EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004426 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4324 bases
Position: chrCCOE01000409.1:381382-385705
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005611	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005781	-	867	-	ENSACIP00000005611	288 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004426	-	90	82.443	ENSACIG00000015616	-	99	79.401
ENSACIG00000004426	-	90	34.601	ENSACIG00000018021	zgc:153654	59	34.601
ENSACIG00000004426	-	89	83.462	ENSACIG00000015684	-	93	83.462
ENSACIG00000004426	-	91	75.094	ENSACIG00000004501	-	92	75.094
ENSACIG00000004426	-	89	78.039	ENSACIG00000004521	-	91	78.039
ENSACIG00000004426	-	97	72.535	ENSACIG00000004408	-	97	72.535
ENSACIG00000004426	-	84	45.749	ENSACIG00000015237	-	92	45.749
ENSACIG00000004426	-	89	61.390	ENSACIG00000000741	-	92	61.390
ENSACIG00000004426	-	88	37.500	ENSACIG00000009430	-	57	36.719
ENSACIG00000004426	-	89	83.529	ENSACIG00000004444	-	97	80.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004426	-	91	63.806	ENSAOCG00000002056	-	89	63.806	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004426	-	89	64.729	ENSAPEG00000021053	-	91	64.729	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004426	-	92	53.731	ENSATEG00000002869	-	96	53.731	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004426	-	89	47.893	ENSATEG00000002718	-	82	47.893	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004426	-	89	66.023	ENSACLG00000027615	-	97	66.023	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	80	57.511	ENSACLG00000016390	-	90	57.511	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	91	66.914	ENSACLG00000016487	-	90	66.914	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	90	50.000	ENSACLG00000018321	-	93	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	88	50.787	ENSACLG00000002020	-	94	50.787	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	87	50.973	ENSACLG00000010292	-	91	50.973	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004426	-	95	34.892	ENSAMXG00000037563	-	93	34.892	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000004426	-	89	51.538	ENSCSEG00000018832	-	97	51.538	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004426	-	85	46.245	ENSCVAG00000007214	-	98	46.245	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004426	-	88	46.304	ENSCVAG00000023166	-	97	46.304	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004426	-	88	47.287	ENSCVAG00000016719	-	90	47.287	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004426	-	59	46.512	ENSCVAG00000014640	-	79	46.512	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004426	-	83	40.816	ENSDARG00000107486	CR855320.3	82	40.816	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	83	40.000	ENSDARG00000075791	si:dkey-79f11.5	78	40.000	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	52	40.667	ENSDARG00000092361	si:dkey-79f11.7	63	40.667	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	84	40.081	ENSDARG00000010729	CABZ01073795.1	85	40.081	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	70	44.444	ENSDARG00000015678	si:dkeyp-75b4.9	98	44.444	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	83	41.633	ENSDARG00000095673	si:dkey-79f11.8	75	41.633	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	83	38.800	ENSDARG00000095309	si:dkey-79f11.9	88	38.800	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	89	38.023	ENSDARG00000092634	CABZ01000634.1	88	38.023	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	80	37.815	ENSDARG00000029720	si:dkeyp-9d4.2	80	37.815	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	87	38.672	ENSDARG00000093857	si:dkey-79f11.10	79	38.672	Danio_rerio
ENSACIG00000004426	-	87	46.640	ENSFHEG00000018078	-	92	46.640	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000004426	-	89	49.425	ENSFHEG00000021105	-	88	49.425	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000004426	-	78	46.311	ENSFHEG00000019992	-	82	46.311	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000004426	-	89	51.737	ENSFHEG00000018069	-	88	51.737	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000004426	-	88	48.263	ENSGAFG00000019423	-	57	48.263	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004426	-	84	41.700	ENSGAFG00000019422	-	95	41.700	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004426	-	88	60.465	ENSGACG00000012556	-	83	60.465	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000004426	-	89	60.232	ENSGACG00000001319	-	96	60.232	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000004426	-	89	59.073	ENSGACG00000012548	-	88	59.073	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000004426	-	85	68.852	ENSHBUG00000010945	-	91	68.852	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000004426	-	91	40.755	ENSIPUG00000006852	-	76	43.210	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004426	-	83	43.210	ENSIPUG00000007632	-	70	43.210	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004426	-	83	43.621	ENSIPUG00000005624	-	90	43.621	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004426	-	60	34.444	ENSIPUG00000006725	-	88	34.444	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004426	-	87	50.196	ENSKMAG00000006729	-	94	50.196	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004426	-	86	51.969	ENSKMAG00000000369	-	93	51.969	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004426	-	87	52.157	ENSKMAG00000000325	-	91	52.157	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004426	-	88	59.766	ENSMAMG00000003570	-	89	59.766	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000004426	-	87	48.450	ENSMAMG00000003546	-	85	48.450	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000004426	-	90	50.000	ENSMZEG00005015498	-	94	50.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000004426	-	89	72.868	ENSMZEG00005008329	-	98	72.868	Maylandia_zebra
ENSACIG00000004426	-	90	70.115	ENSMZEG00005008301	-	98	70.115	Maylandia_zebra
ENSACIG00000004426	-	89	71.318	ENSNBRG00000006386	-	97	71.318	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	89	65.098	ENSNBRG00000006414	-	87	65.098	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	87	51.362	ENSNBRG00000023290	-	86	51.362	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	92	67.164	ENSNBRG00000020806	-	91	67.164	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	90	62.548	ENSNBRG00000020744	-	89	62.548	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	88	69.261	ENSNBRG00000022075	-	91	69.141	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	83	68.313	ENSNBRG00000020781	-	98	68.313	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	94	49.458	ENSNBRG00000024253	-	94	49.458	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000004426	-	88	43.678	ENSONIG00000018790	-	88	43.678	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	62	75.691	ENSONIG00000013227	-	100	75.691	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	84	73.469	ENSONIG00000012317	-	98	73.469	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	89	72.093	ENSONIG00000012319	-	99	72.093	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	85	69.231	ENSONIG00000017465	-	100	69.231	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	88	73.152	ENSONIG00000015247	-	91	73.152	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	88	75.486	ENSONIG00000015167	-	99	75.486	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	83	51.240	ENSONIG00000016843	-	98	51.240	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	88	69.531	ENSONIG00000015371	-	100	69.531	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004426	-	85	49.801	ENSPMGG00000002695	-	95	49.801	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004426	-	89	54.231	ENSPMGG00000012906	-	93	54.231	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004426	-	93	42.086	ENSPMGG00000004994	-	96	42.086	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004426	-	88	47.656	ENSPMGG00000022341	-	76	47.656	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004426	-	90	47.547	ENSPFOG00000003841	-	91	47.547	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004426	-	89	47.674	ENSPFOG00000015455	-	87	47.674	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004426	-	87	49.416	ENSPFOG00000015382	-	90	49.416	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004426	-	96	46.479	ENSPFOG00000003807	-	99	46.479	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004426	-	90	49.049	ENSPFOG00000015493	-	88	49.412	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004426	-	88	46.875	ENSPLAG00000018274	-	91	46.875	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000004426	-	88	49.225	ENSPMEG00000018635	-	90	49.225	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000004426	-	92	46.067	ENSPMEG00000018626	-	95	46.067	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000004426	-	88	46.275	ENSPREG00000005137	-	93	46.275	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000004426	-	90	69.084	ENSPNYG00000024019	-	90	69.084	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000004426	-	88	70.428	ENSPNYG00000005478	-	89	70.428	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000004426	-	96	46.809	ENSPNYG00000001584	-	98	46.809	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000004426	-	87	41.797	ENSPNAG00000009266	-	93	41.797	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000004426	-	87	34.328	ENSPNAG00000006327	-	65	34.328	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000004426	-	89	51.923	ENSSDUG00000002359	-	97	52.308	Seriola_dumerili
ENSACIG00000004426	-	89	52.308	ENSSDUG00000002417	-	98	51.894	Seriola_dumerili
ENSACIG00000004426	-	94	51.648	ENSSLDG00000008952	-	96	50.735	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000004426	-	88	52.326	ENSSLDG00000016397	-	95	52.326	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000004426	-	88	60.618	ENSSPAG00000012915	-	98	60.618	Stegastes_partitus
ENSACIG00000004426	-	88	62.257	ENSSPAG00000012856	-	91	62.257	Stegastes_partitus
ENSACIG00000004426	-	69	46.948	ENSXCOG00000008517	-	66	46.948	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000004426	-	57	49.697	ENSXCOG00000003913	-	85	49.697	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000004426	-	76	47.788	ENSXCOG00000019639	-	86	47.788	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000004426	-	88	51.351	ENSXMAG00000029117	-	91	51.351	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000004426	-	89	47.710	ENSXMAG00000009971	-	69	47.710	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000004426	-	89	46.768	ENSXMAG00000009973	-	93	46.768	Xiphophorus_maculatus