EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005223 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7429 bases
Position: chrCCOE01000017.1:562730-570158
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000006633	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000006835	-	786	-	ENSACIP00000006633	261 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000005223	-	73	47.368	ENSACIG00000014716	-	76	47.368
ENSACIG00000005223	-	76	32.338	ENSACIG00000003906	-	65	32.338
ENSACIG00000005223	-	70	47.826	ENSACIG00000003582	-	59	47.826
ENSACIG00000005223	-	69	75.138	ENSACIG00000012204	-	78	75.138
ENSACIG00000005223	-	70	72.283	ENSACIG00000022355	-	63	72.283
ENSACIG00000005223	-	70	50.543	ENSACIG00000016888	-	59	50.543
ENSACIG00000005223	-	74	59.375	ENSACIG00000012718	-	80	59.375
ENSACIG00000005223	-	71	45.503	ENSACIG00000012714	-	61	45.503
ENSACIG00000005223	-	72	74.603	ENSACIG00000005780	-	57	74.603
ENSACIG00000005223	-	70	36.702	ENSACIG00000014670	-	71	36.170
ENSACIG00000005223	-	70	44.565	ENSACIG00000020244	-	77	44.565
ENSACIG00000005223	-	70	47.568	ENSACIG00000008001	-	78	47.568
ENSACIG00000005223	-	70	32.367	ENSACIG00000009149	-	68	32.367
ENSACIG00000005223	-	73	46.073	ENSACIG00000014745	-	86	46.073
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ENSACIG00000005223	-	70	52.717	ENSACIG00000022362	-	65	52.717
ENSACIG00000005223	-	70	36.957	ENSACIG00000019509	-	84	36.957
ENSACIG00000005223	-	78	32.850	ENSACIG00000003050	-	91	32.850
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ENSACIG00000005223	-	71	62.903	ENSACIG00000007178	-	64	62.903
ENSACIG00000005223	-	71	35.567	ENSACIG00000007725	-	68	35.567
ENSACIG00000005223	-	55	36.184	ENSACIG00000014730	zgc:172131	77	36.184
ENSACIG00000005223	-	73	33.668	ENSACIG00000014737	-	91	33.668
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ENSACIG00000005223	-	73	76.842	ENSACIG00000002950	-	52	75.648
ENSACIG00000005223	-	74	32.000	ENSACIG00000009811	-	81	32.000
ENSACIG00000005223	-	71	40.541	ENSACIG00000016502	-	78	40.541
ENSACIG00000005223	-	70	45.946	ENSACIG00000020225	-	62	45.946
ENSACIG00000005223	-	71	48.108	ENSACIG00000014680	-	80	48.108
ENSACIG00000005223	-	70	43.956	ENSACIG00000004040	-	70	43.956
ENSACIG00000005223	-	62	47.853	ENSACIG00000000631	-	56	47.853
ENSACIG00000005223	-	71	46.774	ENSACIG00000014655	-	69	45.699
ENSACIG00000005223	-	92	57.368	ENSACIG00000007158	-	59	63.587
ENSACIG00000005223	-	70	53.261	ENSACIG00000002263	-	65	53.261
ENSACIG00000005223	-	72	51.323	ENSACIG00000001455	-	68	51.323
ENSACIG00000005223	-	73	46.842	ENSACIG00000001596	-	74	46.842
ENSACIG00000005223	-	71	45.699	ENSACIG00000006503	-	57	45.699
ENSACIG00000005223	-	71	47.849	ENSACIG00000014662	-	75	47.849
ENSACIG00000005223	-	78	72.059	ENSACIG00000019149	-	60	72.059
ENSACIG00000005223	-	51	45.652	ENSACIG00000001465	-	85	45.652
ENSACIG00000005223	-	72	48.128	ENSACIG00000008666	-	89	48.128
ENSACIG00000005223	-	68	32.584	ENSACIG00000007737	-	69	31.892
ENSACIG00000005223	-	70	39.583	ENSACIG00000005587	-	66	39.583
ENSACIG00000005223	-	73	48.421	ENSACIG00000014703	-	78	48.421
ENSACIG00000005223	-	70	50.543	ENSACIG00000008045	-	69	50.543
ENSACIG00000005223	-	71	46.277	ENSACIG00000014634	zgc:113625	73	45.213
ENSACIG00000005223	-	72	61.497	ENSACIG00000012707	-	69	62.842
ENSACIG00000005223	-	74	46.970	ENSACIG00000007494	-	64	47.980
ENSACIG00000005223	-	71	42.781	ENSACIG00000020234	-	65	42.781
ENSACIG00000005223	-	69	42.778	ENSACIG00000000893	-	72	41.848
ENSACIG00000005223	-	86	37.624	ENSACIG00000005573	-	85	37.624
ENSACIG00000005223	-	73	71.134	ENSACIG00000006484	-	59	71.134
ENSACIG00000005223	-	73	51.309	ENSACIG00000022377	-	68	51.309
ENSACIG00000005223	-	65	74.706	ENSACIG00000022374	-	87	74.706
ENSACIG00000005223	-	71	53.226	ENSACIG00000022370	-	65	53.226
ENSACIG00000005223	-	73	48.947	ENSACIG00000014646	zgc:113625	74	47.895
ENSACIG00000005223	-	85	48.198	ENSACIG00000012159	-	56	48.198
ENSACIG00000005223	-	72	49.215	ENSACIG00000007466	-	76	49.215
ENSACIG00000005223	-	74	48.731	ENSACIG00000001070	-	70	48.731
ENSACIG00000005223	-	76	55.051	ENSACIG00000016313	-	62	55.051
ENSACIG00000005223	-	70	75.275	ENSACIG00000012648	-	61	75.275
ENSACIG00000005223	-	73	48.187	ENSACIG00000019524	-	78	48.187
ENSACIG00000005223	-	72	43.939	ENSACIG00000012061	-	58	43.939
ENSACIG00000005223	-	70	56.593	ENSACIG00000007191	-	51	56.593
ENSACIG00000005223	-	71	58.065	ENSACIG00000022222	-	59	58.065
ENSACIG00000005223	-	61	44.375	ENSACIG00000000976	-	78	44.375
ENSACIG00000005223	-	63	74.545	ENSACIG00000012761	-	72	74.545
ENSACIG00000005223	-	75	50.746	ENSACIG00000023381	-	78	50.746
ENSACIG00000005223	-	80	67.136	ENSACIG00000006478	-	74	68.447
ENSACIG00000005223	-	72	48.691	ENSACIG00000004245	-	67	48.691
ENSACIG00000005223	-	76	44.949	ENSACIG00000014690	-	75	44.949

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005223	-	72	78.075	ENSAPOG00000018915	-	80	78.075	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	69	33.684	ENSAPOG00000002527	-	61	33.163	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	74	36.816	ENSAPOG00000009288	-	74	36.816	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	43.229	ENSAPOG00000021365	-	59	43.229	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	74.317	ENSAPOG00000009059	-	92	69.730	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	73	71.134	ENSAPOG00000007123	-	71	71.134	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	71	42.632	ENSAPOG00000000066	-	52	42.408	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	75	58.791	ENSAPOG00000022321	-	84	58.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	39.344	ENSAPOG00000008529	-	71	38.503	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	74	71.066	ENSAPOG00000002337	-	64	71.066	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	36.041	ENSAPOG00000002517	-	66	36.041	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	78.261	ENSAPOG00000001075	-	84	78.261	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	69.189	ENSAPOG00000007631	-	86	69.189	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	71	58.602	ENSAPOG00000010738	-	60	58.602	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	70	51.099	ENSAPOG00000020108	-	52	51.099	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005223	-	66	72.832	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	72.832	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005223	-	70	44.086	ENSAOCG00000013326	-	64	44.086	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005223	-	78	37.745	ENSAOCG00000015984	-	65	37.931	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005223	-	70	37.824	ENSAOCG00000016099	-	84	37.824	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005223	-	64	44.910	ENSAOCG00000007815	-	61	44.910	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005223	-	71	41.398	ENSAPEG00000013532	-	93	41.622	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	70	44.681	ENSAPEG00000019003	-	71	44.681	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	69	34.737	ENSAPEG00000002163	-	65	34.737	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	65	45.294	ENSAPEG00000013378	-	61	45.294	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	78	57.353	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	78	68.468	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	72	41.176	ENSAPEG00000003513	-	79	51.754	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	70	37.824	ENSAPEG00000002121	-	84	37.824	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	71	41.622	ENSAPEG00000013508	-	77	41.622	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005223	-	70	35.233	ENSATEG00000010978	-	72	35.417	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	79	56.923	ENSATEG00000011594	-	79	56.923	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	90	63.830	ENSATEG00000011918	-	67	71.144	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	69	42.222	ENSATEG00000017209	-	67	42.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	73	77.368	ENSATEG00000011820	-	68	77.368	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	72	60.847	ENSATEG00000011789	-	57	60.847	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	68	44.633	ENSATEG00000009383	-	58	44.633	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	72	45.455	ENSATEG00000019504	-	61	44.565	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	64	72.892	ENSATEG00000012017	-	69	72.892	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	70	38.743	ENSATEG00000010991	-	72	38.743	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	75	76.720	ENSATEG00000011931	-	79	76.720	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	70	41.146	ENSATEG00000010966	-	81	41.146	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	75	69.000	ENSATEG00000011712	-	77	69.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	90	67.234	ENSATEG00000011953	-	59	72.038	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	75	76.271	ENSATEG00000011635	-	74	74.457	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	55	67.361	ENSATEG00000011771	-	80	68.310	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	70	34.239	ENSATEG00000020398	-	52	34.239	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	76	70.202	ENSATEG00000011837	-	59	71.579	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	69	77.222	ENSATEG00000011979	-	84	77.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	65	73.964	ENSATEG00000011978	-	85	73.964	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	70	35.602	ENSATEG00000011021	-	54	35.602	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	74	73.958	ENSATEG00000011720	-	70	73.958	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	51	70.149	ENSATEG00000011891	-	84	70.149	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	70	78.261	ENSATEG00000011814	-	59	78.261	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005223	-	72	39.286	ENSACLG00000001790	-	64	39.286	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005223	-	70	32.432	ENSACLG00000000859	-	65	32.432	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005223	-	72	36.869	ENSACLG00000001909	-	59	36.869	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005223	-	70	46.995	ENSACLG00000003393	-	73	46.995	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005223	-	75	37.255	ENSACLG00000001800	-	63	37.059	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005223	-	74	39.604	ENSACLG00000001886	-	64	39.604	Astatotilapia_calliptera
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