EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006705 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr3f
Alias: zgc:56299|zgc:76983
Full Name: polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide F
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3049 bases
Position: chrCCOE01000421.1:93404-96452
Accession: ZDB-GENE-040426-972
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008563	RNA_pol_Rpc34	PF05158.12	8.7e-87	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008817	-	885	-	ENSACIP00000008563	294 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSG00000132664	POLR3F	100	80.696	Homo_sapiens
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.291	ENSAPOG00000008271	polr3f	100	87.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSAMEG00000005222	POLR3F	100	80.380	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.608	ENSAOCG00000000687	polr3f	100	88.608	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.291	ENSAPEG00000015263	polr3f	100	88.291	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006705	polr3f	89	89.531	ENSATEG00000015539	polr3f	100	90.909	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006705	polr3f	89	84.727	ENSAPLG00000005533	POLR3F	100	84.727	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000006705	polr3f	97	83.502	ENSACAG00000014293	POLR3F	96	83.502	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	81.013	ENSANAG00000026726	POLR3F	100	81.013	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.924	ENSACLG00000003615	polr3f	100	88.924	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006705	polr3f	100	86.624	ENSAMXG00000036020	polr3f	100	86.624	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSBTAG00000008825	POLR3F	100	80.063	Bos_taurus
ENSACIG00000006705	polr3f	92	32.867	WBGene00021112	W09C3.4	90	32.867	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000006705	polr3f	100	81.013	ENSCJAG00000005159	POLR3F	100	81.013	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSCAFG00000005420	POLR3F	100	80.380	Canis_familiaris
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSCAFG00020027500	POLR3F	100	80.380	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSCHIG00000014743	POLR3F	100	80.063	Capra_hircus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSTSYG00000004207	POLR3F	100	80.063	Carlito_syrichta
ENSACIG00000006705	polr3f	83	72.078	ENSCAPG00000008423	POLR3F	100	72.078	Cavia_aperea
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSCPOG00000002400	POLR3F	100	80.063	Cavia_porcellus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	70.886	ENSCCAG00000021800	POLR3F	100	70.886	Cebus_capucinus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSCATG00000019507	POLR3F	100	80.380	Cercocebus_atys
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSCLAG00000016296	POLR3F	100	80.696	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSCSAG00000011513	POLR3F	100	80.380	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000006705	polr3f	71	86.517	ENSCHOG00000013268	POLR3F	73	86.517	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000006705	polr3f	89	84.364	ENSCPBG00000023473	POLR3F	100	84.364	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000006705	polr3f	99	56.369	ENSCING00000001212	-	99	56.369	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000006705	polr3f	66	57.282	ENSCSAVG00000003340	-	96	63.905	Ciona_savignyi
ENSACIG00000006705	polr3f	91	79.725	ENSCANG00000037390	POLR3F	100	79.725	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSCGRG00001002032	Polr3f	100	80.063	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSCGRG00000010852	Polr3f	100	80.063	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000006705	polr3f	100	85.127	ENSCSEG00000001247	polr3f	100	84.810	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	90.260	ENSCVAG00000007611	polr3f	100	90.260	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	85.669	ENSDARG00000012572	polr3f	100	85.669	Danio_rerio
ENSACIG00000006705	polr3f	100	77.532	ENSDNOG00000010719	POLR3F	100	77.532	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSDORG00000016352	Polr3f	100	80.380	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000006705	polr3f	97	48.322	FBgn0038951	CG5380	98	48.322	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000006705	polr3f	64	79.487	ENSETEG00000015485	-	67	79.487	Echinops_telfairi
ENSACIG00000006705	polr3f	100	72.026	ENSEBUG00000006783	polr3f	100	72.026	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSEASG00005002022	POLR3F	100	80.696	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSECAG00000009920	POLR3F	100	80.696	Equus_caballus
ENSACIG00000006705	polr3f	78	84.000	ENSEEUG00000000184	POLR3F	80	84.000	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	86.624	ENSELUG00000001558	polr3f	100	86.624	Esox_lucius
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSFCAG00000013828	POLR3F	100	80.380	Felis_catus
ENSACIG00000006705	polr3f	89	85.455	ENSFALG00000007623	POLR3F	100	85.455	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSFDAG00000002528	POLR3F	100	80.063	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	86.392	ENSFHEG00000006450	polr3f	100	86.392	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	82.803	ENSGALG00000008749	POLR3F	100	82.803	Gallus_gallus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.291	ENSGAFG00000003698	polr3f	100	88.291	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	82.166	ENSGAGG00000006151	POLR3F	100	82.166	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSGGOG00000011543	POLR3F	100	80.696	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000006705	polr3f	100	89.241	ENSHBUG00000013806	polr3f	100	89.241	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSHGLG00000011867	POLR3F	100	80.063	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSHGLG00100012577	POLR3F	100	80.063	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000006705	polr3f	100	76.266	ENSHCOG00000011751	polr3f	100	76.266	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSSTOG00000013588	POLR3F	100	80.380	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.747	ENSJJAG00000017513	Polr3f	100	79.747	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000006705	polr3f	89	93.130	ENSKMAG00000016495	polr3f	100	93.130	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000006705	polr3f	79	96.552	ENSLBEG00000011998	polr3f	100	96.552	Labrus_bergylta
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ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSMFAG00000002227	POLR3F	100	80.380	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000006705	polr3f	89	83.636	ENSMMUG00000004143	POLR3F	100	83.636	Macaca_mulatta
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSMNEG00000033404	POLR3F	100	80.380	Macaca_nemestrina
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ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSMOCG00000018352	Polr3f	100	80.063	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000006705	polr3f	96	89.899	ENSMMOG00000018477	polr3f	100	89.899	Mola_mola
ENSACIG00000006705	polr3f	100	81.013	ENSMODG00000005624	POLR3F	100	81.013	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000006705	polr3f	100	87.658	ENSMALG00000006685	polr3f	100	87.658	Monopterus_albus
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ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	ENSMUSG00000027427	Polr3f	100	79.430	Mus_musculus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	MGP_PahariEiJ_G0025829	Polr3f	100	79.430	Mus_pahari
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	MGP_SPRETEiJ_G0025304	Polr3f	100	79.430	Mus_spretus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	60.308	ENSMPUG00000001252	-	100	60.308	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSMLUG00000014844	POLR3F	100	80.380	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	ENSNGAG00000010898	Polr3f	100	79.430	Nannospalax_galili
ENSACIG00000006705	polr3f	100	89.557	ENSNBRG00000020796	polr3f	100	89.557	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSNLEG00000009778	POLR3F	100	80.696	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000006705	polr3f	96	77.966	ENSMEUG00000010320	POLR3F	100	77.966	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	ENSOPRG00000003385	POLR3F	100	79.430	Ochotona_princeps
ENSACIG00000006705	polr3f	100	81.013	ENSODEG00000011521	POLR3F	100	81.013	Octodon_degus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	88.608	ENSONIG00000006858	polr3f	100	88.608	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	81.013	ENSOANG00000001253	POLR3F	100	81.013	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSOCUG00000015067	POLR3F	100	80.380	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	85.443	ENSORLG00000022412	polr3f	100	85.443	Oryzias_latipes
ENSACIG00000006705	polr3f	100	85.443	ENSORLG00020021944	polr3f	100	85.443	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000006705	polr3f	100	79.430	ENSOGAG00000002916	POLR3F	100	79.430	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.063	ENSOARG00000000315	-	100	80.063	Ovis_aries
ENSACIG00000006705	polr3f	100	53.094	ENSOARG00000008647	-	100	53.094	Ovis_aries
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSPPAG00000036681	POLR3F	100	80.696	Pan_paniscus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSPPRG00000024604	POLR3F	100	80.380	Panthera_pardus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSPTIG00000020292	POLR3F	100	80.380	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSPTRG00000013287	POLR3F	100	80.696	Pan_troglodytes
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSPANG00000025015	POLR3F	100	80.380	Papio_anubis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	85.032	ENSPKIG00000004427	polr3f	100	85.032	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000006705	polr3f	89	85.455	ENSPSIG00000016613	POLR3F	100	85.455	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000006705	polr3f	100	53.376	ENSPMGG00000018350	polr3f	100	57.468	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.380	ENSPEMG00000006966	Polr3f	100	80.380	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSACIG00000006705	polr3f	100	80.696	ENSPCIG00000000908	POLR3F	85	80.696	Phascolarctos_cinereus
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