EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006211 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 627 bases
Position: chrCCOE01001675.1:776128-776754
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000007914	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00014	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008150	-	627	-	ENSACIP00000007914	208 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000006211's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000006211's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006211	-	77	31.953	ENSACIG00000010764	rasl10a	84	33.136
ENSACIG00000006211	-	77	35.758	ENSACIG00000006558	-	82	35.758
ENSACIG00000006211	-	79	30.303	ENSACIG00000000100	kras	53	30.303
ENSACIG00000006211	-	77	33.540	ENSACIG00000010619	rab15	75	33.540
ENSACIG00000006211	-	92	30.457	ENSACIG00000008584	rab13	84	30.457
ENSACIG00000006211	-	73	32.903	ENSACIG00000003157	-	80	32.903
ENSACIG00000006211	-	80	31.176	ENSACIG00000022381	-	82	31.176
ENSACIG00000006211	-	80	31.176	ENSACIG00000013630	RAB7A	82	31.176
ENSACIG00000006211	-	76	31.902	ENSACIG00000014012	rab22a	81	31.902
ENSACIG00000006211	-	78	30.539	ENSACIG00000000699	hrasb	85	30.539
ENSACIG00000006211	-	55	32.174	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	61	34.400
ENSACIG00000006211	-	75	31.013	ENSACIG00000014605	rab6a	75	31.013
ENSACIG00000006211	-	76	30.675	ENSACIG00000024376	-	72	30.675
ENSACIG00000006211	-	76	30.675	ENSACIG00000024374	rab11ba	65	30.675
ENSACIG00000006211	-	77	30.409	ENSACIG00000018406	rasl11a	68	30.409
ENSACIG00000006211	-	72	34.228	ENSACIG00000017824	rras	83	35.152
ENSACIG00000006211	-	80	31.765	ENSACIG00000022208	-	82	31.765
ENSACIG00000006211	-	100	80.769	ENSACIG00000008211	rasd4	100	80.769
ENSACIG00000006211	-	75	34.783	ENSACIG00000007739	rab9b	78	34.783
ENSACIG00000006211	-	60	32.031	ENSACIG00000009013	nkiras1	67	32.031
ENSACIG00000006211	-	94	31.343	ENSACIG00000018043	rab9a	96	31.343
ENSACIG00000006211	-	93	31.373	ENSACIG00000009306	RAB15	96	31.373
ENSACIG00000006211	-	77	33.133	ENSACIG00000023481	rasl11b	67	33.133

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006211	-	100	86.058	ENSAPOG00000014798	-	100	86.058	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006211	-	100	53.302	ENSAPOG00000019479	rasd3	100	53.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006211	-	100	81.731	ENSAPOG00000013337	rasd4	100	81.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006211	-	100	85.096	ENSAOCG00000013791	-	100	85.096	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006211	-	100	82.212	ENSAOCG00000011925	rasd4	100	82.212	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006211	-	100	82.212	ENSAPEG00000001236	rasd4	100	82.212	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006211	-	100	85.096	ENSAPEG00000014385	-	100	85.096	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006211	-	100	81.731	ENSATEG00000004192	-	100	81.731	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006211	-	100	87.500	ENSATEG00000004140	rasd4	100	87.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006211	-	100	80.769	ENSACLG00000005453	-	100	80.769	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006211	-	100	85.096	ENSCSEG00000017910	-	100	85.096	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006211	-	99	81.463	ENSCSEG00000003581	rasd4	97	81.463	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006211	-	100	84.135	ENSCVAG00000014662	-	100	84.135	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006211	-	99	76.812	ENSCVAG00000004658	rasd4	99	76.812	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006211	-	90	45.550	FBgn0040370	CG13375	69	45.550	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000006211	-	94	46.939	ENSEBUG00000013908	rasd3	90	46.939	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000006211	-	100	74.408	ENSELUG00000008115	-	100	74.408	Esox_lucius
ENSACIG00000006211	-	99	70.244	ENSFALG00000000852	-	99	70.244	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000006211	-	100	78.846	ENSFHEG00000003385	rasd4	100	78.846	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000006211	-	100	84.615	ENSFHEG00000016103	-	100	84.615	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000006211	-	100	78.365	ENSGAFG00000010126	rasd4	100	78.365	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006211	-	100	80.769	ENSGACG00000019357	rasd4	100	80.769	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000006211	-	99	73.171	ENSGAGG00000022039	-	99	73.171	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000006211	-	100	80.769	ENSHBUG00000003805	-	100	80.769	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006211	-	100	82.212	ENSHCOG00000015161	-	100	82.212	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006211	-	100	75.962	ENSHCOG00000018554	rasd4	100	75.962	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006211	-	100	70.673	ENSIPUG00000021888	-	100	70.673	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000006211	-	100	80.288	ENSKMAG00000000984	rasd4	100	80.288	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000006211	-	100	69.231	ENSLACG00000003581	rasd3	100	69.231	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000006211	-	100	71.635	ENSLACG00000001282	-	100	71.635	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000006211	-	100	74.519	ENSLOCG00000017761	rasd4	100	74.519	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000006211	-	100	64.455	ENSLOCG00000018104	rasd3	100	64.455	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000006211	-	100	82.212	ENSMAMG00000001194	-	100	82.212	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000006211	-	100	80.769	ENSMZEG00005023931	-	100	80.769	Maylandia_zebra
ENSACIG00000006211	-	100	86.538	ENSMMOG00000012444	rasd4	100	86.538	Mola_mola
ENSACIG00000006211	-	100	87.981	ENSMALG00000019233	rasd4	100	87.981	Monopterus_albus
ENSACIG00000006211	-	100	80.288	ENSMALG00000022582	-	100	80.288	Monopterus_albus
ENSACIG00000006211	-	100	92.308	ENSNBRG00000001521	-	100	92.308	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000006211	-	100	81.731	ENSONIG00000021230	-	100	81.731	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006211	-	100	76.442	ENSORLG00020019402	rasd4	100	76.442	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000006211	-	100	76.442	ENSORLG00015019530	rasd4	100	76.442	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000006211	-	100	76.923	ENSOMEG00000010545	rasd4	100	76.923	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000006211	-	100	77.885	ENSOMEG00000019524	-	100	77.885	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000006211	-	100	62.559	ENSPKIG00000013103	rasd3	100	62.559	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000006211	-	100	57.820	ENSPKIG00000018772	-	100	57.820	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000006211	-	100	75.000	ENSPKIG00000007853	rasd4	100	75.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000006211	-	99	72.195	ENSPSIG00000001290	-	99	72.195	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000006211	-	100	84.615	ENSPMGG00000012580	-	100	84.615	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000006211	-	100	75.481	ENSPMGG00000000859	rasd4	100	75.481	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000006211	-	100	82.692	ENSPLAG00000006115	-	100	82.692	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006211	-	100	78.846	ENSPLAG00000003951	rasd4	98	78.846	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006211	-	100	79.327	ENSPMEG00000021391	rasd4	98	79.327	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000006211	-	100	84.135	ENSPMEG00000003690	-	100	84.135	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000006211	-	100	79.327	ENSPREG00000017010	rasd4	100	79.327	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000006211	-	100	83.654	ENSPREG00000015955	-	100	83.654	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000006211	-	100	81.250	ENSPNYG00000016378	-	100	81.250	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000006211	-	100	74.519	ENSPNAG00000005318	-	100	74.519	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000006211	-	100	78.365	ENSSFOG00015004613	rasd4	100	78.365	Scleropages_formosus
ENSACIG00000006211	-	99	61.137	ENSSFOG00015008777	rasd3	99	61.137	Scleropages_formosus
ENSACIG00000006211	-	100	79.808	ENSSMAG00000016456	rasd4	100	79.808	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000006211	-	100	87.981	ENSSMAG00000009101	-	100	87.981	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000006211	-	100	88.942	ENSSDUG00000015982	rasd4	100	88.942	Seriola_dumerili
ENSACIG00000006211	-	100	82.212	ENSSDUG00000020340	-	100	82.212	Seriola_dumerili
ENSACIG00000006211	-	95	56.931	ENSSLDG00000016267	rasd3	94	56.931	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006211	-	100	88.942	ENSSLDG00000017618	rasd4	100	88.942	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006211	-	100	81.731	ENSSLDG00000002757	-	98	81.731	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006211	-	100	82.692	ENSSPAG00000021839	rasd4	100	82.692	Stegastes_partitus
ENSACIG00000006211	-	100	86.538	ENSSPAG00000011401	-	100	86.538	Stegastes_partitus
ENSACIG00000006211	-	99	73.171	ENSTGUG00000007747	-	99	73.171	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000006211	-	100	79.327	ENSTRUG00000022489	rasd4	100	79.327	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000006211	-	100	79.327	ENSXCOG00000013226	rasd4	100	79.327	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000006211	-	95	71.090	ENSXMAG00000021609	rasd4	99	71.090	Xiphophorus_maculatus