EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004641 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2841 bases
Position: chrCCOE01000874.1:429821-432661
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000005877	zf-C2H2	PF00096.26	1e-18	1	3
ENSACIP00000005877	zf-C2H2	PF00096.26	1e-18	2	3
ENSACIP00000005877	zf-C2H2	PF00096.26	1e-18	3	3
ENSACIP00000005877	zf-met	PF12874.7	8.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000006057	-	882	-	ENSACIP00000005877	293 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000004641's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000004641's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004641	-	55	45.312	ENSACIG00000016117	-	83	46.667
ENSACIG00000004641	-	96	40.141	ENSACIG00000015835	-	99	40.141
ENSACIG00000004641	-	55	63.889	ENSACIG00000019804	-	69	63.889
ENSACIG00000004641	-	67	40.816	ENSACIG00000023162	-	67	44.186
ENSACIG00000004641	-	69	49.664	ENSACIG00000004626	-	90	49.664
ENSACIG00000004641	-	57	40.909	ENSACIG00000023049	znf646	99	37.795
ENSACIG00000004641	-	73	40.000	ENSACIG00000006826	-	83	40.000
ENSACIG00000004641	-	73	52.703	ENSACIG00000013470	-	90	52.703
ENSACIG00000004641	-	66	43.636	ENSACIG00000014123	znf236	53	43.636
ENSACIG00000004641	-	68	45.802	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	45.802
ENSACIG00000004641	-	87	52.893	ENSACIG00000017050	-	96	56.989
ENSACIG00000004641	-	62	49.324	ENSACIG00000009755	-	82	49.324
ENSACIG00000004641	-	97	32.615	ENSACIG00000016932	-	97	32.615
ENSACIG00000004641	-	70	48.454	ENSACIG00000007464	-	74	48.454
ENSACIG00000004641	-	54	43.846	ENSACIG00000012263	znf319b	88	43.846
ENSACIG00000004641	-	70	51.449	ENSACIG00000004041	-	90	51.240
ENSACIG00000004641	-	66	44.186	ENSACIG00000007096	-	93	44.186
ENSACIG00000004641	-	52	51.316	ENSACIG00000023212	-	76	51.449
ENSACIG00000004641	-	97	43.662	ENSACIG00000022645	-	98	43.662
ENSACIG00000004641	-	97	40.476	ENSACIG00000017647	-	90	47.904
ENSACIG00000004641	-	54	43.200	ENSACIG00000017644	-	81	43.200
ENSACIG00000004641	-	70	47.244	ENSACIG00000009717	-	96	53.488
ENSACIG00000004641	-	67	43.307	ENSACIG00000024444	-	73	43.307
ENSACIG00000004641	-	53	48.958	ENSACIG00000016944	-	74	48.958
ENSACIG00000004641	-	55	47.712	ENSACIG00000008448	-	97	47.712
ENSACIG00000004641	-	94	44.755	ENSACIG00000022738	-	90	52.041
ENSACIG00000004641	-	67	46.939	ENSACIG00000022293	-	96	46.939
ENSACIG00000004641	-	78	42.222	ENSACIG00000018059	-	72	40.000
ENSACIG00000004641	-	88	51.485	ENSACIG00000010647	-	97	51.240
ENSACIG00000004641	-	91	46.711	ENSACIG00000013604	-	98	46.711
ENSACIG00000004641	-	52	49.180	ENSACIG00000003754	-	83	49.180
ENSACIG00000004641	-	54	44.275	ENSACIG00000013163	-	79	44.275
ENSACIG00000004641	-	58	47.445	ENSACIG00000018440	-	96	47.445
ENSACIG00000004641	-	50	45.455	ENSACIG00000000406	prdm5	72	45.455
ENSACIG00000004641	-	77	50.000	ENSACIG00000006806	-	78	50.000
ENSACIG00000004641	-	60	42.308	ENSACIG00000013750	-	67	42.308
ENSACIG00000004641	-	58	45.714	ENSACIG00000007855	-	93	45.714
ENSACIG00000004641	-	66	49.593	ENSACIG00000022625	-	87	49.593
ENSACIG00000004641	-	71	58.462	ENSACIG00000011515	-	90	58.462
ENSACIG00000004641	-	58	34.234	ENSACIG00000011516	-	77	34.234
ENSACIG00000004641	-	59	41.441	ENSACIG00000021986	-	91	41.441
ENSACIG00000004641	-	53	48.113	ENSACIG00000020938	zbtb47b	67	48.113
ENSACIG00000004641	-	67	44.444	ENSACIG00000019710	-	80	46.903
ENSACIG00000004641	-	62	51.316	ENSACIG00000019102	-	53	51.316
ENSACIG00000004641	-	83	45.283	ENSACIG00000019791	-	96	44.853
ENSACIG00000004641	-	61	48.352	ENSACIG00000006172	-	97	44.853
ENSACIG00000004641	-	56	40.972	ENSACIG00000006377	-	55	40.972
ENSACIG00000004641	-	59	48.092	ENSACIG00000016182	-	95	48.092
ENSACIG00000004641	-	56	59.649	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	91	59.649
ENSACIG00000004641	-	68	51.685	ENSACIG00000011541	-	88	51.685
ENSACIG00000004641	-	70	47.541	ENSACIG00000004745	-	96	47.541
ENSACIG00000004641	-	60	42.222	ENSACIG00000012084	-	93	42.222
ENSACIG00000004641	-	65	36.574	ENSACIG00000007882	-	84	36.574
ENSACIG00000004641	-	65	51.261	ENSACIG00000006755	-	89	51.261
ENSACIG00000004641	-	66	30.702	ENSACIG00000017166	-	84	30.702
ENSACIG00000004641	-	57	41.600	ENSACIG00000019534	-	85	41.600
ENSACIG00000004641	-	67	40.517	ENSACIG00000018952	-	66	40.517
ENSACIG00000004641	-	58	50.000	ENSACIG00000023794	-	52	50.000
ENSACIG00000004641	-	52	38.235	ENSACIG00000002180	-	93	38.235
ENSACIG00000004641	-	55	42.982	ENSACIG00000013149	-	90	42.982
ENSACIG00000004641	-	54	39.695	ENSACIG00000009128	-	81	39.695
ENSACIG00000004641	-	54	45.312	ENSACIG00000016180	znf341	51	45.312
ENSACIG00000004641	-	86	52.066	ENSACIG00000004666	-	98	51.020
ENSACIG00000004641	-	76	43.382	ENSACIG00000017013	-	74	43.382
ENSACIG00000004641	-	86	32.686	ENSACIG00000008611	-	93	32.686
ENSACIG00000004641	-	54	40.299	ENSACIG00000016133	-	61	40.299
ENSACIG00000004641	-	61	36.620	ENSACIG00000010739	-	87	36.620
ENSACIG00000004641	-	90	47.222	ENSACIG00000001860	-	94	47.222
ENSACIG00000004641	-	52	41.892	ENSACIG00000018022	-	87	41.892
ENSACIG00000004641	-	56	50.000	ENSACIG00000003556	-	59	50.000
ENSACIG00000004641	-	55	39.073	ENSACIG00000001767	zbtb41	58	39.073
ENSACIG00000004641	-	71	38.614	ENSACIG00000017683	-	82	38.614
ENSACIG00000004641	-	79	47.273	ENSACIG00000016331	ZBTB14	52	47.273
ENSACIG00000004641	-	59	54.015	ENSACIG00000009780	-	81	54.167
ENSACIG00000004641	-	59	47.748	ENSACIG00000003515	-	93	47.748
ENSACIG00000004641	-	61	55.046	ENSACIG00000000311	-	71	55.046
ENSACIG00000004641	-	81	34.375	ENSACIG00000003694	znf131	57	34.375
ENSACIG00000004641	-	67	49.275	ENSACIG00000022658	-	94	49.275
ENSACIG00000004641	-	52	37.500	ENSACIG00000018641	snai2	53	37.500
ENSACIG00000004641	-	73	37.903	ENSACIG00000020982	znf710b	59	37.903
ENSACIG00000004641	-	57	41.844	ENSACIG00000018404	-	74	41.844
ENSACIG00000004641	-	94	38.129	ENSACIG00000007000	-	85	36.471
ENSACIG00000004641	-	51	44.262	ENSACIG00000006228	-	64	44.262
ENSACIG00000004641	-	54	50.877	ENSACIG00000011153	-	69	50.877
ENSACIG00000004641	-	76	34.959	ENSACIG00000012604	scrt2	74	34.959
ENSACIG00000004641	-	58	47.826	ENSACIG00000019447	-	73	47.826
ENSACIG00000004641	-	56	42.276	ENSACIG00000017892	-	73	42.276
ENSACIG00000004641	-	67	47.967	ENSACIG00000003720	-	81	47.967
ENSACIG00000004641	-	53	52.273	ENSACIG00000022330	-	85	52.273
ENSACIG00000004641	-	59	45.833	ENSACIG00000015411	-	77	45.833
ENSACIG00000004641	-	96	42.857	ENSACIG00000023313	-	96	42.857
ENSACIG00000004641	-	77	40.741	ENSACIG00000002190	gfi1b	74	40.741
ENSACIG00000004641	-	52	53.913	ENSACIG00000000286	-	59	53.913
ENSACIG00000004641	-	65	32.653	ENSACIG00000002944	-	52	32.653
ENSACIG00000004641	-	58	40.000	ENSACIG00000012636	ZNF319	94	41.593
ENSACIG00000004641	-	63	48.413	ENSACIG00000019815	-	99	48.413
ENSACIG00000004641	-	56	47.899	ENSACIG00000015429	-	75	47.899
ENSACIG00000004641	-	50	38.462	ENSACIG00000001369	-	79	38.462

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000004641	-	69	46.512	ENSAPOG00000018429	-	68	46.512	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004641	-	91	52.174	ENSAPOG00000019138	-	87	52.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000004641	-	91	48.551	ENSAOCG00000016897	-	88	48.551	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004641	-	52	45.000	ENSAOCG00000001325	-	65	45.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000004641	-	91	48.936	ENSAPEG00000001556	-	90	48.936	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004641	-	67	43.902	ENSAPEG00000010013	-	56	43.902	Amphiprion_percula
ENSACIG00000004641	-	80	43.333	ENSATEG00000018931	-	91	46.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000004641	-	51	51.765	ENSACLG00000011658	-	85	51.765	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004641	-	62	38.519	ENSACLG00000005694	-	50	38.519	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000004641	-	65	45.455	ENSAMXG00000029518	-	60	45.455	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000004641	-	53	38.710	ENSCING00000002128	zf(c2h2)-35	67	38.710	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000004641	-	52	48.571	ENSCSEG00000015593	-	74	48.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004641	-	65	60.952	ENSCSEG00000010453	-	76	60.952	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004641	-	58	45.745	ENSCSEG00000010264	-	97	45.745	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004641	-	89	50.000	ENSCSEG00000008525	-	82	50.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000004641	-	56	46.721	ENSCVAG00000015616	-	77	46.721	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	54	55.208	ENSCVAG00000012682	-	70	55.208	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	58	40.367	ENSCVAG00000020141	-	76	40.367	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	65	38.095	ENSCVAG00000006653	-	64	38.095	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	63	45.161	ENSCVAG00000003250	-	61	45.161	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	94	44.828	ENSCVAG00000006484	-	96	44.828	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000004641	-	50	52.857	ENSEBUG00000014432	-	80	52.857	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000004641	-	57	44.615	ENSELUG00000001909	-	60	47.222	Esox_lucius
ENSACIG00000004641	-	58	46.602	ENSELUG00000024007	-	65	46.602	Esox_lucius
ENSACIG00000004641	-	96	48.113	ENSELUG00000012088	-	98	48.113	Esox_lucius
ENSACIG00000004641	-	99	50.394	ENSGAFG00000008204	-	96	50.394	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004641	-	55	48.235	ENSGAFG00000007528	-	56	48.235	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004641	-	96	46.218	ENSGAFG00000011998	-	96	46.218	Gambusia_affinis
ENSACIG00000004641	-	59	38.519	ENSHBUG00000006656	-	56	38.519	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000004641	-	55	53.226	ENSHCOG00000020670	-	72	53.226	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	52	52.174	ENSHCOG00000001873	-	54	54.400	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	97	49.367	ENSHCOG00000019389	-	98	49.367	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	52	52.174	ENSHCOG00000008550	-	54	54.400	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	56	53.676	ENSHCOG00000015497	-	77	53.676	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	96	50.000	ENSHCOG00000008213	-	94	50.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	61	51.667	ENSHCOG00000013489	-	98	51.667	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	98	44.898	ENSHCOG00000008227	-	94	44.231	Hippocampus_comes
ENSACIG00000004641	-	77	32.130	ENSKMAG00000021873	-	99	31.707	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004641	-	62	41.837	ENSKMAG00000007699	-	77	41.837	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000004641	-	52	46.154	ENSLBEG00000007106	-	60	46.154	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004641	-	72	44.000	ENSLBEG00000001132	-	73	44.000	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004641	-	96	58.586	ENSLBEG00000011210	-	85	58.586	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004641	-	57	37.692	ENSLBEG00000017424	-	90	37.692	Labrus_bergylta
ENSACIG00000004641	-	66	44.715	ENSLOCG00000004208	-	99	44.715	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000004641	-	97	47.788	ENSMAMG00000017939	-	87	47.788	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000004641	-	53	39.844	ENSMZEG00005013907	-	74	42.478	Maylandia_zebra
ENSACIG00000004641	-	96	40.588	ENSMMOG00000017592	-	99	40.882	Mola_mola
ENSACIG00000004641	-	69	42.857	ENSONIG00000007967	-	59	42.857	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000004641	-	52	52.308	ENSORLG00000021885	-	62	52.308	Oryzias_latipes
ENSACIG00000004641	-	68	46.939	ENSORLG00000002268	-	90	46.939	Oryzias_latipes
ENSACIG00000004641	-	96	46.789	ENSORLG00020019227	-	94	46.789	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000004641	-	58	37.179	ENSORLG00020018921	-	58	38.889	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000004641	-	57	37.288	ENSORLG00015018099	-	72	37.288	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000004641	-	54	39.552	ENSOMEG00000005578	-	63	39.552	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000004641	-	62	54.762	ENSOMEG00000019114	-	54	52.083	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000004641	-	97	41.129	ENSPKIG00000005164	-	99	41.129	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000004641	-	52	53.125	ENSPMGG00000002661	-	65	53.125	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	59	42.038	ENSPMGG00000002455	-	94	43.396	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	54	40.426	ENSPMGG00000019750	-	77	40.426	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	81	52.174	ENSPMGG00000002659	-	75	49.206	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	59	49.593	ENSPMGG00000009571	-	78	47.692	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	63	37.879	ENSPMGG00000007051	-	55	43.077	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	56	37.500	ENSPMGG00000006928	-	51	37.500	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000004641	-	52	39.516	ENSPMAG00000004189	-	98	39.516	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000004641	-	52	40.777	ENSPMAG00000002022	-	100	40.777	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000004641	-	52	42.697	ENSPMAG00000000839	-	86	42.697	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000004641	-	91	47.407	ENSPFOG00000009491	-	99	47.407	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004641	-	67	46.269	ENSPFOG00000018860	-	99	46.269	Poecilia_formosa
ENSACIG00000004641	-	75	44.068	ENSPLAG00000014832	-	88	44.068	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000004641	-	56	52.137	ENSPLAG00000010067	-	63	52.137	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000004641	-	91	47.407	ENSPMEG00000024117	-	99	47.407	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000004641	-	52	46.903	ENSPMEG00000005210	-	72	46.903	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000004641	-	54	42.857	ENSPMEG00000002953	-	66	42.857	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000004641	-	59	52.239	ENSPREG00000009488	-	90	52.239	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000004641	-	60	39.175	ENSPREG00000002603	-	69	39.175	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000004641	-	52	49.515	ENSPNYG00000017888	-	51	49.515	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000004641	-	61	35.185	ENSPNAG00000005946	-	89	33.951	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000004641	-	52	47.826	ENSSFOG00015011531	-	86	38.017	Scleropages_formosus
ENSACIG00000004641	-	58	48.101	ENSSMAG00000013291	-	91	48.611	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000004641	-	56	40.331	ENSSDUG00000020774	-	65	40.331	Seriola_dumerili
ENSACIG00000004641	-	64	42.857	ENSSLDG00000011849	-	55	42.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000004641	-	65	42.478	ENSSLDG00000014436	-	70	42.478	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000004641	-	52	40.000	ENSSPAG00000011544	-	52	40.000	Stegastes_partitus
ENSACIG00000004641	-	70	48.052	ENSSPAG00000005770	-	65	48.052	Stegastes_partitus
ENSACIG00000004641	-	61	42.424	ENSXETG00000012506	znf91	99	42.424	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000004641	-	56	47.917	ENSXCOG00000000254	-	58	47.917	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000004641	-	52	46.364	ENSXCOG00000020768	-	63	46.364	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000004641	-	65	33.333	ENSXCOG00000014360	-	72	33.333	Xiphophorus_couchianus