EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000004666 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33188 bases
Position: chrCCOE01000533.1:237552-270739
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000006000	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-61	10	12
ENSACIP00000006000	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-61	11	12
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ENSACIP00000006784	zf-C2H2	PF00096.26	2e-56	10	10
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ENSACIP00000006899	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-30	3	5
ENSACIP00000006899	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-30	4	5
ENSACIP00000006899	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-30	5	5
ENSACIP00000006517	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-26	1	5
ENSACIP00000006517	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-26	2	5
ENSACIP00000006517	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-26	3	5
ENSACIP00000006517	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-26	4	5
ENSACIP00000006517	zf-C2H2	PF00096.26	1.8e-26	5	5
ENSACIP00000006000	zf-met	PF12874.7	2.4e-18	1	1
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ENSACIP00000006139	zf-met	PF12874.7	1.2e-17	2	2
ENSACIP00000006043	zf-met	PF12874.7	2.2e-12	1	1
ENSACIP00000006784	zf-met	PF12874.7	2.4e-09	1	1
ENSACIP00000006744	zf-met	PF12874.7	1.9e-07	1	1
ENSACIP00000006899	zf-met	PF12874.7	2.1e-06	1	1
ENSACIP00000006850	zf-met	PF12874.7	9.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSACIT00000006439	-	999	-	ENSACIP00000006253	332 (aa)	-	-
ENSACIT00000006182	-	1443	-	ENSACIP00000006000	480 (aa)	-	-
ENSACIT00000006783	-	1119	-	ENSACIP00000006584	372 (aa)	-	-
ENSACIT00000006714	-	765	-	ENSACIP00000006517	254 (aa)	-	-
ENSACIT00000006951	-	1020	-	ENSACIP00000006744	339 (aa)	-	-
ENSACIT00000006225	-	1212	-	ENSACIP00000006043	403 (aa)	-	-
ENSACIT00000006493	-	852	-	ENSACIP00000006306	283 (aa)	-	-
ENSACIT00000006322	-	1050	-	ENSACIP00000006139	349 (aa)	-	-
ENSACIT00000006877	-	789	-	ENSACIP00000006674	262 (aa)	-	-
ENSACIT00000006991	-	1017	-	ENSACIP00000006784	338 (aa)	-	-
ENSACIT00000006601	-	789	-	ENSACIP00000006412	262 (aa)	-	-
ENSACIT00000007058	-	822	-	ENSACIP00000006850	274 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000004666	-	98	50.000	ENSACIG00000009780	-	96	51.256
ENSACIG00000004666	-	96	53.097	ENSACIG00000018952	-	80	53.097
ENSACIG00000004666	-	88	32.422	ENSACIG00000016180	znf341	52	31.535
ENSACIG00000004666	-	92	50.943	ENSACIG00000017298	sall4	54	48.000
ENSACIG00000004666	-	99	52.836	ENSACIG00000013604	-	99	56.388
ENSACIG00000004666	-	99	48.333	ENSACIG00000016117	-	92	48.649
ENSACIG00000004666	-	99	44.776	ENSACIG00000018404	-	77	48.684
ENSACIG00000004666	-	99	59.643	ENSACIG00000017647	-	97	65.854
ENSACIG00000004666	-	99	45.854	ENSACIG00000023794	-	77	50.568
ENSACIG00000004666	-	97	51.829	ENSACIG00000007096	-	97	48.750
ENSACIG00000004666	-	97	40.000	ENSACIG00000001296	-	51	39.623
ENSACIG00000004666	-	94	45.455	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	48.182
ENSACIG00000004666	-	98	62.051	ENSACIG00000016944	-	98	63.571
ENSACIG00000004666	-	98	42.636	ENSACIG00000002180	-	99	45.536
ENSACIG00000004666	-	99	50.735	ENSACIG00000019804	-	98	47.794
ENSACIG00000004666	-	97	38.931	ENSACIG00000006586	-	50	41.121
ENSACIG00000004666	-	99	64.497	ENSACIG00000017050	-	99	67.368
ENSACIG00000004666	-	99	53.182	ENSACIG00000011541	-	94	48.101
ENSACIG00000004666	-	99	50.340	ENSACIG00000004626	-	99	49.791
ENSACIG00000004666	-	96	57.339	ENSACIG00000019791	-	97	58.182
ENSACIG00000004666	-	93	60.870	ENSACIG00000010660	-	91	62.791
ENSACIG00000004666	-	100	47.917	ENSACIG00000023212	-	89	48.571
ENSACIG00000004666	-	98	65.054	ENSACIG00000000286	-	95	62.069
ENSACIG00000004666	-	99	41.975	ENSACIG00000023313	-	99	40.299
ENSACIG00000004666	-	97	40.580	ENSACIG00000017166	-	93	41.007
ENSACIG00000004666	-	98	57.031	ENSACIG00000011153	-	98	52.734
ENSACIG00000004666	-	92	46.617	ENSACIG00000015411	-	90	44.444
ENSACIG00000004666	-	94	58.904	ENSACIG00000022658	-	93	59.341
ENSACIG00000004666	-	97	45.070	ENSACIG00000019534	-	91	44.248
ENSACIG00000004666	-	99	53.030	ENSACIG00000010637	-	69	53.785
ENSACIG00000004666	-	92	50.000	ENSACIG00000016354	gfi1ab	50	45.181
ENSACIG00000004666	-	99	35.537	ENSACIG00000011516	-	93	34.899
ENSACIG00000004666	-	99	53.516	ENSACIG00000011515	-	96	53.175
ENSACIG00000004666	-	99	63.448	ENSACIG00000006172	-	99	55.758
ENSACIG00000004666	-	98	63.542	ENSACIG00000004041	-	99	62.500
ENSACIG00000004666	-	92	70.879	ENSACIG00000000311	-	81	74.257
ENSACIG00000004666	-	97	38.182	ENSACIG00000016779	patz1	63	36.413
ENSACIG00000004666	-	99	59.259	ENSACIG00000003720	-	100	58.036
ENSACIG00000004666	-	99	45.270	ENSACIG00000017892	-	91	44.355
ENSACIG00000004666	-	97	41.026	ENSACIG00000006377	-	61	53.247
ENSACIG00000004666	-	99	43.902	ENSACIG00000013163	-	97	44.715
ENSACIG00000004666	-	99	31.381	ENSACIG00000002944	-	93	39.024
ENSACIG00000004666	-	99	39.196	ENSACIG00000000406	prdm5	86	43.023
ENSACIG00000004666	-	98	37.037	ENSACIG00000012604	scrt2	75	35.507
ENSACIG00000004666	-	89	50.355	ENSACIG00000009128	-	93	45.378
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