EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005198 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5856 bases
Position: chrCCOE01000017.1:524219-530074
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000006597	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000006796	-	1668	-	ENSACIP00000006597	555 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000005198	-	50	45.035	ENSACIG00000012718	-	86	58.252
ENSACIG00000005198	-	60	58.912	ENSACIG00000006484	-	88	57.704
ENSACIG00000005198	-	50	64.727	ENSACIG00000012648	-	90	64.727
ENSACIG00000005198	-	52	62.369	ENSACIG00000022355	-	88	65.504
ENSACIG00000005198	-	53	52.365	ENSACIG00000022222	-	82	52.290
ENSACIG00000005198	-	69	57.143	ENSACIG00000007158	-	62	60.476
ENSACIG00000005198	-	50	41.637	ENSACIG00000007466	-	74	44.094
ENSACIG00000005198	-	66	39.837	ENSACIG00000012159	-	80	39.244
ENSACIG00000005198	-	50	67.986	ENSACIG00000002950	-	71	69.318

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005198	-	92	50.760	ENSAPOG00000017368	-	90	50.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005198	-	80	47.241	ENSAPOG00000009034	-	81	47.241	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005198	-	92	50.760	ENSAPOG00000008987	-	88	50.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005198	-	95	56.147	ENSAOCG00000022545	-	92	56.147	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005198	-	92	44.173	ENSAOCG00000001095	-	82	45.234	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005198	-	94	44.673	ENSATEG00000011352	-	96	44.936	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005198	-	77	55.012	ENSATEG00000012058	-	86	54.167	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005198	-	92	44.757	ENSATEG00000011330	-	99	46.168	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005198	-	93	42.697	ENSATEG00000011336	-	95	43.633	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005198	-	61	54.094	ENSATEG00000011735	-	91	54.094	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005198	-	72	56.235	ENSACLG00000005220	-	97	55.746	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005198	-	89	50.881	ENSACLG00000012195	-	95	51.468	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005198	-	96	65.056	ENSACLG00000005679	-	98	64.815	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005198	-	88	46.964	ENSACLG00000004980	-	92	46.693	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005198	-	92	43.396	ENSACLG00000024857	-	82	40.761	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005198	-	62	47.076	ENSAMXG00000030783	-	74	53.785	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005198	-	54	47.039	ENSAMXG00000030288	-	74	47.566	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005198	-	57	40.426	ENSAMXG00000030715	-	76	41.497	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005198	-	89	45.489	ENSCVAG00000023267	-	96	48.211	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000005198	-	97	38.609	ENSCVAG00000018481	-	61	52.245	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000005198	-	56	47.134	ENSDARG00000086048	si:ch211-229i14.2	68	52.308	Danio_rerio
ENSACIG00000005198	-	67	43.243	ENSELUG00000015106	-	64	52.124	Esox_lucius
ENSACIG00000005198	-	52	52.896	ENSELUG00000005405	-	81	52.091	Esox_lucius
ENSACIG00000005198	-	92	44.225	ENSELUG00000015135	-	57	50.193	Esox_lucius
ENSACIG00000005198	-	75	55.980	ENSFHEG00000000207	-	87	50.405	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005198	-	93	50.547	ENSFHEG00000019202	-	96	51.825	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005198	-	92	51.465	ENSFHEG00000013865	-	96	52.747	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005198	-	89	46.484	ENSFHEG00000011334	-	92	43.680	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005198	-	93	50.383	ENSGAFG00000015917	-	92	49.453	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005198	-	90	43.303	ENSGAFG00000001852	-	95	42.703	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005198	-	92	36.964	ENSGAFG00000015999	-	60	54.425	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005198	-	96	46.010	ENSGAFG00000015908	-	82	44.198	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005198	-	78	48.705	ENSGACG00000013107	-	81	66.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000005198	-	85	48.529	ENSHBUG00000003015	-	85	49.686	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005198	-	92	67.751	ENSHBUG00000011672	-	78	68.085	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005198	-	89	50.881	ENSHBUG00000010247	-	95	51.468	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005198	-	87	57.367	ENSHBUG00000013269	-	89	57.937	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005198	-	92	54.029	ENSHBUG00000020633	-	95	57.143	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005198	-	82	40.969	ENSIPUG00000004161	-	58	49.071	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000005198	-	81	51.693	ENSKMAG00000010851	-	83	51.345	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000005198	-	93	42.884	ENSKMAG00000010293	-	96	40.104	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000005198	-	63	60.286	ENSLBEG00000022878	-	93	56.091	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005198	-	67	56.623	ENSLBEG00000012647	-	89	56.331	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005198	-	55	63.265	ENSLBEG00000010625	-	83	66.795	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005198	-	93	55.153	ENSMAMG00000018170	-	95	57.955	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	68	44.619	ENSMAMG00000018061	-	90	42.782	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	76	47.294	ENSMAMG00000017884	-	90	43.648	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	87	49.393	ENSMAMG00000018175	-	85	50.299	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	70	65.796	ENSMAMG00000018162	si:ch211-229i14.2	85	65.625	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	60	46.286	ENSMAMG00000017906	-	97	37.925	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	92	42.293	ENSMAMG00000017849	-	98	41.399	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005198	-	78	42.141	ENSMZEG00005028364	-	87	42.045	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005198	-	53	49.669	ENSMZEG00005021732	-	72	55.187	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005198	-	67	41.711	ENSMALG00000004282	-	82	41.176	Monopterus_albus
ENSACIG00000005198	-	90	42.907	ENSMALG00000001082	-	89	52.415	Monopterus_albus
ENSACIG00000005198	-	80	42.857	ENSNBRG00000014894	-	92	37.248	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005198	-	92	54.945	ENSNBRG00000003245	-	98	55.814	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005198	-	54	54.362	ENSNBRG00000014905	-	88	55.944	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005198	-	78	68.065	ENSONIG00000012315	-	85	68.821	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	77	48.485	ENSONIG00000004482	-	96	58.755	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	71	72.000	ENSONIG00000000233	-	90	72.774	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	60	74.699	ENSONIG00000000314	-	93	88.889	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	71	55.051	ENSONIG00000011313	-	95	52.645	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	76	47.897	ENSONIG00000010736	-	89	46.560	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	73	55.097	ENSONIG00000013863	-	91	52.913	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005198	-	91	46.484	ENSORLG00000017091	-	92	46.289	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005198	-	93	50.832	ENSORLG00000025924	si:ch211-229i14.2	92	51.661	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005198	-	84	46.652	ENSORLG00000030459	-	85	46.652	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005198	-	94	44.181	ENSORLG00020014225	-	85	44.181	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000005198	-	93	45.825	ENSORLG00020016100	-	93	45.437	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000005198	-	93	50.936	ENSORLG00015004505	-	87	51.124	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000005198	-	93	46.094	ENSORLG00015006787	-	92	45.898	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000005198	-	80	46.652	ENSOMEG00000009393	-	87	44.181	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005198	-	93	58.838	ENSOMEG00000013595	-	87	54.025	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005198	-	91	47.544	ENSOMEG00000003632	-	93	45.120	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005198	-	90	50.095	ENSOMEG00000007494	-	93	50.568	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005198	-	51	49.648	ENSPMGG00000002488	-	86	52.510	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000005198	-	74	47.816	ENSPFOG00000001388	-	82	46.318	Poecilia_formosa
ENSACIG00000005198	-	89	43.912	ENSPFOG00000024835	-	86	42.262	Poecilia_formosa
ENSACIG00000005198	-	75	51.765	ENSPFOG00000022293	-	94	52.817	Poecilia_formosa
ENSACIG00000005198	-	91	37.757	ENSPFOG00000000973	-	52	55.357	Poecilia_formosa
ENSACIG00000005198	-	82	48.802	ENSPLAG00000015541	-	85	48.802	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000005198	-	92	49.817	ENSPMEG00000002123	-	95	50.733	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000005198	-	82	51.957	ENSPMEG00000008599	-	88	53.043	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000005198	-	82	48.584	ENSPMEG00000003917	-	82	48.584	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000005198	-	95	40.569	ENSPMEG00000010900	-	93	41.187	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000005198	-	82	49.342	ENSPREG00000017114	-	83	46.799	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005198	-	85	50.218	ENSPREG00000017000	-	83	52.242	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005198	-	93	58.611	ENSPREG00000017086	-	64	59.143	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005198	-	93	45.648	ENSPREG00000016826	-	87	45.570	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005198	-	67	53.333	ENSPREG00000006470	-	94	51.889	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005198	-	92	40.672	ENSPNYG00000008493	-	99	41.791	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	59	63.354	ENSPNYG00000004195	-	71	68.182	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	80	60.265	ENSPNYG00000000712	-	89	60.265	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	94	72.571	ENSPNYG00000006913	-	96	72.571	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	51	48.070	ENSPNYG00000008579	-	84	47.482	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	84	48.408	ENSPNYG00000008570	-	84	49.576	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	61	62.575	ENSPNYG00000003568	-	89	62.108	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000005198	-	80	38.158	ENSPNAG00000026011	-	71	38.998	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000005198	-	92	44.528	ENSSDUG00000016851	-	98	43.284	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	93	53.019	ENSSDUG00000016624	-	77	53.962	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	67	43.767	ENSSDUG00000005095	-	84	43.048	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	93	55.759	ENSSDUG00000005270	-	92	55.941	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	66	55.220	ENSSDUG00000009253	-	93	55.344	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	52	54.196	ENSSDUG00000016809	-	77	55.273	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	53	45.333	ENSSDUG00000016459	-	92	50.000	Seriola_dumerili
ENSACIG00000005198	-	50	58.273	ENSSLDG00000004233	-	90	60.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000005198	-	51	56.679	ENSSLDG00000002339	-	93	57.692	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000005198	-	59	45.758	ENSSLDG00000013126	-	92	46.061	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000005198	-	58	77.778	ENSSLDG00000007022	-	66	77.778	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000005198	-	92	45.138	ENSSLDG00000001533	-	75	62.441	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000005198	-	81	60.976	ENSSPAG00000005977	-	92	62.084	Stegastes_partitus
ENSACIG00000005198	-	87	41.683	ENSSPAG00000001386	-	94	41.078	Stegastes_partitus
ENSACIG00000005198	-	78	41.364	ENSTRUG00000025882	-	59	41.364	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000005198	-	92	39.850	ENSTRUG00000020623	-	68	49.640	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000005198	-	90	49.606	ENSXMAG00000027923	-	84	50.098	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000005198	-	89	41.132	ENSXMAG00000019889	-	89	38.188	Xiphophorus_maculatus