EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000005897 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo3
Alias: zgc:55409
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28121 bases
Position: chrCCOE01000877.1:142036-170156
Accession: ZDB-GENE-040426-708
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000007558	Xpo1	PF08389.12	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000007778	-	2643	-	ENSACIP00000007558	880 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSG00000064419	TNPO3	100	84.247	Homo_sapiens
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	94.494	ENSAPOG00000018347	tnpo3	96	95.130	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	80.921	ENSAMEG00000005135	TNPO3	94	80.921	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	94.719	ENSAOCG00000008264	tnpo3	96	95.357	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.357	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	95.357	Amphiprion_percula
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	93.371	ENSATEG00000003197	tnpo3	96	93.998	Anabas_testudineus
ENSACIG00000005897	tnpo3	74	81.445	ENSAPLG00000005946	TNPO3	90	81.445	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000005897	tnpo3	83	83.401	ENSACAG00000013470	TNPO3	92	84.060	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSANAG00000037940	TNPO3	96	84.145	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.372	ENSACLG00000005561	tnpo3	96	95.372	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	90.225	ENSAMXG00000016236	tnpo3	96	90.225	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.258	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	84.364	Bos_taurus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.258	ENSCJAG00000018085	TNPO3	96	84.258	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCAFG00000001543	TNPO3	96	84.145	Canis_familiaris
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCAFG00020022462	TNPO3	95	83.766	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	83.596	ENSCHIG00000011721	TNPO3	96	84.145	Capra_hircus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSTSYG00000002989	TNPO3	96	84.032	Carlito_syrichta
ENSACIG00000005897	tnpo3	74	84.946	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	84.946	Cavia_aperea
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	83.258	ENSCPOG00000039784	TNPO3	96	83.805	Cavia_porcellus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.258	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	84.364	Cebus_capucinus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	84.247	Cercocebus_atys
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.352	ENSCLAG00000016298	TNPO3	96	83.352	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSCSAG00000009966	TNPO3	96	84.032	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000005897	tnpo3	92	62.368	ENSCHOG00000011547	TNPO3	89	62.368	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000005897	tnpo3	96	83.781	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	83.781	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	47.410	ENSCING00000005042	-	96	47.410	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	45.885	ENSCSAVG00000008623	-	96	45.885	Ciona_savignyi
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	84.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	96	84.145	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	96	84.145	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.348	ENSCSEG00000005952	tnpo3	96	91.959	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.937	ENSCVAG00000020285	tnpo3	96	92.551	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	90.600	ENSDARG00000045680	tnpo3	96	90.600	Danio_rerio
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSDNOG00000002556	TNPO3	96	84.032	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000005897	tnpo3	61	83.700	ENSDORG00000002433	Tnpo3	90	83.700	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	42.969	FBgn0031456	Tnpo-SR	96	42.969	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000005897	tnpo3	94	85.301	ENSETEG00000002101	TNPO3	86	85.301	Echinops_telfairi
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	68.427	ENSEBUG00000016931	tnpo3	97	68.427	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSEASG00005008677	TNPO3	96	84.032	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	84.131	Equus_caballus
ENSACIG00000005897	tnpo3	98	79.283	ENSEEUG00000005178	TNPO3	93	79.283	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	92.752	ENSELUG00000012153	tnpo3	96	92.752	Esox_lucius
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSFCAG00000018186	TNPO3	100	84.247	Felis_catus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	79.822	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	79.822	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.729	ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	83.729	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.601	ENSFHEG00000012859	tnpo3	96	92.212	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	92.186	ENSGMOG00000007324	tnpo3	96	92.186	Gadus_morhua
ENSACIG00000005897	tnpo3	60	84.181	ENSGALG00000039420	TNPO3	93	84.181	Gallus_gallus
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	92.584	ENSGACG00000000699	tnpo3	96	92.584	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	96	83.664	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	83.664	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	84.247	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.372	ENSHBUG00000008351	tnpo3	96	95.372	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSHGLG00000004463	TNPO3	96	84.032	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSHGLG00100005509	TNPO3	96	84.032	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	89.663	ENSHCOG00000007221	tnpo3	96	89.663	Hippocampus_comes
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	89.462	ENSIPUG00000014979	TNPO3	96	89.354	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSSTOG00000004885	TNPO3	100	84.131	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	97	79.977	ENSJJAG00000013530	Tnpo3	96	79.977	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	92.438	ENSKMAG00000010497	tnpo3	96	92.438	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	91.280	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	91.280	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	89.001	ENSLBEG00000011988	-	100	89.001	Labrus_bergylta
ENSACIG00000005897	tnpo3	82	85.666	ENSLACG00000002351	TNPO3	95	85.666	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	89.807	ENSLOCG00000015556	tnpo3	96	89.807	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.427	ENSLAFG00000002738	TNPO3	96	83.427	Loxodonta_africana
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMFAG00000032385	TNPO3	100	84.247	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMMUG00000004311	TNPO3	100	84.247	Macaca_mulatta
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	84.247	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	84.247	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	93.820	ENSMAMG00000021096	tnpo3	96	94.451	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.372	ENSMZEG00005015084	tnpo3	96	95.372	Maylandia_zebra
ENSACIG00000005897	tnpo3	81	80.471	ENSMGAG00000002839	TNPO3	99	80.471	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSMAUG00000013463	Tnpo3	96	84.032	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMICG00000000140	TNPO3	96	84.145	Microcebus_murinus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	96	84.145	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	92.697	ENSMMOG00000005887	tnpo3	96	92.697	Mola_mola
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.598	ENSMODG00000014700	TNPO3	96	84.598	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	93.318	ENSMALG00000006675	tnpo3	96	93.318	Monopterus_albus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.918	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	96	83.918	Mus_caroli
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.918	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	96	83.918	Mus_musculus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	96	84.032	Mus_pahari
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.805	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	96	83.805	Mus_spretus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSMPUG00000006021	TNPO3	96	84.145	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	75.198	ENSMLUG00000000947	TNPO3	95	75.198	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	96	84.032	Nannospalax_galili
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	93.057	ENSNBRG00000019001	tnpo3	95	95.289	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	80.916	ENSNLEG00000012491	TNPO3	96	80.916	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	65.902	ENSMEUG00000002445	TNPO3	87	73.298	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000005897	tnpo3	89	84.028	ENSOPRG00000006163	TNPO3	86	84.028	Ochotona_princeps
ENSACIG00000005897	tnpo3	97	83.546	ENSODEG00000012826	TNPO3	96	83.546	Octodon_degus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	95.824	ENSONIG00000007604	tnpo3	96	95.824	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	81.216	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	81.216	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	80.921	ENSOCUG00000010105	TNPO3	94	80.921	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.265	ENSORLG00000029369	tnpo3	96	91.874	Oryzias_latipes
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.265	ENSORLG00020003464	tnpo3	96	91.874	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.377	ENSORLG00015002610	tnpo3	96	91.986	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	91.601	ENSOMEG00000021006	tnpo3	96	92.212	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.371	ENSOGAG00000015340	TNPO3	96	84.371	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000005897	tnpo3	100	83.596	ENSOARG00000004026	TNPO3	96	84.145	Ovis_aries
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	84.247	Pan_paniscus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSPPRG00000002050	TNPO3	96	84.145	Panthera_pardus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSPTIG00000016167	TNPO3	96	84.145	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.145	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	84.247	Pan_troglodytes
ENSACIG00000005897	tnpo3	97	83.931	ENSPANG00000022226	TNPO3	95	83.931	Papio_anubis
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ENSACIG00000005897	tnpo3	99	86.750	ENSPKIG00000023234	tnpo3	96	86.750	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000005897	tnpo3	60	87.879	ENSPMGG00000009763	tnpo3	92	87.879	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000005897	tnpo3	99	84.032	ENSPEMG00000000422	Tnpo3	96	84.032	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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