EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006484 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3388 bases
Position: chrCCOE01000754.1:526035-529422
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008253	MMR_HSR1	PF01926.23	5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008501	-	981	-	ENSACIP00000008253	326 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006484	-	88	57.704	ENSACIG00000005198	-	60	58.912
ENSACIG00000006484	-	54	46.328	ENSACIG00000008666	-	85	46.328
ENSACIG00000006484	-	76	64.542	ENSACIG00000005780	-	82	62.409
ENSACIG00000006484	-	65	53.052	ENSACIG00000007178	-	73	53.052
ENSACIG00000006484	-	63	42.233	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	42.233
ENSACIG00000006484	-	74	52.653	ENSACIG00000022222	-	78	52.653
ENSACIG00000006484	-	65	43.256	ENSACIG00000020244	-	90	43.256
ENSACIG00000006484	-	74	48.750	ENSACIG00000022366	-	83	48.750
ENSACIG00000006484	-	68	48.458	ENSACIG00000022362	-	81	48.458
ENSACIG00000006484	-	52	68.786	ENSACIG00000012204	-	74	68.786
ENSACIG00000006484	-	64	43.269	ENSACIG00000014690	-	79	43.269
ENSACIG00000006484	-	83	41.935	ENSACIG00000012718	-	87	54.808
ENSACIG00000006484	-	84	38.351	ENSACIG00000012714	-	87	38.351
ENSACIG00000006484	-	73	45.902	ENSACIG00000008001	-	91	45.902
ENSACIG00000006484	-	62	43.564	ENSACIG00000014716	-	81	43.564
ENSACIG00000006484	-	64	40.952	ENSACIG00000020234	-	73	40.952
ENSACIG00000006484	-	76	49.398	ENSACIG00000007191	-	68	49.398
ENSACIG00000006484	-	84	44.407	ENSACIG00000012159	-	74	47.038
ENSACIG00000006484	-	57	35.025	ENSACIG00000007725	-	69	35.025
ENSACIG00000006484	-	66	48.837	ENSACIG00000001455	-	79	48.837
ENSACIG00000006484	-	57	35.859	ENSACIG00000009811	-	78	35.859
ENSACIG00000006484	-	66	44.860	ENSACIG00000014662	-	87	44.860
ENSACIG00000006484	-	71	46.320	ENSACIG00000001070	-	81	46.320
ENSACIG00000006484	-	56	45.604	ENSACIG00000015088	-	72	45.604
ENSACIG00000006484	-	61	44.949	ENSACIG00000014745	-	89	44.949
ENSACIG00000006484	-	80	61.278	ENSACIG00000019149	-	92	58.940
ENSACIG00000006484	-	60	31.193	ENSACIG00000009149	-	73	31.193
ENSACIG00000006484	-	50	46.914	ENSACIG00000000631	-	73	40.084
ENSACIG00000006484	-	60	42.132	ENSACIG00000014634	zgc:113625	83	40.191
ENSACIG00000006484	-	77	65.217	ENSACIG00000016635	-	89	65.217
ENSACIG00000006484	-	54	33.898	ENSACIG00000003050	-	77	33.898
ENSACIG00000006484	-	78	63.178	ENSACIG00000022355	-	89	63.178
ENSACIG00000006484	-	79	43.191	ENSACIG00000007466	-	89	43.191
ENSACIG00000006484	-	63	45.411	ENSACIG00000014680	-	90	45.411
ENSACIG00000006484	-	68	47.964	ENSACIG00000003582	-	71	47.964
ENSACIG00000006484	-	62	33.333	ENSACIG00000003906	-	67	33.333
ENSACIG00000006484	-	69	42.544	ENSACIG00000016888	-	74	42.544
ENSACIG00000006484	-	66	47.685	ENSACIG00000004040	-	84	47.685
ENSACIG00000006484	-	54	32.584	ENSACIG00000007737	-	70	32.620
ENSACIG00000006484	-	78	63.504	ENSACIG00000002950	-	74	64.111
ENSACIG00000006484	-	50	37.195	ENSACIG00000019509	-	76	37.195
ENSACIG00000006484	-	59	71.134	ENSACIG00000005223	-	73	71.134
ENSACIG00000006484	-	71	40.541	ENSACIG00000005573	-	93	40.541
ENSACIG00000006484	-	62	42.574	ENSACIG00000014655	-	76	42.574
ENSACIG00000006484	-	63	49.756	ENSACIG00000008045	-	87	46.444
ENSACIG00000006484	-	66	49.537	ENSACIG00000022370	-	80	49.339
ENSACIG00000006484	-	50	68.519	ENSACIG00000022374	-	83	68.519
ENSACIG00000006484	-	70	48.918	ENSACIG00000022377	-	84	48.918
ENSACIG00000006484	-	64	71.770	ENSACIG00000006478	-	78	71.770
ENSACIG00000006484	-	61	55.224	ENSACIG00000012707	-	76	55.224
ENSACIG00000006484	-	83	53.927	ENSACIG00000007158	-	75	51.942
ENSACIG00000006484	-	68	41.629	ENSACIG00000016502	-	94	41.629
ENSACIG00000006484	-	60	44.279	ENSACIG00000001596	-	79	44.279
ENSACIG00000006484	-	73	42.259	ENSACIG00000006503	-	72	42.259
ENSACIG00000006484	-	86	47.500	ENSACIG00000016313	-	82	47.500
ENSACIG00000006484	-	64	43.119	ENSACIG00000012061	-	63	43.119
ENSACIG00000006484	-	62	44.554	ENSACIG00000014703	-	83	44.554
ENSACIG00000006484	-	76	39.161	ENSACIG00000000893	-	84	44.076
ENSACIG00000006484	-	61	45.274	ENSACIG00000020225	-	78	44.118
ENSACIG00000006484	-	69	48.899	ENSACIG00000023381	-	89	48.899
ENSACIG00000006484	-	71	43.348	ENSACIG00000007494	-	74	43.777
ENSACIG00000006484	-	63	45.411	ENSACIG00000019524	-	86	45.411
ENSACIG00000006484	-	69	50.218	ENSACIG00000002263	-	82	50.218
ENSACIG00000006484	-	64	39.450	ENSACIG00000005587	-	75	39.450
ENSACIG00000006484	-	56	34.225	ENSACIG00000014670	-	71	34.225
ENSACIG00000006484	-	69	47.345	ENSACIG00000004245	-	79	47.345
ENSACIG00000006484	-	76	65.748	ENSACIG00000012648	-	86	65.748
ENSACIG00000006484	-	55	34.392	ENSACIG00000014737	-	85	34.392

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006484	-	65	68.545	ENSAPOG00000001075	-	98	68.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	56	52.542	ENSAPOG00000022321	-	81	52.542	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	77	34.615	ENSAPOG00000009288	-	94	34.615	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	85	33.974	ENSAPOG00000007181	-	56	36.491	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	78	48.410	ENSAPOG00000001444	-	52	49.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	71	62.598	ENSAPOG00000007123	-	94	62.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	76	39.924	ENSAPOG00000021365	-	86	39.924	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	68	64.251	ENSAPOG00000009059	-	91	66.477	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	80	44.944	ENSAPOG00000010738	-	82	44.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	61	72.362	ENSAPOG00000018915	-	85	72.362	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	64	32.143	ENSAPOG00000002527	-	70	32.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	66	36.444	ENSAPOG00000002517	-	77	36.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	85	45.000	ENSAPOG00000020108	-	80	45.907	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	90	57.143	ENSAPOG00000002337	-	89	55.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	95	44.385	ENSAPOG00000017667	-	68	44.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	51	67.262	ENSAPOG00000007631	-	78	67.262	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	59	33.333	ENSAPOG00000008819	-	85	33.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	66	36.449	ENSAPOG00000008529	-	83	36.449	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	70	42.489	ENSAPOG00000000066	-	72	41.923	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006484	-	69	38.496	ENSAOCG00000013326	-	85	39.004	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	57	36.548	ENSAOCG00000016099	-	86	36.548	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	64	33.333	ENSAOCG00000016082	-	50	33.482	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	53	69.767	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	69.767	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	72	38.618	ENSAOCG00000015984	-	80	38.618	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	51	44.242	ENSAOCG00000007815	-	61	44.242	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006484	-	72	58.051	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	90	58.051	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	52	43.787	ENSAPEG00000013378	-	61	43.787	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	74	38.095	ENSAPEG00000003513	-	89	39.024	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	57	36.548	ENSAPEG00000002121	-	86	36.548	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	60	42.268	ENSAPEG00000013532	-	98	42.268	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	63	42.439	ENSAPEG00000013508	-	86	42.439	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	70	38.961	ENSAPEG00000019003	-	90	38.961	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	68	32.609	ENSAPEG00000002163	-	76	32.609	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	61	34.197	ENSAPEG00000008662	-	52	34.197	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006484	-	67	66.364	ENSATEG00000011720	-	78	66.364	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	63	64.390	ENSATEG00000011712	-	79	64.390	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	76	61.481	ENSATEG00000011837	-	81	64.286	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	60	70.558	ENSATEG00000011979	-	92	70.558	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	58	61.376	ENSATEG00000011978	-	89	61.376	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	82	37.828	ENSATEG00000019504	-	82	37.828	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	70	38.428	ENSATEG00000009383	-	71	38.017	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	64	40.553	ENSATEG00000010991	-	82	40.553	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	73	33.871	ENSATEG00000011021	-	68	33.871	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	95	47.159	ENSATEG00000011341	-	63	47.443	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	76	61.710	ENSATEG00000011953	-	75	65.428	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	50	70.552	ENSATEG00000012017	-	67	70.552	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	63	68.780	ENSATEG00000011820	-	73	68.780	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	84	47.331	ENSATEG00000011594	-	89	51.064	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	60	37.379	ENSATEG00000010978	-	78	37.379	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	70	40.088	ENSATEG00000017209	-	83	40.088	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	68	69.458	ENSATEG00000011931	-	86	69.458	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	64	40.826	ENSATEG00000010901	-	55	40.826	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	82	47.619	ENSATEG00000011789	-	95	49.363	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	56	33.880	ENSATEG00000020398	-	52	33.880	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	73	71.176	ENSATEG00000011635	-	79	58.150	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	66	72.350	ENSATEG00000011814	-	89	65.468	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	74	62.548	ENSATEG00000011918	-	85	67.181	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	62	40.476	ENSATEG00000010966	-	89	40.476	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006484	-	69	70.044	ENSACLG00000005232	-	85	70.044	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006484	-	65	68.075	ENSACLG00000004543	-	93	68.142	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006484	-	71	34.310	ENSACLG00000001869	-	64	34.310	Astatotilapia_calliptera
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