EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000006949 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB17
Alias: -
Full Name: RAB17%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4014 bases
Position: chrCCOE01000040.1:906722-910735
Accession: 16523
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008885	MMR_HSR1	PF01926.23	8.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009153	RAB17-201	684	-	ENSACIP00000008885	227 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000006949	RAB17	75	38.372	ENSACIG00000009006	zgc:171927	80	38.372
ENSACIG00000006949	RAB17	68	33.333	ENSACIG00000013119	-	80	33.333
ENSACIG00000006949	RAB17	72	36.145	ENSACIG00000023837	-	78	36.145
ENSACIG00000006949	RAB17	71	37.349	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	37.349
ENSACIG00000006949	RAB17	86	39.706	ENSACIG00000003092	rab11a	93	39.706
ENSACIG00000006949	RAB17	74	43.195	ENSACIG00000017414	rab25b	81	43.195
ENSACIG00000006949	RAB17	62	33.333	ENSACIG00000020496	rab23	74	33.987
ENSACIG00000006949	RAB17	74	36.686	ENSACIG00000009617	rab18a	81	36.686
ENSACIG00000006949	RAB17	70	33.939	ENSACIG00000022381	-	79	33.939
ENSACIG00000006949	RAB17	59	30.496	ENSACIG00000000949	-	67	30.496
ENSACIG00000006949	RAB17	70	37.888	ENSACIG00000010619	rab15	75	37.888
ENSACIG00000006949	RAB17	69	40.506	ENSACIG00000020616	rab12	64	40.506
ENSACIG00000006949	RAB17	71	38.037	ENSACIG00000008584	rab13	78	38.037
ENSACIG00000006949	RAB17	58	46.970	ENSACIG00000019631	rab11bb	69	46.970
ENSACIG00000006949	RAB17	88	30.732	ENSACIG00000007739	rab9b	98	30.732
ENSACIG00000006949	RAB17	71	52.147	ENSACIG00000019251	rab5aa	76	52.147
ENSACIG00000006949	RAB17	70	30.909	ENSACIG00000021459	zgc:101559	72	30.909
ENSACIG00000006949	RAB17	70	34.146	ENSACIG00000009139	dnajc27	60	34.146
ENSACIG00000006949	RAB17	70	41.615	ENSACIG00000007154	rab6ba	75	41.615
ENSACIG00000006949	RAB17	89	31.628	ENSACIG00000022520	rab33a	95	31.628
ENSACIG00000006949	RAB17	73	38.922	ENSACIG00000008102	rab18b	81	38.922
ENSACIG00000006949	RAB17	77	32.778	ENSACIG00000022208	-	84	32.778
ENSACIG00000006949	RAB17	74	30.357	ENSACIG00000000100	kras	54	30.357
ENSACIG00000006949	RAB17	72	32.727	ENSACIG00000000670	rabl2	72	32.727
ENSACIG00000006949	RAB17	67	38.816	ENSACIG00000003157	-	80	38.816
ENSACIG00000006949	RAB17	86	35.678	ENSACIG00000019049	rab1ab	97	35.468
ENSACIG00000006949	RAB17	72	37.349	ENSACIG00000000154	RAB39B	78	37.349
ENSACIG00000006949	RAB17	51	30.769	ENSACIG00000013244	arl14	56	30.769
ENSACIG00000006949	RAB17	70	31.792	ENSACIG00000021855	rab33ba	72	31.792
ENSACIG00000006949	RAB17	70	42.236	ENSACIG00000014605	rab6a	76	42.236
ENSACIG00000006949	RAB17	72	37.349	ENSACIG00000003102	rab42a	76	37.349
ENSACIG00000006949	RAB17	71	50.920	ENSACIG00000010896	rab5c	75	50.920
ENSACIG00000006949	RAB17	70	40.000	ENSACIG00000023222	-	69	40.000
ENSACIG00000006949	RAB17	70	39.375	ENSACIG00000010914	RAB41	75	39.375
ENSACIG00000006949	RAB17	74	42.604	ENSACIG00000019803	rab25a	79	42.604
ENSACIG00000006949	RAB17	74	44.379	ENSACIG00000017403	rab11al	78	44.379
ENSACIG00000006949	RAB17	70	40.000	ENSACIG00000014094	rab6bb	77	40.000
ENSACIG00000006949	RAB17	87	31.034	ENSACIG00000006558	-	98	31.034
ENSACIG00000006949	RAB17	73	31.034	ENSACIG00000018043	rab9a	84	31.034
ENSACIG00000006949	RAB17	71	38.889	ENSACIG00000014012	rab22a	83	38.889
ENSACIG00000006949	RAB17	70	34.146	ENSACIG00000013630	RAB7A	79	34.146
ENSACIG00000006949	RAB17	58	31.579	ENSACIG00000000699	hrasb	84	30.435
ENSACIG00000006949	RAB17	74	43.195	ENSACIG00000024376	-	77	43.195
ENSACIG00000006949	RAB17	69	45.860	ENSACIG00000024374	rab11ba	64	45.860
ENSACIG00000006949	RAB17	75	35.260	ENSACIG00000014625	-	85	35.260
ENSACIG00000006949	RAB17	58	31.159	ENSACIG00000013359	arl4d	65	31.159
ENSACIG00000006949	RAB17	70	37.576	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	80	37.576
ENSACIG00000006949	RAB17	81	31.658	ENSACIG00000009306	RAB15	94	31.658
ENSACIG00000006949	RAB17	74	31.319	ENSACIG00000018839	-	84	31.319
ENSACIG00000006949	RAB17	70	31.515	ENSACIG00000017824	rras	81	31.515
ENSACIG00000006949	RAB17	71	33.333	ENSACIG00000000642	rab36	63	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000006949	RAB17	100	76.652	ENSAOCG00000009167	-	100	76.652	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000006949	RAB17	100	77.533	ENSAPEG00000002915	RAB17	100	77.533	Amphiprion_percula
ENSACIG00000006949	RAB17	86	46.701	ENSACAG00000004554	RAB17	88	46.701	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000006949	RAB17	100	82.819	ENSACLG00000001218	RAB17	100	82.819	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000006949	RAB17	74	51.497	ENSFCAG00000012724	RAB17	78	51.497	Felis_catus
ENSACIG00000006949	RAB17	70	55.000	ENSFALG00000012783	RAB17	75	55.000	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000006949	RAB17	70	56.875	ENSGALG00000003899	RAB17	75	56.875	Gallus_gallus
ENSACIG00000006949	RAB17	100	83.260	ENSHBUG00000001462	RAB17	100	83.260	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000006949	RAB17	92	69.484	ENSLBEG00000027691	RAB17	93	69.484	Labrus_bergylta
ENSACIG00000006949	RAB17	100	83.260	ENSMZEG00005013677	RAB17	100	83.260	Maylandia_zebra
ENSACIG00000006949	RAB17	70	57.500	ENSMGAG00000003135	RAB17	74	57.500	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000006949	RAB17	82	50.000	ENSMOCG00000006448	Rab17	86	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000006949	RAB17	100	74.890	ENSMMOG00000019258	RAB17	100	74.890	Mola_mola
ENSACIG00000006949	RAB17	80	48.352	ENSMODG00000008949	RAB17	84	48.352	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000006949	RAB17	94	61.972	ENSMALG00000007905	RAB17	88	61.972	Monopterus_albus
ENSACIG00000006949	RAB17	90	84.390	ENSNBRG00000017793	RAB17	92	84.390	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000006949	RAB17	69	52.564	ENSMEUG00000005002	RAB17	89	52.564	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000006949	RAB17	100	85.903	ENSONIG00000016776	RAB17	100	85.903	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000006949	RAB17	71	51.235	ENSPPRG00000003974	RAB17	76	51.235	Panthera_pardus
ENSACIG00000006949	RAB17	74	49.102	ENSPTIG00000014452	RAB17	78	49.102	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000006949	RAB17	89	48.293	ENSPSIG00000016995	RAB17	84	48.293	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000006949	RAB17	82	48.663	ENSPCIG00000021558	-	64	48.663	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000006949	RAB17	100	83.260	ENSPNYG00000011135	RAB17	100	83.260	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000006949	RAB17	82	48.128	ENSSHAG00000009306	RAB17	87	48.128	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000006949	RAB17	100	76.652	ENSSDUG00000006618	RAB17	100	76.652	Seriola_dumerili
ENSACIG00000006949	RAB17	100	77.093	ENSSLDG00000020918	RAB17	100	77.093	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000006949	RAB17	57	57.692	ENSSPUG00000015409	RAB17	60	57.692	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000006949	RAB17	100	72.687	ENSSPAG00000022624	-	100	72.687	Stegastes_partitus
ENSACIG00000006949	RAB17	70	56.250	ENSTGUG00000003786	RAB17	76	56.250	Taeniopygia_guttata