EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005573 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22674 bases
Position: chrCCOE01000710.1:4940-27613
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000007102	MMR_HSR1	PF01926.23	4.5e-29	1	2
ENSACIP00000007102	MMR_HSR1	PF01926.23	4.5e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000007314	-	2028	-	ENSACIP00000007102	675 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000005573	-	93	40.541	ENSACIG00000006484	-	71	40.541
ENSACIG00000005573	-	94	35.096	ENSACIG00000007466	-	83	35.096
ENSACIG00000005573	-	91	39.720	ENSACIG00000000893	-	84	39.720
ENSACIG00000005573	-	97	39.301	ENSACIG00000008045	-	78	40.704
ENSACIG00000005573	-	88	37.245	ENSACIG00000012714	-	70	37.245
ENSACIG00000005573	-	90	36.916	ENSACIG00000012718	-	89	36.916
ENSACIG00000005573	-	89	38.500	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	38.500
ENSACIG00000005573	-	88	36.364	ENSACIG00000020225	-	70	36.364
ENSACIG00000005573	-	87	55.288	ENSACIG00000012061	-	62	55.288
ENSACIG00000005573	-	85	37.755	ENSACIG00000007178	-	66	37.755
ENSACIG00000005573	-	90	39.899	ENSACIG00000014690	-	83	39.899
ENSACIG00000005573	-	89	38.265	ENSACIG00000006478	-	77	38.265
ENSACIG00000005573	-	96	40.465	ENSACIG00000005780	-	75	40.465
ENSACIG00000005573	-	90	37.500	ENSACIG00000023381	-	85	37.500
ENSACIG00000005573	-	89	38.144	ENSACIG00000004245	-	73	38.144
ENSACIG00000005573	-	89	35.407	ENSACIG00000014716	-	88	35.407
ENSACIG00000005573	-	85	37.624	ENSACIG00000005223	-	86	37.624
ENSACIG00000005573	-	92	39.269	ENSACIG00000014655	-	80	39.269
ENSACIG00000005573	-	91	41.146	ENSACIG00000022370	-	78	41.146
ENSACIG00000005573	-	73	40.230	ENSACIG00000012204	-	75	40.230
ENSACIG00000005573	-	89	39.796	ENSACIG00000002263	-	74	40.306
ENSACIG00000005573	-	81	32.886	ENSACIG00000003906	-	69	32.886
ENSACIG00000005573	-	91	35.821	ENSACIG00000016313	-	71	35.821
ENSACIG00000005573	-	89	32.990	ENSACIG00000016502	-	89	32.990
ENSACIG00000005573	-	88	37.186	ENSACIG00000014745	-	90	37.186
ENSACIG00000005573	-	88	39.196	ENSACIG00000007158	-	65	39.196
ENSACIG00000005573	-	92	39.207	ENSACIG00000016635	-	85	39.207
ENSACIG00000005573	-	81	34.146	ENSACIG00000014670	-	80	34.146
ENSACIG00000005573	-	91	31.818	ENSACIG00000007725	-	87	31.818
ENSACIG00000005573	-	97	36.087	ENSACIG00000020234	-	81	36.087
ENSACIG00000005573	-	79	30.918	ENSACIG00000014737	-	93	30.918
ENSACIG00000005573	-	84	36.979	ENSACIG00000015088	-	75	36.979
ENSACIG00000005573	-	89	38.191	ENSACIG00000014680	-	94	38.191
ENSACIG00000005573	-	72	41.615	ENSACIG00000022374	-	87	41.615
ENSACIG00000005573	-	91	40.306	ENSACIG00000022355	-	75	40.306
ENSACIG00000005573	-	88	39.691	ENSACIG00000008001	-	88	39.691
ENSACIG00000005573	-	95	37.946	ENSACIG00000004040	-	96	37.946
ENSACIG00000005573	-	90	37.209	ENSACIG00000019149	-	65	38.140
ENSACIG00000005573	-	51	43.519	ENSACIG00000001465	-	76	43.519
ENSACIG00000005573	-	89	38.144	ENSACIG00000001070	-	74	38.144
ENSACIG00000005573	-	87	32.243	ENSACIG00000009149	-	74	32.243
ENSACIG00000005573	-	89	38.318	ENSACIG00000002950	-	55	38.318
ENSACIG00000005573	-	89	39.487	ENSACIG00000022362	-	75	39.487
ENSACIG00000005573	-	90	40.909	ENSACIG00000022366	-	77	40.909
ENSACIG00000005573	-	89	42.056	ENSACIG00000022222	-	66	42.056
ENSACIG00000005573	-	88	37.500	ENSACIG00000012707	-	79	37.500
ENSACIG00000005573	-	74	30.726	ENSACIG00000003050	-	76	30.726
ENSACIG00000005573	-	92	59.556	ENSACIG00000005587	-	82	59.556
ENSACIG00000005573	-	91	38.164	ENSACIG00000019524	-	89	38.164
ENSACIG00000005573	-	75	37.267	ENSACIG00000008666	-	86	37.267
ENSACIG00000005573	-	90	41.667	ENSACIG00000022377	-	76	41.667
ENSACIG00000005573	-	85	34.518	ENSACIG00000009811	-	81	34.518
ENSACIG00000005573	-	89	36.318	ENSACIG00000006503	-	65	36.318
ENSACIG00000005573	-	70	38.462	ENSACIG00000000976	-	85	38.462
ENSACIG00000005573	-	92	37.186	ENSACIG00000014662	-	89	37.186
ENSACIG00000005573	-	90	39.726	ENSACIG00000007191	-	59	39.726
ENSACIG00000005573	-	91	39.381	ENSACIG00000012648	-	77	39.381
ENSACIG00000005573	-	89	35.111	ENSACIG00000020244	-	89	35.111
ENSACIG00000005573	-	89	35.500	ENSACIG00000014703	-	85	35.500
ENSACIG00000005573	-	71	42.236	ENSACIG00000000631	-	58	42.236
ENSACIG00000005573	-	92	36.364	ENSACIG00000001455	-	82	36.364
ENSACIG00000005573	-	83	31.443	ENSACIG00000019509	-	91	31.443
ENSACIG00000005573	-	90	36.681	ENSACIG00000016888	-	71	36.681
ENSACIG00000005573	-	68	44.025	ENSACIG00000012761	-	71	44.025
ENSACIG00000005573	-	88	38.647	ENSACIG00000014634	zgc:113625	81	38.462
ENSACIG00000005573	-	88	39.487	ENSACIG00000003582	-	65	39.487
ENSACIG00000005573	-	89	37.436	ENSACIG00000007494	-	67	38.462
ENSACIG00000005573	-	89	35.616	ENSACIG00000012159	-	55	35.616
ENSACIG00000005573	-	86	37.766	ENSACIG00000001596	-	76	37.766

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005573	-	87	30.348	ENSAPOG00000008819	-	88	30.348	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	88	36.818	ENSAPOG00000010738	-	68	36.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	89	38.350	ENSAPOG00000001075	-	95	38.350	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	94	68.137	ENSAPOG00000002517	-	89	68.137	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	71	37.423	ENSAPOG00000007631	-	78	37.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	93	37.255	ENSAPOG00000007123	-	100	37.255	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	88	55.072	ENSAPOG00000009288	-	79	55.072	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	89	60.000	ENSAPOG00000002527	-	82	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	88	32.547	ENSAPOG00000020108	-	59	32.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	82	36.207	ENSAPOG00000009059	-	93	36.207	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	89	36.842	ENSAPOG00000018915	-	87	36.842	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	97	39.091	ENSAPOG00000002337	-	81	39.091	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	89	35.859	ENSAPOG00000021365	-	70	35.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	91	39.698	ENSAPOG00000000066	-	62	39.698	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	88	33.838	ENSAPOG00000008529	-	78	33.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005573	-	90	58.796	ENSAOCG00000016082	-	52	58.796	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	74	40.237	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	71	40.237	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	89	59.799	ENSAOCG00000016099	-	96	59.799	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	72	41.509	ENSAOCG00000007815	-	65	39.655	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	90	34.375	ENSAOCG00000013326	-	79	34.375	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	90	35.780	ENSAOCG00000015984	-	70	35.780	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005573	-	89	34.715	ENSAPEG00000019003	-	84	34.715	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	73	40.828	ENSAPEG00000013378	-	63	40.828	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	96	30.049	ENSAPEG00000008662	-	54	30.049	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	92	49.029	ENSAPEG00000002163	-	87	49.029	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	92	34.862	ENSAPEG00000003513	-	79	42.478	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	91	40.889	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	84	40.870	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	93	30.052	ENSAPEG00000008618	-	55	30.052	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	89	35.533	ENSAPEG00000013508	-	88	35.533	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	89	59.799	ENSAPEG00000002121	-	96	59.799	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005573	-	87	35.751	ENSAPEG00000013532	-	100	35.751	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000005573	-	87	38.835	ENSATEG00000011979	-	92	38.835	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	69	40.881	ENSATEG00000011978	-	83	40.881	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	67.692	ENSATEG00000010901	-	56	67.692	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	88	38.000	ENSATEG00000011720	-	76	38.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	37.000	ENSATEG00000011837	-	64	36.735	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	65.138	ENSATEG00000011021	-	62	65.138	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	97	53.365	ENSATEG00000010951	-	55	53.365	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	97	31.887	ENSATEG00000011594	-	90	31.887	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	90	32.673	ENSATEG00000019504	-	73	32.673	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	38.140	ENSATEG00000011918	-	70	38.140	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	90	41.509	ENSATEG00000011789	-	64	41.509	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	59	40.972	ENSATEG00000011891	-	91	40.972	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	39.070	ENSATEG00000011814	-	66	39.070	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	88	68.966	ENSATEG00000010978	-	78	68.966	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	94	37.755	ENSATEG00000011820	-	78	37.755	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	95	31.873	ENSATEG00000011931	-	88	31.873	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	96	41.150	ENSATEG00000011341	-	55	41.150	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	88	37.129	ENSATEG00000011712	-	79	37.129	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000005573	-	90	68.912	ENSATEG00000010991	-	85	68.912	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	87	36.585	ENSATEG00000017209	-	74	36.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	61.972	ENSATEG00000010966	-	93	61.972	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	93	40.930	ENSATEG00000011635	-	97	32.817	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	57	40.909	ENSATEG00000011771	-	74	40.909	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	75	39.412	ENSATEG00000009383	-	60	39.412	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005573	-	89	32.536	ENSACLG00000016272	-	76	32.536	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005573	-	91	59.556	ENSACLG00000001800	-	70	52.000	Astatotilapia_calliptera
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