EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007158 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20657 bases
Position: chrCCOE01000501.1:172046-192702
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009135	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-22	1	2
ENSACIP00000009135	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-22	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009411	-	1953	-	ENSACIP00000009135	650 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007158	-	61	32.292	ENSACIG00000007725	-	70	32.292
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ENSACIG00000007158	-	58	34.762	ENSACIG00000009149	-	70	34.762
ENSACIG00000007158	-	58	52.273	ENSACIG00000008666	-	88	52.273
ENSACIG00000007158	-	54	35.484	ENSACIG00000019509	-	88	35.484
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ENSACIG00000007158	-	56	34.737	ENSACIG00000003050	-	83	35.106
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ENSACIG00000007158	-	60	50.500	ENSACIG00000014716	-	78	50.259
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ENSACIG00000007158	-	72	66.495	ENSACIG00000007191	-	55	74.737
ENSACIG00000007158	-	63	42.857	ENSACIG00000016502	-	82	42.857
ENSACIG00000007158	-	75	51.942	ENSACIG00000006484	-	83	53.927
ENSACIG00000007158	-	66	47.668	ENSACIG00000001455	-	71	47.668
ENSACIG00000007158	-	61	48.128	ENSACIG00000004040	-	74	48.128
ENSACIG00000007158	-	61	49.741	ENSACIG00000023381	-	77	49.741
ENSACIG00000007158	-	60	42.180	ENSACIG00000012061	-	59	43.284
ENSACIG00000007158	-	62	48.438	ENSACIG00000000893	-	78	48.438
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ENSACIG00000007158	-	62	47.706	ENSACIG00000022370	-	68	48.980
ENSACIG00000007158	-	63	47.162	ENSACIG00000022377	-	72	49.741
ENSACIG00000007158	-	51	60.119	ENSACIG00000022374	-	86	60.119
ENSACIG00000007158	-	60	50.990	ENSACIG00000014703	-	80	51.295
ENSACIG00000007158	-	63	48.969	ENSACIG00000008045	-	75	48.969
ENSACIG00000007158	-	71	56.281	ENSACIG00000019149	-	95	56.784
ENSACIG00000007158	-	61	47.887	ENSACIG00000014655	-	72	50.000
ENSACIG00000007158	-	63	62.963	ENSACIG00000012718	-	86	63.725
ENSACIG00000007158	-	70	56.838	ENSACIG00000005780	-	60	60.302
ENSACIG00000007158	-	78	50.235	ENSACIG00000012159	-	55	55.238
ENSACIG00000007158	-	59	45.408	ENSACIG00000015088	-	77	45.408
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ENSACIG00000007158	-	57	57.609	ENSACIG00000012761	-	86	59.538
ENSACIG00000007158	-	61	50.802	ENSACIG00000014680	-	83	50.802
ENSACIG00000007158	-	64	40.976	ENSACIG00000006503	-	65	42.487
ENSACIG00000007158	-	66	59.585	ENSACIG00000012648	-	70	60.963
ENSACIG00000007158	-	72	55.172	ENSACIG00000016313	-	65	60.406
ENSACIG00000007158	-	50	46.584	ENSACIG00000000631	-	56	46.296
ENSACIG00000007158	-	74	54.887	ENSACIG00000022222	-	63	62.755
ENSACIG00000007158	-	58	44.330	ENSACIG00000001596	-	76	43.523
ENSACIG00000007158	-	59	63.587	ENSACIG00000005223	-	92	57.368
ENSACIG00000007158	-	68	44.444	ENSACIG00000012714	-	65	43.979
ENSACIG00000007158	-	55	40.860	ENSACIG00000014737	-	86	40.860
ENSACIG00000007158	-	66	43.925	ENSACIG00000020244	-	81	45.833
ENSACIG00000007158	-	62	60.476	ENSACIG00000005198	-	69	57.143
ENSACIG00000007158	-	64	50.802	ENSACIG00000004245	-	71	50.802
ENSACIG00000007158	-	73	57.513	ENSACIG00000002950	-	81	57.513
ENSACIG00000007158	-	64	32.035	ENSACIG00000009811	-	95	32.035

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007158	-	65	41.791	ENSAPOG00000000066	-	57	41.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	61	37.838	ENSAPOG00000002517	-	70	38.835	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	61	61.957	ENSAPOG00000009059	-	92	61.850	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	72	54.595	ENSAPOG00000020108	-	84	54.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	93	53.991	ENSAPOG00000002337	-	80	58.163	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	59	32.990	ENSAPOG00000008819	-	86	32.990	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	73	55.399	ENSAPOG00000010738	-	68	61.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	61	57.732	ENSAPOG00000007123	-	79	57.732	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	65	58.289	ENSAPOG00000022321	-	88	61.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	60	63.184	ENSAPOG00000001075	-	91	63.317	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	60	38.710	ENSAPOG00000009288	-	75	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	51	64.881	ENSAPOG00000007631	-	78	64.881	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	60	34.545	ENSAPOG00000002527	-	65	33.663	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	61	61.735	ENSAPOG00000018915	-	89	61.856	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	69	38.647	ENSAPOG00000008529	-	75	38.542	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	63	43.158	ENSAPOG00000021365	-	64	42.473	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007158	-	59	39.024	ENSAOCG00000016099	-	88	40.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007158	-	64	41.711	ENSAOCG00000015984	-	64	41.711	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007158	-	62	47.059	ENSAOCG00000013326	-	68	48.421	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007158	-	53	63.584	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	63.584	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007158	-	50	42.500	ENSAOCG00000007815	-	60	42.500	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000007158	-	59	39.024	ENSAPEG00000002121	-	88	40.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	50	42.945	ENSAPEG00000013378	-	62	42.945	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	61	76.410	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	77	78.704	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	58	35.567	ENSAPEG00000008662	-	50	35.567	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	60	35.922	ENSAPEG00000002163	-	76	37.056	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	63	47.321	ENSAPEG00000019003	-	77	48.958	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	64	41.711	ENSAPEG00000003513	-	82	50.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	59	38.860	ENSAPEG00000013532	-	97	38.830	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007158	-	65	59.259	ENSATEG00000011820	-	76	60.784	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	73	58.173	ENSATEG00000011594	-	78	63.776	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	59	41.379	ENSATEG00000010978	-	76	41.294	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	63	60.648	ENSATEG00000011814	-	99	58.673	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000007158	-	62	36.364	ENSATEG00000011021	-	57	36.634	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	66	64.767	ENSATEG00000011789	-	93	64.767	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	60	34.906	ENSATEG00000010951	-	68	30.808	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000007158	-	57	43.850	ENSATEG00000009383	-	62	43.850	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	76	54.040	ENSATEG00000011837	-	91	54.040	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	61	40.092	ENSATEG00000010901	-	51	40.704	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	53	61.677	ENSATEG00000011978	-	90	61.677	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	58	63.021	ENSATEG00000011979	-	89	63.158	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	65	59.391	ENSATEG00000011720	-	79	59.391	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	87	63.063	ENSATEG00000011341	-	60	63.636	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	74	47.120	ENSATEG00000019504	-	86	47.120	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	62	41.429	ENSATEG00000010966	-	94	39.545	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	72	60.000	ENSATEG00000011953	-	85	60.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	61	40.865	ENSATEG00000017209	-	72	41.667	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	72	63.265	ENSATEG00000011635	-	79	68.750	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	59	40.097	ENSATEG00000010991	-	76	40.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	62	61.275	ENSATEG00000011931	-	82	61.386	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	55	59.302	ENSATEG00000012017	-	82	60.843	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	60	59.585	ENSATEG00000011712	-	75	59.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007158	-	58	35.417	ENSACLG00000011585	-	92	35.417	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007158	-	62	61.780	ENSACLG00000005232	-	86	59.036	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007158	-	72	60.622	ENSACLG00000005659	-	91	60.938	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007158	-	58	34.896	ENSACLG00000000859	-	68	34.896	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007158	-	62	37.443	ENSACLG00000016222	-	68	37.113	Astatotilapia_calliptera
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