EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006478 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1548 bases
Position: chrCCOE01000754.1:498228-499775
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008236	MMR_HSR1	PF01926.23	4.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008484	-	810	-	ENSACIP00000008236	269 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006478	-	77	51.208	ENSACIG00000001455	-	75	51.208
ENSACIG00000006478	-	76	50.980	ENSACIG00000004245	-	71	50.980
ENSACIG00000006478	-	77	51.675	ENSACIG00000023381	-	81	51.923
ENSACIG00000006478	-	82	47.511	ENSACIG00000014745	-	98	47.511
ENSACIG00000006478	-	72	64.103	ENSACIG00000012204	-	82	64.103
ENSACIG00000006478	-	76	32.243	ENSACIG00000003906	-	68	32.243
ENSACIG00000006478	-	77	52.657	ENSACIG00000002263	-	74	52.657
ENSACIG00000006478	-	76	55.122	ENSACIG00000007191	-	57	55.122
ENSACIG00000006478	-	76	40.278	ENSACIG00000012714	-	70	40.278
ENSACIG00000006478	-	78	58.852	ENSACIG00000012718	-	87	58.852
ENSACIG00000006478	-	78	45.024	ENSACIG00000014716	-	84	45.024
ENSACIG00000006478	-	77	50.718	ENSACIG00000008045	-	75	51.961
ENSACIG00000006478	-	77	48.309	ENSACIG00000003582	-	66	48.309
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ENSACIG00000006478	-	76	53.171	ENSACIG00000022370	-	72	53.171
ENSACIG00000006478	-	78	71.770	ENSACIG00000006484	-	64	71.770
ENSACIG00000006478	-	76	46.829	ENSACIG00000014690	-	78	46.829
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ENSACIG00000006478	-	77	51.442	ENSACIG00000007466	-	81	51.442
ENSACIG00000006478	-	67	33.333	ENSACIG00000019509	-	82	33.333
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ENSACIG00000006478	-	77	47.087	ENSACIG00000014703	-	84	47.087
ENSACIG00000006478	-	76	51.471	ENSACIG00000001070	-	72	51.471
ENSACIG00000006478	-	77	45.411	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	45.411
ENSACIG00000006478	-	63	46.243	ENSACIG00000000631	-	59	46.243
ENSACIG00000006478	-	75	45.545	ENSACIG00000020225	-	68	45.545
ENSACIG00000006478	-	76	73.171	ENSACIG00000012648	-	69	73.171
ENSACIG00000006478	-	77	46.635	ENSACIG00000007494	-	67	47.596
ENSACIG00000006478	-	77	53.365	ENSACIG00000012159	-	53	53.365
ENSACIG00000006478	-	75	45.771	ENSACIG00000000893	-	79	45.771
ENSACIG00000006478	-	76	45.098	ENSACIG00000006503	-	63	45.098
ENSACIG00000006478	-	66	49.438	ENSACIG00000008666	-	85	49.438
ENSACIG00000006478	-	77	38.265	ENSACIG00000005573	-	89	38.265
ENSACIG00000006478	-	76	38.028	ENSACIG00000005587	-	73	38.028
ENSACIG00000006478	-	68	34.239	ENSACIG00000003050	-	80	34.239
ENSACIG00000006478	-	74	45.960	ENSACIG00000014634	zgc:113625	79	45.500
ENSACIG00000006478	-	70	48.148	ENSACIG00000001596	-	74	48.148
ENSACIG00000006478	-	77	55.769	ENSACIG00000022222	-	66	55.769
ENSACIG00000006478	-	72	36.548	ENSACIG00000009811	-	80	36.548
ENSACIG00000006478	-	66	37.297	ENSACIG00000014737	-	84	37.297
ENSACIG00000006478	-	76	47.317	ENSACIG00000019524	-	84	47.317
ENSACIG00000006478	-	79	58.216	ENSACIG00000012707	-	78	58.216
ENSACIG00000006478	-	66	33.333	ENSACIG00000007737	-	70	32.275
ENSACIG00000006478	-	74	43.284	ENSACIG00000020244	-	84	43.284
ENSACIG00000006478	-	78	49.048	ENSACIG00000014662	-	85	49.048
ENSACIG00000006478	-	78	72.249	ENSACIG00000016635	-	79	72.249
ENSACIG00000006478	-	77	60.209	ENSACIG00000007158	-	63	60.209
ENSACIG00000006478	-	68	45.902	ENSACIG00000015088	-	72	45.902
ENSACIG00000006478	-	60	46.296	ENSACIG00000000976	-	79	46.296
ENSACIG00000006478	-	73	32.420	ENSACIG00000009149	-	73	32.420
ENSACIG00000006478	-	85	46.288	ENSACIG00000008001	-	92	46.288
ENSACIG00000006478	-	80	72.093	ENSACIG00000019149	-	66	72.093
ENSACIG00000006478	-	77	44.712	ENSACIG00000014655	-	77	44.712
ENSACIG00000006478	-	83	51.339	ENSACIG00000016313	-	69	51.339
ENSACIG00000006478	-	68	36.898	ENSACIG00000014670	-	71	36.898
ENSACIG00000006478	-	74	45.771	ENSACIG00000004040	-	77	45.771
ENSACIG00000006478	-	77	41.063	ENSACIG00000016502	-	88	41.063
ENSACIG00000006478	-	74	68.447	ENSACIG00000005223	-	80	67.136
ENSACIG00000006478	-	77	50.962	ENSACIG00000022362	-	74	50.962
ENSACIG00000006478	-	76	54.369	ENSACIG00000022366	-	73	54.369
ENSACIG00000006478	-	78	73.333	ENSACIG00000002950	-	56	73.333
ENSACIG00000006478	-	77	47.087	ENSACIG00000014680	-	89	47.087
ENSACIG00000006478	-	70	62.234	ENSACIG00000007178	-	65	62.234
ENSACIG00000006478	-	67	35.938	ENSACIG00000014730	zgc:172131	93	35.938
ENSACIG00000006478	-	78	70.476	ENSACIG00000005780	-	64	70.476
ENSACIG00000006478	-	72	38.889	ENSACIG00000007725	-	69	38.889
ENSACIG00000006478	-	60	71.605	ENSACIG00000012761	-	71	71.605
ENSACIG00000006478	-	77	71.014	ENSACIG00000022355	-	71	71.014
ENSACIG00000006478	-	81	42.009	ENSACIG00000020234	-	76	42.009

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006478	-	74	40.909	ENSAPOG00000021365	-	64	40.909	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	77	73.430	ENSAPOG00000001075	-	95	73.430	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	72	57.513	ENSAPOG00000010738	-	62	57.513	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	75	38.725	ENSAPOG00000008529	-	78	38.725	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	77	43.602	ENSAPOG00000000066	-	58	43.256	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	80	56.044	ENSAPOG00000022321	-	88	56.044	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	89	63.223	ENSAPOG00000007123	-	89	63.223	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	94	72.193	ENSAPOG00000009059	-	92	70.950	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	74	76.500	ENSAPOG00000018915	-	85	76.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	75	50.000	ENSAPOG00000020108	-	58	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	76	33.178	ENSAPOG00000002527	-	69	33.178	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	72	30.653	ENSAPOG00000008819	-	85	31.156	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	78	38.462	ENSAPOG00000009288	-	80	38.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	73	37.441	ENSAPOG00000002517	-	71	37.441	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	79	72.770	ENSAPOG00000002337	-	67	72.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006478	-	62	74.850	ENSAPOG00000007631	-	78	74.850	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000006478	-	74	38.191	ENSAOCG00000015984	-	64	38.191	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006478	-	64	72.832	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	72.832	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006478	-	74	42.211	ENSAOCG00000013326	-	70	42.211	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006478	-	62	44.311	ENSAOCG00000007815	-	59	45.181	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006478	-	73	34.951	ENSAPEG00000002163	-	70	34.951	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	76	38.537	ENSAPEG00000003513	-	79	45.614	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	75	42.786	ENSAPEG00000019003	-	78	42.786	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	76	42.647	ENSAPEG00000013508	-	85	42.647	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	63	44.706	ENSAPEG00000013378	-	61	44.253	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	80	55.814	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	76	62.963	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	70	36.869	ENSAPEG00000002121	-	86	36.869	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	72	42.564	ENSAPEG00000013532	-	98	42.564	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	88	33.471	ENSAPEG00000008662	-	57	33.471	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006478	-	77	74.038	ENSATEG00000011918	-	69	74.038	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	61	71.779	ENSATEG00000012017	-	86	71.779	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	52	62.857	ENSATEG00000011891	-	88	62.857	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	87	48.927	ENSATEG00000011594	-	81	51.835	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000006478	-	75	74.129	ENSATEG00000011720	-	74	74.129	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000006478	-	66	64.607	ENSATEG00000011978	-	89	64.607	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	73	74.112	ENSATEG00000011979	-	92	74.112	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	78	70.335	ENSATEG00000011837	-	64	70.874	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	77	40.553	ENSATEG00000010901	-	54	40.553	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	50	66.418	ENSATEG00000011771	-	75	66.418	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	78	73.837	ENSATEG00000011635	-	73	72.472	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	77	75.243	ENSATEG00000011814	-	67	74.879	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000006478	-	78	73.206	ENSATEG00000011953	-	59	73.206	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	70	41.799	ENSATEG00000009383	-	61	41.799	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	68	37.705	ENSATEG00000020398	-	52	37.705	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	72	41.262	ENSATEG00000010966	-	86	41.262	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000006478	-	79	73.239	ENSATEG00000011931	-	83	73.239	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	77	68.116	ENSATEG00000011712	-	80	68.116	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	76	63.725	ENSATEG00000011789	-	62	63.725	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000006478	-	74	40.097	ENSATEG00000010978	-	78	40.097	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006478	-	76	37.037	ENSACLG00000006534	-	57	37.037	Astatotilapia_calliptera
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