	-	90	43.662
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ENSACIG00000004245	-	74	50.000	ENSACIG00000016635	-	80	50.000
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ENSACIG00000004245	-	64	40.217	ENSACIG00000014670	-	71	40.217
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ENSACIG00000004245	-	90	59.055	ENSACIG00000007466	-	91	61.088
ENSACIG00000004245	-	72	50.732	ENSACIG00000012718	-	86	50.732
ENSACIG00000004245	-	80	39.485	ENSACIG00000012714	-	78	39.485
ENSACIG00000004245	-	72	46.078	ENSACIG00000014716	-	82	46.078
ENSACIG00000004245	-	86	30.451	ENSACIG00000009149	-	72	33.649
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ENSACIG00000004245	-	75	48.585	ENSACIG00000000893	-	86	48.585
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ENSACIG00000004245	-	85	60.338	ENSACIG00000022377	-	90	59.184
ENSACIG00000004245	-	57	51.235	ENSACIG00000022374	-	83	51.235
ENSACIG00000004245	-	91	58.984	ENSACIG00000022370	-	84	61.966
ENSACIG00000004245	-	93	56.716	ENSACIG00000007494	-	89	56.985
ENSACIG00000004245	-	56	50.000	ENSACIG00000012761	-	70	50.000
ENSACIG00000004245	-	89	87.903	ENSACIG00000001070	-	87	88.382
ENSACIG00000004245	-	73	41.176	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	41.176
ENSACIG00000004245	-	81	57.895	ENSACIG00000008001	-	90	59.809
ENSACIG00000004245	-	64	42.222	ENSACIG00000000631	-	63	42.222
ENSACIG00000004245	-	74	50.476	ENSACIG00000012648	-	71	50.476
ENSACIG00000004245	-	68	43.229	ENSACIG00000012159	-	50	43.229
ENSACIG00000004245	-	71	46.500	ENSACIG00000019524	-	84	46.500
ENSACIG00000004245	-	65	46.448	ENSACIG00000015088	-	73	46.448
ENSACIG00000004245	-	79	47.345	ENSACIG00000006484	-	69	47.345
ENSACIG00000004245	-	66	58.289	ENSACIG00000001596	-	74	58.289
ENSACIG00000004245	-	72	44.608	ENSACIG00000020225	-	92	40.892
ENSACIG00000004245	-	83	67.094	ENSACIG00000002263	-	87	65.560
ENSACIG00000004245	-	62	32.386	ENSACIG00000019509	-	81	32.386
ENSACIG00000004245	-	69	43.590	ENSACIG00000014634	zgc:113625	79	43.147
ENSACIG00000004245	-	80	38.667	ENSACIG00000016502	-	97	38.667
ENSACIG00000004245	-	71	44.000	ENSACIG00000014703	-	83	44.000
ENSACIG00000004245	-	89	62.151	ENSACIG00000003582	-	77	63.866
ENSACIG00000004245	-	74	51.923	ENSACIG00000004040	-	82	51.923
ENSACIG00000004245	-	74	45.933	ENSACIG00000014662	-	85	45.933
ENSACIG00000004245	-	56	49.045	ENSACIG00000000976	-	78	49.045

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004245	-	96	43.960	ENSAPOG00000014759	-	98	43.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	87	41.241	ENSAPOG00000001268	-	67	41.603	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	65	51.099	ENSAPOG00000001262	-	87	51.099	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	79	50.000	ENSAPOG00000006177	-	50	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	85	60.504	ENSAPOG00000012716	-	80	60.504	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	74	53.623	ENSAPOG00000006488	-	92	50.211	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	69	44.388	ENSAPOG00000022240	-	57	44.388	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	71	44.059	ENSAPOG00000007333	-	64	42.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	85	41.909	ENSAPOG00000014243	-	97	41.949	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	74	49.758	ENSAPOG00000020897	-	84	48.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	74	53.623	ENSAPOG00000006169	-	66	50.211	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	80	42.920	ENSAPOG00000001315	-	69	42.920	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	73	53.202	ENSAPOG00000011509	-	80	49.785	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	85	42.149	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	85	42.149	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	93	59.004	ENSAPOG00000021159	-	79	61.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	95	57.519	ENSAPOG00000008063	-	83	57.519	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004245	-	74	45.192	ENSAPOG00000007322	-	71	45.631	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000004245	-	78	52.055	ENSAOCG00000023240	-	81	52.055	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	84	52.119	ENSAOCG00000008525	-	69	52.119	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	71	44.059	ENSAOCG00000011155	-	64	42.727	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	81	50.000	ENSAOCG00000021905	-	69	50.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	78	52.968	ENSAOCG00000023255	-	78	52.968	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	69	50.521	ENSAOCG00000001993	-	86	48.430	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	74	43.750	ENSAOCG00000011167	-	68	44.175	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	83	48.855	ENSAOCG00000014702	-	87	48.855	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	78	53.881	ENSAOCG00000008522	-	72	53.881	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	71	42.574	ENSAOCG00000012651	-	86	42.927	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004245	-	72	40.196	ENSAPEG00000013651	-	80	40.196	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004245	-	71	43.564	ENSAPEG00000012184	-	64	42.273	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004245	-	74	43.750	ENSAPEG00000012179	-	71	44.175	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004245	-	83	48.855	ENSAPEG00000016533	-	88	48.855	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004245	-	93	50.575	ENSAPEG00000003884	-	73	55.556	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004245	-	71	50.251	ENSAPEG00000016554	-	87	48.261	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000004245	-	97	56.228	ENSATEG00000013008	-	88	57.519	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	75	51.429	ENSATEG00000019003	-	80	51.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	72	45.771	ENSATEG00000020431	zgc:113625	79	45.771	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	87	48.708	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	88	48.123	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	80	40.265	ENSATEG00000005844	-	67	40.265	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	69	57.436	ENSATEG00000016536	-	59	57.436	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000004245	-	71	44.059	ENSATEG00000017193	-	66	43.421	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	72	45.274	ENSATEG00000020391	-	83	45.274	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004245	-	83	61.638	ENSATEG00000014085	-	79	62.500	Anabas_testudineus
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