EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005333 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago3a
Alias: Ago3a|eif2c3a|sb:eu275|sb:eu416
Full Name: argonaute RISC catalytic component 3a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17631 bases
Position: chrCCOE01000497.1:176717-194347
Accession: ZDB-GENE-051107-16
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000006805	PAZ	PF02170.22	1.3e-28	1	1
ENSACIP00000006805	Piwi	PF02171.17	8.7e-114	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000007012	-	2376	-	ENSACIP00000006805	791 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.966	ENSACIG00000019272	AGO3	100	96.966
ENSACIG00000005333	ago3a	100	81.491	ENSACIG00000014548	ago4	100	81.491
ENSACIG00000005333	ago3a	87	85.423	ENSACIG00000005298	ago1	95	85.423
ENSACIG00000005333	ago3a	87	85.341	ENSACIG00000001179	ago2	95	85.341

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSG00000126070	AGO3	100	98.403	Homo_sapiens
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	ENSAPOG00000024260	ago3a	92	99.874	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.491	ENSAPOG00000014494	-	92	96.491	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSAMEG00000000497	AGO3	92	97.851	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000005333	ago3a	50	91.951	ENSAOCG00000022538	-	78	91.951	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005333	ago3a	100	89.128	ENSAOCG00000017051	-	99	89.128	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	ENSAOCG00000017642	ago3a	92	99.874	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.997	ENSAPEG00000004375	ago3a	92	98.997	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.366	ENSAPEG00000020249	-	92	96.366	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.491	ENSATEG00000005160	-	92	96.491	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.997	ENSATEG00000008458	ago3a	92	98.997	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.854	ENSAPLG00000009642	AGO3	92	97.854	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSACAG00000003385	AGO3	92	97.851	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSANAG00000037735	AGO3	92	97.851	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	ENSACLG00000000963	ago3a	100	98.491	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.990	ENSACLG00000001965	-	92	95.990	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.219	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	97.219	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.449	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	95.449	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSBTAG00000018324	AGO3	97	97.851	Bos_taurus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCJAG00000031580	AGO3	92	97.851	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSCAFG00000024682	AGO3	92	97.724	Canis_familiaris
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCAFG00020009051	AGO3	98	98.542	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCHIG00000011536	AGO3	92	97.851	Capra_hircus
ENSACIG00000005333	ago3a	83	97.710	ENSTSYG00000011897	AGO3	90	97.710	Carlito_syrichta
ENSACIG00000005333	ago3a	100	82.346	ENSCAPG00000011589	AGO3	99	78.463	Cavia_aperea
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.058	ENSCPOG00000030524	AGO3	92	94.058	Cavia_porcellus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	98.403	Cebus_capucinus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCATG00000029748	AGO3	100	98.403	Cercocebus_atys
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCLAG00000013184	AGO3	93	97.851	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCSAG00000001092	AGO3	92	97.851	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000005333	ago3a	87	97.143	ENSCHOG00000011621	AGO3	80	97.143	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.977	ENSCPBG00000018583	AGO3	98	97.977	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSCANG00000033258	AGO3	100	98.403	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSCGRG00001024614	Ago3	92	97.724	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSCGRG00000010670	Ago3	92	97.724	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.862	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	98.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	91.011	ENSCSEG00000009788	-	100	91.011	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.621	ENSCVAG00000018224	ago3a	92	99.621	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.598	ENSDARG00000063079	ago3b	92	97.598	Danio_rerio
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.496	ENSDARG00000059888	ago3a	92	98.496	Danio_rerio
ENSACIG00000005333	ago3a	87	97.823	ENSDNOG00000008106	AGO3	91	97.823	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSDORG00000009414	Ago3	92	97.724	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000005333	ago3a	80	96.620	ENSETEG00000007639	AGO3	78	96.620	Echinops_telfairi
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSEASG00005012089	AGO3	92	97.851	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSECAG00000023972	AGO3	97	97.851	Equus_caballus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	79.772	ENSEEUG00000007058	AGO3	92	79.772	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.828	ENSELUG00000016755	ago3a	100	95.828	Esox_lucius
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.674	ENSELUG00000001774	-	100	92.920	Esox_lucius
ENSACIG00000005333	ago3a	79	98.403	ENSFCAG00000000747	-	100	98.403	Felis_catus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.854	ENSFALG00000000802	AGO3	92	97.854	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSFDAG00000012874	AGO3	93	97.851	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.862	ENSFHEG00000016205	-	92	94.915	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.104	ENSGMOG00000013069	-	95	98.104	Gadus_morhua
ENSACIG00000005333	ago3a	89	80.081	ENSGMOG00000019418	-	89	80.081	Gadus_morhua
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.977	ENSGALG00000043711	AGO3	94	97.977	Gallus_gallus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	ENSGAFG00000009808	ago3a	92	99.874	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.987	ENSGAFG00000015911	-	100	92.162	Gambusia_affinis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.460	ENSGACG00000002455	AGO3	95	96.460	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.866	ENSGACG00000012453	ago3a	99	98.866	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.977	ENSGAGG00000012887	AGO3	92	97.977	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSGGOG00000036711	AGO3	92	97.851	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.990	ENSHBUG00000017794	-	92	95.990	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005333	ago3a	93	95.393	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	95.393	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSHGLG00000012538	AGO3	92	97.851	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.345	ENSHGLG00100006043	AGO3	93	97.345	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000005333	ago3a	87	97.399	ENSHCOG00000005674	ago3a	90	97.399	Hippocampus_comes
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.862	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	92.035	Hippocampus_comes
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.368	ENSIPUG00000008548	ago3b	92	97.368	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	93.317	ENSIPUG00000023241	ago3a	92	93.317	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000005333	ago3a	96	97.886	ENSSTOG00000025904	AGO3	92	97.886	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSJJAG00000017436	Ago3	92	97.724	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.997	ENSKMAG00000019534	ago3a	92	98.997	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.494	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	99.494	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.056	ENSLBEG00000016073	-	92	95.056	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSLAFG00000002744	AGO3	92	97.851	Loxodonta_africana
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	98.403	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMMUG00000006252	AGO3	92	97.851	Macaca_mulatta
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	98.403	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	98.403	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	98.862	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	98.862	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	95.865	ENSMAMG00000005697	-	92	95.865	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	98.491	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.115	ENSMZEG00005026243	-	92	96.115	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.854	ENSMGAG00000003773	AGO3	92	97.854	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000005333	ago3a	100	84.829	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	84.956	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMICG00000016158	AGO3	92	97.851	Microcebus_murinus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.690	ENSMOCG00000020568	Ago3	92	94.690	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.437	ENSMMOG00000014065	-	100	94.437	Mola_mola
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.541	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	94.541	Mola_mola
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSMODG00000017869	AGO3	92	97.851	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.311	ENSMALG00000014658	-	100	91.801	Monopterus_albus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.207	ENSMALG00000010895	ago3a	100	93.665	Monopterus_albus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.345	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	97.345	Mus_caroli
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.092	ENSMUSG00000028842	Ago3	92	97.092	Mus_musculus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.345	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	92	97.345	Mus_pahari
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.472	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	92	97.472	Mus_spretus
ENSACIG00000005333	ago3a	79	98.243	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	98.243	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	ENSNGAG00000012607	Ago3	93	97.724	Nannospalax_galili
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.839	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	96.839	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005333	ago3a	100	90.818	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	90.818	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005333	ago3a	100	93.173	ENSNLEG00000027092	AGO3	92	93.173	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000005333	ago3a	87	94.286	ENSMEUG00000009200	AGO3	84	94.286	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000005333	ago3a	80	97.790	ENSOPRG00000012344	AGO3	74	97.790	Ochotona_princeps
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSODEG00000005161	AGO3	93	97.851	Octodon_degus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	100.000	ENSONIG00000016349	ago3a	92	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	96.966	ENSONIG00000013760	AGO3	92	96.966	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.854	ENSOANG00000002078	AGO3	94	97.854	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	ENSOCUG00000006255	AGO3	92	97.851	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.621	ENSORLG00000015016	ago3a	100	99.621	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005333	ago3a	100	94.564	ENSORLG00000009091	-	92	94.564	Oryzias_latipes
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