EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006503 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1199 bases
Position: chrCCOE01001764.1:20992-22190
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008275	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-10	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000008524	-	954	-	ENSACIP00000008275	317 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006503	-	69	39.381	ENSACIG00000014662	-	92	39.381
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ENSACIG00000006503	-	74	65.823	ENSACIG00000002263	-	83	67.391
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ENSACIG00000006503	-	72	59.130	ENSACIG00000004245	-	82	59.130
ENSACIG00000006503	-	61	33.168	ENSACIG00000014737	-	84	35.165
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ENSACIG00000006503	-	68	47.511	ENSACIG00000012648	-	73	47.511
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ENSACIG00000006503	-	66	41.315	ENSACIG00000014680	-	91	41.315
ENSACIG00000006503	-	65	42.487	ENSACIG00000007158	-	64	40.976
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ENSACIG00000006503	-	65	46.479	ENSACIG00000012718	-	88	46.479
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ENSACIG00000006503	-	66	41.860	ENSACIG00000014655	-	78	41.860
ENSACIG00000006503	-	54	30.682	ENSACIG00000007737	-	69	31.148
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ENSACIG00000006503	-	60	36.041	ENSACIG00000009811	-	81	36.041
ENSACIG00000006503	-	65	47.619	ENSACIG00000016635	-	80	47.619
ENSACIG00000006503	-	57	42.857	ENSACIG00000015088	-	73	42.857

Orthologs

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ENSACIG00000006503	-	72	63.043	ENSAPOG00000012716	-	77	63.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	65	43.750	ENSAPOG00000020897	-	80	43.602	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	64	43.478	ENSAPOG00000007322	-	68	45.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	65	41.827	ENSAPOG00000001315	-	65	41.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	65	40.670	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	40.670	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	91	51.034	ENSAPOG00000008063	-	74	58.696	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	64	40.777	ENSAPOG00000014243	-	85	40.777	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	65	48.792	ENSAPOG00000006488	-	88	46.696	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000006503	-	61	43.299	ENSAPOG00000022240	-	56	43.299	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	88	40.065	ENSAPOG00000014759	-	87	40.840	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	58	48.925	ENSAPOG00000001262	-	89	48.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	72	40.969	ENSAPOG00000001268	-	53	42.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	63	43.564	ENSAPOG00000007333	-	64	42.544	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	64	49.020	ENSAPOG00000011509	-	77	46.875	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006503	-	82	55.344	ENSAPOG00000021159	-	75	58.952	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000006503	-	63	43.564	ENSAOCG00000011155	-	64	42.544	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006503	-	69	40.271	ENSAOCG00000011794	-	66	40.271	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006503	-	89	40.317	ENSAOCG00000008525	-	63	48.611	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006503	-	68	47.248	ENSAOCG00000023255	-	77	47.248	Amphiprion_ocellaris
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