EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005298 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16272 bases
Position: chrCCOE01000497.1:141235-157506
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000006752	PAZ	PF02170.22	5.5e-29	1	1
ENSACIP00000006752	Piwi	PF02171.17	6.7e-90	1	2
ENSACIP00000006752	Piwi	PF02171.17	6.7e-90	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000006959	-	2052	-	ENSACIP00000006752	683 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000005298	ago1	95	84.694	ENSACIG00000019272	AGO3	87	84.694
ENSACIG00000005298	ago1	95	82.665	ENSACIG00000014548	ago4	88	82.665
ENSACIG00000005298	ago1	99	78.661	ENSACIG00000001179	ago2	99	78.661
ENSACIG00000005298	ago1	95	85.423	ENSACIG00000005333	ago3a	87	85.423

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSG00000092847	AGO1	90	92.023	Homo_sapiens
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSAPOG00000024299	ago1	96	94.898	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSAMEG00000000504	AGO1	82	92.023	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSAOCG00000017727	ago1	82	93.162	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSAPEG00000004458	ago1	83	93.162	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSATEG00000008523	ago1	82	93.162	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005298	ago1	93	86.337	ENSAPLG00000010440	AGO1	79	86.337	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSACAG00000029174	AGO1	90	92.023	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSANAG00000037711	AGO1	82	92.023	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	ENSACLG00000000890	ago1	89	87.607	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005298	ago1	95	94.752	ENSAMXG00000001917	ago1	98	94.752	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSBTAG00000012253	AGO1	82	92.023	Bos_taurus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCJAG00000032023	AGO1	82	92.023	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCAFG00000003443	AGO1	82	92.023	Canis_familiaris
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCAFG00020009251	AGO1	85	91.607	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCHIG00000011848	-	82	91.089	Capra_hircus
ENSACIG00000005298	ago1	98	72.080	ENSTSYG00000032426	-	96	73.324	Carlito_syrichta
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSTSYG00000009767	-	82	92.023	Carlito_syrichta
ENSACIG00000005298	ago1	84	92.600	ENSCAPG00000010228	AGO1	86	91.915	Cavia_aperea
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCPOG00000011568	AGO1	82	92.023	Cavia_porcellus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCCAG00000011823	AGO1	82	92.023	Cebus_capucinus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCATG00000031521	AGO1	90	92.023	Cercocebus_atys
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCLAG00000011507	AGO1	82	92.023	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCSAG00000001091	AGO1	82	92.023	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000005298	ago1	83	90.909	ENSCHOG00000011591	AGO1	67	90.909	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCPBG00000018594	AGO1	82	92.023	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCANG00000039798	AGO1	82	92.023	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCGRG00001022708	Ago1	82	92.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSCGRG00000010386	Ago1	83	92.023	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.074	ENSCSEG00000001051	ago1	83	91.074	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSCVAG00000018173	ago1	82	93.162	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.877	ENSDARG00000092644	ago1	82	92.877	Danio_rerio
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSDNOG00000008077	AGO1	90	92.023	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000005298	ago1	98	90.120	ENSDORG00000008494	Ago1	82	90.419	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000005298	ago1	83	88.516	ENSETEG00000007626	AGO1	79	88.516	Echinops_telfairi
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSEASG00005012086	AGO1	82	92.023	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSECAG00000024353	AGO1	82	92.023	Equus_caballus
ENSACIG00000005298	ago1	98	82.621	ENSEEUG00000005349	AGO1	82	82.621	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000005298	ago1	99	92.275	ENSELUG00000016803	ago1	91	92.275	Esox_lucius
ENSACIG00000005298	ago1	98	96.707	ENSFCAG00000000746	AGO1	81	96.707	Felis_catus
ENSACIG00000005298	ago1	95	89.826	ENSFALG00000000790	AGO1	88	89.826	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSFDAG00000017210	AGO1	82	92.023	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSFHEG00000017927	ago1	84	93.162	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005298	ago1	98	79.374	ENSGMOG00000019413	ago1	94	79.374	Gadus_morhua
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSGALG00000002249	AGO1	82	92.023	Gallus_gallus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSGAFG00000009775	ago1	82	93.162	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.766	ENSGACG00000012443	ago1	94	92.766	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSGAGG00000012893	-	90	92.023	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSGGOG00000003316	AGO1	82	92.023	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	ENSHBUG00000010459	ago1	89	87.607	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSHGLG00000011540	AGO1	82	92.023	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSHGLG00100005568	AGO1	82	92.023	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSHCOG00000005708	ago1	83	93.162	Hippocampus_comes
ENSACIG00000005298	ago1	98	94.767	ENSIPUG00000023216	ago1	90	94.767	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSSTOG00000010857	AGO1	82	92.023	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSJJAG00000019449	Ago1	82	92.023	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSKMAG00000019464	ago1	82	93.162	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000005298	ago1	96	97.904	ENSLBEG00000007694	ago1	99	97.904	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005298	ago1	98	85.227	ENSLACG00000017009	AGO1	82	85.227	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000005298	ago1	98	88.889	ENSLOCG00000000504	AGO1	82	88.889	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSLAFG00000010835	AGO1	83	92.023	Loxodonta_africana
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMFAG00000002846	AGO1	82	92.023	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000005298	ago1	98	86.467	ENSMMUG00000006251	AGO1	83	86.460	Macaca_mulatta
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMNEG00000028881	AGO1	90	92.023	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMLEG00000038388	AGO1	82	92.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSMAMG00000008381	ago1	99	91.317	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	ENSMZEG00005007996	ago1	89	87.607	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005298	ago1	96	87.896	ENSMGAG00000003822	AGO1	81	87.896	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMAUG00000015189	Ago1	82	92.023	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMICG00000016147	AGO1	82	92.023	Microcebus_murinus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMOCG00000000537	Ago1	82	92.023	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000005298	ago1	93	93.648	ENSMMOG00000018459	ago1	94	93.648	Mola_mola
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	ENSMODG00000023335	AGO1	82	91.880	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.020	ENSMALG00000011057	ago1	84	93.020	Monopterus_albus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	91.863	Mus_caroli
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	91.863	Mus_musculus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	91.863	Mus_pahari
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	91.863	Mus_spretus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSMPUG00000014872	AGO1	98	92.023	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000005298	ago1	55	94.667	ENSMLUG00000009628	AGO1	72	94.667	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSNGAG00000017448	Ago1	82	92.023	Nannospalax_galili
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	ENSNBRG00000010867	ago1	90	93.305	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSNLEG00000011181	AGO1	82	92.023	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000005298	ago1	81	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	71	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000005298	ago1	86	97.959	ENSOPRG00000012325	AGO1	73	97.959	Ochotona_princeps
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSODEG00000005321	AGO1	82	92.023	Octodon_degus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.305	ENSONIG00000016345	ago1	83	93.305	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005298	ago1	98	82.553	ENSOANG00000002080	AGO1	82	82.553	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	ENSOCUG00000023116	AGO1	82	91.880	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSORLG00000014965	ago1	82	93.162	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSORLG00020018253	ago1	82	93.162	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSORLG00015003287	ago1	82	93.162	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSOMEG00000020528	ago1	82	93.162	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSOGAG00000010279	AGO1	82	92.023	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSOARG00000019591	AGO1	82	92.023	Ovis_aries
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPPAG00000034838	AGO1	82	92.023	Pan_paniscus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPPRG00000006475	AGO1	82	92.023	Panthera_pardus
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.738	ENSPTIG00000020991	AGO1	82	91.738	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPTRG00000000528	AGO1	82	92.023	Pan_troglodytes
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPANG00000009060	AGO1	82	92.023	Papio_anubis
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.051	ENSPSIG00000017482	AGO1	84	91.051	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000005298	ago1	96	94.485	ENSPMGG00000024099	ago1	99	94.485	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPEMG00000023313	Ago1	82	92.023	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	ENSPCIG00000000172	AGO1	82	91.880	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSPFOG00000005867	ago1	82	93.162	Poecilia_formosa
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSPLAG00000002824	ago1	99	94.898	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSPMEG00000001787	ago1	99	94.898	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	ENSPREG00000006534	ago1	82	93.162	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPPYG00000001551	AGO1	82	92.023	Pongo_abelii
ENSACIG00000005298	ago1	56	99.153	ENSPCAG00000005604	AGO1	51	99.153	Procavia_capensis
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPCOG00000022061	AGO1	90	92.023	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	ENSPVAG00000005082	AGO1	82	92.023	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000005298	ago1	98	87.607	ENSPNYG00000012586	ago1	89	87.607	Pundamilia_nyererei
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