EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004534 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ddx39b
Alias: bat1|zgc:63773
Full Name: DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39B
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11029 bases
Position: chrCCOE01000874.1:369542-380570
Accession: ZDB-GENE-040426-1259
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005755	ResIII	PF04851.15	6.1e-07	1	1
ENSACIP00000005755	DEAD	PF00270.29	2.6e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000005932	-	1305	-	ENSACIP00000005755	434 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004534	ddx39b	87	31.398	ENSACIG00000023989	ddx6	74	31.398
ENSACIG00000004534	ddx39b	89	30.221	ENSACIG00000023986	-	61	30.073
ENSACIG00000004534	ddx39b	90	38.010	ENSACIG00000000989	eif4a2	93	38.281
ENSACIG00000004534	ddx39b	84	30.563	ENSACIG00000016665	zgc:193690	71	30.563
ENSACIG00000004534	ddx39b	86	31.759	ENSACIG00000011029	ddx49	78	31.759
ENSACIG00000004534	ddx39b	85	31.525	ENSACIG00000008618	DDX41	64	31.525
ENSACIG00000004534	ddx39b	79	30.226	ENSACIG00000018534	ddx18	54	30.588
ENSACIG00000004534	ddx39b	80	36.311	ENSACIG00000022802	ddx47	71	36.311
ENSACIG00000004534	ddx39b	82	30.000	ENSACIG00000009666	ddx59	58	30.564
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	87.935	ENSACIG00000020898	DDX39A	99	87.935
ENSACIG00000004534	ddx39b	86	32.021	ENSACIG00000014378	ddx27	93	36.702
ENSACIG00000004534	ddx39b	94	31.354	ENSACIG00000018355	-	76	31.429
ENSACIG00000004534	ddx39b	81	31.467	ENSACIG00000013354	-	63	31.467
ENSACIG00000004534	ddx39b	76	30.588	ENSACIG00000022414	ddx5	69	30.588
ENSACIG00000004534	ddx39b	86	32.552	ENSACIG00000014804	ddx19	84	32.552
ENSACIG00000004534	ddx39b	84	38.251	ENSACIG00000009719	eif4a3	90	38.005
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	87.471	ENSACIG00000007948	-	99	87.007

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSG00000198563	DDX39B	99	93.677	Homo_sapiens
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSAMEG00000009508	DDX39B	99	93.443	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	97.190	ENSATEG00000012366	ddx39b	99	97.190	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.224	ENSACAG00000012240	DDX39B	99	92.991	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSANAG00000030372	DDX39B	99	93.677	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	94.954	ENSACLG00000018759	ddx39b	99	95.183	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.735	ENSAMXG00000017837	ddx39b	99	92.807	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSBTAG00000014490	DDX39B	99	93.677	Bos_taurus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSCJAG00000003152	DDX39B	99	93.677	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSCAFG00000000509	DDX39B	98	96.393	Canis_familiaris
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSCAFG00020020530	DDX39B	99	93.443	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSCHIG00000004579	DDX39B	99	93.677	Capra_hircus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSTSYG00000010226	-	99	93.677	Carlito_syrichta
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	80.510	ENSTSYG00000029741	-	91	81.308	Carlito_syrichta
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSCAPG00000010066	DDX39B	99	93.443	Cavia_aperea
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSCPOG00000002335	DDX39B	99	93.443	Cavia_porcellus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSCCAG00000027897	DDX39B	99	93.677	Cebus_capucinus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	84.382	ENSCATG00000043709	DDX39B	99	84.382	Cercocebus_atys
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSCLAG00000014555	DDX39B	99	93.443	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	93.473	ENSCSAG00000008517	DDX39B	100	93.473	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000004534	ddx39b	62	96.269	ENSCPBG00000014671	-	98	96.269	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSCANG00000041217	DDX39B	99	93.677	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000004534	ddx39b	57	91.165	ENSCGRG00001017315	-	95	89.524	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000004534	ddx39b	81	81.250	ENSCGRG00001021916	-	87	81.250	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000004534	ddx39b	57	91.165	ENSCGRG00000012479	-	76	91.165	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	94.186	ENSDARG00000036069	ddx39b	99	93.953	Danio_rerio
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSDNOG00000010215	DDX39B	99	93.677	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000004534	ddx39b	87	93.651	ENSDORG00000004985	Ddx39b	100	93.651	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000004534	ddx39b	87	81.481	ENSETEG00000009649	DDX39B	87	81.217	Echinops_telfairi
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSEASG00005017156	DDX39B	99	93.677	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSECAG00000007750	DDX39B	99	93.677	Equus_caballus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	93.318	ENSELUG00000017904	ddx39b	99	93.208	Esox_lucius
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSFCAG00000004497	DDX39B	99	93.443	Felis_catus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSFDAG00000011074	DDX39B	99	93.443	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000004534	ddx39b	72	96.463	ENSGAGG00000001300	-	79	96.463	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSGGOG00000005989	DDX39B	99	93.677	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.974	ENSHGLG00000019248	DDX39B	99	92.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.974	ENSHGLG00100011850	DDX39B	99	92.974	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.575	ENSIPUG00000015733	DDX39B	93	92.343	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.208	ENSSTOG00000012838	DDX39B	99	93.208	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.974	ENSJJAG00000005660	-	99	92.974	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	81.776	ENSLBEG00000012254	ddx39b	99	81.776	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004534	ddx39b	65	81.139	ENSLBEG00000017177	-	81	81.139	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	85.219	ENSLACG00000002110	DDX39B	99	85.219	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSLAFG00000014202	DDX39B	99	93.443	Loxodonta_africana
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMFAG00000034233	DDX39B	99	93.677	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMMUG00000008839	DDX39B	99	93.677	Macaca_mulatta
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMNEG00000041059	DDX39B	99	93.677	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMLEG00000043791	DDX39B	99	93.677	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	95.183	ENSMZEG00005017654	ddx39b	99	95.413	Maylandia_zebra
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMAUG00000008059	Ddx39b	99	93.677	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSMICG00000017349	DDX39B	99	93.677	Microcebus_murinus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSMOCG00000011169	Ddx39b	99	93.443	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000004534	ddx39b	88	93.684	ENSMODG00000015791	DDX39B	88	93.684	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSMUSG00000019432	Ddx39b	100	96.622	Mus_musculus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	MGP_PahariEiJ_G0020513	Ddx39b	100	96.622	Mus_pahari
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	MGP_SPRETEiJ_G0022424	Ddx39b	99	93.443	Mus_spretus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSMPUG00000011407	DDX39B	99	93.443	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000004534	ddx39b	71	96.405	ENSMLUG00000001681	DDX39B	98	96.405	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	93.692	ENSNGAG00000022948	Ddx39b	99	93.677	Nannospalax_galili
ENSACIG00000004534	ddx39b	65	96.071	ENSNLEG00000006094	DDX39B	79	96.071	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000004534	ddx39b	84	97.235	ENSMEUG00000008264	DDX39B	84	97.235	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSOPRG00000011923	DDX39B	99	93.443	Ochotona_princeps
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSODEG00000018083	DDX39B	99	93.443	Octodon_degus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	95.824	ENSONIG00000004740	ddx39b	99	95.824	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004534	ddx39b	56	90.456	ENSOANG00000008361	DDX39B	95	90.456	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	90.045	ENSOCUG00000024126	DDX39B	99	90.045	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.290	ENSOGAG00000028850	-	99	92.290	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000004534	ddx39b	75	95.062	ENSOGAG00000009067	-	100	95.062	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSOARG00000008787	DDX39B	97	93.677	Ovis_aries
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPPAG00000043072	DDX39B	99	93.677	Pan_paniscus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSPPRG00000001913	DDX39B	99	93.443	Panthera_pardus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.523	ENSPTIG00000017669	DDX39B	99	92.506	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPTRG00000032509	DDX39B	99	93.677	Pan_troglodytes
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPANG00000018609	DDX39B	99	93.677	Papio_anubis
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.361	ENSPKIG00000011324	ddx39b	99	91.898	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.208	ENSPEMG00000016905	Ddx39b	99	93.208	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPCIG00000017572	DDX39B	99	93.677	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPPYG00000016433	DDX39B	99	93.677	Pongo_abelii
ENSACIG00000004534	ddx39b	64	96.057	ENSPCAG00000003484	DDX39B	98	96.057	Procavia_capensis
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPCOG00000018656	DDX39B	99	93.677	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSPVAG00000004653	DDX39B	99	93.677	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	86.836	ENSPNYG00000010382	ddx39b	99	86.836	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.735	ENSPNAG00000026926	ddx39b	99	92.807	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.443	ENSRNOG00000000841	Ddx39b	99	93.443	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	83.607	ENSRBIG00000031309	DDX39B	99	83.607	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSRROG00000039517	DDX39B	99	93.677	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	83.607	ENSSBOG00000035513	-	99	83.607	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	93.677	ENSSHAG00000003209	DDX39B	99	93.677	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000004534	ddx39b	99	93.318	ENSSFOG00015016107	ddx39b	99	93.056	Scleropages_formosus
ENSACIG00000004534	ddx39b	98	97.892	ENSSDUG00000011557	ddx39b	99	97.892	Seriola_dumerili
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