EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007000 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17749 bases
Position: chrCCOE01001554.1:63233-80981
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008955	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-32	1	5
ENSACIP00000008955	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-32	2	5
ENSACIP00000008955	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-32	3	5
ENSACIP00000008955	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-32	4	5
ENSACIP00000008955	zf-C2H2	PF00096.26	2.4e-32	5	5
ENSACIP00000008955	zf-met	PF12874.7	0.00014	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009226	-	1701	-	ENSACIP00000008955	566 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007000	-	61	35.577	ENSACIG00000014282	znf526	53	35.577
ENSACIG00000007000	-	66	38.934	ENSACIG00000004626	-	80	37.097
ENSACIG00000007000	-	63	36.170	ENSACIG00000013470	-	79	36.900
ENSACIG00000007000	-	85	33.180	ENSACIG00000015835	-	97	33.180
ENSACIG00000007000	-	60	41.667	ENSACIG00000009780	-	71	41.667
ENSACIG00000007000	-	63	31.698	ENSACIG00000012263	znf319b	91	32.328
ENSACIG00000007000	-	58	35.938	ENSACIG00000017644	-	89	35.938
ENSACIG00000007000	-	92	39.062	ENSACIG00000017647	-	91	38.868
ENSACIG00000007000	-	69	37.900	ENSACIG00000022625	-	82	37.900
ENSACIG00000007000	-	57	36.199	ENSACIG00000022330	-	84	36.199
ENSACIG00000007000	-	68	37.549	ENSACIG00000013604	-	98	38.222
ENSACIG00000007000	-	65	44.262	ENSACIG00000022738	-	92	35.294
ENSACIG00000007000	-	61	36.161	ENSACIG00000004745	-	90	34.231
ENSACIG00000007000	-	57	38.938	ENSACIG00000006806	-	56	36.327
ENSACIG00000007000	-	58	36.458	ENSACIG00000009755	-	79	35.821
ENSACIG00000007000	-	62	42.857	ENSACIG00000022658	-	98	43.548
ENSACIG00000007000	-	61	39.560	ENSACIG00000003556	-	64	40.541
ENSACIG00000007000	-	54	41.860	ENSACIG00000007464	-	50	43.077
ENSACIG00000007000	-	65	33.681	ENSACIG00000024444	-	63	37.879
ENSACIG00000007000	-	73	42.105	ENSACIG00000002190	gfi1b	59	42.105
ENSACIG00000007000	-	63	32.751	ENSACIG00000001369	-	79	32.751
ENSACIG00000007000	-	57	39.674	ENSACIG00000000311	-	60	40.268
ENSACIG00000007000	-	59	40.940	ENSACIG00000012084	-	98	35.909
ENSACIG00000007000	-	90	33.036	ENSACIG00000010647	-	98	40.690
ENSACIG00000007000	-	59	34.184	ENSACIG00000011516	-	78	34.184
ENSACIG00000007000	-	58	39.535	ENSACIG00000011515	-	66	39.535
ENSACIG00000007000	-	85	42.400	ENSACIG00000022645	-	56	48.276
ENSACIG00000007000	-	85	36.471	ENSACIG00000004641	-	94	38.129
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ENSACIG00000007000	-	60	36.466	ENSACIG00000022293	-	99	36.576
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ENSACIG00000007000	-	65	34.118	ENSACIG00000023212	-	79	36.691
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ENSACIG00000007000	-	63	38.830	ENSACIG00000000286	-	68	43.750
ENSACIG00000007000	-	63	38.571	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	73	32.000
ENSACIG00000007000	-	55	30.556	ENSACIG00000013508	ZNF384	51	30.651
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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007000	-	92	43.728	ENSTRUG00000003454	-	97	55.776	Takifugu_rubripes