EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006755 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5989 bases
Position: chrCCOE01001462.1:39736-45724
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	1	6
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	2	6
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	3	6
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	4	6
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	5	6
ENSACIP00000008621	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-27	6	6
ENSACIP00000008621	zf-met	PF12874.7	2.9e-11	1	3
ENSACIP00000008621	zf-met	PF12874.7	2.9e-11	2	3
ENSACIP00000008621	zf-met	PF12874.7	2.9e-11	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008878	-	792	-	ENSACIP00000008621	263 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006755	-	73	47.826	ENSACIG00000012084	-	95	47.826
ENSACIG00000006755	-	85	33.600	ENSACIG00000002944	-	84	32.961
ENSACIG00000006755	-	95	49.756	ENSACIG00000004626	-	91	53.684
ENSACIG00000006755	-	75	43.307	ENSACIG00000017892	-	74	43.307
ENSACIG00000006755	-	66	48.872	ENSACIG00000013163	-	85	48.872
ENSACIG00000006755	-	97	48.538	ENSACIG00000006172	-	93	45.930
ENSACIG00000006755	-	86	44.872	ENSACIG00000022658	-	94	50.000
ENSACIG00000006755	-	77	51.163	ENSACIG00000016182	-	98	52.023
ENSACIG00000006755	-	73	32.973	ENSACIG00000016180	znf341	51	32.973
ENSACIG00000006755	-	87	45.370	ENSACIG00000003515	-	93	45.370
ENSACIG00000006755	-	79	41.420	ENSACIG00000013149	-	93	41.420
ENSACIG00000006755	-	87	47.977	ENSACIG00000017647	-	92	52.326
ENSACIG00000006755	-	75	44.186	ENSACIG00000017644	-	88	44.186
ENSACIG00000006755	-	79	52.778	ENSACIG00000018440	-	95	52.778
ENSACIG00000006755	-	68	49.333	ENSACIG00000018022	-	51	49.333
ENSACIG00000006755	-	81	48.936	ENSACIG00000013750	-	67	48.936
ENSACIG00000006755	-	77	50.595	ENSACIG00000010637	-	70	50.595
ENSACIG00000006755	-	68	53.988	ENSACIG00000008448	-	69	53.988
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ENSACIG00000006755	-	71	47.273	ENSACIG00000015835	-	73	47.664
ENSACIG00000006755	-	71	38.172	ENSACIG00000019534	-	76	38.172
ENSACIG00000006755	-	75	38.068	ENSACIG00000000406	prdm5	75	38.068
ENSACIG00000006755	-	79	45.652	ENSACIG00000006228	-	62	45.652
ENSACIG00000006755	-	84	33.184	ENSACIG00000017166	-	84	33.184
ENSACIG00000006755	-	89	51.462	ENSACIG00000010647	-	97	51.613
ENSACIG00000006755	-	78	51.149	ENSACIG00000022293	-	92	51.149
ENSACIG00000006755	-	90	43.333	ENSACIG00000006826	-	76	43.333
ENSACIG00000006755	-	83	52.071	ENSACIG00000003754	-	96	52.071
ENSACIG00000006755	-	92	43.200	ENSACIG00000000311	-	79	43.200
ENSACIG00000006755	-	90	30.196	ENSACIG00000001860	-	69	30.196
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ENSACIG00000006755	-	94	48.824	ENSACIG00000019791	-	96	50.980
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ENSACIG00000006755	-	92	45.977	ENSACIG00000022738	-	97	50.000
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ENSACIG00000006755	-	72	40.426	ENSACIG00000007000	-	61	40.426
ENSACIG00000006755	-	67	34.940	ENSACIG00000014233	znf407	61	34.940
ENSACIG00000006755	-	95	58.904	ENSACIG00000007464	-	69	63.291
ENSACIG00000006755	-	83	49.708	ENSACIG00000024444	-	72	49.708
ENSACIG00000006755	-	89	54.651	ENSACIG00000011541	-	86	54.651
ENSACIG00000006755	-	75	38.793	ENSACIG00000023313	-	94	38.793
ENSACIG00000006755	-	89	53.529	ENSACIG00000006806	-	71	53.529
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ENSACIG00000006755	-	79	47.701	ENSACIG00000009780	-	90	48.521
ENSACIG00000006755	-	70	39.157	ENSACIG00000001369	-	82	39.157
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ENSACIG00000006755	-	68	42.073	ENSACIG00000017683	-	80	39.216
ENSACIG00000006755	-	71	51.553	ENSACIG00000000286	-	71	51.553
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ENSACIG00000006755	-	68	50.000	ENSACIG00000018404	-	76	50.000
ENSACIG00000006755	-	73	47.651	ENSACIG00000009755	-	78	47.651
ENSACIG00000006755	-	90	51.462	ENSACIG00000019102	-	61	51.462
ENSACIG00000006755	-	92	47.191	ENSACIG00000019815	-	100	47.009
ENSACIG00000006755	-	66	48.780	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	79	46.746
ENSACIG00000006755	-	90	52.299	ENSACIG00000010966	-	60	52.299
ENSACIG00000006755	-	93	50.000	ENSACIG00000017050	-	99	57.895
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ENSACIG00000006755	-	86	52.258	ENSACIG00000019447	-	74	52.258
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ENSACIG00000006755	-	79	40.541	ENSACIG00000008886	znf1164	92	44.318
ENSACIG00000006755	-	69	46.392	ENSACIG00000017653	-	96	46.392
ENSACIG00000006755	-	87	38.182	ENSACIG00000016117	-	88	39.344
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ENSACIG00000006755	-	74	42.857	ENSACIG00000012636	ZNF319	93	42.857
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ENSACIG00000006755	-	74	52.907	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	85	52.907
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ENSACIG00000006755	-	98	56.140	ENSACIG00000004041	-	99	56.140
ENSACIG00000006755	-	65	52.174	ENSACIG00000010660	-	95	52.174
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ENSACIG00000006755	-	75	50.581	ENSACIG00000009717	-	94	50.581
ENSACIG00000006755	-	93	50.000	ENSACIG00000013604	-	98	50.000
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ENSACIG00000006755	-	66	51.220	ENSACIG00000007034	-	71	51.220
ENSACIG00000006755	-	67	32.903	ENSACIG00000009443	-	69	32.283
ENSACIG00000006755	-	73	38.043	ENSACIG00000006377	-	62	38.043
ENSACIG00000006755	-	72	45.133	ENSACIG00000007882	-	81	45.133
ENSACIG00000006755	-	92	44.211	ENSACIG00000003720	-	79	44.211
ENSACIG00000006755	-	70	40.491	ENSACIG00000020938	zbtb47b	67	40.491
ENSACIG00000006755	-	84	32.018	ENSACIG00000016133	-	74	32.018
ENSACIG00000006755	-	97	41.818	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	70	41.818
ENSACIG00000006755	-	71	53.247	ENSACIG00000007855	-	94	53.247
ENSACIG00000006755	-	72	46.951	ENSACIG00000022330	-	85	46.951
ENSACIG00000006755	-	75	45.977	ENSACIG00000015429	-	90	45.333
ENSACIG00000006755	-	84	51.163	ENSACIG00000019804	-	83	51.163

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006755	-	66	54.598	ENSAPOG00000021383	-	59	54.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	77	43.169	ENSAPOG00000013982	-	74	43.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	83	53.529	ENSAPOG00000021991	-	89	53.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	70	48.521	ENSAPOG00000021959	-	75	48.521	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	93	45.098	ENSAPOG00000019061	-	83	50.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	74	48.276	ENSAPOG00000010200	-	57	48.276	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	93	48.837	ENSAPOG00000005195	-	68	48.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006755	-	89	45.872	ENSAOCG00000007134	-	86	43.023	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	67	47.977	ENSAOCG00000010471	-	95	47.977	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	89	52.941	ENSAOCG00000002795	-	80	52.941	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	82	52.047	ENSAOCG00000017602	-	84	52.047	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	95	51.613	ENSAOCG00000016905	-	83	52.459	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	76	54.598	ENSAOCG00000017595	-	81	54.598	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	68	48.214	ENSAOCG00000002430	-	95	48.214	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	95	43.636	ENSAOCG00000012813	-	86	46.067	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006755	-	82	52.047	ENSAPEG00000012470	-	84	52.047	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	75	46.512	ENSAPEG00000013097	-	72	50.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	78	52.601	ENSAPEG00000015337	-	94	48.901	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	95	51.613	ENSAPEG00000001546	-	96	52.459	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	68	48.214	ENSAPEG00000013044	-	79	48.214	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	76	54.023	ENSAPEG00000012443	-	61	54.023	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006755	-	66	42.683	ENSAPEG00000019106	-	53	42.683	Amphiprion_percula
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