EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006826 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4231 bases
Position: chrCCOE01001554.1:16927-21157
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008715	zf-C2H2	PF00096.26	4.1e-13	1	1
ENSACIP00000008715	zf-met	PF12874.7	0.00014	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000008975	-	690	-	ENSACIP00000008715	229 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006826	-	84	38.235	ENSACIG00000016932	-	72	38.235
ENSACIG00000006826	-	57	39.130	ENSACIG00000003754	-	93	39.130
ENSACIG00000006826	-	57	34.783	ENSACIG00000008886	znf1164	87	34.783
ENSACIG00000006826	-	51	39.496	ENSACIG00000023162	-	54	39.496
ENSACIG00000006826	-	62	41.837	ENSACIG00000007096	-	84	41.837
ENSACIG00000006826	-	50	40.336	ENSACIG00000016182	-	79	44.660
ENSACIG00000006826	-	83	40.000	ENSACIG00000004641	-	73	40.000
ENSACIG00000006826	-	68	40.833	ENSACIG00000008448	-	82	43.689
ENSACIG00000006826	-	60	43.103	ENSACIG00000003515	-	87	38.667
ENSACIG00000006826	-	82	42.857	ENSACIG00000009717	-	94	44.340
ENSACIG00000006826	-	51	37.963	ENSACIG00000006377	-	50	37.963
ENSACIG00000006826	-	69	40.000	ENSACIG00000006172	-	95	39.216
ENSACIG00000006826	-	73	37.795	ENSACIG00000024444	-	77	37.795
ENSACIG00000006826	-	51	43.363	ENSACIG00000022330	-	64	43.363
ENSACIG00000006826	-	82	45.000	ENSACIG00000011541	-	90	43.478
ENSACIG00000006826	-	59	43.478	ENSACIG00000010966	-	53	43.478
ENSACIG00000006826	-	77	41.509	ENSACIG00000015429	-	82	44.211
ENSACIG00000006826	-	59	48.438	ENSACIG00000022738	-	90	48.438
ENSACIG00000006826	-	90	39.252	ENSACIG00000019102	-	59	39.252
ENSACIG00000006826	-	76	43.333	ENSACIG00000006755	-	90	43.333
ENSACIG00000006826	-	86	46.429	ENSACIG00000004626	-	96	46.429
ENSACIG00000006826	-	80	40.336	ENSACIG00000000286	-	88	46.875
ENSACIG00000006826	-	82	43.697	ENSACIG00000011515	-	91	43.697
ENSACIG00000006826	-	68	43.925	ENSACIG00000019791	-	93	42.400
ENSACIG00000006826	-	51	43.137	ENSACIG00000019804	-	57	43.137
ENSACIG00000006826	-	62	37.931	ENSACIG00000001296	-	58	37.931
ENSACIG00000006826	-	82	43.925	ENSACIG00000010647	-	99	45.588
ENSACIG00000006826	-	60	44.643	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	91	44.643
ENSACIG00000006826	-	52	37.273	ENSACIG00000022625	-	75	39.091
ENSACIG00000006826	-	78	56.364	ENSACIG00000018404	-	85	56.364
ENSACIG00000006826	-	54	49.231	ENSACIG00000017166	-	60	49.231
ENSACIG00000006826	-	59	41.593	ENSACIG00000017644	-	87	41.593
ENSACIG00000006826	-	66	42.373	ENSACIG00000017647	-	81	43.089
ENSACIG00000006826	-	69	40.000	ENSACIG00000022658	-	97	40.000
ENSACIG00000006826	-	50	41.837	ENSACIG00000000311	-	60	41.837
ENSACIG00000006826	-	83	48.980	ENSACIG00000017050	-	96	47.541
ENSACIG00000006826	-	59	51.471	ENSACIG00000009755	-	83	51.471
ENSACIG00000006826	-	79	35.514	ENSACIG00000013163	-	76	35.514
ENSACIG00000006826	-	66	50.000	ENSACIG00000014123	znf236	50	50.000
ENSACIG00000006826	-	91	36.400	ENSACIG00000007464	-	75	36.400
ENSACIG00000006826	-	83	42.391	ENSACIG00000023212	-	91	42.391
ENSACIG00000006826	-	52	58.333	ENSACIG00000007034	-	78	58.333
ENSACIG00000006826	-	77	36.765	ENSACIG00000015835	-	76	36.765
ENSACIG00000006826	-	80	40.336	ENSACIG00000003556	-	84	40.336
ENSACIG00000006826	-	59	33.036	ENSACIG00000012263	znf319b	61	33.036
ENSACIG00000006826	-	54	47.368	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	82	47.368
ENSACIG00000006826	-	82	44.167	ENSACIG00000013470	-	88	44.538
ENSACIG00000006826	-	59	43.590	ENSACIG00000009780	-	79	43.590
ENSACIG00000006826	-	92	39.344	ENSACIG00000004041	-	99	44.538
ENSACIG00000006826	-	82	30.198	ENSACIG00000018952	-	72	30.198
ENSACIG00000006826	-	73	46.296	ENSACIG00000006806	-	79	46.296
ENSACIG00000006826	-	73	40.870	ENSACIG00000004745	-	86	40.984
ENSACIG00000006826	-	78	34.653	ENSACIG00000012636	ZNF319	71	34.653
ENSACIG00000006826	-	61	46.667	ENSACIG00000013750	-	53	46.667
ENSACIG00000006826	-	69	44.037	ENSACIG00000019710	-	67	44.037
ENSACIG00000006826	-	80	37.097	ENSACIG00000004666	-	98	41.071
ENSACIG00000006826	-	52	43.077	ENSACIG00000023049	znf646	86	43.077
ENSACIG00000006826	-	61	42.478	ENSACIG00000019447	-	61	42.478
ENSACIG00000006826	-	62	38.211	ENSACIG00000021986	-	85	38.211
ENSACIG00000006826	-	61	36.697	ENSACIG00000013149	-	64	36.538
ENSACIG00000006826	-	68	39.252	ENSACIG00000011153	-	84	39.252
ENSACIG00000006826	-	50	43.860	ENSACIG00000022293	-	91	43.860
ENSACIG00000006826	-	58	41.228	ENSACIG00000013604	-	93	41.228
ENSACIG00000006826	-	51	44.554	ENSACIG00000018440	-	91	44.554

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006826	-	86	37.019	ENSAPOG00000018429	-	61	37.019	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006826	-	82	42.857	ENSAPOG00000019138	-	77	42.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000006826	-	82	52.941	ENSAOCG00000016897	-	79	52.941	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006826	-	82	52.941	ENSAPEG00000001556	-	79	52.941	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006826	-	92	39.394	ENSAPEG00000010013	-	64	39.394	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006826	-	74	38.596	ENSATEG00000018931	-	70	39.423	Anabas_testudineus
ENSACIG00000006826	-	60	44.068	ENSCSEG00000008528	-	54	44.068	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006826	-	83	46.078	ENSCSEG00000008525	-	67	46.078	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000006826	-	52	41.772	ENSCVAG00000020141	-	64	41.772	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006826	-	50	39.655	ENSCVAG00000015616	-	74	39.655	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006826	-	71	40.385	ENSCVAG00000003250	-	65	40.385	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000006826	-	66	46.809	ENSELUG00000024007	-	62	46.809	Esox_lucius
ENSACIG00000006826	-	72	33.333	ENSGAFG00000007528	-	67	33.333	Gambusia_affinis
ENSACIG00000006826	-	59	35.714	ENSHBUG00000006656	-	56	35.714	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006826	-	64	37.838	ENSHCOG00000008213	-	52	37.838	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	62	39.837	ENSHCOG00000008550	-	61	39.837	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	57	46.667	ENSHCOG00000020670	-	89	46.667	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	62	39.837	ENSHCOG00000001873	-	61	39.837	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	65	41.538	ENSHCOG00000008227	-	71	41.538	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	83	62.857	ENSHCOG00000013489	-	97	44.144	Hippocampus_comes
ENSACIG00000006826	-	73	33.708	ENSKMAG00000007699	-	76	33.708	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000006826	-	60	45.098	ENSLBEG00000001132	-	55	45.098	Labrus_bergylta
ENSACIG00000006826	-	62	43.333	ENSLBEG00000011210	-	61	43.333	Labrus_bergylta
ENSACIG00000006826	-	75	35.417	ENSMAMG00000017939	-	56	39.683	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000006826	-	83	46.667	ENSMMOG00000017592	-	60	46.667	Mola_mola
ENSACIG00000006826	-	79	38.144	ENSONIG00000007967	-	57	38.144	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006826	-	71	42.188	ENSONIG00000005050	-	65	42.188	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006826	-	55	51.852	ENSORLG00000021885	-	68	45.614	Oryzias_latipes
ENSACIG00000006826	-	76	48.000	ENSORLG00000002268	-	68	48.000	Oryzias_latipes
ENSACIG00000006826	-	55	39.310	ENSORLG00020018921	-	60	42.982	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000006826	-	51	45.614	ENSORLG00015018099	-	61	45.614	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000006826	-	59	33.083	ENSPMAG00000004189	-	80	33.083	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000006826	-	64	36.937	ENSPFOG00000018860	-	94	36.893	Poecilia_formosa
ENSACIG00000006826	-	55	44.828	ENSPLAG00000010067	-	54	44.828	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006826	-	56	35.135	ENSPLAG00000014832	-	77	32.692	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006826	-	56	36.134	ENSPLAG00000008941	-	81	36.134	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000006826	-	56	35.135	ENSPMEG00000005210	-	77	32.692	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000006826	-	59	35.075	ENSPREG00000002603	-	67	35.075	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000006826	-	61	45.455	ENSPNYG00000017888	-	67	40.187	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000006826	-	59	39.286	ENSPNAG00000005946	-	96	36.364	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000006826	-	74	38.333	ENSSMAG00000013291	-	89	46.875	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000006826	-	80	32.275	ENSSMAG00000004259	-	89	32.275	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000006826	-	74	40.217	ENSSDUG00000020774	-	65	40.217	Seriola_dumerili
ENSACIG00000006826	-	57	32.886	ENSSLDG00000014436	-	59	32.886	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006826	-	74	37.374	ENSSPAG00000011544	-	67	37.374	Stegastes_partitus
ENSACIG00000006826	-	64	40.541	ENSXETG00000012506	znf91	98	40.541	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000006826	-	66	43.750	ENSXCOG00000003441	-	69	38.318	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000006826	-	59	33.333	ENSXCOG00000020768	-	71	33.333	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000006826	-	78	40.678	ENSXCOG00000014360	-	67	40.678	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000006826	-	56	35.135	ENSXMAG00000012936	-	76	32.692	Xiphophorus_maculatus