EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007178 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3765 bases
Position: chrCCOE01000501.1:200757-204521
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009148	MMR_HSR1	PF01926.23	3.7e-12	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000009424	-	864	-	ENSACIP00000009148	287 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007178	-	66	63.684	ENSACIG00000022222	-	61	63.684
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ENSACIG00000007178	-	68	40.500	ENSACIG00000012714	-	65	40.500
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ENSACIG00000007178	-	67	43.814	ENSACIG00000007494	-	63	44.330
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ENSACIG00000007178	-	82	38.115	ENSACIG00000012061	-	72	37.500
ENSACIG00000007178	-	61	40.761	ENSACIG00000014737	-	84	40.761
ENSACIG00000007178	-	61	37.912	ENSACIG00000014730	zgc:172131	89	37.912
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ENSACIG00000007178	-	66	42.105	ENSACIG00000006503	-	59	42.105
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ENSACIG00000007178	-	73	46.698	ENSACIG00000014703	-	87	46.698
ENSACIG00000007178	-	80	58.079	ENSACIG00000012707	-	86	58.079
ENSACIG00000007178	-	65	62.234	ENSACIG00000006478	-	70	62.234
ENSACIG00000007178	-	66	48.947	ENSACIG00000019524	-	79	48.947
ENSACIG00000007178	-	66	46.114	ENSACIG00000001455	-	69	46.114
ENSACIG00000007178	-	66	61.579	ENSACIG00000016313	-	60	61.579
ENSACIG00000007178	-	70	32.000	ENSACIG00000009149	-	72	32.000
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ENSACIG00000007178	-	61	61.017	ENSACIG00000012204	-	76	61.017

Orthologs

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ENSACIG00000007178	-	66	64.921	ENSAPOG00000001075	-	88	64.921	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	66	41.667	ENSAPOG00000000066	-	53	41.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	64	32.275	ENSAPOG00000008819	-	82	32.275	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	68	63.483	ENSAPOG00000022321	-	83	63.483	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	67	40.385	ENSAPOG00000009288	-	76	40.385	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	74	56.338	ENSAPOG00000007123	-	79	56.338	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	65	60.847	ENSAPOG00000007631	-	85	60.847	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	67	39.691	ENSAPOG00000008529	-	75	39.691	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	66	62.105	ENSAPOG00000018915	-	81	62.105	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	69	64.583	ENSAPOG00000002337	-	63	64.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	64	60.326	ENSAPOG00000020108	-	53	60.326	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	68	36.364	ENSAPOG00000002517	-	71	36.364	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	64	32.821	ENSAPOG00000002527	-	62	32.821	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	66	62.632	ENSAPOG00000010738	-	62	62.632	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	70	41.584	ENSAPOG00000021365	-	66	41.584	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007178	-	67	61.957	ENSAPOG00000009059	-	90	61.143	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000007178	-	65	40.404	ENSAOCG00000016099	-	87	40.404	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007178	-	60	63.584	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	63.584	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007178	-	71	45.813	ENSAOCG00000013326	-	72	45.813	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007178	-	71	39.706	ENSAOCG00000015984	-	66	39.706	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000007178	-	60	41.520	ENSAPEG00000013378	-	62	41.520	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007178	-	71	40.394	ENSAPEG00000003513	-	85	45.161	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007178	-	65	38.830	ENSAPEG00000013508	-	79	38.830	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007178	-	65	40.404	ENSAPEG00000002121	-	87	40.404	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000007178	-	73	70.283	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	76	79.630	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007178	-	65	36.224	ENSAPEG00000002163	-	67	36.224	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000007178	-	69	39.899	ENSATEG00000017209	-	74	39.899	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000007178	-	74	57.674	ENSATEG00000011814	-	62	61.458	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000007178	-	66	69.149	ENSATEG00000011789	-	58	69.149	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007178	-	72	33.173	ENSATEG00000020398	-	58	33.173	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000007178	-	65	58.730	ENSATEG00000011712	-	73	58.730	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007178	-	74	56.744	ENSATEG00000011918	-	72	56.744	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007178	-	79	53.165	ENSATEG00000011820	-	85	53.165	Anabas_testudineus
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