EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006172 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 74038 bases
Position: chrCCOE01001601.1:5227-79264
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008712	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-69	1	11
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ENSACIP00000008802	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-61	1	11
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ENSACIP00000008802	zf-C2H2	PF00096.26	6.2e-61	11	11
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ENSACIP00000008772	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-46	7	7
ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	1	8
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ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	3	8
ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	4	8
ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	5	8
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ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	7	8
ENSACIP00000008644	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-43	8	8
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	1	6
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	2	6
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	3	6
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	4	6
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	5	6
ENSACIP00000008397	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-39	6	6
ENSACIP00000008101	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-24	1	4
ENSACIP00000008101	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-24	2	4
ENSACIP00000008101	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-24	3	4
ENSACIP00000008101	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-24	4	4
ENSACIP00000008871	zf-met	PF12874.7	9.3e-18	1	2
ENSACIP00000008871	zf-met	PF12874.7	9.3e-18	2	2
ENSACIP00000008712	zf-met	PF12874.7	3.3e-17	1	3
ENSACIP00000008712	zf-met	PF12874.7	3.3e-17	2	3
ENSACIP00000008712	zf-met	PF12874.7	3.3e-17	3	3
ENSACIP00000008551	zf-met	PF12874.7	3.6e-16	1	2
ENSACIP00000008551	zf-met	PF12874.7	3.6e-16	2	2
ENSACIP00000008229	zf-met	PF12874.7	6.3e-16	1	2
ENSACIP00000008229	zf-met	PF12874.7	6.3e-16	2	2
ENSACIP00000008189	zf-met	PF12874.7	2.5e-15	1	1
ENSACIP00000008802	zf-met	PF12874.7	7.9e-12	1	1
ENSACIP00000008644	zf-met	PF12874.7	7.3e-11	1	2
ENSACIP00000008644	zf-met	PF12874.7	7.3e-11	2	2
ENSACIP00000008440	zf-met	PF12874.7	4.1e-10	1	1
ENSACIP00000008772	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	1	1
ENSACIP00000008101	zf-met	PF12874.7	6.7e-08	1	1
ENSACIP00000008397	zf-met	PF12874.7	0.00015	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008341	-	705	-	ENSACIP00000008101	234 (aa)	-	-
ENSACIT00000008691	-	1272	-	ENSACIP00000008440	423 (aa)	-	-
ENSACIT00000008436	-	858	-	ENSACIP00000008189	285 (aa)	-	-
ENSACIT00000009067	-	1740	-	ENSACIP00000008802	579 (aa)	-	-
ENSACIT00000008476	-	1173	-	ENSACIP00000008229	390 (aa)	-	-
ENSACIT00000008972	-	1338	-	ENSACIP00000008712	445 (aa)	-	-
ENSACIT00000009036	-	1401	-	ENSACIP00000008772	466 (aa)	-	-
ENSACIT00000008648	-	915	-	ENSACIP00000008397	304 (aa)	-	-
ENSACIT00000008903	-	1044	-	ENSACIP00000008644	347 (aa)	-	-
ENSACIT00000008805	-	1032	-	ENSACIP00000008551	343 (aa)	-	-
ENSACIT00000009139	-	1215	-	ENSACIP00000008871	404 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006172	-	94	46.154	ENSACIG00000023794	-	83	42.500
ENSACIG00000006172	-	86	45.455	ENSACIG00000007192	zbtb7b	52	41.322
ENSACIG00000006172	-	87	37.037	ENSACIG00000020982	znf710b	50	40.206
ENSACIG00000006172	-	98	50.549	ENSACIG00000001860	-	69	50.549
ENSACIG00000006172	-	95	41.850	ENSACIG00000000406	prdm5	86	42.105
ENSACIG00000006172	-	87	41.538	ENSACIG00000006586	-	57	37.908
ENSACIG00000006172	-	95	39.189	ENSACIG00000013163	-	94	45.833
ENSACIG00000006172	-	97	52.353	ENSACIG00000000311	-	90	55.208
ENSACIG00000006172	-	99	55.758	ENSACIG00000004666	-	99	63.448
ENSACIG00000006172	-	99	55.556	ENSACIG00000018022	-	98	46.405
ENSACIG00000006172	-	97	58.140	ENSACIG00000022625	-	99	54.015
ENSACIG00000006172	-	88	39.597	ENSACIG00000014233	znf407	65	46.341
ENSACIG00000006172	-	97	57.377	ENSACIG00000019791	-	95	70.803
ENSACIG00000006172	-	84	58.904	ENSACIG00000018440	-	96	59.184
ENSACIG00000006172	-	89	49.682	ENSACIG00000007096	-	86	47.887
ENSACIG00000006172	-	83	52.809	ENSACIG00000006228	-	70	54.098
ENSACIG00000006172	-	90	47.899	ENSACIG00000022330	-	90	46.199
ENSACIG00000006172	-	97	41.875	ENSACIG00000013750	-	94	48.252
ENSACIG00000006172	-	85	44.134	ENSACIG00000017653	-	93	44.954
ENSACIG00000006172	-	98	53.070	ENSACIG00000019102	-	63	50.799
ENSACIG00000006172	-	98	56.696	ENSACIG00000004041	-	100	56.696
ENSACIG00000006172	-	84	38.095	ENSACIG00000018641	snai2	67	39.316
ENSACIG00000006172	-	95	40.769	ENSACIG00000013613	scrt1b	81	38.393
ENSACIG00000006172	-	94	56.842	ENSACIG00000014123	znf236	68	56.842
ENSACIG00000006172	-	99	59.000	ENSACIG00000017050	-	99	56.410
ENSACIG00000006172	-	90	53.219	ENSACIG00000012084	-	99	64.062
ENSACIG00000006172	-	99	49.655	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	97	53.521
ENSACIG00000006172	-	89	42.991	ENSACIG00000016117	-	88	45.455
ENSACIG00000006172	-	89	42.857	ENSACIG00000016354	gfi1ab	56	45.062
ENSACIG00000006172	-	99	52.632	ENSACIG00000019710	-	97	53.188
ENSACIG00000006172	-	97	50.833	ENSACIG00000003720	-	97	50.562
ENSACIG00000006172	-	89	50.820	ENSACIG00000015429	-	92	46.617
ENSACIG00000006172	-	95	41.860	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	83	41.860
ENSACIG00000006172	-	89	43.429	ENSACIG00000010739	-	99	40.278
ENSACIG00000006172	-	99	53.061	ENSACIG00000010966	-	77	51.977
ENSACIG00000006172	-	93	82.812	ENSACIG00000011153	-	95	82.812
ENSACIG00000006172	-	98	46.354	ENSACIG00000009717	-	98	44.224
ENSACIG00000006172	-	91	39.231	ENSACIG00000013946	-	71	36.066
ENSACIG00000006172	-	100	44.286	ENSACIG00000013149	-	85	44.286
ENSACIG00000006172	-	99	55.797	ENSACIG00000013604	-	98	61.905
ENSACIG00000006172	-	86	38.400	ENSACIG00000012263	znf319b	94	36.885
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