EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007096 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5739 bases
Position: chrCCOE01000384.1:4516515-4522253
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009055	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-29	1	5
ENSACIP00000009055	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-29	2	5
ENSACIP00000009055	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-29	3	5
ENSACIP00000009055	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-29	4	5
ENSACIP00000009055	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-29	5	5
ENSACIP00000009055	zf-met	PF12874.7	7.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009328	-	678	-	ENSACIP00000009055	225 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007096	-	72	51.376	ENSACIG00000019815	-	83	51.376
ENSACIG00000007096	-	82	46.023	ENSACIG00000019447	-	69	46.023
ENSACIG00000007096	-	80	44.805	ENSACIG00000022738	-	98	44.720
ENSACIG00000007096	-	70	44.444	ENSACIG00000017683	-	77	40.426
ENSACIG00000007096	-	89	34.848	ENSACIG00000011516	-	84	33.514
ENSACIG00000007096	-	72	46.341	ENSACIG00000017166	-	76	46.341
ENSACIG00000007096	-	88	47.312	ENSACIG00000014123	znf236	61	47.312
ENSACIG00000007096	-	90	51.282	ENSACIG00000013470	-	70	51.282
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ENSACIG00000007096	-	96	43.312	ENSACIG00000022625	-	86	46.729
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ENSACIG00000007096	-	76	41.558	ENSACIG00000020938	zbtb47b	68	41.558
ENSACIG00000007096	-	88	47.170	ENSACIG00000012084	-	96	47.531
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ENSACIG00000007096	-	89	45.517	ENSACIG00000015429	-	81	43.902
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ENSACIG00000007096	-	81	30.366	ENSACIG00000013613	scrt1b	67	31.683
ENSACIG00000007096	-	79	43.662	ENSACIG00000017653	-	93	43.662
ENSACIG00000007096	-	73	44.853	ENSACIG00000007464	-	52	44.853
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ENSACIG00000007096	-	87	47.368	ENSACIG00000018404	-	85	47.368
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ENSACIG00000007096	-	84	47.826	ENSACIG00000009755	-	83	47.826
ENSACIG00000007096	-	82	40.523	ENSACIG00000015411	-	83	40.523
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ENSACIG00000007096	-	91	45.513	ENSACIG00000023794	-	65	45.513
ENSACIG00000007096	-	84	36.923	ENSACIG00000006586	-	56	36.923
ENSACIG00000007096	-	89	41.844	ENSACIG00000010739	-	88	41.844
ENSACIG00000007096	-	73	53.472	ENSACIG00000022658	-	92	53.472
ENSACIG00000007096	-	92	43.624	ENSACIG00000024444	-	64	46.341
ENSACIG00000007096	-	72	50.000	ENSACIG00000023162	-	53	50.000
ENSACIG00000007096	-	78	37.126	ENSACIG00000001369	-	77	37.126
ENSACIG00000007096	-	74	44.275	ENSACIG00000009128	-	81	44.275

Orthologs

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ENSACIG00000007096	-	73	48.201	ENSAPOG00000009709	-	55	48.201	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007096	-	92	72.596	ENSAPOG00000021966	-	58	72.596	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007096	-	68	53.659	ENSAPOG00000004997	-	89	53.659	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007096	-	76	52.083	ENSAPOG00000023008	-	59	52.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007096	-	74	44.785	ENSAOCG00000016409	-	72	44.805	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007096	-	92	71.635	ENSAOCG00000022529	-	59	71.635	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007096	-	74	44.785	ENSAPEG00000008746	-	72	44.785	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007096	-	88	45.652	ENSATEG00000014684	-	99	42.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007096	-	87	44.805	ENSATEG00000022064	-	93	40.854	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007096	-	72	48.837	ENSATEG00000015238	-	59	48.837	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007096	-	86	63.402	ENSATEG00000021602	-	78	63.402	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007096	-	71	48.092	ENSACLG00000018716	-	85	48.092	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	92	37.379	ENSACLG00000005795	-	71	37.379	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	90	46.099	ENSACLG00000011239	-	74	46.099	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	72	45.270	ENSACLG00000001368	-	95	47.899	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	79	44.134	ENSACLG00000019482	-	74	44.134	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	93	77.143	ENSACLG00000008374	-	59	77.143	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	77	45.455	ENSACLG00000015462	-	60	45.455	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	87	44.444	ENSACLG00000019349	-	70	44.444	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	74	48.062	ENSACLG00000006718	-	61	48.062	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	87	42.763	ENSACLG00000022482	-	78	42.763	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	74	48.062	ENSACLG00000020333	-	61	48.062	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	90	42.484	ENSACLG00000014365	-	91	42.484	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007096	-	80	45.139	ENSAMXG00000007973	-	91	38.693	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007096	-	80	50.000	ENSAMXG00000034934	-	77	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007096	-	75	47.170	ENSCSEG00000019848	-	54	43.636	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007096	-	77	37.209	ENSCSEG00000019599	-	69	37.209	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007096	-	86	45.000	ENSCVAG00000019097	-	66	45.926	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007096	-	97	40.994	ENSCVAG00000020968	-	65	40.994	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007096	-	84	44.186	ENSCVAG00000010887	-	62	44.186	Cyprinodon_variegatus
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