EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006228 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3100 bases
Position: chrCCOE01000167.1:763241-766340
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000007946	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-24	1	4
ENSACIP00000007946	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-24	2	4
ENSACIP00000007946	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-24	3	4
ENSACIP00000007946	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-24	4	4
ENSACIP00000007946	zf-met	PF12874.7	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008182	-	609	-	ENSACIP00000007946	202 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006228	-	71	48.361	ENSACIG00000022293	-	94	48.361
ENSACIG00000006228	-	72	48.276	ENSACIG00000013470	-	55	48.276
ENSACIG00000006228	-	64	47.826	ENSACIG00000019534	-	75	47.826
ENSACIG00000006228	-	81	50.000	ENSACIG00000004666	-	99	50.000
ENSACIG00000006228	-	80	49.123	ENSACIG00000003754	-	92	49.123
ENSACIG00000006228	-	69	43.119	ENSACIG00000020938	zbtb47b	68	43.119
ENSACIG00000006228	-	87	46.154	ENSACIG00000013750	-	67	46.154
ENSACIG00000006228	-	64	38.793	ENSACIG00000016133	-	53	38.793
ENSACIG00000006228	-	87	44.275	ENSACIG00000022738	-	90	45.055
ENSACIG00000006228	-	64	44.262	ENSACIG00000004641	-	51	44.262
ENSACIG00000006228	-	75	48.673	ENSACIG00000023212	-	76	48.673
ENSACIG00000006228	-	59	49.123	ENSACIG00000018022	-	51	49.123
ENSACIG00000006228	-	66	43.478	ENSACIG00000017644	-	85	43.478
ENSACIG00000006228	-	98	50.442	ENSACIG00000017647	-	90	50.442
ENSACIG00000006228	-	66	46.847	ENSACIG00000000286	-	69	46.847
ENSACIG00000006228	-	64	50.000	ENSACIG00000019791	-	88	48.696
ENSACIG00000006228	-	68	47.619	ENSACIG00000007034	-	73	47.619
ENSACIG00000006228	-	98	49.565	ENSACIG00000017050	-	96	51.163
ENSACIG00000006228	-	60	42.157	ENSACIG00000009128	-	72	42.157
ENSACIG00000006228	-	90	47.000	ENSACIG00000022645	-	65	47.000
ENSACIG00000006228	-	77	45.614	ENSACIG00000019710	-	71	46.281
ENSACIG00000006228	-	65	49.565	ENSACIG00000008448	-	67	49.565
ENSACIG00000006228	-	78	44.545	ENSACIG00000009717	-	85	44.545
ENSACIG00000006228	-	87	49.558	ENSACIG00000004745	-	91	49.558
ENSACIG00000006228	-	85	42.857	ENSACIG00000003515	-	93	42.857
ENSACIG00000006228	-	71	47.826	ENSACIG00000018440	-	94	47.826
ENSACIG00000006228	-	64	43.651	ENSACIG00000023794	-	57	43.651
ENSACIG00000006228	-	83	51.429	ENSACIG00000022625	-	82	51.429
ENSACIG00000006228	-	93	49.206	ENSACIG00000010647	-	96	47.541
ENSACIG00000006228	-	59	44.167	ENSACIG00000017166	-	58	44.167
ENSACIG00000006228	-	57	50.000	ENSACIG00000019804	-	57	50.000
ENSACIG00000006228	-	71	49.425	ENSACIG00000024444	-	61	49.425
ENSACIG00000006228	-	84	49.153	ENSACIG00000013604	-	89	47.788
ENSACIG00000006228	-	71	49.123	ENSACIG00000011541	-	66	49.123
ENSACIG00000006228	-	70	54.098	ENSACIG00000006172	-	83	52.809
ENSACIG00000006228	-	68	48.193	ENSACIG00000016117	-	86	48.193
ENSACIG00000006228	-	69	48.810	ENSACIG00000004626	-	80	43.443
ENSACIG00000006228	-	70	46.491	ENSACIG00000007096	-	70	46.491
ENSACIG00000006228	-	66	51.261	ENSACIG00000022658	-	89	51.261
ENSACIG00000006228	-	66	50.000	ENSACIG00000006377	-	59	50.000
ENSACIG00000006228	-	65	40.164	ENSACIG00000002190	gfi1b	56	40.164
ENSACIG00000006228	-	87	44.954	ENSACIG00000014282	znf526	51	44.954
ENSACIG00000006228	-	63	34.783	ENSACIG00000011516	-	64	34.783
ENSACIG00000006228	-	62	50.820	ENSACIG00000022330	-	83	50.820
ENSACIG00000006228	-	66	47.656	ENSACIG00000007464	-	52	47.656
ENSACIG00000006228	-	70	35.455	ENSACIG00000001767	zbtb41	63	35.455
ENSACIG00000006228	-	71	42.202	ENSACIG00000017653	-	93	42.202
ENSACIG00000006228	-	66	47.863	ENSACIG00000000311	-	58	47.863
ENSACIG00000006228	-	79	51.948	ENSACIG00000014123	znf236	51	51.948
ENSACIG00000006228	-	59	57.143	ENSACIG00000010660	-	88	57.143
ENSACIG00000006228	-	67	40.196	ENSACIG00000001369	-	80	40.196
ENSACIG00000006228	-	64	45.133	ENSACIG00000000406	prdm5	75	45.133
ENSACIG00000006228	-	62	49.398	ENSACIG00000006806	-	56	49.398
ENSACIG00000006228	-	71	48.246	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	48.246
ENSACIG00000006228	-	64	38.017	ENSACIG00000008886	znf1164	80	38.017
ENSACIG00000006228	-	69	40.385	ENSACIG00000007855	-	91	40.385
ENSACIG00000006228	-	57	38.095	ENSACIG00000018641	snai2	54	38.095
ENSACIG00000006228	-	60	48.246	ENSACIG00000010637	-	53	48.246
ENSACIG00000006228	-	69	48.598	ENSACIG00000019815	-	82	48.598
ENSACIG00000006228	-	66	41.284	ENSACIG00000017683	-	94	42.353
ENSACIG00000006228	-	97	50.000	ENSACIG00000016944	-	88	50.000
ENSACIG00000006228	-	93	50.602	ENSACIG00000012636	ZNF319	80	50.602
ENSACIG00000006228	-	60	49.541	ENSACIG00000015835	-	67	47.368
ENSACIG00000006228	-	52	37.624	ENSACIG00000013613	scrt1b	50	37.624
ENSACIG00000006228	-	72	51.754	ENSACIG00000003556	-	66	51.754
ENSACIG00000006228	-	58	47.253	ENSACIG00000017013	-	50	47.253
ENSACIG00000006228	-	86	48.438	ENSACIG00000011515	-	71	48.438
ENSACIG00000006228	-	82	43.511	ENSACIG00000009755	-	80	43.511
ENSACIG00000006228	-	86	48.837	ENSACIG00000018404	-	79	48.837
ENSACIG00000006228	-	71	50.000	ENSACIG00000019447	-	72	50.000
ENSACIG00000006228	-	81	44.715	ENSACIG00000013163	-	84	44.715
ENSACIG00000006228	-	85	39.823	ENSACIG00000023313	-	96	39.823
ENSACIG00000006228	-	67	45.918	ENSACIG00000011153	-	73	49.123
ENSACIG00000006228	-	73	33.945	ENSACIG00000012604	scrt2	55	33.945
ENSACIG00000006228	-	75	43.966	ENSACIG00000017892	-	77	43.966
ENSACIG00000006228	-	66	50.000	ENSACIG00000016182	-	83	50.000
ENSACIG00000006228	-	62	45.652	ENSACIG00000006755	-	79	45.652
ENSACIG00000006228	-	74	37.719	ENSACIG00000002180	-	98	37.719
ENSACIG00000006228	-	80	42.857	ENSACIG00000015429	-	96	51.807
ENSACIG00000006228	-	71	43.363	ENSACIG00000009780	-	74	43.363
ENSACIG00000006228	-	73	40.000	ENSACIG00000021986	-	91	40.000
ENSACIG00000006228	-	89	45.783	ENSACIG00000012263	znf319b	93	45.783
ENSACIG00000006228	-	71	47.541	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	81	47.541
ENSACIG00000006228	-	99	46.957	ENSACIG00000004041	-	90	48.750
ENSACIG00000006228	-	69	46.835	ENSACIG00000023049	znf646	99	36.893
ENSACIG00000006228	-	60	41.739	ENSACIG00000010739	-	77	41.739
ENSACIG00000006228	-	89	49.123	ENSACIG00000003720	-	73	49.123
ENSACIG00000006228	-	76	44.037	ENSACIG00000007882	-	82	44.037
ENSACIG00000006228	-	73	48.315	ENSACIG00000023162	-	50	48.315
ENSACIG00000006228	-	72	39.623	ENSACIG00000013149	-	80	38.202
ENSACIG00000006228	-	87	41.667	ENSACIG00000015411	-	68	41.667
ENSACIG00000006228	-	83	48.193	ENSACIG00000012084	-	95	48.193

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006228	-	56	41.250	ENSAPOG00000004997	-	92	41.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006228	-	68	45.614	ENSAPOG00000009709	-	53	45.614	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006228	-	81	45.349	ENSAPOG00000023008	-	63	45.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006228	-	64	44.737	ENSAOCG00000022529	-	57	44.737	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006228	-	81	45.349	ENSAOCG00000016409	-	63	45.349	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006228	-	81	45.349	ENSAPEG00000008746	-	63	45.349	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006228	-	59	44.643	ENSAPEG00000009553	-	52	44.643	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006228	-	62	47.312	ENSATEG00000021602	-	65	47.312	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006228	-	76	43.119	ENSATEG00000022064	-	95	43.119	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006228	-	81	45.299	ENSATEG00000015238	-	67	45.299	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006228	-	66	52.703	ENSATEG00000014684	-	89	48.684	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006228	-	61	43.119	ENSACLG00000019482	-	74	43.119	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	77	46.491	ENSACLG00000008374	-	56	46.491	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	65	43.820	ENSACLG00000019349	-	73	43.820	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	61	47.368	ENSACLG00000005795	-	59	47.368	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	65	45.669	ENSACLG00000022482	-	81	45.669	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	63	44.681	ENSACLG00000018716	-	71	44.681	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	65	43.411	ENSACLG00000001368	-	87	43.411	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	81	44.538	ENSACLG00000015462	-	62	44.538	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	62	47.368	ENSACLG00000020333	-	57	47.368	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	62	47.368	ENSACLG00000006718	-	57	47.368	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	77	41.176	ENSACLG00000014365	-	91	41.176	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	60	42.697	ENSACLG00000011239	-	69	42.697	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006228	-	73	48.113	ENSAMXG00000007973	-	89	40.196	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000006228	-	74	40.517	ENSAMXG00000034934	-	88	40.517	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000006228	-	71	40.476	ENSCSEG00000019599	-	65	40.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006228	-	77	38.182	ENSCSEG00000019848	-	53	38.182	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006228	-	92	44.545	ENSCVAG00000019097	-	66	44.545	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006228	-	87	69.318	ENSCVAG00000021152	-	51	60.403	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006228	-	71	45.614	ENSELUG00000004677	-	58	45.614	Esox_lucius
ENSACIG00000006228	-	81	46.903	ENSFHEG00000003460	-	61	46.903	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000006228	-	69	57.377	ENSGMOG00000017518	-	63	57.377	Gadus_morhua
ENSACIG00000006228	-	81	46.364	ENSGMOG00000009187	ZNF626	76	46.364	Gadus_morhua
ENSACIG00000006228	-	81	44.167	ENSGAFG00000001481	-	80	45.000	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006228	-	61	40.000	ENSGAFG00000007532	-	73	40.000	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006228	-	56	45.133	ENSGAGG00000015232	-	60	45.133	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000006228	-	64	46.491	ENSHBUG00000011944	-	61	46.491	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006228	-	63	43.089	ENSHBUG00000020527	-	86	43.089	Haplochromis_burtoni
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ENSACIG00000006228	-	61	48.246	ENSHBUG00000013065	-	53	48.246	Haplochromis_burtoni
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