EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006734 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrh1
Alias: zgc:112961
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5831 bases
Position: chrCCOE01001138.1:148257-154087
Accession: ZDB-GENE-050306-33
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008598	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	3.9e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008854	-	702	-	ENSACIP00000008598	233 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSG00000187024	PTRH1	80	57.895	Homo_sapiens
ENSACIG00000006734	ptrh1	90	81.340	ENSAPOG00000000947	PTRH1	73	81.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006734	ptrh1	90	81.340	ENSAPOG00000010719	ptrh1	73	81.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006734	ptrh1	90	81.340	ENSAPOG00000003014	-	73	81.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	55.556	ENSAMEG00000016791	PTRH1	81	55.556	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000006734	ptrh1	83	84.021	ENSAOCG00000009725	ptrh1	73	80.861	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006734	ptrh1	83	84.021	ENSAPEG00000020993	ptrh1	73	80.861	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	83.256	ENSATEG00000010003	ptrh1	77	83.256	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.819	ENSANAG00000025547	PTRH1	80	60.819	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	87.907	ENSACLG00000025462	ptrh1	85	87.907	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006734	ptrh1	88	69.608	ENSAMXG00000034117	ptrh1	75	69.608	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.064	ENSCJAG00000019841	PTRH1	61	62.162	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.558	ENSCAFG00000020123	PTRH1	80	57.558	Canis_familiaris
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSCAFG00020015776	PTRH1	77	57.895	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	59.116	ENSCHIG00000008188	PTRH1	84	59.116	Capra_hircus
ENSACIG00000006734	ptrh1	54	57.937	ENSCAPG00000015926	PTRH1	91	57.937	Cavia_aperea
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSCPOG00000023968	PTRH1	80	58.480	Cavia_porcellus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.064	ENSCCAG00000023134	PTRH1	80	59.064	Cebus_capucinus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSCATG00000042852	PTRH1	80	58.480	Cercocebus_atys
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	56.593	ENSCLAG00000011155	PTRH1	85	56.593	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSCSAG00000013748	PTRH1	75	58.480	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000006734	ptrh1	72	52.096	ENSCPBG00000025207	PTRH1	95	52.096	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSCANG00000039856	PTRH1	80	58.480	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.649	ENSCGRG00001013108	Ptrh1	84	59.649	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.649	ENSCGRG00000016553	Ptrh1	94	59.649	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	68.349	ENSCSEG00000010332	ptrh1	78	68.349	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006734	ptrh1	90	80.000	ENSCVAG00000010701	ptrh1	76	80.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	99	61.638	ENSDARG00000098206	ptrh1	93	63.303	Danio_rerio
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	ENSDNOG00000024194	PTRH1	80	60.234	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	56.831	ENSDORG00000013321	Ptrh1	85	56.831	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	56.044	ENSEASG00005020466	PTRH1	80	58.480	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSECAG00000007615	PTRH1	63	58.480	Equus_caballus
ENSACIG00000006734	ptrh1	89	72.464	ENSELUG00000015467	ptrh1	76	72.464	Esox_lucius
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSFCAG00000001483	PTRH1	80	58.480	Felis_catus
ENSACIG00000006734	ptrh1	75	54.023	ENSFALG00000001352	PTRH1	83	54.023	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000006734	ptrh1	79	56.021	ENSFDAG00000020077	PTRH1	90	57.609	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	86.885	ENSFHEG00000010590	ptrh1	76	84.925	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	84.772	ENSGAFG00000016215	ptrh1	83	84.772	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006734	ptrh1	70	83.537	ENSGACG00000014682	ptrh1	86	83.030	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	80	55.080	ENSGAGG00000022860	PTRH1	83	55.080	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.310	ENSGGOG00000011033	PTRH1	80	57.310	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	86.977	ENSHBUG00000020824	ptrh1	77	86.977	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	57.692	ENSHGLG00000019147	PTRH1	88	57.692	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	54.396	ENSHGLG00100003681	PTRH1	91	54.396	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000006734	ptrh1	75	75.287	ENSHCOG00000014772	ptrh1	73	70.681	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006734	ptrh1	84	69.388	ENSIPUG00000015364	ptrh1	76	69.388	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	67	60.897	ENSSTOG00000008942	PTRH1	84	58.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	57.143	ENSJJAG00000014338	Ptrh1	88	57.143	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	85.308	ENSKMAG00000003253	ptrh1	76	85.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000006734	ptrh1	61	81.560	ENSLBEG00000028842	ptrh1	76	85.827	Labrus_bergylta
ENSACIG00000006734	ptrh1	72	62.500	ENSLACG00000016741	PTRH1	69	62.500	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	55.233	ENSLAFG00000021934	PTRH1	84	55.233	Loxodonta_africana
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSMFAG00000001700	PTRH1	80	58.480	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSMMUG00000016424	PTRH1	80	58.480	Macaca_mulatta
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSMNEG00000033061	PTRH1	75	58.480	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	80.095	ENSMAMG00000017386	ptrh1	77	80.095	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	86.977	ENSMZEG00005020001	ptrh1	85	86.977	Maylandia_zebra
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	ENSMAUG00000006266	Ptrh1	84	60.234	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSMICG00000005611	PTRH1	79	58.480	Microcebus_murinus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	ENSMOCG00000013992	Ptrh1	84	60.234	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000006734	ptrh1	89	78.673	ENSMMOG00000014747	ptrh1	74	81.043	Mola_mola
ENSACIG00000006734	ptrh1	79	55.914	ENSMODG00000005503	PTRH1	85	55.914	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000006734	ptrh1	70	73.333	ENSMALG00000005392	ptrh1	96	73.333	Monopterus_albus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	MGP_CAROLIEiJ_G0023450	Ptrh1	84	60.234	Mus_caroli
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	ENSMUSG00000053746	Ptrh1	84	60.234	Mus_musculus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	60.234	MGP_PahariEiJ_G0024907	Ptrh1	84	60.234	Mus_pahari
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.649	MGP_SPRETEiJ_G0024367	Ptrh1	84	59.649	Mus_spretus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	56.069	ENSMPUG00000013790	PTRH1	80	56.069	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	53.846	ENSMLUG00000013454	PTRH1	82	54.396	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	57.143	ENSNGAG00000014008	Ptrh1	89	57.143	Nannospalax_galili
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	87.442	ENSNBRG00000015590	ptrh1	77	87.442	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSNLEG00000017468	PTRH1	80	57.895	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	56.593	ENSODEG00000004012	PTRH1	86	56.593	Octodon_degus
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	84.651	ENSONIG00000013912	ptrh1	82	87.442	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006734	ptrh1	82	53.927	ENSOANG00000011891	PTRH1	85	53.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSOCUG00000006894	PTRH1	74	57.895	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000006734	ptrh1	79	56.522	ENSOGAG00000008094	PTRH1	87	56.522	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	54.167	ENSOARG00000011808	PTRH1	85	54.167	Ovis_aries
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSPPAG00000041782	PTRH1	80	57.895	Pan_paniscus
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	57.692	ENSPPRG00000007889	PTRH1	85	57.692	Panthera_pardus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	57.895	ENSPTRG00000021394	PTRH1	80	57.895	Pan_troglodytes
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	49.425	ENSPANG00000031755	PTRH1	80	49.425	Papio_anubis
ENSACIG00000006734	ptrh1	88	64.878	ENSPKIG00000005449	ptrh1	68	64.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000006734	ptrh1	80	52.406	ENSPSIG00000013828	PTRH1	68	52.406	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000006734	ptrh1	71	68.675	ENSPMGG00000002148	ptrh1	68	63.317	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	67	63.057	ENSPEMG00000014360	Ptrh1	84	61.404	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	84.772	ENSPFOG00000003715	ptrh1	74	84.772	Poecilia_formosa
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	84.264	ENSPLAG00000023354	ptrh1	79	84.264	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	84.772	ENSPMEG00000000447	ptrh1	74	84.772	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	82.234	ENSPREG00000012612	ptrh1	74	82.234	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	54.386	ENSPPYG00000019628	PTRH1	74	54.386	Pongo_abelii
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.064	ENSPCAG00000007016	PTRH1	80	59.064	Procavia_capensis
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSPCOG00000014541	PTRH1	79	58.480	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.064	ENSPVAG00000000954	PTRH1	80	59.064	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	86.512	ENSPNYG00000007789	ptrh1	77	86.512	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000006734	ptrh1	88	70.098	ENSPNAG00000029930	ptrh1	76	70.098	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	61.404	ENSRNOG00000049034	Ptrh1	84	61.404	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSRBIG00000027290	PTRH1	80	58.480	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSRROG00000028799	PTRH1	75	58.480	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000006734	ptrh1	71	36.571	YHR189W	PTH1	90	36.571	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSSBOG00000026699	PTRH1	75	58.480	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.523	ENSSHAG00000018238	PTRH1	86	58.523	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000006734	ptrh1	76	72.316	ENSSFOG00015007053	ptrh1	84	72.515	Scleropages_formosus
ENSACIG00000006734	ptrh1	85	75.000	ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	75.000	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	78.774	ENSSDUG00000013471	ptrh1	87	85.185	Seriola_dumerili
ENSACIG00000006734	ptrh1	91	80.660	ENSSLDG00000024662	ptrh1	93	82.160	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	56.140	ENSSPUG00000000040	PTRH1	75	56.140	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	84	84.615	ENSSPAG00000003298	ptrh1	92	85.326	Stegastes_partitus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	59.649	ENSSSCG00000005615	PTRH1	80	59.649	Sus_scrofa
ENSACIG00000006734	ptrh1	58	57.463	ENSTGUG00000003648	PTRH1	100	57.463	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000006734	ptrh1	84	79.798	ENSTRUG00000019801	PTRH1	78	79.812	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000006734	ptrh1	84	76.650	ENSTNIG00000016735	ptrh1	88	76.650	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000006734	ptrh1	78	53.846	ENSTTRG00000016458	PTRH1	85	53.846	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000006734	ptrh1	73	58.480	ENSUAMG00000023948	-	77	58.480	Ursus_americanus
ENSACIG00000006734	ptrh1	74	45.349	ENSVPAG00000001805	PTRH1	95	45.349	Vicugna_pacos
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