EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007034 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 929 bases
Position: chrCCOE01001554.1:79151-80079
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000008981	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-15	1	2
ENSACIP00000008981	zf-C2H2	PF00096.26	3.7e-15	2	2
ENSACIP00000008981	zf-met	PF12874.7	8.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009252	-	366	-	ENSACIP00000008981	121 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007034	-	83	49.231	ENSACIG00000019815	-	82	49.231
ENSACIG00000007034	-	70	52.381	ENSACIG00000010637	-	51	52.381
ENSACIG00000007034	-	72	49.425	ENSACIG00000003754	-	82	49.425
ENSACIG00000007034	-	72	42.529	ENSACIG00000012636	ZNF319	63	42.529
ENSACIG00000007034	-	71	50.000	ENSACIG00000017653	-	96	50.000
ENSACIG00000007034	-	100	46.341	ENSACIG00000003515	-	81	52.778
ENSACIG00000007034	-	72	41.176	ENSACIG00000016117	-	83	41.176
ENSACIG00000007034	-	74	44.872	ENSACIG00000000406	prdm5	62	44.872
ENSACIG00000007034	-	75	51.220	ENSACIG00000011515	-	65	51.220
ENSACIG00000007034	-	73	36.000	ENSACIG00000011516	-	50	32.222
ENSACIG00000007034	-	92	48.235	ENSACIG00000010647	-	94	49.206
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ENSACIG00000007034	-	81	45.882	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	45.882
ENSACIG00000007034	-	96	45.763	ENSACIG00000017683	-	85	41.791
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ENSACIG00000007034	-	96	41.111	ENSACIG00000015411	-	56	41.111
ENSACIG00000007034	-	73	47.619	ENSACIG00000006228	-	68	47.619
ENSACIG00000007034	-	79	46.667	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	77	46.667
ENSACIG00000007034	-	79	45.882	ENSACIG00000009780	-	73	45.882
ENSACIG00000007034	-	82	54.217	ENSACIG00000022658	-	91	54.217
ENSACIG00000007034	-	88	46.988	ENSACIG00000004666	-	98	51.220
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ENSACIG00000007034	-	72	42.857	ENSACIG00000016133	-	55	42.857
ENSACIG00000007034	-	92	47.059	ENSACIG00000017050	-	96	46.341
ENSACIG00000007034	-	71	51.220	ENSACIG00000006755	-	66	51.220
ENSACIG00000007034	-	70	51.613	ENSACIG00000000311	-	57	51.613
ENSACIG00000007034	-	73	48.611	ENSACIG00000019710	-	71	48.611
ENSACIG00000007034	-	70	50.602	ENSACIG00000008448	-	68	50.602
ENSACIG00000007034	-	79	46.429	ENSACIG00000016182	-	79	48.193
ENSACIG00000007034	-	88	42.353	ENSACIG00000023313	-	85	42.353
ENSACIG00000007034	-	73	50.685	ENSACIG00000013149	-	68	50.685
ENSACIG00000007034	-	78	58.333	ENSACIG00000006826	-	52	58.333
ENSACIG00000007034	-	71	47.727	ENSACIG00000007882	-	76	47.727
ENSACIG00000007034	-	97	41.270	ENSACIG00000008886	znf1164	84	41.270
ENSACIG00000007034	-	73	45.902	ENSACIG00000015835	-	67	45.902
ENSACIG00000007034	-	74	43.038	ENSACIG00000018404	-	67	43.038
ENSACIG00000007034	-	72	46.377	ENSACIG00000022330	-	82	45.833
ENSACIG00000007034	-	70	40.789	ENSACIG00000003720	-	60	40.789
ENSACIG00000007034	-	74	53.846	ENSACIG00000003556	-	65	53.846
ENSACIG00000007034	-	79	51.064	ENSACIG00000004041	-	90	51.064
ENSACIG00000007034	-	79	44.318	ENSACIG00000007096	-	79	44.318
ENSACIG00000007034	-	71	45.238	ENSACIG00000010739	-	50	45.238
ENSACIG00000007034	-	71	43.529	ENSACIG00000002190	gfi1b	53	43.529
ENSACIG00000007034	-	81	41.860	ENSACIG00000007855	-	70	41.860
ENSACIG00000007034	-	95	50.000	ENSACIG00000022738	-	94	50.000
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ENSACIG00000007034	-	91	46.591	ENSACIG00000022625	-	84	46.591
ENSACIG00000007034	-	75	49.438	ENSACIG00000009717	-	85	49.438
ENSACIG00000007034	-	95	47.059	ENSACIG00000006172	-	89	47.674
ENSACIG00000007034	-	72	47.761	ENSACIG00000017644	-	85	47.761
ENSACIG00000007034	-	96	50.000	ENSACIG00000013604	-	95	50.000
ENSACIG00000007034	-	71	39.759	ENSACIG00000001767	zbtb41	51	39.759
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ENSACIG00000007034	-	98	47.727	ENSACIG00000013163	-	76	43.902
ENSACIG00000007034	-	82	44.578	ENSACIG00000004745	-	86	44.578
ENSACIG00000007034	-	69	36.145	ENSACIG00000002944	-	63	36.145
ENSACIG00000007034	-	95	54.545	ENSACIG00000004626	-	79	54.545
ENSACIG00000007034	-	73	48.780	ENSACIG00000019447	-	65	48.780
ENSACIG00000007034	-	75	40.659	ENSACIG00000012263	znf319b	65	40.659
ENSACIG00000007034	-	70	49.398	ENSACIG00000013470	-	62	49.398
ENSACIG00000007034	-	70	42.857	ENSACIG00000010660	-	91	41.791
ENSACIG00000007034	-	88	50.000	ENSACIG00000022293	-	91	50.000
ENSACIG00000007034	-	70	50.000	ENSACIG00000016944	-	75	50.000
ENSACIG00000007034	-	89	44.776	ENSACIG00000021986	-	87	45.783
ENSACIG00000007034	-	73	45.763	ENSACIG00000024444	-	63	45.763
ENSACIG00000007034	-	88	50.794	ENSACIG00000019534	-	79	50.794
ENSACIG00000007034	-	71	40.698	ENSACIG00000009128	-	69	40.698
ENSACIG00000007034	-	74	42.105	ENSACIG00000017166	-	60	42.105
ENSACIG00000007034	-	74	40.299	ENSACIG00000001369	-	75	40.299
ENSACIG00000007034	-	71	41.667	ENSACIG00000002180	-	95	41.667
ENSACIG00000007034	-	74	47.541	ENSACIG00000011541	-	67	47.541
ENSACIG00000007034	-	91	48.780	ENSACIG00000017647	-	89	51.351

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007034	-	88	89.535	ENSAPOG00000018586	-	66	89.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	96	48.611	ENSAPOG00000020116	-	68	48.611	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	80	48.235	ENSAPOG00000001054	-	93	49.398	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	80	44.706	ENSAPOG00000013493	-	78	44.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	73	47.727	ENSAPOG00000013499	-	67	47.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	88	47.761	ENSAPOG00000018492	-	51	47.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007034	-	79	48.780	ENSAOCG00000013934	-	54	48.780	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	89	51.190	ENSAOCG00000018484	-	93	51.190	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	73	47.727	ENSAOCG00000019475	-	66	47.727	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	71	64.286	ENSAOCG00000012903	-	69	64.286	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	73	44.444	ENSAOCG00000013578	-	72	44.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	77	42.857	ENSAOCG00000020624	-	70	42.857	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	93	50.000	ENSAOCG00000015369	-	96	54.762	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	82	48.276	ENSAOCG00000022459	-	89	49.398	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007034	-	78	43.750	ENSAPEG00000005678	-	53	43.750	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	83	48.780	ENSAPEG00000012236	-	57	48.780	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	73	47.727	ENSAPEG00000016462	-	66	47.727	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	76	89.535	ENSAPEG00000018471	-	63	89.535	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	73	46.296	ENSAPEG00000009515	-	83	42.857	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	89	51.220	ENSAPEG00000011020	-	95	51.190	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	71	64.286	ENSAPEG00000018460	-	69	64.286	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	93	52.381	ENSAPEG00000013031	-	83	52.381	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	87	49.383	ENSAPEG00000008020	-	97	48.864	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007034	-	98	48.810	ENSATEG00000005519	-	97	52.778	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007034	-	74	45.783	ENSATEG00000007325	-	72	45.783	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007034	-	95	63.158	ENSATEG00000010560	-	85	63.158	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007034	-	94	51.807	ENSACLG00000024957	-	94	51.807	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	74	48.837	ENSACLG00000024491	-	83	48.837	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	80	45.882	ENSACLG00000017941	-	61	45.882	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	94	51.389	ENSACLG00000025251	-	92	51.389	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	79	92.941	ENSACLG00000006702	-	65	92.941	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	71	55.294	ENSACLG00000006697	-	62	55.294	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	82	50.000	ENSACLG00000022505	-	83	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007034	-	93	42.857	ENSCSEG00000005974	-	83	41.176	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007034	-	93	45.205	ENSCSEG00000005983	-	99	45.205	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007034	-	87	55.224	ENSCSEG00000019029	-	97	55.224	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007034	-	95	50.602	ENSCVAG00000010442	-	96	50.602	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	82	61.628	ENSCVAG00000005112	-	71	61.628	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	70	50.000	ENSCVAG00000001609	-	71	50.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	75	43.820	ENSCVAG00000003396	-	59	43.820	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	93	57.895	ENSCVAG00000004958	-	75	57.895	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	84	51.220	ENSCVAG00000012543	-	99	51.220	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	76	51.111	ENSCVAG00000012284	-	79	51.111	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	88	48.214	ENSCVAG00000014269	-	97	48.214	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007034	-	71	54.217	ENSDARG00000102027	si:dkey-172k15.11	82	54.217	Danio_rerio
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